Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IPL5

Protein Details
Accession A0A139IPL5    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
287-312RCDAQHGKVKPKPKKATKQAGDQEQRHydrophilic
473-495PPAIEPKKKEKAPKKKPQTITELHydrophilic
538-560QETAKVKKPRKPRSKKADVDNAAHydrophilic
873-918LTDDASPRERKRPRGRPKKVNAIVEATTPKRRGRPPKQTQAIPDRLHydrophilic
1047-1067RVEVRKGRSVAKSKGRKRSGEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
122-129KLPKFKKP
211-247KVAKRARKSKAAVAGETSDKPARQSKKKAARVVGEKK
294-306KVKPKPKKATKQA
463-489AARKAEALPPPPAIEPKKKEKAPKKKP
542-574KVKKPRKPRSKKADVDNAAETGKPKKAKATKAK
880-909RERKRPRGRPKKVNAIVEATTPKRRGRPPK
1051-1064RKGRSVAKSKGRKR
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 12.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
Amino Acid Sequences MPGHSPVVIDSSSPAASAFRAPTISPQPQPQEDTRKSKSTAQSSSSPGLPSPSTLFAKSTTSGLAAASTAQQVPESADNGFASAASLLKSHYFGASVGASKEGARRRVEDGGDHGQDKSAGKLPKFKKPEAAEHARPERQRSMTPFDDYAYLALSPTARKASRSPILASPIVLAPPRDALQKPRAPRISLSGYDCRPGQQSPSEAVLPVGKVAKRARKSKAAVAGETSDKPARQSKKKAARVVGEKKSDKSASFILNSDDLASTQFAALEAKDVQGERLENLGAGGRCDAQHGKVKPKPKKATKQAGDQEQRTSKPAKKNANAKTSITHAPEVQHDQQSAFFAPAKTSSNVDLNTFTVPTVSPQRSESGAAAFEEVLAPAHRRRLSWTPAKNTSAAPLIRPDTACSNTSVDAERPTLCLADIIGSFEYAHGDKPQPVQRTHSGEALTKRRRVDLADDATRAPAARKAEALPPPPAIEPKKKEKAPKKKPQTITELATKAYRPGDVVPAPVNQPTVSSFFVTNAEAEVAAPEAPASEGQETAKVKKPRKPRSKKADVDNAAETGKPKKAKATKAKVRFNEADYLAQLYHPEQARAEERRQDFLFGTSSQLGGEDSPTFMRQMQMAVRESESISGLLNGTSPTRKSCTKVTSAPHGTSLSVGQGSKEHWCSAARDHDGETLDASYIRPAFALRMAQRDGRNASAETNSDLLRPQPELHSPGTALPTISGVVSDHGFDGDIVDTAVEPAREIVDLCRSSSPAAMGPTLAICNGRQKSPSQADSGLPEPQAAPRKASPPPNAEGATSESKPIDSWNALNDLTPVPPWSPPLKAQLPSLQRSATSPIRPALQMLDSNIHIPLHKLPYTTGSIAQDRGLTDDASPRERKRPRGRPKKVNAIVEATTPKRRGRPPKQTQAIPDRLSPLKLSPAFESASQPESSAKYVNIDEISDDEKSPSTPSPPRIRARSSPPSIRTLDIVPAPAILFTAKLKPDDPSWPSIAATLFPKISATIRSTPPTNDLKSPSWYEKILLFDPIVLEDLTGWLNEKGVRVEVRKGRSVAKSKGRKRSGEGEVGEVVEVELMPWMVQKWCEEKSVCCLWREGLRGGVRVRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.11
3 0.12
4 0.16
5 0.16
6 0.15
7 0.17
8 0.17
9 0.24
10 0.32
11 0.38
12 0.37
13 0.43
14 0.48
15 0.51
16 0.56
17 0.57
18 0.59
19 0.61
20 0.67
21 0.65
22 0.65
23 0.64
24 0.67
25 0.68
26 0.67
27 0.66
28 0.61
29 0.61
30 0.6
31 0.6
32 0.54
33 0.47
34 0.38
35 0.35
36 0.3
37 0.26
38 0.24
39 0.27
40 0.27
41 0.27
42 0.28
43 0.26
44 0.29
45 0.27
46 0.25
47 0.2
48 0.18
49 0.17
50 0.15
51 0.14
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.11
59 0.1
60 0.13
61 0.15
62 0.15
63 0.13
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.15
68 0.11
69 0.09
70 0.09
71 0.09
72 0.07
73 0.08
74 0.08
75 0.1
76 0.11
77 0.12
78 0.12
79 0.12
80 0.11
81 0.14
82 0.15
83 0.15
84 0.15
85 0.15
86 0.15
87 0.15
88 0.22
89 0.25
90 0.29
91 0.31
92 0.33
93 0.37
94 0.43
95 0.43
96 0.4
97 0.4
98 0.42
99 0.42
100 0.4
101 0.36
102 0.3
103 0.31
104 0.29
105 0.25
106 0.24
107 0.26
108 0.27
109 0.37
110 0.41
111 0.49
112 0.55
113 0.54
114 0.57
115 0.58
116 0.66
117 0.65
118 0.7
119 0.67
120 0.69
121 0.75
122 0.72
123 0.69
124 0.65
125 0.63
126 0.58
127 0.57
128 0.54
129 0.54
130 0.52
131 0.53
132 0.48
133 0.41
134 0.39
135 0.32
136 0.26
137 0.2
138 0.15
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.13
144 0.19
145 0.18
146 0.21
147 0.25
148 0.33
149 0.38
150 0.4
151 0.41
152 0.4
153 0.45
154 0.43
155 0.39
156 0.32
157 0.27
158 0.25
159 0.22
160 0.18
161 0.13
162 0.15
163 0.16
164 0.19
165 0.2
166 0.25
167 0.33
168 0.39
169 0.44
170 0.51
171 0.54
172 0.52
173 0.53
174 0.53
175 0.5
176 0.48
177 0.49
178 0.46
179 0.43
180 0.43
181 0.41
182 0.36
183 0.32
184 0.28
185 0.27
186 0.24
187 0.26
188 0.26
189 0.3
190 0.28
191 0.25
192 0.25
193 0.23
194 0.18
195 0.17
196 0.18
197 0.15
198 0.21
199 0.27
200 0.36
201 0.42
202 0.49
203 0.54
204 0.59
205 0.63
206 0.65
207 0.68
208 0.63
209 0.57
210 0.52
211 0.49
212 0.42
213 0.39
214 0.35
215 0.28
216 0.24
217 0.25
218 0.3
219 0.36
220 0.42
221 0.51
222 0.58
223 0.66
224 0.75
225 0.79
226 0.78
227 0.78
228 0.79
229 0.79
230 0.77
231 0.75
232 0.7
233 0.64
234 0.63
235 0.57
236 0.47
237 0.41
238 0.37
239 0.32
240 0.31
241 0.3
242 0.26
243 0.24
244 0.23
245 0.21
246 0.16
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.07
256 0.08
257 0.08
258 0.08
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.12
263 0.12
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.13
270 0.11
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.11
275 0.14
276 0.15
277 0.14
278 0.23
279 0.26
280 0.34
281 0.38
282 0.48
283 0.54
284 0.64
285 0.71
286 0.73
287 0.8
288 0.81
289 0.88
290 0.84
291 0.85
292 0.82
293 0.82
294 0.79
295 0.7
296 0.67
297 0.61
298 0.56
299 0.49
300 0.47
301 0.43
302 0.46
303 0.52
304 0.55
305 0.57
306 0.66
307 0.71
308 0.74
309 0.71
310 0.64
311 0.57
312 0.52
313 0.5
314 0.43
315 0.35
316 0.28
317 0.25
318 0.27
319 0.32
320 0.31
321 0.28
322 0.26
323 0.25
324 0.24
325 0.25
326 0.22
327 0.17
328 0.15
329 0.13
330 0.13
331 0.15
332 0.17
333 0.16
334 0.17
335 0.18
336 0.2
337 0.2
338 0.21
339 0.2
340 0.17
341 0.17
342 0.16
343 0.13
344 0.1
345 0.09
346 0.11
347 0.17
348 0.17
349 0.17
350 0.19
351 0.21
352 0.21
353 0.23
354 0.21
355 0.15
356 0.14
357 0.13
358 0.13
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.08
366 0.08
367 0.15
368 0.16
369 0.16
370 0.22
371 0.28
372 0.35
373 0.43
374 0.49
375 0.51
376 0.56
377 0.57
378 0.53
379 0.47
380 0.41
381 0.38
382 0.3
383 0.24
384 0.21
385 0.21
386 0.21
387 0.21
388 0.21
389 0.19
390 0.21
391 0.21
392 0.19
393 0.19
394 0.18
395 0.19
396 0.19
397 0.15
398 0.15
399 0.16
400 0.14
401 0.13
402 0.13
403 0.12
404 0.1
405 0.09
406 0.07
407 0.08
408 0.07
409 0.08
410 0.07
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.09
415 0.07
416 0.08
417 0.08
418 0.1
419 0.11
420 0.17
421 0.23
422 0.27
423 0.28
424 0.32
425 0.37
426 0.43
427 0.42
428 0.4
429 0.35
430 0.34
431 0.39
432 0.44
433 0.43
434 0.4
435 0.39
436 0.38
437 0.38
438 0.36
439 0.35
440 0.33
441 0.34
442 0.33
443 0.34
444 0.32
445 0.31
446 0.29
447 0.24
448 0.16
449 0.13
450 0.12
451 0.11
452 0.12
453 0.14
454 0.2
455 0.24
456 0.26
457 0.25
458 0.24
459 0.25
460 0.24
461 0.27
462 0.25
463 0.29
464 0.31
465 0.38
466 0.46
467 0.48
468 0.58
469 0.63
470 0.7
471 0.74
472 0.79
473 0.81
474 0.82
475 0.86
476 0.82
477 0.8
478 0.73
479 0.66
480 0.61
481 0.52
482 0.43
483 0.37
484 0.31
485 0.24
486 0.2
487 0.17
488 0.11
489 0.11
490 0.15
491 0.14
492 0.16
493 0.15
494 0.15
495 0.16
496 0.15
497 0.15
498 0.1
499 0.1
500 0.1
501 0.12
502 0.11
503 0.12
504 0.11
505 0.11
506 0.13
507 0.12
508 0.11
509 0.08
510 0.07
511 0.06
512 0.06
513 0.05
514 0.04
515 0.04
516 0.04
517 0.03
518 0.03
519 0.03
520 0.04
521 0.05
522 0.04
523 0.05
524 0.05
525 0.1
526 0.11
527 0.14
528 0.21
529 0.27
530 0.31
531 0.37
532 0.48
533 0.55
534 0.65
535 0.73
536 0.76
537 0.8
538 0.86
539 0.86
540 0.83
541 0.82
542 0.74
543 0.67
544 0.58
545 0.48
546 0.38
547 0.31
548 0.25
549 0.17
550 0.18
551 0.16
552 0.15
553 0.22
554 0.28
555 0.37
556 0.47
557 0.55
558 0.6
559 0.69
560 0.76
561 0.71
562 0.71
563 0.64
564 0.55
565 0.5
566 0.42
567 0.33
568 0.25
569 0.24
570 0.17
571 0.15
572 0.13
573 0.08
574 0.11
575 0.11
576 0.11
577 0.1
578 0.12
579 0.17
580 0.2
581 0.22
582 0.25
583 0.26
584 0.3
585 0.3
586 0.3
587 0.25
588 0.23
589 0.22
590 0.16
591 0.17
592 0.12
593 0.12
594 0.1
595 0.1
596 0.09
597 0.07
598 0.07
599 0.05
600 0.06
601 0.06
602 0.07
603 0.07
604 0.08
605 0.08
606 0.07
607 0.09
608 0.1
609 0.14
610 0.15
611 0.15
612 0.15
613 0.15
614 0.15
615 0.14
616 0.13
617 0.09
618 0.07
619 0.07
620 0.06
621 0.05
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.07
626 0.08
627 0.1
628 0.13
629 0.15
630 0.18
631 0.24
632 0.27
633 0.31
634 0.36
635 0.38
636 0.44
637 0.46
638 0.44
639 0.4
640 0.36
641 0.31
642 0.25
643 0.22
644 0.13
645 0.11
646 0.1
647 0.08
648 0.08
649 0.09
650 0.12
651 0.13
652 0.13
653 0.13
654 0.14
655 0.15
656 0.19
657 0.25
658 0.23
659 0.23
660 0.24
661 0.25
662 0.25
663 0.23
664 0.2
665 0.13
666 0.11
667 0.1
668 0.09
669 0.08
670 0.07
671 0.07
672 0.07
673 0.06
674 0.07
675 0.08
676 0.14
677 0.13
678 0.17
679 0.19
680 0.24
681 0.25
682 0.28
683 0.29
684 0.25
685 0.26
686 0.22
687 0.22
688 0.19
689 0.18
690 0.16
691 0.15
692 0.14
693 0.12
694 0.12
695 0.11
696 0.11
697 0.12
698 0.12
699 0.13
700 0.15
701 0.19
702 0.19
703 0.19
704 0.18
705 0.19
706 0.19
707 0.17
708 0.14
709 0.1
710 0.1
711 0.09
712 0.08
713 0.07
714 0.05
715 0.06
716 0.06
717 0.06
718 0.06
719 0.06
720 0.06
721 0.05
722 0.06
723 0.05
724 0.05
725 0.05
726 0.04
727 0.04
728 0.05
729 0.06
730 0.05
731 0.04
732 0.05
733 0.05
734 0.05
735 0.06
736 0.07
737 0.13
738 0.14
739 0.15
740 0.16
741 0.16
742 0.17
743 0.17
744 0.17
745 0.12
746 0.13
747 0.12
748 0.11
749 0.11
750 0.11
751 0.1
752 0.09
753 0.08
754 0.07
755 0.15
756 0.17
757 0.18
758 0.19
759 0.2
760 0.29
761 0.35
762 0.37
763 0.32
764 0.32
765 0.32
766 0.33
767 0.34
768 0.28
769 0.21
770 0.19
771 0.16
772 0.19
773 0.26
774 0.24
775 0.26
776 0.26
777 0.3
778 0.35
779 0.43
780 0.44
781 0.41
782 0.43
783 0.44
784 0.42
785 0.38
786 0.34
787 0.31
788 0.29
789 0.25
790 0.24
791 0.19
792 0.18
793 0.18
794 0.17
795 0.16
796 0.13
797 0.14
798 0.15
799 0.17
800 0.17
801 0.17
802 0.18
803 0.15
804 0.14
805 0.13
806 0.12
807 0.11
808 0.11
809 0.15
810 0.15
811 0.17
812 0.2
813 0.27
814 0.31
815 0.31
816 0.34
817 0.38
818 0.42
819 0.42
820 0.42
821 0.35
822 0.3
823 0.3
824 0.33
825 0.32
826 0.28
827 0.28
828 0.27
829 0.29
830 0.29
831 0.28
832 0.24
833 0.21
834 0.2
835 0.19
836 0.19
837 0.18
838 0.18
839 0.18
840 0.16
841 0.13
842 0.13
843 0.16
844 0.19
845 0.2
846 0.2
847 0.2
848 0.24
849 0.28
850 0.28
851 0.26
852 0.24
853 0.25
854 0.25
855 0.25
856 0.23
857 0.19
858 0.2
859 0.18
860 0.14
861 0.13
862 0.18
863 0.2
864 0.24
865 0.29
866 0.3
867 0.39
868 0.45
869 0.55
870 0.6
871 0.69
872 0.74
873 0.81
874 0.88
875 0.89
876 0.92
877 0.93
878 0.89
879 0.85
880 0.77
881 0.71
882 0.61
883 0.54
884 0.51
885 0.43
886 0.42
887 0.39
888 0.39
889 0.42
890 0.5
891 0.57
892 0.62
893 0.69
894 0.74
895 0.81
896 0.86
897 0.83
898 0.83
899 0.82
900 0.79
901 0.7
902 0.62
903 0.56
904 0.5
905 0.46
906 0.39
907 0.31
908 0.31
909 0.31
910 0.31
911 0.28
912 0.29
913 0.28
914 0.28
915 0.3
916 0.24
917 0.24
918 0.22
919 0.21
920 0.2
921 0.21
922 0.22
923 0.2
924 0.18
925 0.18
926 0.18
927 0.21
928 0.19
929 0.17
930 0.16
931 0.16
932 0.18
933 0.16
934 0.16
935 0.14
936 0.13
937 0.14
938 0.16
939 0.16
940 0.2
941 0.26
942 0.34
943 0.43
944 0.51
945 0.59
946 0.63
947 0.68
948 0.68
949 0.71
950 0.73
951 0.71
952 0.72
953 0.68
954 0.67
955 0.63
956 0.57
957 0.49
958 0.41
959 0.37
960 0.29
961 0.27
962 0.21
963 0.19
964 0.18
965 0.15
966 0.14
967 0.09
968 0.09
969 0.09
970 0.15
971 0.16
972 0.18
973 0.19
974 0.21
975 0.25
976 0.32
977 0.34
978 0.34
979 0.35
980 0.34
981 0.33
982 0.33
983 0.3
984 0.24
985 0.22
986 0.2
987 0.18
988 0.16
989 0.17
990 0.16
991 0.18
992 0.19
993 0.22
994 0.25
995 0.3
996 0.34
997 0.36
998 0.37
999 0.41
1000 0.45
1001 0.43
1002 0.42
1003 0.43
1004 0.43
1005 0.46
1006 0.5
1007 0.5
1008 0.46
1009 0.43
1010 0.39
1011 0.37
1012 0.39
1013 0.34
1014 0.31
1015 0.25
1016 0.22
1017 0.22
1018 0.2
1019 0.18
1020 0.13
1021 0.11
1022 0.09
1023 0.1
1024 0.09
1025 0.09
1026 0.1
1027 0.08
1028 0.1
1029 0.12
1030 0.14
1031 0.14
1032 0.18
1033 0.24
1034 0.25
1035 0.34
1036 0.4
1037 0.45
1038 0.49
1039 0.5
1040 0.52
1041 0.57
1042 0.62
1043 0.63
1044 0.66
1045 0.71
1046 0.74
1047 0.82
1048 0.83
1049 0.79
1050 0.78
1051 0.78
1052 0.75
1053 0.73
1054 0.65
1055 0.58
1056 0.52
1057 0.46
1058 0.39
1059 0.3
1060 0.22
1061 0.13
1062 0.11
1063 0.06
1064 0.06
1065 0.05
1066 0.05
1067 0.06
1068 0.08
1069 0.1
1070 0.12
1071 0.16
1072 0.21
1073 0.23
1074 0.3
1075 0.31
1076 0.33
1077 0.38
1078 0.46
1079 0.45
1080 0.41
1081 0.41
1082 0.39
1083 0.44
1084 0.46
1085 0.41
1086 0.39
1087 0.4
1088 0.43