FuNGI

A0A139IFS4

Protein Details

Accession

A0A139IFS4

Localization Confidence

High

Confidence Score

16.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-128	VDERMSKRRKTSRLPISYSG	Hydrophilic
180-200	VGDLTGKNRRSKQNTRERFYA	Hydrophilic
832-851	LEERPKRKPRILEAIKKVEN	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
838-839	RK

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto 9.5, cyto_mito 7, mito 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR003107 HAT IPR010491 PRP1_N IPR045075 Syf1-like IPR011990 TPR-like_helical_dom_sf IPR019734 TPR_repeat
Gene Ontology	GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
Pfam	View protein in Pfam PF06424 PRP1_N PF13181 TPR_8

Amino Acid Sequences

MSGRKDFLSQQAPENYVAGLGRGATGFTTRSDLGPAREGPSEEQIKEALAKRAAALGNAPPTAYGVKGKKDDEAEDDDRYQDAENEEGLFASGNYDREDDEADRIYQDVDERMSKRRKTSRLPISYSGALADLRVNREERERKEREEFEAKNPKIQQQFADLKRALGTVSDEDWASIPEVGDLTGKNRRSKQNTRERFYAVPDSVLAGARDSGQLGTEIQDEGMATGADGASNEQADGTMTNFADIGAARDKVLKARLDKAAAGTETASAGTSTSIDPKGYMTALASTELSKGDIPVGDIKRARVLLESVIKTNPRHGPGWIAAARLEEYAGKIVAARNVIRRGCEMCPKNEDVWLESMRLNDNANAKIIAAKAIEHNDRSVRLWIEASKLETIPASKKRVLRKALDHIPQSVAIWKEAVNLEENPDDAKLLLAKATEIIPLSVELWLALARLETPEQAQVVLNKARKAVPASYEIWVAAARLQEQTGQEAMVAKVMERAVKALARESAMLKREEWISQAETCEEEGAPLTCRAIIKETIGFGLDPDDDRKQIWLNDAQSSMDRGMYETARAIYSAARNEFYTRKSVWLAAAELERKAGSKEQLWSILEEAVSSIPTSSELWMQLAREKWLAGDVEGARRVLGEAFSKNPENEDIYLAAVKLEADNGQEERARMLLAQAREEARTDRVFVRSVAFERQTNHPDRALELVNEGLQSFPKTDKLWMMKGQIYEGKGMKPQAREAFSNGTRHCPKSVPLWILAARLEESMGIVVKARSTLDRARLAVPKNDRLWTESIRLEIRAKNLPAANQKLAQALQECPNSGLIWAERIWNLEERPKRKPRILEAIKKVENDPILFVTAARIFWSERKLDKADSWFLKAVTLDPDLGDSWAWWYKFLIQHGTEEKQEQIIKQCTSNEPKHGEVWQTIRKAPENARKTTEEVLKLVAKALN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.33
3	0.26
4	0.24
5	0.17
6	0.11
7	0.09
8	0.09
9	0.08
10	0.09
11	0.08
12	0.09
13	0.1
14	0.11
15	0.15
16	0.15
17	0.16
18	0.21
19	0.23
20	0.25
21	0.3
22	0.3
23	0.29
24	0.31
25	0.32
26	0.31
27	0.36
28	0.38
29	0.33
30	0.32
31	0.29
32	0.28
33	0.32
34	0.33
35	0.31
36	0.27
37	0.28
38	0.27
39	0.32
40	0.31
41	0.26
42	0.25
43	0.23
44	0.26
45	0.26
46	0.25
47	0.19
48	0.2
49	0.2
50	0.19
51	0.22
52	0.22
53	0.29
54	0.34
55	0.36
56	0.39
57	0.42
58	0.43
59	0.4
60	0.44
61	0.41
62	0.39
63	0.39
64	0.35
65	0.32
66	0.3
67	0.25
68	0.19
69	0.17
70	0.14
71	0.14
72	0.14
73	0.14
74	0.13
75	0.13
76	0.1
77	0.08
78	0.1
79	0.11
80	0.11
81	0.13
82	0.13
83	0.14
84	0.15
85	0.18
86	0.17
87	0.18
88	0.19
89	0.19
90	0.18
91	0.18
92	0.17
93	0.15
94	0.15
95	0.14
96	0.14
97	0.2
98	0.22
99	0.31
100	0.39
101	0.43
102	0.51
103	0.59
104	0.64
105	0.68
106	0.76
107	0.78
108	0.79
109	0.81
110	0.77
111	0.73
112	0.65
113	0.56
114	0.46
115	0.36
116	0.26
117	0.19
118	0.19
119	0.16
120	0.17
121	0.2
122	0.21
123	0.21
124	0.31
125	0.39
126	0.42
127	0.5
128	0.52
129	0.56
130	0.63
131	0.65
132	0.63
133	0.64
134	0.6
135	0.6
136	0.66
137	0.6
138	0.59
139	0.58
140	0.57
141	0.53
142	0.52
143	0.44
144	0.42
145	0.51
146	0.46
147	0.52
148	0.46
149	0.41
150	0.39
151	0.37
152	0.28
153	0.2
154	0.2
155	0.14
156	0.14
157	0.15
158	0.13
159	0.14
160	0.14
161	0.13
162	0.11
163	0.1
164	0.08
165	0.08
166	0.08
167	0.08
168	0.09
169	0.09
170	0.12
171	0.18
172	0.23
173	0.29
174	0.36
175	0.46
176	0.54
177	0.64
178	0.71
179	0.75
180	0.81
181	0.81
182	0.79
183	0.74
184	0.66
185	0.62
186	0.59
187	0.48
188	0.39
189	0.32
190	0.28
191	0.25
192	0.24
193	0.18
194	0.1
195	0.1
196	0.1
197	0.1
198	0.09
199	0.08
200	0.07
201	0.08
202	0.08
203	0.08
204	0.09
205	0.08
206	0.08
207	0.08
208	0.07
209	0.07
210	0.07
211	0.05
212	0.04
213	0.04
214	0.04
215	0.04
216	0.04
217	0.05
218	0.05
219	0.06
220	0.06
221	0.05
222	0.05
223	0.06
224	0.06
225	0.06
226	0.08
227	0.08
228	0.08
229	0.08
230	0.08
231	0.09
232	0.08
233	0.1
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.13
238	0.14
239	0.16
240	0.21
241	0.23
242	0.24
243	0.29
244	0.33
245	0.33
246	0.33
247	0.32
248	0.31
249	0.26
250	0.23
251	0.18
252	0.14
253	0.12
254	0.11
255	0.1
256	0.06
257	0.06
258	0.05
259	0.06
260	0.06
261	0.09
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.11
266	0.12
267	0.11
268	0.11
269	0.08
270	0.09
271	0.1
272	0.1
273	0.1
274	0.09
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.08
279	0.08
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.16
284	0.17
285	0.21
286	0.22
287	0.22
288	0.24
289	0.24
290	0.23
291	0.17
292	0.17
293	0.17
294	0.23
295	0.24
296	0.22
297	0.24
298	0.27
299	0.26
300	0.31
301	0.31
302	0.27
303	0.27
304	0.26
305	0.28
306	0.27
307	0.33
308	0.28
309	0.24
310	0.21
311	0.21
312	0.21
313	0.16
314	0.15
315	0.08
316	0.08
317	0.08
318	0.07
319	0.07
320	0.07
321	0.08
322	0.1
323	0.12
324	0.13
325	0.17
326	0.23
327	0.23
328	0.23
329	0.25
330	0.26
331	0.26
332	0.34
333	0.32
334	0.3
335	0.34
336	0.36
337	0.35
338	0.34
339	0.32
340	0.25
341	0.26
342	0.23
343	0.2
344	0.18
345	0.18
346	0.16
347	0.17
348	0.16
349	0.15
350	0.17
351	0.16
352	0.16
353	0.15
354	0.13
355	0.14
356	0.13
357	0.12
358	0.09
359	0.09
360	0.1
361	0.14
362	0.16
363	0.15
364	0.17
365	0.17
366	0.18
367	0.19
368	0.2
369	0.16
370	0.15
371	0.16
372	0.15
373	0.16
374	0.16
375	0.16
376	0.15
377	0.14
378	0.13
379	0.12
380	0.13
381	0.17
382	0.21
383	0.24
384	0.27
385	0.32
386	0.4
387	0.48
388	0.52
389	0.51
390	0.52
391	0.56
392	0.6
393	0.6
394	0.54
395	0.47
396	0.43
397	0.37
398	0.31
399	0.26
400	0.18
401	0.13
402	0.12
403	0.1
404	0.12
405	0.12
406	0.12
407	0.11
408	0.1
409	0.12
410	0.12
411	0.12
412	0.1
413	0.09
414	0.09
415	0.06
416	0.06
417	0.05
418	0.05
419	0.05
420	0.05
421	0.05
422	0.05
423	0.06
424	0.06
425	0.06
426	0.06
427	0.05
428	0.06
429	0.06
430	0.06
431	0.05
432	0.04
433	0.04
434	0.04
435	0.04
436	0.04
437	0.03
438	0.03
439	0.04
440	0.05
441	0.05
442	0.05
443	0.06
444	0.06
445	0.07
446	0.07
447	0.07
448	0.11
449	0.15
450	0.17
451	0.17
452	0.18
453	0.18
454	0.19
455	0.21
456	0.19
457	0.17
458	0.19
459	0.2
460	0.19
461	0.19
462	0.17
463	0.15
464	0.13
465	0.11
466	0.08
467	0.07
468	0.07
469	0.07
470	0.07
471	0.09
472	0.09
473	0.1
474	0.09
475	0.08
476	0.08
477	0.08
478	0.08
479	0.08
480	0.08
481	0.06
482	0.08
483	0.09
484	0.09
485	0.08
486	0.09
487	0.08
488	0.1
489	0.1
490	0.09
491	0.1
492	0.1
493	0.11
494	0.12
495	0.15
496	0.16
497	0.17
498	0.15
499	0.16
500	0.17
501	0.16
502	0.16
503	0.14
504	0.13
505	0.14
506	0.14
507	0.13
508	0.12
509	0.12
510	0.11
511	0.08
512	0.07
513	0.06
514	0.06
515	0.07
516	0.07
517	0.07
518	0.07
519	0.08
520	0.08
521	0.1
522	0.1
523	0.1
524	0.12
525	0.12
526	0.11
527	0.11
528	0.1
529	0.08
530	0.08
531	0.07
532	0.07
533	0.09
534	0.1
535	0.1
536	0.1
537	0.12
538	0.12
539	0.13
540	0.15
541	0.18
542	0.18
543	0.2
544	0.2
545	0.2
546	0.18
547	0.19
548	0.16
549	0.12
550	0.1
551	0.08
552	0.1
553	0.09
554	0.1
555	0.09
556	0.09
557	0.09
558	0.09
559	0.08
560	0.09
561	0.11
562	0.14
563	0.15
564	0.15
565	0.15
566	0.18
567	0.2
568	0.2
569	0.21
570	0.19
571	0.2
572	0.2
573	0.21
574	0.19
575	0.18
576	0.18
577	0.15
578	0.17
579	0.16
580	0.14
581	0.14
582	0.13
583	0.11
584	0.12
585	0.13
586	0.12
587	0.14
588	0.17
589	0.18
590	0.22
591	0.23
592	0.22
593	0.2
594	0.19
595	0.16
596	0.13
597	0.12
598	0.08
599	0.07
600	0.06
601	0.05
602	0.04
603	0.06
604	0.06
605	0.07
606	0.08
607	0.08
608	0.09
609	0.1
610	0.11
611	0.13
612	0.14
613	0.15
614	0.14
615	0.14
616	0.13
617	0.14
618	0.14
619	0.1
620	0.14
621	0.14
622	0.16
623	0.18
624	0.17
625	0.15
626	0.14
627	0.15
628	0.1
629	0.1
630	0.1
631	0.11
632	0.13
633	0.16
634	0.18
635	0.18
636	0.19
637	0.19
638	0.19
639	0.18
640	0.17
641	0.15
642	0.14
643	0.14
644	0.13
645	0.11
646	0.08
647	0.07
648	0.06
649	0.06
650	0.05
651	0.06
652	0.08
653	0.08
654	0.1
655	0.11
656	0.11
657	0.11
658	0.11
659	0.1
660	0.09
661	0.11
662	0.14
663	0.14
664	0.15
665	0.17
666	0.18
667	0.18
668	0.2
669	0.19
670	0.18
671	0.18
672	0.19
673	0.19
674	0.21
675	0.21
676	0.21
677	0.22
678	0.2
679	0.22
680	0.25
681	0.24
682	0.24
683	0.26
684	0.32
685	0.36
686	0.38
687	0.38
688	0.35
689	0.33
690	0.32
691	0.33
692	0.28
693	0.21
694	0.18
695	0.16
696	0.14
697	0.14
698	0.12
699	0.09
700	0.08
701	0.09
702	0.09
703	0.1
704	0.13
705	0.14
706	0.16
707	0.23
708	0.27
709	0.31
710	0.34
711	0.37
712	0.37
713	0.37
714	0.38
715	0.34
716	0.3
717	0.3
718	0.27
719	0.24
720	0.24
721	0.28
722	0.29
723	0.28
724	0.34
725	0.36
726	0.38
727	0.38
728	0.39
729	0.43
730	0.42
731	0.47
732	0.41
733	0.44
734	0.45
735	0.46
736	0.44
737	0.38
738	0.36
739	0.37
740	0.44
741	0.38
742	0.34
743	0.36
744	0.35
745	0.34
746	0.33
747	0.26
748	0.19
749	0.16
750	0.14
751	0.1
752	0.09
753	0.08
754	0.08
755	0.07
756	0.07
757	0.07
758	0.08
759	0.09
760	0.1
761	0.1
762	0.15
763	0.2
764	0.26
765	0.3
766	0.32
767	0.36
768	0.41
769	0.43
770	0.46
771	0.47
772	0.48
773	0.47
774	0.49
775	0.45
776	0.43
777	0.44
778	0.4
779	0.39
780	0.33
781	0.33
782	0.31
783	0.33
784	0.33
785	0.31
786	0.32
787	0.34
788	0.33
789	0.35
790	0.35
791	0.39
792	0.43
793	0.46
794	0.45
795	0.41
796	0.41
797	0.39
798	0.37
799	0.33
800	0.27
801	0.24
802	0.27
803	0.27
804	0.27
805	0.24
806	0.25
807	0.22
808	0.2
809	0.19
810	0.13
811	0.14
812	0.14
813	0.15
814	0.15
815	0.17
816	0.19
817	0.2
818	0.22
819	0.28
820	0.37
821	0.39
822	0.49
823	0.57
824	0.62
825	0.65
826	0.72
827	0.72
828	0.74
829	0.79
830	0.8
831	0.79
832	0.82
833	0.78
834	0.72
835	0.64
836	0.58
837	0.51
838	0.41
839	0.34
840	0.26
841	0.24
842	0.22
843	0.2
844	0.19
845	0.17
846	0.16
847	0.14
848	0.14
849	0.15
850	0.19
851	0.24
852	0.26
853	0.27
854	0.34
855	0.36
856	0.38
857	0.42
858	0.44
859	0.48
860	0.47
861	0.48
862	0.45
863	0.41
864	0.4
865	0.34
866	0.3
867	0.25
868	0.23
869	0.18
870	0.16
871	0.18
872	0.16
873	0.16
874	0.14
875	0.1
876	0.13
877	0.18
878	0.18
879	0.17
880	0.17
881	0.23
882	0.28
883	0.32
884	0.35
885	0.31
886	0.38
887	0.43
888	0.45
889	0.42
890	0.39
891	0.37
892	0.35
893	0.36
894	0.33
895	0.35
896	0.39
897	0.39
898	0.4
899	0.43
900	0.46
901	0.53
902	0.56
903	0.55
904	0.53
905	0.54
906	0.53
907	0.53
908	0.49
909	0.45
910	0.48
911	0.47
912	0.46
913	0.47
914	0.48
915	0.49
916	0.51
917	0.55
918	0.58
919	0.57
920	0.59
921	0.62
922	0.6
923	0.59
924	0.61
925	0.58
926	0.52
927	0.46
928	0.45
929	0.42
930	0.39

A0A139IFS4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer