FuNGI

A0A139IVA0

Protein Details

Accession

A0A139IVA0

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
31-54	AVDIFHKKKKPAVRRPLQPGQRVV	Hydrophilic
197-238	GGDPSKQIKKKQQKKVEEGRDESDPKRQKRSKLRYEEARPWH	Basic
420-449	EQLEKLEERKKQKRMRRQLRKREHQGQYSD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
24-46	APARKKPAVDIFHKKKKPAVRRP
202-228	KQIKKKQQKKVEEGRDESDPKRQKRSK
426-441	EERKKQKRMRRQLRKR
581-582	PK

Subcellular Location(s)

nucl 25

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSASPARPPSGPNSVTPTTGGPPAPARKKPAVDIFHKKKKPAVRRPLQPGQRVVPPSTQNNGPPLHSFQQPMNGTTRNPNPTVHSIAPSNEPEKGTYSEFPIVISKRQLEAGLRFHAMKLQSRIENGEPVTVNPYDERQFTRPLRLHRRYPGDKPEAADQSDAASGVDDKERELNNVRRAERQAEREENQKLIAPTGGDPSKQIKKKQQKKVEEGRDESDPKRQKRSKLRYEEARPWHLEDFESKNVWVGSYEQALSERSIMLEVKDDGTFGMVPIEKWYKFQQTNRVNTIPSDDVDKMMAKRIQPSRWAMKTHAVMDEAAKEAYMKKIAMARAKREDDEVPRRVKDEGEFDADRDMLDVEMGDLNEFQDDDEGTLFQIEDDDDAKELEMRLFLEMRDAGLGGTGVKDDALDVEGQLRKEQLEKLEERKKQKRMRRQLRKREHQGQYSDSDDSDDPYADSSDSMDSEDEREEERKKEEAKKAAQVNGDKSGASTKGTNTPTGRPEKRDPSRLGASLKRPGSPDVSDLSGNESSRKKVKSLNGKPMPANSGAARSLSPDASKKGAGSGSDTDTSRKGRSSAPKIKLKNSPAGTPSASRAASPARSPSSSTGFPTIDEVKAAIPNDGIDIKSLVQLFKLRVAGKTADFIKMVKLAGKQSTDPASKGKIVPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.41
3	0.39
4	0.36
5	0.29
6	0.31
7	0.28
8	0.23
9	0.29
10	0.37
11	0.45
12	0.47
13	0.52
14	0.55
15	0.59
16	0.63
17	0.65
18	0.63
19	0.64
20	0.7
21	0.73
22	0.76
23	0.78
24	0.73
25	0.71
26	0.74
27	0.75
28	0.75
29	0.76
30	0.75
31	0.8
32	0.87
33	0.9
34	0.88
35	0.84
36	0.8
37	0.73
38	0.71
39	0.65
40	0.58
41	0.55
42	0.52
43	0.5
44	0.48
45	0.48
46	0.43
47	0.45
48	0.44
49	0.39
50	0.37
51	0.38
52	0.37
53	0.36
54	0.35
55	0.31
56	0.38
57	0.38
58	0.36
59	0.35
60	0.33
61	0.32
62	0.38
63	0.44
64	0.41
65	0.41
66	0.4
67	0.41
68	0.44
69	0.49
70	0.43
71	0.39
72	0.35
73	0.36
74	0.39
75	0.37
76	0.33
77	0.3
78	0.29
79	0.27
80	0.28
81	0.29
82	0.28
83	0.25
84	0.28
85	0.28
86	0.27
87	0.27
88	0.29
89	0.28
90	0.28
91	0.3
92	0.28
93	0.26
94	0.27
95	0.28
96	0.26
97	0.3
98	0.31
99	0.3
100	0.3
101	0.29
102	0.28
103	0.3
104	0.29
105	0.29
106	0.3
107	0.32
108	0.32
109	0.34
110	0.38
111	0.35
112	0.37
113	0.31
114	0.31
115	0.25
116	0.24
117	0.26
118	0.22
119	0.21
120	0.17
121	0.2
122	0.18
123	0.2
124	0.24
125	0.23
126	0.32
127	0.33
128	0.42
129	0.44
130	0.52
131	0.6
132	0.63
133	0.67
134	0.68
135	0.75
136	0.72
137	0.75
138	0.75
139	0.71
140	0.66
141	0.6
142	0.59
143	0.53
144	0.47
145	0.4
146	0.3
147	0.24
148	0.22
149	0.2
150	0.12
151	0.08
152	0.07
153	0.08
154	0.11
155	0.09
156	0.09
157	0.15
158	0.15
159	0.18
160	0.26
161	0.32
162	0.37
163	0.45
164	0.46
165	0.46
166	0.48
167	0.52
168	0.5
169	0.5
170	0.5
171	0.5
172	0.5
173	0.52
174	0.51
175	0.45
176	0.4
177	0.36
178	0.29
179	0.22
180	0.21
181	0.15
182	0.14
183	0.19
184	0.19
185	0.15
186	0.17
187	0.22
188	0.3
189	0.35
190	0.4
191	0.45
192	0.55
193	0.66
194	0.74
195	0.78
196	0.79
197	0.84
198	0.88
199	0.88
200	0.85
201	0.78
202	0.7
203	0.66
204	0.6
205	0.52
206	0.5
207	0.48
208	0.45
209	0.52
210	0.54
211	0.57
212	0.65
213	0.74
214	0.75
215	0.77
216	0.81
217	0.81
218	0.83
219	0.83
220	0.79
221	0.74
222	0.65
223	0.58
224	0.51
225	0.41
226	0.34
227	0.29
228	0.28
229	0.25
230	0.24
231	0.21
232	0.21
233	0.2
234	0.19
235	0.16
236	0.12
237	0.11
238	0.11
239	0.12
240	0.1
241	0.11
242	0.12
243	0.12
244	0.1
245	0.09
246	0.07
247	0.08
248	0.08
249	0.07
250	0.08
251	0.08
252	0.09
253	0.09
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.06
259	0.08
260	0.07
261	0.07
262	0.1
263	0.14
264	0.13
265	0.16
266	0.19
267	0.24
268	0.29
269	0.33
270	0.4
271	0.45
272	0.51
273	0.54
274	0.53
275	0.46
276	0.41
277	0.41
278	0.32
279	0.23
280	0.21
281	0.15
282	0.14
283	0.15
284	0.16
285	0.12
286	0.16
287	0.18
288	0.15
289	0.22
290	0.27
291	0.28
292	0.31
293	0.36
294	0.39
295	0.41
296	0.43
297	0.37
298	0.38
299	0.38
300	0.36
301	0.32
302	0.24
303	0.21
304	0.19
305	0.18
306	0.13
307	0.1
308	0.08
309	0.07
310	0.07
311	0.08
312	0.09
313	0.07
314	0.08
315	0.12
316	0.15
317	0.21
318	0.24
319	0.28
320	0.34
321	0.35
322	0.35
323	0.34
324	0.34
325	0.35
326	0.39
327	0.4
328	0.36
329	0.35
330	0.36
331	0.34
332	0.31
333	0.26
334	0.22
335	0.19
336	0.21
337	0.21
338	0.2
339	0.2
340	0.19
341	0.17
342	0.13
343	0.1
344	0.05
345	0.04
346	0.04
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.04
351	0.04
352	0.04
353	0.04
354	0.05
355	0.04
356	0.04
357	0.04
358	0.04
359	0.04
360	0.04
361	0.04
362	0.05
363	0.04
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.05
369	0.05
370	0.05
371	0.06
372	0.06
373	0.06
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.07
379	0.07
380	0.07
381	0.08
382	0.08
383	0.08
384	0.07
385	0.07
386	0.06
387	0.05
388	0.06
389	0.04
390	0.04
391	0.04
392	0.03
393	0.03
394	0.03
395	0.03
396	0.03
397	0.04
398	0.04
399	0.04
400	0.08
401	0.11
402	0.11
403	0.12
404	0.12
405	0.12
406	0.14
407	0.16
408	0.15
409	0.2
410	0.23
411	0.31
412	0.39
413	0.45
414	0.53
415	0.59
416	0.65
417	0.68
418	0.75
419	0.77
420	0.8
421	0.86
422	0.88
423	0.9
424	0.92
425	0.94
426	0.95
427	0.94
428	0.93
429	0.89
430	0.84
431	0.78
432	0.7
433	0.62
434	0.54
435	0.44
436	0.34
437	0.29
438	0.21
439	0.19
440	0.16
441	0.13
442	0.1
443	0.1
444	0.11
445	0.08
446	0.08
447	0.07
448	0.07
449	0.07
450	0.08
451	0.08
452	0.07
453	0.09
454	0.09
455	0.1
456	0.11
457	0.14
458	0.16
459	0.18
460	0.21
461	0.25
462	0.3
463	0.38
464	0.44
465	0.49
466	0.52
467	0.57
468	0.59
469	0.59
470	0.58
471	0.53
472	0.49
473	0.45
474	0.41
475	0.33
476	0.28
477	0.26
478	0.21
479	0.19
480	0.17
481	0.14
482	0.22
483	0.24
484	0.28
485	0.28
486	0.32
487	0.38
488	0.46
489	0.48
490	0.47
491	0.54
492	0.59
493	0.64
494	0.68
495	0.65
496	0.62
497	0.64
498	0.61
499	0.59
500	0.55
501	0.53
502	0.52
503	0.5
504	0.45
505	0.42
506	0.4
507	0.39
508	0.33
509	0.3
510	0.24
511	0.25
512	0.22
513	0.21
514	0.23
515	0.22
516	0.2
517	0.23
518	0.23
519	0.25
520	0.31
521	0.33
522	0.31
523	0.35
524	0.44
525	0.5
526	0.57
527	0.65
528	0.66
529	0.69
530	0.68
531	0.65
532	0.59
533	0.5
534	0.43
535	0.32
536	0.28
537	0.24
538	0.23
539	0.19
540	0.18
541	0.19
542	0.18
543	0.2
544	0.19
545	0.22
546	0.24
547	0.24
548	0.22
549	0.23
550	0.23
551	0.21
552	0.22
553	0.23
554	0.24
555	0.27
556	0.27
557	0.26
558	0.28
559	0.31
560	0.28
561	0.27
562	0.25
563	0.3
564	0.4
565	0.48
566	0.54
567	0.6
568	0.67
569	0.71
570	0.76
571	0.77
572	0.72
573	0.71
574	0.64
575	0.61
576	0.54
577	0.54
578	0.49
579	0.42
580	0.4
581	0.36
582	0.33
583	0.27
584	0.27
585	0.28
586	0.29
587	0.29
588	0.33
589	0.31
590	0.33
591	0.36
592	0.37
593	0.38
594	0.37
595	0.38
596	0.37
597	0.32
598	0.31
599	0.33
600	0.31
601	0.26
602	0.24
603	0.21
604	0.17
605	0.2
606	0.2
607	0.16
608	0.14
609	0.13
610	0.15
611	0.16
612	0.15
613	0.12
614	0.13
615	0.13
616	0.16
617	0.18
618	0.15
619	0.16
620	0.2
621	0.21
622	0.25
623	0.3
624	0.28
625	0.28
626	0.33
627	0.34
628	0.31
629	0.36
630	0.33
631	0.3
632	0.29
633	0.28
634	0.27
635	0.26
636	0.26
637	0.23
638	0.25
639	0.28
640	0.33
641	0.36
642	0.34
643	0.37
644	0.44
645	0.43
646	0.41
647	0.41
648	0.4
649	0.41

A0A139IVA0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer