Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HRE9

Protein Details
Accession A0A139HRE9    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
248-278SVVKEVRNVNMKKKDRKKPNRRGGKTTNLHMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
259-272KKKDRKKPNRRGGK
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040501  TFA2_Winged_2  
IPR016656  TFIIE-bsu  
IPR003166  TFIIE_bsu_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005673  C:transcription factor TFIIE complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF18121  TFA2_Winged_2  
PF02186  TFIIE_beta  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51351  TFIIE_BETA_C  
Amino Acid Sequences MSLQKQLASFKQEYGDATTRNISHSRPAAAVPARSSTPKPLVATSSSDAVKRNHDDAFSTAPVPAQSFGEEMLTQVHFAIEKLKSNKLEAITFDDLIAYLSLPNDAQRRIPLIKRALQDSDRVEFIPKSQTKSGKDAFCYRPKHPVTNAEELKDYLAKQSTAQGIPVRELKDGWPDCGPAIDELEQQHFLLATRRKKDNSASMIWQDSPSYHTHISDDFKEFWAKTKLPATENEIRTDLEKAGITPTSVVKEVRNVNMKKKDRKKPNRRGGKTTNLHMAGILKDYSRK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.36
3 0.29
4 0.3
5 0.32
6 0.3
7 0.33
8 0.33
9 0.27
10 0.29
11 0.32
12 0.32
13 0.29
14 0.29
15 0.33
16 0.34
17 0.36
18 0.3
19 0.3
20 0.29
21 0.31
22 0.32
23 0.32
24 0.33
25 0.35
26 0.34
27 0.33
28 0.35
29 0.34
30 0.37
31 0.32
32 0.31
33 0.28
34 0.27
35 0.29
36 0.27
37 0.31
38 0.3
39 0.31
40 0.29
41 0.28
42 0.29
43 0.28
44 0.31
45 0.26
46 0.23
47 0.2
48 0.19
49 0.19
50 0.18
51 0.15
52 0.11
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.1
58 0.09
59 0.11
60 0.1
61 0.09
62 0.09
63 0.09
64 0.07
65 0.07
66 0.12
67 0.12
68 0.18
69 0.21
70 0.26
71 0.27
72 0.29
73 0.32
74 0.29
75 0.29
76 0.25
77 0.29
78 0.26
79 0.24
80 0.23
81 0.19
82 0.17
83 0.15
84 0.14
85 0.06
86 0.05
87 0.04
88 0.05
89 0.05
90 0.08
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.12
95 0.17
96 0.2
97 0.23
98 0.27
99 0.3
100 0.35
101 0.35
102 0.37
103 0.37
104 0.34
105 0.36
106 0.32
107 0.28
108 0.23
109 0.22
110 0.21
111 0.17
112 0.17
113 0.21
114 0.2
115 0.23
116 0.27
117 0.32
118 0.33
119 0.39
120 0.44
121 0.37
122 0.38
123 0.42
124 0.43
125 0.46
126 0.48
127 0.43
128 0.47
129 0.46
130 0.48
131 0.43
132 0.45
133 0.43
134 0.48
135 0.48
136 0.39
137 0.38
138 0.34
139 0.32
140 0.24
141 0.19
142 0.11
143 0.11
144 0.1
145 0.1
146 0.13
147 0.16
148 0.15
149 0.17
150 0.17
151 0.16
152 0.18
153 0.21
154 0.19
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.22
159 0.23
160 0.23
161 0.2
162 0.19
163 0.19
164 0.19
165 0.18
166 0.09
167 0.11
168 0.1
169 0.11
170 0.11
171 0.14
172 0.14
173 0.13
174 0.12
175 0.1
176 0.1
177 0.15
178 0.22
179 0.27
180 0.32
181 0.37
182 0.38
183 0.42
184 0.47
185 0.49
186 0.47
187 0.45
188 0.43
189 0.41
190 0.42
191 0.39
192 0.34
193 0.26
194 0.2
195 0.18
196 0.16
197 0.18
198 0.16
199 0.16
200 0.17
201 0.2
202 0.23
203 0.24
204 0.26
205 0.23
206 0.24
207 0.27
208 0.26
209 0.28
210 0.31
211 0.28
212 0.29
213 0.34
214 0.36
215 0.35
216 0.38
217 0.4
218 0.43
219 0.44
220 0.43
221 0.38
222 0.35
223 0.34
224 0.32
225 0.25
226 0.18
227 0.16
228 0.14
229 0.15
230 0.15
231 0.14
232 0.13
233 0.15
234 0.15
235 0.17
236 0.18
237 0.16
238 0.23
239 0.27
240 0.33
241 0.41
242 0.42
243 0.5
244 0.59
245 0.67
246 0.71
247 0.77
248 0.8
249 0.82
250 0.9
251 0.92
252 0.92
253 0.94
254 0.95
255 0.92
256 0.92
257 0.89
258 0.89
259 0.85
260 0.8
261 0.78
262 0.68
263 0.6
264 0.52
265 0.45
266 0.35
267 0.31
268 0.26