Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139ICH3

Protein Details
Accession A0A139ICH3    Localization Confidence High Confidence Score 21.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
356-383ALANGDPKKRQKRPYKQRDPNAPKRPLTHydrophilic
511-538PVKPPPPPPQAPKKKSSKKNKAAATPVAHydrophilic
562-587AGEETPATEKKKKKNRKSEVDPASAQHydrophilic
594-615QPVATPGAEKKEKKKKRKSEAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
363-379KKRQKRPYKQRDPNAPK
514-578PPPPPPQAPKKKSSKKNKAAATPVAAVPPPPAPMAAPEPVSSKKRKAPAGEETPATEKKKKKNRK
602-614EKKEKKKKRKSEA
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 12, cyto 6, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd22012  HMG-box_ABF2_IXR1-like_rpt2  
Amino Acid Sequences MDAALESIILLMATAPAIDTELRADVRFLLSDEPVPWCNTPDSLRHTSKLAPRNLLLTTLYTSSSQTTLITPSTASDYGNLDRENGLHIHMWNAYFPVLIERIREHHSTMPELWELERESVEFFTFCFVPIIPFSLKPWHCVNCHICHFQQDLKYRPDVQQQMDNPSQAGQQQIPMQNGPPQGWNSGNPYAGQANMSAVQFRRPSILSLDHKAISAATMNPAHLDPRLQTPTDARVNELIEWANKQAVNTPQELQQLQQPQQLQSPMRDRIVVTIDRERFTQTRNALTSAYIGLSNAVDKAVKAYIDHTDVILQGEGTLDISHLLNPFTGAVGAAQTAEFNIANGLHAVTTGTAEALANGDPKKRQKRPYKQRDPNAPKRPLTAYFRYLKEVRPLIAAEVHDHPPSDGTKAGDISKIATERWKALGDARRKPYHQAYQSELAAYEAAVKEYKAAGGNVDAPKTPGDEDEDEDEEDEGDESPAKVVAAADESSSSDDSSSDEEESDSEEEVPVKPPPPPPQAPKKKSSKKNKAAATPVAAVPPPPAPMAAPEPVSSKKRKAPAGEETPATEKKKKKNRKSEVDPASAQLQLESSQPVATPGAEKKEKKKKRKSEAA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.04
2 0.04
3 0.04
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.08
8 0.11
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.14
13 0.16
14 0.16
15 0.16
16 0.15
17 0.15
18 0.17
19 0.18
20 0.21
21 0.21
22 0.24
23 0.23
24 0.23
25 0.23
26 0.24
27 0.26
28 0.28
29 0.34
30 0.4
31 0.44
32 0.43
33 0.44
34 0.48
35 0.53
36 0.55
37 0.54
38 0.5
39 0.47
40 0.49
41 0.47
42 0.42
43 0.34
44 0.28
45 0.24
46 0.2
47 0.2
48 0.17
49 0.18
50 0.17
51 0.16
52 0.15
53 0.13
54 0.13
55 0.14
56 0.15
57 0.14
58 0.12
59 0.13
60 0.17
61 0.17
62 0.16
63 0.15
64 0.18
65 0.2
66 0.24
67 0.23
68 0.2
69 0.2
70 0.2
71 0.21
72 0.17
73 0.17
74 0.15
75 0.15
76 0.16
77 0.17
78 0.17
79 0.15
80 0.16
81 0.14
82 0.11
83 0.11
84 0.13
85 0.13
86 0.13
87 0.15
88 0.16
89 0.19
90 0.24
91 0.25
92 0.25
93 0.28
94 0.3
95 0.32
96 0.31
97 0.31
98 0.28
99 0.27
100 0.24
101 0.22
102 0.21
103 0.18
104 0.17
105 0.14
106 0.14
107 0.14
108 0.14
109 0.11
110 0.09
111 0.11
112 0.1
113 0.11
114 0.1
115 0.09
116 0.11
117 0.11
118 0.15
119 0.14
120 0.15
121 0.16
122 0.25
123 0.25
124 0.27
125 0.33
126 0.34
127 0.34
128 0.41
129 0.45
130 0.43
131 0.49
132 0.5
133 0.44
134 0.44
135 0.46
136 0.42
137 0.44
138 0.43
139 0.43
140 0.43
141 0.46
142 0.43
143 0.44
144 0.48
145 0.47
146 0.42
147 0.44
148 0.43
149 0.47
150 0.46
151 0.43
152 0.34
153 0.29
154 0.27
155 0.2
156 0.2
157 0.13
158 0.14
159 0.19
160 0.22
161 0.23
162 0.23
163 0.23
164 0.25
165 0.26
166 0.24
167 0.22
168 0.19
169 0.2
170 0.21
171 0.22
172 0.23
173 0.24
174 0.24
175 0.21
176 0.21
177 0.19
178 0.18
179 0.17
180 0.11
181 0.1
182 0.11
183 0.11
184 0.11
185 0.11
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.18
190 0.16
191 0.18
192 0.19
193 0.27
194 0.26
195 0.29
196 0.32
197 0.29
198 0.28
199 0.27
200 0.23
201 0.15
202 0.13
203 0.1
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.11
208 0.11
209 0.12
210 0.1
211 0.11
212 0.09
213 0.15
214 0.18
215 0.17
216 0.18
217 0.19
218 0.25
219 0.3
220 0.29
221 0.23
222 0.23
223 0.24
224 0.23
225 0.22
226 0.17
227 0.12
228 0.13
229 0.12
230 0.12
231 0.11
232 0.11
233 0.14
234 0.19
235 0.2
236 0.21
237 0.22
238 0.23
239 0.26
240 0.26
241 0.22
242 0.21
243 0.24
244 0.24
245 0.26
246 0.24
247 0.22
248 0.24
249 0.28
250 0.24
251 0.24
252 0.28
253 0.27
254 0.27
255 0.26
256 0.24
257 0.23
258 0.25
259 0.23
260 0.2
261 0.24
262 0.25
263 0.25
264 0.26
265 0.26
266 0.23
267 0.23
268 0.27
269 0.22
270 0.24
271 0.25
272 0.26
273 0.23
274 0.22
275 0.21
276 0.15
277 0.13
278 0.08
279 0.07
280 0.06
281 0.06
282 0.06
283 0.05
284 0.05
285 0.04
286 0.04
287 0.05
288 0.06
289 0.06
290 0.06
291 0.07
292 0.09
293 0.11
294 0.11
295 0.1
296 0.1
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.07
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.03
307 0.04
308 0.04
309 0.05
310 0.06
311 0.06
312 0.05
313 0.06
314 0.06
315 0.05
316 0.05
317 0.04
318 0.03
319 0.03
320 0.04
321 0.04
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.04
326 0.04
327 0.04
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.05
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.07
346 0.08
347 0.1
348 0.14
349 0.22
350 0.32
351 0.39
352 0.49
353 0.58
354 0.68
355 0.78
356 0.86
357 0.89
358 0.89
359 0.91
360 0.92
361 0.91
362 0.91
363 0.89
364 0.85
365 0.75
366 0.68
367 0.63
368 0.57
369 0.54
370 0.48
371 0.44
372 0.42
373 0.43
374 0.44
375 0.42
376 0.39
377 0.39
378 0.35
379 0.3
380 0.26
381 0.25
382 0.21
383 0.22
384 0.2
385 0.16
386 0.18
387 0.19
388 0.17
389 0.17
390 0.16
391 0.15
392 0.15
393 0.14
394 0.12
395 0.11
396 0.13
397 0.14
398 0.15
399 0.15
400 0.14
401 0.14
402 0.15
403 0.15
404 0.14
405 0.16
406 0.17
407 0.18
408 0.2
409 0.2
410 0.18
411 0.24
412 0.31
413 0.35
414 0.42
415 0.48
416 0.5
417 0.51
418 0.56
419 0.57
420 0.59
421 0.58
422 0.54
423 0.52
424 0.52
425 0.51
426 0.45
427 0.37
428 0.28
429 0.21
430 0.16
431 0.14
432 0.09
433 0.09
434 0.09
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.12
439 0.1
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.17
444 0.18
445 0.19
446 0.18
447 0.17
448 0.17
449 0.18
450 0.17
451 0.12
452 0.15
453 0.15
454 0.18
455 0.21
456 0.22
457 0.21
458 0.21
459 0.2
460 0.15
461 0.13
462 0.11
463 0.08
464 0.06
465 0.07
466 0.07
467 0.07
468 0.07
469 0.07
470 0.07
471 0.06
472 0.07
473 0.08
474 0.08
475 0.08
476 0.09
477 0.1
478 0.11
479 0.12
480 0.11
481 0.09
482 0.08
483 0.09
484 0.11
485 0.12
486 0.11
487 0.11
488 0.11
489 0.11
490 0.14
491 0.13
492 0.12
493 0.1
494 0.1
495 0.11
496 0.12
497 0.14
498 0.14
499 0.14
500 0.18
501 0.24
502 0.31
503 0.39
504 0.45
505 0.52
506 0.6
507 0.71
508 0.73
509 0.77
510 0.8
511 0.82
512 0.85
513 0.88
514 0.88
515 0.87
516 0.89
517 0.88
518 0.85
519 0.83
520 0.78
521 0.72
522 0.64
523 0.55
524 0.48
525 0.4
526 0.31
527 0.25
528 0.21
529 0.17
530 0.14
531 0.13
532 0.11
533 0.15
534 0.19
535 0.2
536 0.2
537 0.2
538 0.24
539 0.3
540 0.36
541 0.38
542 0.41
543 0.45
544 0.51
545 0.57
546 0.6
547 0.62
548 0.66
549 0.69
550 0.67
551 0.61
552 0.57
553 0.56
554 0.56
555 0.54
556 0.51
557 0.5
558 0.55
559 0.65
560 0.72
561 0.78
562 0.82
563 0.88
564 0.91
565 0.93
566 0.93
567 0.91
568 0.88
569 0.79
570 0.7
571 0.62
572 0.52
573 0.42
574 0.31
575 0.23
576 0.16
577 0.16
578 0.15
579 0.13
580 0.12
581 0.12
582 0.14
583 0.13
584 0.13
585 0.17
586 0.2
587 0.29
588 0.37
589 0.42
590 0.51
591 0.61
592 0.71
593 0.77
594 0.84
595 0.85