Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139HNY1

Protein Details
Accession A0A139HNY1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
319-344VIVVRPSSKREAKKRKRLADPSRGGYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
325-337SSKREAKKRKRLA
497-515RRKREERLNALGSSKKKGK
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 13, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR014729  Rossmann-like_a/b/a_fold  
IPR006016  UspA  
Pfam View protein in Pfam  
PF00582  Usp  
CDD cd00293  USP_Like  
Amino Acid Sequences MSAQPSPRSGTPTLQNNSDAPSPRSLPAANGTTTTTLPEQKIPPAELANSTASPNAGSTTLGNNAASTASTYTPAWRRPTITIDGQSDAARRPSVQFVPSATKDSGTASRSSSAKPPSTRRSIAYGNASNGKSPAGRRLSSPPPPAQFQERVSFDTFDNKEASDFSLTLNRKHKDYEYTKRSRTFLCGTDTNEYSDTALEWLIDELVDDGDEIVCLRVVEKDSKEALKWSGGQGQRGYRREATRFLEEIEKKNTEDRAISLVLEFSIGKVHDTIQQMIRIYEPAMLVVGTRGRSLTGYQGLLSSGSVSKYCLQYSPVPVIVVRPSSKREAKKRKRLADPSRGGYRDILDKSEDAPRGRGGHLLDFNNRLSLAGADFGALGEFGSNPDEEARRVAEAIGYRNSGTHTSQRGSSLSRVTSAQSAASEVSSPPGRLLKSPELGVVDSPNVSDDENGGEISDEDLGAGEEGFIRPEDEAAQLAYERAQVEAEAVREDAEARRKREERLNALGSSKKKGKGNGDEEEGGGAAVLDIFEKLKRGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.48
2 0.48
3 0.44
4 0.45
5 0.45
6 0.41
7 0.34
8 0.36
9 0.36
10 0.34
11 0.37
12 0.33
13 0.3
14 0.32
15 0.33
16 0.28
17 0.27
18 0.28
19 0.26
20 0.26
21 0.26
22 0.22
23 0.23
24 0.24
25 0.28
26 0.29
27 0.33
28 0.37
29 0.36
30 0.35
31 0.33
32 0.33
33 0.29
34 0.3
35 0.27
36 0.24
37 0.23
38 0.21
39 0.18
40 0.17
41 0.15
42 0.13
43 0.1
44 0.1
45 0.11
46 0.13
47 0.16
48 0.17
49 0.16
50 0.15
51 0.15
52 0.14
53 0.13
54 0.11
55 0.1
56 0.09
57 0.11
58 0.12
59 0.18
60 0.24
61 0.3
62 0.34
63 0.36
64 0.39
65 0.4
66 0.46
67 0.45
68 0.46
69 0.46
70 0.43
71 0.41
72 0.39
73 0.37
74 0.33
75 0.29
76 0.25
77 0.2
78 0.18
79 0.19
80 0.24
81 0.26
82 0.25
83 0.25
84 0.26
85 0.33
86 0.33
87 0.35
88 0.3
89 0.27
90 0.26
91 0.27
92 0.29
93 0.23
94 0.23
95 0.21
96 0.25
97 0.26
98 0.27
99 0.3
100 0.32
101 0.37
102 0.42
103 0.49
104 0.52
105 0.59
106 0.6
107 0.56
108 0.55
109 0.52
110 0.51
111 0.51
112 0.46
113 0.42
114 0.45
115 0.43
116 0.37
117 0.34
118 0.3
119 0.24
120 0.22
121 0.27
122 0.26
123 0.26
124 0.29
125 0.36
126 0.42
127 0.48
128 0.53
129 0.5
130 0.48
131 0.5
132 0.5
133 0.49
134 0.46
135 0.41
136 0.42
137 0.38
138 0.38
139 0.37
140 0.36
141 0.3
142 0.34
143 0.31
144 0.26
145 0.25
146 0.21
147 0.2
148 0.19
149 0.2
150 0.13
151 0.12
152 0.11
153 0.19
154 0.2
155 0.25
156 0.33
157 0.33
158 0.32
159 0.35
160 0.36
161 0.38
162 0.46
163 0.51
164 0.53
165 0.6
166 0.64
167 0.66
168 0.65
169 0.57
170 0.54
171 0.48
172 0.42
173 0.39
174 0.36
175 0.35
176 0.37
177 0.36
178 0.32
179 0.28
180 0.24
181 0.19
182 0.15
183 0.13
184 0.09
185 0.08
186 0.06
187 0.05
188 0.05
189 0.05
190 0.04
191 0.04
192 0.04
193 0.04
194 0.04
195 0.03
196 0.03
197 0.03
198 0.03
199 0.04
200 0.03
201 0.03
202 0.03
203 0.04
204 0.06
205 0.08
206 0.12
207 0.12
208 0.16
209 0.18
210 0.19
211 0.19
212 0.2
213 0.19
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.21
218 0.21
219 0.23
220 0.24
221 0.29
222 0.34
223 0.35
224 0.37
225 0.35
226 0.38
227 0.38
228 0.4
229 0.38
230 0.35
231 0.33
232 0.31
233 0.34
234 0.33
235 0.34
236 0.33
237 0.3
238 0.26
239 0.29
240 0.28
241 0.21
242 0.19
243 0.17
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.07
252 0.04
253 0.05
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.07
258 0.12
259 0.13
260 0.15
261 0.15
262 0.17
263 0.18
264 0.17
265 0.17
266 0.12
267 0.11
268 0.11
269 0.09
270 0.07
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.06
279 0.06
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.11
284 0.11
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.1
290 0.08
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.08
295 0.1
296 0.11
297 0.12
298 0.12
299 0.14
300 0.17
301 0.2
302 0.21
303 0.2
304 0.18
305 0.18
306 0.19
307 0.17
308 0.17
309 0.16
310 0.15
311 0.18
312 0.24
313 0.31
314 0.38
315 0.47
316 0.56
317 0.65
318 0.74
319 0.81
320 0.83
321 0.86
322 0.89
323 0.88
324 0.87
325 0.83
326 0.78
327 0.75
328 0.67
329 0.58
330 0.48
331 0.4
332 0.35
333 0.3
334 0.25
335 0.19
336 0.19
337 0.2
338 0.25
339 0.27
340 0.21
341 0.22
342 0.22
343 0.24
344 0.24
345 0.25
346 0.2
347 0.22
348 0.26
349 0.27
350 0.27
351 0.28
352 0.27
353 0.25
354 0.24
355 0.18
356 0.14
357 0.12
358 0.09
359 0.07
360 0.07
361 0.06
362 0.06
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.03
368 0.03
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.11
377 0.12
378 0.11
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.13
383 0.17
384 0.17
385 0.17
386 0.17
387 0.17
388 0.19
389 0.19
390 0.19
391 0.22
392 0.24
393 0.25
394 0.26
395 0.28
396 0.28
397 0.29
398 0.3
399 0.28
400 0.24
401 0.24
402 0.23
403 0.23
404 0.23
405 0.2
406 0.18
407 0.13
408 0.14
409 0.13
410 0.12
411 0.11
412 0.09
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.14
417 0.17
418 0.18
419 0.19
420 0.26
421 0.29
422 0.31
423 0.31
424 0.32
425 0.3
426 0.29
427 0.28
428 0.23
429 0.17
430 0.14
431 0.14
432 0.12
433 0.11
434 0.1
435 0.1
436 0.08
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.09
441 0.08
442 0.08
443 0.09
444 0.08
445 0.06
446 0.05
447 0.05
448 0.06
449 0.05
450 0.05
451 0.04
452 0.05
453 0.05
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.07
458 0.08
459 0.09
460 0.09
461 0.1
462 0.09
463 0.1
464 0.1
465 0.1
466 0.1
467 0.11
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.09
472 0.11
473 0.13
474 0.13
475 0.12
476 0.12
477 0.12
478 0.12
479 0.13
480 0.17
481 0.24
482 0.31
483 0.33
484 0.43
485 0.46
486 0.51
487 0.6
488 0.64
489 0.62
490 0.65
491 0.66
492 0.59
493 0.61
494 0.62
495 0.55
496 0.54
497 0.52
498 0.49
499 0.49
500 0.54
501 0.59
502 0.63
503 0.68
504 0.66
505 0.66
506 0.61
507 0.56
508 0.49
509 0.39
510 0.28
511 0.2
512 0.13
513 0.06
514 0.05
515 0.04
516 0.04
517 0.05
518 0.06
519 0.07