Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139IKP1

Protein Details
Accession A0A139IKP1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
197-218PTEPRRKSSAHFRRNRNEPTPLHydrophilic
345-364LEVAAKRRRRENVRKLRSATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
350-356KRRRREN
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 13, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MAFSPRFSVDSPSDLTSPTSQRSAYPFPTHDGRPSSSRRMSRRGSTASQMSVGSIGGSLDMQTRRGSTVRETSQNAISTLLQPPIVRTGLLPHTHASAAAAGFKAPTTKDIPPVTLTNVPHVPPDTFRDYLHRIGPLFESFQRGRAESEQHAWLKKDKELEKAEALERRLSRDNSAPTTPVSPNASRHGPISPLERPTEPRRKSSAHFRRNRNEPTPLSTIPNVYFDEDFHLENPRTFDVVSERSEIVRPPPASQQAEQKSSNSAFQPPRRALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASSGFFAALGSLKELQTEAEQSVAKIQSLRDDLRRLDKEVAVSGLEVAAKRRRRENVRKLRSATAQVQSVVENISKADELVDAGAYSEAADQMDRVGRLVCGHQEPGQDNTELIDLRPLRALQGLDSGLQELQLRIGTGYAQSFESILMKDLREHIERVPSDQTLQRWSRQRGIPPTYMETDDDFRKDLLSALNGLARAGHTAPAAAGYREAVNKEVKSIIRRSLPSSSDDDADSMVSTSTRGGSRPSQQEKSMILSRNLRALDAEDAEKLFVSIYTSISEALRRVSTQTKIILDVTSQMQAPESRAPPRSPNEQGSNEQFAAGMKSDSMNAVREEITQALDMSSLLGQAVDTAQTQIGRVLKVRNEQAIRLPIKLFLRYFTLNRLFADECEAVSGRGGNVLKGIINAQLSGFVQVLGTAEAERTASRLENDSWNAEDFSDKDNTVLQRILASMSSDPPEWTKITTQIWEEPGLSPNANGNSIPEQSNGTNEMPTTNGTTPAAVGKAAVKPAYIDETRYILVSSAASLLSTIDTFLSLTSWLPSMTSQISTSLLEVLRAFNSRTNQMILGAGATRVGGLKNITTKHLALASQALSFVIALIPYMRECVRRHIPAGQGGILAEFDKTKRLYQDHQSGVYDKLVDIMTSRSAFHIKAMHNVDFDKSCADDKPSAYMEQFTKETLVLSRTLSRHLSEVDVGMIMRQIFATVREQWTQAYDDLHVKTRAGEKRLLRDVELLGAKLGKLEGFEPVGREIAGVVKAKVSLEDEQPKMAEEEKSKLASAATASKAFFDQDEEKANGGQEEEESKPEEAKEEGNPKE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.27
2 0.3
3 0.29
4 0.31
5 0.3
6 0.3
7 0.27
8 0.3
9 0.36
10 0.4
11 0.42
12 0.45
13 0.43
14 0.45
15 0.51
16 0.5
17 0.5
18 0.48
19 0.46
20 0.46
21 0.51
22 0.55
23 0.58
24 0.64
25 0.65
26 0.68
27 0.71
28 0.71
29 0.73
30 0.71
31 0.67
32 0.66
33 0.64
34 0.57
35 0.52
36 0.44
37 0.35
38 0.28
39 0.23
40 0.16
41 0.11
42 0.08
43 0.06
44 0.06
45 0.06
46 0.11
47 0.13
48 0.14
49 0.15
50 0.17
51 0.19
52 0.21
53 0.24
54 0.24
55 0.33
56 0.38
57 0.43
58 0.46
59 0.47
60 0.5
61 0.5
62 0.44
63 0.36
64 0.31
65 0.27
66 0.27
67 0.25
68 0.21
69 0.19
70 0.2
71 0.23
72 0.22
73 0.19
74 0.16
75 0.21
76 0.26
77 0.29
78 0.29
79 0.25
80 0.27
81 0.27
82 0.26
83 0.21
84 0.16
85 0.14
86 0.15
87 0.14
88 0.12
89 0.12
90 0.12
91 0.14
92 0.12
93 0.15
94 0.18
95 0.21
96 0.28
97 0.3
98 0.33
99 0.34
100 0.35
101 0.37
102 0.37
103 0.35
104 0.34
105 0.35
106 0.33
107 0.32
108 0.32
109 0.28
110 0.25
111 0.31
112 0.3
113 0.29
114 0.29
115 0.33
116 0.36
117 0.39
118 0.39
119 0.37
120 0.31
121 0.31
122 0.33
123 0.29
124 0.28
125 0.25
126 0.29
127 0.26
128 0.31
129 0.32
130 0.3
131 0.31
132 0.31
133 0.35
134 0.32
135 0.36
136 0.37
137 0.39
138 0.42
139 0.4
140 0.42
141 0.41
142 0.4
143 0.45
144 0.41
145 0.46
146 0.48
147 0.5
148 0.48
149 0.49
150 0.5
151 0.46
152 0.45
153 0.43
154 0.38
155 0.39
156 0.41
157 0.4
158 0.38
159 0.41
160 0.45
161 0.43
162 0.45
163 0.4
164 0.35
165 0.38
166 0.35
167 0.32
168 0.32
169 0.29
170 0.31
171 0.35
172 0.37
173 0.33
174 0.34
175 0.31
176 0.28
177 0.28
178 0.3
179 0.3
180 0.3
181 0.32
182 0.33
183 0.37
184 0.45
185 0.52
186 0.49
187 0.51
188 0.54
189 0.56
190 0.58
191 0.64
192 0.65
193 0.65
194 0.71
195 0.74
196 0.77
197 0.82
198 0.85
199 0.8
200 0.77
201 0.7
202 0.67
203 0.64
204 0.56
205 0.51
206 0.44
207 0.41
208 0.33
209 0.33
210 0.28
211 0.23
212 0.22
213 0.18
214 0.22
215 0.2
216 0.2
217 0.17
218 0.22
219 0.21
220 0.22
221 0.25
222 0.2
223 0.2
224 0.19
225 0.19
226 0.19
227 0.22
228 0.23
229 0.23
230 0.22
231 0.23
232 0.24
233 0.24
234 0.21
235 0.26
236 0.24
237 0.24
238 0.3
239 0.36
240 0.39
241 0.4
242 0.46
243 0.45
244 0.49
245 0.48
246 0.42
247 0.4
248 0.38
249 0.39
250 0.31
251 0.32
252 0.35
253 0.4
254 0.47
255 0.44
256 0.46
257 0.45
258 0.44
259 0.39
260 0.39
261 0.37
262 0.33
263 0.34
264 0.32
265 0.29
266 0.28
267 0.27
268 0.19
269 0.17
270 0.14
271 0.11
272 0.11
273 0.13
274 0.15
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.12
282 0.1
283 0.09
284 0.08
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.05
289 0.06
290 0.06
291 0.06
292 0.06
293 0.05
294 0.06
295 0.06
296 0.06
297 0.07
298 0.09
299 0.09
300 0.09
301 0.09
302 0.1
303 0.1
304 0.11
305 0.09
306 0.11
307 0.11
308 0.11
309 0.15
310 0.15
311 0.14
312 0.14
313 0.14
314 0.17
315 0.21
316 0.24
317 0.23
318 0.27
319 0.29
320 0.37
321 0.39
322 0.37
323 0.36
324 0.35
325 0.32
326 0.29
327 0.28
328 0.18
329 0.16
330 0.13
331 0.1
332 0.09
333 0.08
334 0.11
335 0.17
336 0.22
337 0.25
338 0.31
339 0.39
340 0.49
341 0.6
342 0.68
343 0.72
344 0.76
345 0.81
346 0.79
347 0.76
348 0.7
349 0.64
350 0.59
351 0.51
352 0.44
353 0.37
354 0.33
355 0.28
356 0.24
357 0.19
358 0.13
359 0.1
360 0.08
361 0.08
362 0.07
363 0.07
364 0.07
365 0.05
366 0.05
367 0.06
368 0.06
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.04
373 0.04
374 0.04
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.05
380 0.07
381 0.07
382 0.07
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.12
388 0.12
389 0.13
390 0.16
391 0.18
392 0.2
393 0.22
394 0.22
395 0.2
396 0.18
397 0.17
398 0.16
399 0.13
400 0.11
401 0.13
402 0.12
403 0.12
404 0.14
405 0.13
406 0.12
407 0.15
408 0.15
409 0.1
410 0.13
411 0.13
412 0.12
413 0.12
414 0.12
415 0.09
416 0.1
417 0.1
418 0.06
419 0.07
420 0.06
421 0.06
422 0.05
423 0.06
424 0.05
425 0.06
426 0.06
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.07
431 0.07
432 0.08
433 0.07
434 0.08
435 0.09
436 0.09
437 0.1
438 0.12
439 0.16
440 0.16
441 0.17
442 0.17
443 0.23
444 0.23
445 0.25
446 0.24
447 0.21
448 0.22
449 0.23
450 0.23
451 0.23
452 0.25
453 0.28
454 0.34
455 0.36
456 0.42
457 0.43
458 0.48
459 0.49
460 0.52
461 0.51
462 0.45
463 0.45
464 0.4
465 0.37
466 0.32
467 0.25
468 0.22
469 0.19
470 0.18
471 0.15
472 0.13
473 0.12
474 0.12
475 0.11
476 0.09
477 0.09
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.09
482 0.09
483 0.08
484 0.07
485 0.08
486 0.07
487 0.07
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.07
492 0.08
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.08
498 0.09
499 0.09
500 0.12
501 0.12
502 0.13
503 0.15
504 0.16
505 0.19
506 0.21
507 0.23
508 0.25
509 0.27
510 0.29
511 0.3
512 0.3
513 0.29
514 0.31
515 0.27
516 0.24
517 0.22
518 0.19
519 0.15
520 0.13
521 0.11
522 0.06
523 0.05
524 0.04
525 0.04
526 0.04
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.09
531 0.12
532 0.19
533 0.28
534 0.33
535 0.34
536 0.35
537 0.37
538 0.36
539 0.37
540 0.36
541 0.3
542 0.27
543 0.28
544 0.28
545 0.29
546 0.28
547 0.24
548 0.18
549 0.17
550 0.16
551 0.12
552 0.12
553 0.08
554 0.08
555 0.08
556 0.08
557 0.07
558 0.05
559 0.04
560 0.04
561 0.05
562 0.05
563 0.06
564 0.06
565 0.07
566 0.07
567 0.08
568 0.07
569 0.08
570 0.08
571 0.08
572 0.1
573 0.13
574 0.14
575 0.16
576 0.19
577 0.18
578 0.19
579 0.19
580 0.17
581 0.13
582 0.13
583 0.12
584 0.1
585 0.09
586 0.08
587 0.08
588 0.09
589 0.1
590 0.13
591 0.14
592 0.17
593 0.19
594 0.21
595 0.25
596 0.29
597 0.34
598 0.34
599 0.36
600 0.39
601 0.4
602 0.41
603 0.4
604 0.4
605 0.33
606 0.29
607 0.24
608 0.18
609 0.16
610 0.13
611 0.09
612 0.05
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.08
618 0.08
619 0.09
620 0.09
621 0.1
622 0.1
623 0.1
624 0.1
625 0.08
626 0.08
627 0.07
628 0.06
629 0.06
630 0.05
631 0.05
632 0.04
633 0.04
634 0.03
635 0.03
636 0.03
637 0.04
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.05
642 0.05
643 0.06
644 0.08
645 0.09
646 0.1
647 0.11
648 0.14
649 0.17
650 0.21
651 0.23
652 0.26
653 0.26
654 0.27
655 0.29
656 0.34
657 0.32
658 0.29
659 0.27
660 0.25
661 0.26
662 0.28
663 0.24
664 0.17
665 0.2
666 0.21
667 0.21
668 0.24
669 0.27
670 0.25
671 0.25
672 0.28
673 0.24
674 0.22
675 0.26
676 0.2
677 0.15
678 0.15
679 0.15
680 0.12
681 0.11
682 0.11
683 0.06
684 0.1
685 0.1
686 0.08
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.09
691 0.1
692 0.08
693 0.08
694 0.08
695 0.07
696 0.08
697 0.08
698 0.09
699 0.08
700 0.06
701 0.06
702 0.06
703 0.06
704 0.05
705 0.05
706 0.04
707 0.04
708 0.05
709 0.05
710 0.05
711 0.05
712 0.06
713 0.07
714 0.08
715 0.11
716 0.13
717 0.17
718 0.18
719 0.19
720 0.19
721 0.2
722 0.19
723 0.16
724 0.15
725 0.12
726 0.13
727 0.14
728 0.13
729 0.12
730 0.15
731 0.16
732 0.17
733 0.16
734 0.13
735 0.12
736 0.12
737 0.12
738 0.09
739 0.1
740 0.09
741 0.1
742 0.11
743 0.11
744 0.11
745 0.12
746 0.14
747 0.13
748 0.15
749 0.14
750 0.17
751 0.19
752 0.21
753 0.22
754 0.23
755 0.24
756 0.24
757 0.23
758 0.2
759 0.2
760 0.19
761 0.17
762 0.14
763 0.15
764 0.15
765 0.15
766 0.13
767 0.14
768 0.15
769 0.17
770 0.17
771 0.15
772 0.16
773 0.16
774 0.18
775 0.19
776 0.17
777 0.15
778 0.14
779 0.14
780 0.12
781 0.13
782 0.16
783 0.13
784 0.14
785 0.13
786 0.13
787 0.13
788 0.14
789 0.13
790 0.09
791 0.09
792 0.1
793 0.11
794 0.13
795 0.13
796 0.11
797 0.11
798 0.13
799 0.18
800 0.15
801 0.16
802 0.15
803 0.18
804 0.18
805 0.18
806 0.16
807 0.11
808 0.12
809 0.1
810 0.08
811 0.07
812 0.07
813 0.06
814 0.06
815 0.06
816 0.06
817 0.06
818 0.05
819 0.04
820 0.05
821 0.05
822 0.05
823 0.05
824 0.05
825 0.06
826 0.06
827 0.07
828 0.06
829 0.07
830 0.07
831 0.1
832 0.11
833 0.12
834 0.11
835 0.12
836 0.14
837 0.13
838 0.14
839 0.14
840 0.13
841 0.12
842 0.12
843 0.13
844 0.13
845 0.14
846 0.15
847 0.15
848 0.18
849 0.2
850 0.21
851 0.22
852 0.2
853 0.2
854 0.19
855 0.15
856 0.13
857 0.11
858 0.09
859 0.07
860 0.07
861 0.06
862 0.06
863 0.06
864 0.07
865 0.07
866 0.1
867 0.15
868 0.16
869 0.19
870 0.21
871 0.21
872 0.22
873 0.23
874 0.21
875 0.17
876 0.19
877 0.18
878 0.15
879 0.15
880 0.13
881 0.11
882 0.1
883 0.09
884 0.06
885 0.04
886 0.04
887 0.05
888 0.06
889 0.06
890 0.08
891 0.1
892 0.14
893 0.16
894 0.25
895 0.32
896 0.35
897 0.38
898 0.41
899 0.45
900 0.45
901 0.47
902 0.39
903 0.31
904 0.27
905 0.25
906 0.19
907 0.15
908 0.1
909 0.08
910 0.08
911 0.12
912 0.14
913 0.17
914 0.22
915 0.27
916 0.33
917 0.41
918 0.5
919 0.5
920 0.52
921 0.51
922 0.48
923 0.45
924 0.4
925 0.31
926 0.21
927 0.19
928 0.16
929 0.13
930 0.12
931 0.12
932 0.14
933 0.14
934 0.15
935 0.15
936 0.17
937 0.17
938 0.19
939 0.24
940 0.22
941 0.29
942 0.34
943 0.34
944 0.34
945 0.35
946 0.35
947 0.29
948 0.28
949 0.22
950 0.18
951 0.18
952 0.18
953 0.22
954 0.23
955 0.23
956 0.28
957 0.28
958 0.29
959 0.28
960 0.31
961 0.28
962 0.28
963 0.28
964 0.23
965 0.22
966 0.2
967 0.2
968 0.18
969 0.18
970 0.15
971 0.17
972 0.22
973 0.22
974 0.26
975 0.27
976 0.26
977 0.27
978 0.27
979 0.27
980 0.22
981 0.21
982 0.18
983 0.16
984 0.14
985 0.12
986 0.12
987 0.1
988 0.09
989 0.08
990 0.08
991 0.08
992 0.1
993 0.14
994 0.18
995 0.22
996 0.23
997 0.24
998 0.25
999 0.27
1000 0.27
1001 0.24
1002 0.21
1003 0.2
1004 0.24
1005 0.26
1006 0.3
1007 0.29
1008 0.26
1009 0.28
1010 0.35
1011 0.4
1012 0.38
1013 0.43
1014 0.43
1015 0.51
1016 0.6
1017 0.58
1018 0.51
1019 0.48
1020 0.45
1021 0.44
1022 0.4
1023 0.31
1024 0.24
1025 0.22
1026 0.2
1027 0.17
1028 0.17
1029 0.1
1030 0.1
1031 0.1
1032 0.12
1033 0.15
1034 0.16
1035 0.17
1036 0.18
1037 0.18
1038 0.17
1039 0.16
1040 0.14
1041 0.14
1042 0.17
1043 0.17
1044 0.16
1045 0.16
1046 0.18
1047 0.18
1048 0.19
1049 0.19
1050 0.19
1051 0.25
1052 0.33
1053 0.33
1054 0.35
1055 0.35
1056 0.34
1057 0.32
1058 0.32
1059 0.29
1060 0.24
1061 0.28
1062 0.31
1063 0.33
1064 0.32
1065 0.31
1066 0.28
1067 0.24
1068 0.24
1069 0.25
1070 0.24
1071 0.25
1072 0.25
1073 0.25
1074 0.26
1075 0.25
1076 0.22
1077 0.21
1078 0.21
1079 0.22
1080 0.28
1081 0.29
1082 0.29
1083 0.29
1084 0.3
1085 0.25
1086 0.21
1087 0.18
1088 0.15
1089 0.18
1090 0.18
1091 0.19
1092 0.21
1093 0.21
1094 0.23
1095 0.23
1096 0.23
1097 0.2
1098 0.22
1099 0.28