Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4HWE2

Protein Details
Accession Q4HWE2    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
105-124GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
412-443RRKEQEDRREANFKRRKLQNEVNGRGGRQGGP
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.833, cyto 8, cyto_mito 6.833, mito 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027073  5_3_exoribonuclease  
IPR041412  Xrn1_helical  
IPR004859  Xrn1_N  
IPR017151  Xrn2/3/4  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0004534  F:5'-3' RNA exonuclease activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006353  P:DNA-templated transcription termination  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG fgr:FGSG_10716  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17846  XRN_M  
PF03159  XRN_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
CDD cd18673  PIN_XRN1-2-like  
Amino Acid Sequences MGIPAAFRWLSTRYPKIISPVIEDQPLVMEDGSTIPVDTTRPNPNGEEFDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPAPKDEEEMMMEVFRYTDRVVNMVRPRKILMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAQEKEQDKQELIKMLKQQNGGNLSTESLETVTKKAFDSNSITPGTPFMDILALSLRYWCQYKLNTDPGWAKLKIIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRASPDHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFFQDQKARLCKICGQKGHDAQNCRGEEKKKDGEHDEKDKGVALKPFIWLHVAVLREYLAVELGVPNLPFRFDLERAVDDWIFMCCFVGNDFLPHLPALEIREHGIDTLTKIWKDNLPVMGGYVTKDGHIDLERAQVILDGLAQQEDNIFKRRKEQEDRREANFKRRKLQNEVNGRGGRQGGPSHPKKINGHENPENGLPLQAVGAYTGRHEQTLTHDMVVNRSTAPDANVANKSAASVLKAQLQSQKSLSNPKPENPEQESPSALGKRKASSIEEGNSSVPDAASVSTPSTSAEEGPVDDVRLWEDGYADRYYEKKFHKDPKDIEFRHGVGRAYVEGLAWVLLYYFQGCPSWEWYYPYHYAPFAADFKDIAKMNISFEKGRVSKPFEQLMSVLPAASRHALPEVFHDLMLNPESNIIDFYPEDFEIDLNGKKFAWQGVALLPFIEMPRLLAAVQSKYPELSAADSARNEMGRDVLIFSEGHESLYDEVLTKFYSKKQGDSKFKLNPKKSDGLSGRVEKKEGYVPHSELKYPLERNSMPDLDYDRSVSVYYDFPQASQTHKSMLLRGVQLPTPALTQNDIQDMRSRANRGGRGGFGRGHDRGGYNGPGMTRGSQYNRNQGGYGRGNGHYPPAPASHVPPPPGAPGFGIGVPPPPPPNSYHNQPYDNRYGASSGYNQYRGPPHPANGAPGYHGHGDASSERGRGSGGYSSRGRYRDNRSYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.44
3 0.48
4 0.5
5 0.46
6 0.44
7 0.45
8 0.44
9 0.42
10 0.39
11 0.33
12 0.29
13 0.27
14 0.21
15 0.13
16 0.1
17 0.09
18 0.1
19 0.12
20 0.1
21 0.09
22 0.08
23 0.09
24 0.11
25 0.14
26 0.18
27 0.25
28 0.28
29 0.31
30 0.33
31 0.37
32 0.41
33 0.4
34 0.4
35 0.34
36 0.35
37 0.32
38 0.3
39 0.26
40 0.2
41 0.19
42 0.13
43 0.1
44 0.08
45 0.09
46 0.09
47 0.09
48 0.1
49 0.13
50 0.18
51 0.21
52 0.23
53 0.29
54 0.38
55 0.46
56 0.51
57 0.53
58 0.53
59 0.51
60 0.52
61 0.47
62 0.41
63 0.35
64 0.3
65 0.26
66 0.21
67 0.19
68 0.15
69 0.14
70 0.1
71 0.1
72 0.1
73 0.13
74 0.13
75 0.17
76 0.19
77 0.27
78 0.36
79 0.43
80 0.45
81 0.44
82 0.45
83 0.44
84 0.44
85 0.39
86 0.32
87 0.28
88 0.26
89 0.24
90 0.24
91 0.21
92 0.2
93 0.18
94 0.15
95 0.1
96 0.13
97 0.19
98 0.26
99 0.36
100 0.45
101 0.55
102 0.66
103 0.74
104 0.8
105 0.82
106 0.78
107 0.75
108 0.75
109 0.75
110 0.73
111 0.75
112 0.7
113 0.65
114 0.68
115 0.64
116 0.56
117 0.52
118 0.45
119 0.36
120 0.35
121 0.36
122 0.35
123 0.34
124 0.37
125 0.4
126 0.44
127 0.48
128 0.47
129 0.45
130 0.44
131 0.47
132 0.42
133 0.36
134 0.3
135 0.26
136 0.23
137 0.21
138 0.15
139 0.12
140 0.13
141 0.12
142 0.13
143 0.14
144 0.14
145 0.15
146 0.19
147 0.19
148 0.21
149 0.27
150 0.29
151 0.32
152 0.33
153 0.32
154 0.28
155 0.28
156 0.25
157 0.19
158 0.16
159 0.11
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.12
169 0.14
170 0.15
171 0.17
172 0.21
173 0.27
174 0.33
175 0.41
176 0.4
177 0.43
178 0.45
179 0.44
180 0.46
181 0.41
182 0.34
183 0.29
184 0.31
185 0.28
186 0.26
187 0.22
188 0.18
189 0.21
190 0.21
191 0.18
192 0.15
193 0.14
194 0.12
195 0.13
196 0.12
197 0.09
198 0.1
199 0.09
200 0.13
201 0.14
202 0.16
203 0.17
204 0.21
205 0.28
206 0.29
207 0.3
208 0.32
209 0.36
210 0.41
211 0.43
212 0.5
213 0.48
214 0.52
215 0.54
216 0.52
217 0.54
218 0.48
219 0.42
220 0.33
221 0.27
222 0.22
223 0.22
224 0.19
225 0.11
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.08
230 0.06
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.04
236 0.05
237 0.07
238 0.07
239 0.11
240 0.13
241 0.13
242 0.17
243 0.19
244 0.23
245 0.25
246 0.25
247 0.25
248 0.29
249 0.29
250 0.26
251 0.3
252 0.28
253 0.3
254 0.32
255 0.33
256 0.28
257 0.31
258 0.37
259 0.4
260 0.45
261 0.46
262 0.48
263 0.53
264 0.59
265 0.65
266 0.63
267 0.58
268 0.54
269 0.57
270 0.52
271 0.46
272 0.45
273 0.39
274 0.4
275 0.44
276 0.49
277 0.43
278 0.47
279 0.51
280 0.54
281 0.57
282 0.6
283 0.55
284 0.47
285 0.44
286 0.42
287 0.37
288 0.32
289 0.27
290 0.21
291 0.2
292 0.22
293 0.22
294 0.2
295 0.2
296 0.16
297 0.15
298 0.15
299 0.15
300 0.12
301 0.12
302 0.11
303 0.1
304 0.1
305 0.08
306 0.05
307 0.04
308 0.04
309 0.04
310 0.05
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.06
315 0.07
316 0.07
317 0.09
318 0.13
319 0.13
320 0.16
321 0.19
322 0.2
323 0.2
324 0.23
325 0.2
326 0.16
327 0.15
328 0.13
329 0.1
330 0.08
331 0.08
332 0.05
333 0.05
334 0.06
335 0.08
336 0.07
337 0.08
338 0.09
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.07
344 0.08
345 0.09
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.11
350 0.11
351 0.1
352 0.1
353 0.08
354 0.08
355 0.13
356 0.14
357 0.14
358 0.15
359 0.17
360 0.18
361 0.2
362 0.23
363 0.19
364 0.18
365 0.17
366 0.17
367 0.16
368 0.14
369 0.13
370 0.1
371 0.09
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.12
380 0.12
381 0.12
382 0.12
383 0.1
384 0.09
385 0.08
386 0.07
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.04
391 0.04
392 0.05
393 0.07
394 0.09
395 0.15
396 0.17
397 0.17
398 0.26
399 0.33
400 0.4
401 0.49
402 0.58
403 0.62
404 0.71
405 0.75
406 0.71
407 0.74
408 0.67
409 0.68
410 0.65
411 0.58
412 0.56
413 0.58
414 0.59
415 0.58
416 0.65
417 0.63
418 0.66
419 0.66
420 0.64
421 0.58
422 0.53
423 0.46
424 0.38
425 0.3
426 0.22
427 0.2
428 0.17
429 0.25
430 0.27
431 0.32
432 0.33
433 0.38
434 0.38
435 0.44
436 0.5
437 0.46
438 0.51
439 0.5
440 0.49
441 0.46
442 0.44
443 0.37
444 0.26
445 0.21
446 0.13
447 0.08
448 0.06
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.05
453 0.04
454 0.05
455 0.08
456 0.08
457 0.08
458 0.08
459 0.08
460 0.13
461 0.17
462 0.17
463 0.15
464 0.18
465 0.18
466 0.19
467 0.19
468 0.15
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.08
473 0.08
474 0.09
475 0.09
476 0.12
477 0.13
478 0.13
479 0.13
480 0.13
481 0.12
482 0.1
483 0.1
484 0.08
485 0.09
486 0.09
487 0.14
488 0.15
489 0.16
490 0.21
491 0.22
492 0.22
493 0.21
494 0.23
495 0.19
496 0.28
497 0.29
498 0.33
499 0.34
500 0.36
501 0.42
502 0.42
503 0.47
504 0.44
505 0.46
506 0.39
507 0.38
508 0.35
509 0.28
510 0.29
511 0.26
512 0.22
513 0.21
514 0.21
515 0.21
516 0.23
517 0.24
518 0.22
519 0.22
520 0.24
521 0.22
522 0.22
523 0.22
524 0.2
525 0.18
526 0.16
527 0.13
528 0.09
529 0.07
530 0.05
531 0.05
532 0.05
533 0.05
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.07
538 0.07
539 0.07
540 0.07
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.09
545 0.08
546 0.08
547 0.08
548 0.07
549 0.07
550 0.08
551 0.07
552 0.06
553 0.06
554 0.07
555 0.1
556 0.1
557 0.09
558 0.1
559 0.12
560 0.13
561 0.19
562 0.22
563 0.27
564 0.34
565 0.43
566 0.51
567 0.57
568 0.61
569 0.62
570 0.7
571 0.64
572 0.6
573 0.54
574 0.46
575 0.41
576 0.39
577 0.3
578 0.2
579 0.2
580 0.17
581 0.14
582 0.12
583 0.09
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.05
588 0.04
589 0.03
590 0.03
591 0.03
592 0.05
593 0.05
594 0.05
595 0.06
596 0.07
597 0.08
598 0.12
599 0.16
600 0.15
601 0.18
602 0.19
603 0.24
604 0.26
605 0.26
606 0.23
607 0.2
608 0.2
609 0.17
610 0.19
611 0.16
612 0.15
613 0.13
614 0.12
615 0.13
616 0.17
617 0.16
618 0.14
619 0.14
620 0.14
621 0.16
622 0.19
623 0.21
624 0.17
625 0.17
626 0.24
627 0.23
628 0.25
629 0.28
630 0.32
631 0.36
632 0.4
633 0.43
634 0.36
635 0.36
636 0.34
637 0.31
638 0.26
639 0.2
640 0.15
641 0.11
642 0.11
643 0.11
644 0.12
645 0.1
646 0.08
647 0.1
648 0.1
649 0.1
650 0.14
651 0.18
652 0.17
653 0.17
654 0.17
655 0.15
656 0.16
657 0.17
658 0.13
659 0.08
660 0.09
661 0.09
662 0.09
663 0.09
664 0.07
665 0.08
666 0.07
667 0.09
668 0.1
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.1
673 0.09
674 0.12
675 0.13
676 0.11
677 0.12
678 0.11
679 0.12
680 0.13
681 0.13
682 0.13
683 0.11
684 0.12
685 0.15
686 0.17
687 0.16
688 0.15
689 0.13
690 0.12
691 0.12
692 0.11
693 0.06
694 0.05
695 0.06
696 0.07
697 0.06
698 0.08
699 0.1
700 0.12
701 0.14
702 0.15
703 0.15
704 0.14
705 0.14
706 0.13
707 0.12
708 0.12
709 0.14
710 0.14
711 0.17
712 0.16
713 0.18
714 0.18
715 0.18
716 0.16
717 0.13
718 0.12
719 0.09
720 0.1
721 0.1
722 0.08
723 0.09
724 0.08
725 0.09
726 0.12
727 0.12
728 0.12
729 0.11
730 0.12
731 0.12
732 0.13
733 0.12
734 0.09
735 0.09
736 0.09
737 0.1
738 0.11
739 0.12
740 0.15
741 0.25
742 0.25
743 0.32
744 0.4
745 0.5
746 0.59
747 0.64
748 0.68
749 0.68
750 0.76
751 0.79
752 0.77
753 0.74
754 0.71
755 0.71
756 0.63
757 0.64
758 0.59
759 0.54
760 0.54
761 0.55
762 0.55
763 0.49
764 0.49
765 0.4
766 0.39
767 0.39
768 0.35
769 0.32
770 0.3
771 0.32
772 0.37
773 0.39
774 0.37
775 0.32
776 0.34
777 0.36
778 0.33
779 0.34
780 0.35
781 0.34
782 0.38
783 0.43
784 0.4
785 0.33
786 0.33
787 0.33
788 0.28
789 0.29
790 0.25
791 0.19
792 0.18
793 0.18
794 0.16
795 0.14
796 0.13
797 0.14
798 0.18
799 0.17
800 0.17
801 0.21
802 0.21
803 0.24
804 0.27
805 0.26
806 0.23
807 0.27
808 0.28
809 0.28
810 0.31
811 0.32
812 0.3
813 0.32
814 0.32
815 0.29
816 0.29
817 0.26
818 0.23
819 0.2
820 0.19
821 0.17
822 0.16
823 0.16
824 0.18
825 0.24
826 0.23
827 0.22
828 0.27
829 0.28
830 0.3
831 0.34
832 0.34
833 0.33
834 0.4
835 0.43
836 0.42
837 0.44
838 0.44
839 0.42
840 0.43
841 0.41
842 0.36
843 0.38
844 0.34
845 0.33
846 0.3
847 0.28
848 0.27
849 0.29
850 0.27
851 0.22
852 0.23
853 0.2
854 0.2
855 0.21
856 0.2
857 0.18
858 0.21
859 0.26
860 0.33
861 0.39
862 0.47
863 0.5
864 0.5
865 0.48
866 0.45
867 0.48
868 0.44
869 0.43
870 0.37
871 0.33
872 0.33
873 0.33
874 0.36
875 0.3
876 0.26
877 0.25
878 0.22
879 0.26
880 0.25
881 0.3
882 0.33
883 0.35
884 0.36
885 0.35
886 0.35
887 0.36
888 0.35
889 0.31
890 0.24
891 0.21
892 0.21
893 0.19
894 0.18
895 0.14
896 0.15
897 0.16
898 0.18
899 0.19
900 0.2
901 0.21
902 0.24
903 0.31
904 0.35
905 0.42
906 0.48
907 0.52
908 0.57
909 0.6
910 0.63
911 0.64
912 0.6
913 0.52
914 0.44
915 0.39
916 0.33
917 0.32
918 0.29
919 0.27
920 0.31
921 0.33
922 0.32
923 0.35
924 0.41
925 0.41
926 0.45
927 0.44
928 0.41
929 0.47
930 0.48
931 0.49
932 0.45
933 0.42
934 0.36
935 0.33
936 0.33
937 0.27
938 0.26
939 0.2
940 0.17
941 0.19
942 0.18
943 0.22
944 0.2
945 0.2
946 0.19
947 0.19
948 0.19
949 0.17
950 0.18
951 0.2
952 0.2
953 0.26
954 0.29
955 0.34
956 0.4
957 0.43
958 0.46
959 0.47
960 0.54