Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RDJ1

Protein Details
Accession I1RDJ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
75-97LVDENPKKRRRLSPPSIQPPLKRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
82-85KRRR
311-352KPSAVDRAREKEAKAAAKEIEKEAKRREKEEAKQEKIREKQR
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 12.833, cyto_mito 4.666, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR042530  EME1/EME2_C  
IPR006166  ERCC4_domain  
IPR033310  Mms4/EME1/EME2  
IPR047521  XPF_nuclease_EME1_ascomycetes  
Gene Ontology GO:0048476  C:Holliday junction resolvase complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0004518  F:nuclease activity  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
KEGG fgr:FGSG_01691  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02732  ERCC4  
CDD cd20085  XPF_nuclease_Mms4  
Amino Acid Sequences MANDVIDLISSSPPSHCLPPPSAQLPQLDDATQEEGQQHSINATKSDAVARVPLSSQFFLSDDFDTTIDLDEPILVDENPKKRRRLSPPSIQPPLKRISPAPESWSILPPVRTNQNSRLQAVDDSIQLTSSPGLISPGQMRPSNATSAKPIEQTIAEDSDPFASSPAAVRRSPSKPTSKAILKTAARPIESSDPFASSPQPALTTSKEPDIIITSPSAPVNKLLPKKNAAWDPISSSAPEAISFDSSPPGNKRDVINIDDDSNGENGSEDDELPDITAFDVTRMRRRSQLQRSKSDVVSTGSRARPTAANKPSAVDRAREKEAKAAAKEIEKEAKRREKEEAKQEKIREKQRNAALAEVNKLRTDKKVSTPEMMVDIPSSLNSTVTTALQAMLEPFDVQYTTWDSPVENVIKWRRKVRSRYNDDIGLWEPIPLRIQDEKHALVVMHCDELVKLALDDAISSHVEKVRKHFSEHHVIYLIEGLTTWIRKNRNLRSRQFASSVRAQEAATSGNRRNKPAQEYVPEEKIEDALLQLQVMHEVLIHHTMVPMETAEQILTFTQHISTIPYRKQRDQATLGAGFCMESGQVKTGEDTKDTYVRMLQEIARVTAPIAHGVAKEFDTVSDLVRGFETTGPMRLEGVRKMANKDGTFSDRTVGQAVSRRMYKVFTGVDETSTDV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.23
3 0.25
4 0.29
5 0.33
6 0.38
7 0.45
8 0.46
9 0.47
10 0.45
11 0.45
12 0.43
13 0.42
14 0.38
15 0.3
16 0.27
17 0.25
18 0.26
19 0.23
20 0.2
21 0.18
22 0.17
23 0.2
24 0.2
25 0.18
26 0.15
27 0.19
28 0.19
29 0.19
30 0.2
31 0.19
32 0.19
33 0.22
34 0.21
35 0.18
36 0.2
37 0.2
38 0.19
39 0.2
40 0.22
41 0.24
42 0.23
43 0.23
44 0.21
45 0.21
46 0.21
47 0.23
48 0.2
49 0.17
50 0.17
51 0.17
52 0.16
53 0.15
54 0.14
55 0.12
56 0.11
57 0.09
58 0.08
59 0.08
60 0.08
61 0.09
62 0.08
63 0.12
64 0.19
65 0.28
66 0.37
67 0.43
68 0.47
69 0.54
70 0.64
71 0.7
72 0.74
73 0.75
74 0.76
75 0.82
76 0.86
77 0.88
78 0.84
79 0.76
80 0.71
81 0.67
82 0.59
83 0.51
84 0.44
85 0.42
86 0.43
87 0.43
88 0.43
89 0.42
90 0.42
91 0.42
92 0.42
93 0.38
94 0.34
95 0.34
96 0.3
97 0.31
98 0.36
99 0.38
100 0.41
101 0.46
102 0.52
103 0.54
104 0.53
105 0.49
106 0.42
107 0.39
108 0.36
109 0.29
110 0.2
111 0.17
112 0.16
113 0.14
114 0.12
115 0.11
116 0.09
117 0.08
118 0.07
119 0.06
120 0.08
121 0.08
122 0.1
123 0.14
124 0.18
125 0.21
126 0.23
127 0.24
128 0.26
129 0.29
130 0.33
131 0.31
132 0.28
133 0.29
134 0.32
135 0.33
136 0.3
137 0.28
138 0.24
139 0.22
140 0.23
141 0.22
142 0.19
143 0.17
144 0.15
145 0.15
146 0.15
147 0.15
148 0.13
149 0.1
150 0.08
151 0.08
152 0.12
153 0.17
154 0.19
155 0.19
156 0.21
157 0.27
158 0.32
159 0.38
160 0.41
161 0.45
162 0.45
163 0.49
164 0.55
165 0.56
166 0.55
167 0.53
168 0.55
169 0.48
170 0.49
171 0.52
172 0.48
173 0.41
174 0.37
175 0.37
176 0.36
177 0.35
178 0.34
179 0.28
180 0.26
181 0.26
182 0.26
183 0.24
184 0.16
185 0.16
186 0.13
187 0.13
188 0.13
189 0.15
190 0.18
191 0.21
192 0.21
193 0.22
194 0.23
195 0.21
196 0.21
197 0.21
198 0.18
199 0.15
200 0.14
201 0.13
202 0.13
203 0.14
204 0.14
205 0.11
206 0.12
207 0.15
208 0.21
209 0.27
210 0.32
211 0.35
212 0.39
213 0.42
214 0.47
215 0.47
216 0.43
217 0.39
218 0.35
219 0.34
220 0.33
221 0.31
222 0.24
223 0.2
224 0.18
225 0.15
226 0.14
227 0.11
228 0.08
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.1
234 0.13
235 0.14
236 0.16
237 0.16
238 0.18
239 0.19
240 0.24
241 0.27
242 0.26
243 0.27
244 0.25
245 0.25
246 0.23
247 0.22
248 0.16
249 0.13
250 0.11
251 0.07
252 0.06
253 0.05
254 0.06
255 0.07
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.04
264 0.05
265 0.04
266 0.05
267 0.1
268 0.11
269 0.18
270 0.22
271 0.23
272 0.28
273 0.34
274 0.44
275 0.51
276 0.6
277 0.6
278 0.65
279 0.7
280 0.69
281 0.63
282 0.54
283 0.45
284 0.37
285 0.31
286 0.26
287 0.25
288 0.23
289 0.23
290 0.22
291 0.21
292 0.23
293 0.25
294 0.32
295 0.29
296 0.31
297 0.31
298 0.32
299 0.32
300 0.33
301 0.3
302 0.24
303 0.24
304 0.25
305 0.29
306 0.3
307 0.29
308 0.28
309 0.32
310 0.33
311 0.29
312 0.27
313 0.24
314 0.25
315 0.25
316 0.23
317 0.26
318 0.23
319 0.27
320 0.32
321 0.39
322 0.38
323 0.39
324 0.45
325 0.46
326 0.51
327 0.58
328 0.6
329 0.58
330 0.62
331 0.63
332 0.63
333 0.62
334 0.65
335 0.63
336 0.56
337 0.58
338 0.57
339 0.59
340 0.52
341 0.48
342 0.41
343 0.33
344 0.34
345 0.28
346 0.24
347 0.19
348 0.19
349 0.17
350 0.17
351 0.21
352 0.21
353 0.27
354 0.35
355 0.36
356 0.38
357 0.37
358 0.35
359 0.32
360 0.29
361 0.21
362 0.13
363 0.11
364 0.08
365 0.08
366 0.08
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.06
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.06
375 0.07
376 0.06
377 0.06
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.04
383 0.04
384 0.05
385 0.05
386 0.06
387 0.1
388 0.11
389 0.11
390 0.11
391 0.11
392 0.12
393 0.16
394 0.16
395 0.12
396 0.17
397 0.26
398 0.32
399 0.36
400 0.43
401 0.47
402 0.54
403 0.63
404 0.69
405 0.71
406 0.73
407 0.77
408 0.75
409 0.7
410 0.62
411 0.55
412 0.45
413 0.36
414 0.27
415 0.21
416 0.16
417 0.13
418 0.14
419 0.11
420 0.14
421 0.15
422 0.17
423 0.19
424 0.23
425 0.23
426 0.23
427 0.23
428 0.2
429 0.16
430 0.18
431 0.14
432 0.1
433 0.09
434 0.09
435 0.08
436 0.09
437 0.09
438 0.07
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.05
443 0.06
444 0.05
445 0.06
446 0.07
447 0.07
448 0.09
449 0.12
450 0.15
451 0.17
452 0.22
453 0.3
454 0.31
455 0.35
456 0.41
457 0.44
458 0.52
459 0.51
460 0.49
461 0.41
462 0.39
463 0.35
464 0.29
465 0.23
466 0.12
467 0.11
468 0.09
469 0.09
470 0.1
471 0.11
472 0.14
473 0.17
474 0.23
475 0.33
476 0.42
477 0.51
478 0.59
479 0.64
480 0.68
481 0.71
482 0.69
483 0.65
484 0.59
485 0.54
486 0.52
487 0.49
488 0.41
489 0.37
490 0.33
491 0.28
492 0.25
493 0.23
494 0.18
495 0.2
496 0.25
497 0.32
498 0.35
499 0.39
500 0.44
501 0.47
502 0.51
503 0.54
504 0.55
505 0.52
506 0.57
507 0.58
508 0.56
509 0.5
510 0.44
511 0.36
512 0.3
513 0.24
514 0.16
515 0.11
516 0.09
517 0.09
518 0.08
519 0.08
520 0.08
521 0.08
522 0.08
523 0.07
524 0.05
525 0.06
526 0.07
527 0.09
528 0.09
529 0.09
530 0.09
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.08
535 0.07
536 0.07
537 0.08
538 0.07
539 0.07
540 0.08
541 0.07
542 0.08
543 0.07
544 0.07
545 0.07
546 0.08
547 0.09
548 0.13
549 0.19
550 0.25
551 0.32
552 0.41
553 0.47
554 0.51
555 0.59
556 0.6
557 0.62
558 0.61
559 0.58
560 0.55
561 0.52
562 0.47
563 0.4
564 0.33
565 0.25
566 0.19
567 0.15
568 0.08
569 0.07
570 0.08
571 0.1
572 0.11
573 0.11
574 0.13
575 0.18
576 0.2
577 0.2
578 0.21
579 0.23
580 0.27
581 0.27
582 0.27
583 0.25
584 0.25
585 0.25
586 0.26
587 0.23
588 0.24
589 0.25
590 0.25
591 0.22
592 0.21
593 0.19
594 0.19
595 0.18
596 0.15
597 0.14
598 0.14
599 0.14
600 0.15
601 0.17
602 0.15
603 0.16
604 0.14
605 0.13
606 0.14
607 0.14
608 0.14
609 0.17
610 0.16
611 0.16
612 0.16
613 0.16
614 0.15
615 0.16
616 0.19
617 0.16
618 0.21
619 0.22
620 0.21
621 0.23
622 0.25
623 0.27
624 0.26
625 0.31
626 0.33
627 0.35
628 0.4
629 0.45
630 0.49
631 0.46
632 0.46
633 0.46
634 0.45
635 0.45
636 0.41
637 0.36
638 0.29
639 0.3
640 0.29
641 0.23
642 0.22
643 0.26
644 0.3
645 0.34
646 0.36
647 0.36
648 0.35
649 0.37
650 0.35
651 0.34
652 0.33
653 0.29
654 0.33
655 0.31
656 0.32