Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RDF7

Protein Details
Accession I1RDF7    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-163KETVGKGRRKRKVKWTRVRAYDHVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
144-154GKGRRKRKVKW
Subcellular Location(s) nucl 13, cyto_nucl 11, cyto 7, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016939  Mt__Rbsml_prot_S25  
Gene Ontology GO:0005763  C:mitochondrial small ribosomal subunit  
GO:0003735  F:structural constituent of ribosome  
KEGG fgr:FGSG_01653  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF13741  MRP-S25  
Amino Acid Sequences MGGRQIRPARVFQTVTEELNHNILGKKSVPTPPWYNIMQKVPPAETLVRNVTPLIKPSRESTTKIKNIFRPLPIRYLEDELRGIFYRDHPWELARPRVILELDGKDYQHCDWSKGLKQPNTPLTGESVVQYWMWLLENGKETVGKGRRKRKVKWTRVRAYDHVRHQFYRLRQEEQIEKRVAQEEARYVGAYFGQTRIDVSHGLEDREFENWKLWAGKETERQEQNRNGEIDDFGLEDEAEEVIGDAEATPEVKAEAAEGKKSP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.38
2 0.37
3 0.35
4 0.33
5 0.27
6 0.28
7 0.27
8 0.2
9 0.19
10 0.19
11 0.19
12 0.19
13 0.2
14 0.24
15 0.3
16 0.31
17 0.36
18 0.41
19 0.41
20 0.44
21 0.45
22 0.45
23 0.44
24 0.47
25 0.43
26 0.4
27 0.4
28 0.37
29 0.35
30 0.33
31 0.31
32 0.26
33 0.28
34 0.3
35 0.27
36 0.26
37 0.26
38 0.26
39 0.24
40 0.27
41 0.28
42 0.26
43 0.27
44 0.3
45 0.37
46 0.37
47 0.4
48 0.43
49 0.47
50 0.52
51 0.57
52 0.6
53 0.57
54 0.63
55 0.63
56 0.62
57 0.57
58 0.53
59 0.52
60 0.48
61 0.45
62 0.39
63 0.39
64 0.34
65 0.3
66 0.28
67 0.22
68 0.23
69 0.2
70 0.18
71 0.14
72 0.15
73 0.19
74 0.2
75 0.21
76 0.19
77 0.21
78 0.26
79 0.29
80 0.32
81 0.27
82 0.26
83 0.25
84 0.26
85 0.25
86 0.2
87 0.2
88 0.16
89 0.17
90 0.18
91 0.17
92 0.15
93 0.16
94 0.15
95 0.18
96 0.16
97 0.15
98 0.17
99 0.22
100 0.26
101 0.32
102 0.38
103 0.36
104 0.38
105 0.43
106 0.45
107 0.43
108 0.39
109 0.33
110 0.29
111 0.25
112 0.23
113 0.17
114 0.13
115 0.1
116 0.09
117 0.08
118 0.06
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.07
124 0.09
125 0.09
126 0.1
127 0.1
128 0.09
129 0.17
130 0.23
131 0.28
132 0.35
133 0.44
134 0.53
135 0.6
136 0.67
137 0.71
138 0.75
139 0.79
140 0.82
141 0.83
142 0.83
143 0.83
144 0.83
145 0.78
146 0.75
147 0.72
148 0.69
149 0.67
150 0.61
151 0.54
152 0.51
153 0.51
154 0.46
155 0.49
156 0.44
157 0.4
158 0.39
159 0.42
160 0.48
161 0.47
162 0.5
163 0.41
164 0.38
165 0.36
166 0.36
167 0.33
168 0.25
169 0.22
170 0.18
171 0.18
172 0.19
173 0.17
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.12
178 0.1
179 0.09
180 0.1
181 0.09
182 0.1
183 0.1
184 0.11
185 0.11
186 0.11
187 0.17
188 0.17
189 0.18
190 0.18
191 0.18
192 0.17
193 0.19
194 0.2
195 0.14
196 0.16
197 0.15
198 0.17
199 0.18
200 0.18
201 0.2
202 0.22
203 0.28
204 0.34
205 0.39
206 0.45
207 0.5
208 0.54
209 0.57
210 0.61
211 0.6
212 0.58
213 0.54
214 0.46
215 0.41
216 0.37
217 0.3
218 0.23
219 0.17
220 0.11
221 0.1
222 0.09
223 0.07
224 0.08
225 0.06
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.04
230 0.05
231 0.04
232 0.04
233 0.05
234 0.05
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.07
242 0.15
243 0.17