Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C3YIL1

Protein Details
Accession A0A1C3YIL1    Localization Confidence High Confidence Score 16.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-57RTISTTKKPRGRPPGTASKIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-71KKPRGRPPGTASKITKPAQRATRRGGKE
128-135GTRGRPKK
151-154RRGR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14, cyto 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR040349  Csm1/Pcs1  
IPR020981  Csm1/Pcs1_C  
IPR038608  Csm1/Pcs1_C_sf  
Gene Ontology GO:0033551  C:monopolin complex  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF12539  Csm1  
Amino Acid Sequences MPPRARAKPVAEPAAPAVSDSEPDLDMFDKSDLQAAARTISTTKKPRGRPPGTASKITKPAQRATRRGGKEKLQAVPEAVAQPDTAGKATGSGTNATRKAQQMAPDETVTFEDIEGPSSVPATDVKKGTRGRPKKSNGDTSVLAPESAVKRRGRPPRQPETPIVEVPETQHEDPMELDPVLEESEDDNAGAVPDVETIVPWSSYDTTDDSTRRRLEDLTRKYAALESSHRDLREVGVREAERNFERLKKQAEERTAAATKLIAELKAELAAQTALANESEELRKQLEANETETESLENNIKTLNGSLSEAKSEIKSLSTKLAAARSNETNSRVPGSAIKTGLMNRTAQAGAAHAHAAQLTAQAKERLYADLTDLILRGVKQDEAEDIFDCIQTGRNGTLHFKLVVENDASDNYEDVSFTYQPQLNPGRDQELIDVLPGYLTEEITFPRSQAPKFYSRVNKSLTEDLTRQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.4
3 0.31
4 0.25
5 0.18
6 0.18
7 0.17
8 0.16
9 0.12
10 0.13
11 0.14
12 0.12
13 0.12
14 0.13
15 0.13
16 0.12
17 0.12
18 0.16
19 0.15
20 0.15
21 0.18
22 0.17
23 0.17
24 0.17
25 0.18
26 0.16
27 0.21
28 0.29
29 0.35
30 0.43
31 0.5
32 0.58
33 0.67
34 0.76
35 0.78
36 0.78
37 0.78
38 0.8
39 0.78
40 0.78
41 0.73
42 0.7
43 0.71
44 0.66
45 0.63
46 0.56
47 0.59
48 0.6
49 0.65
50 0.64
51 0.64
52 0.7
53 0.71
54 0.74
55 0.72
56 0.7
57 0.69
58 0.69
59 0.66
60 0.59
61 0.53
62 0.47
63 0.41
64 0.36
65 0.29
66 0.22
67 0.17
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.1
73 0.09
74 0.08
75 0.09
76 0.11
77 0.13
78 0.13
79 0.14
80 0.17
81 0.23
82 0.25
83 0.25
84 0.29
85 0.28
86 0.31
87 0.31
88 0.36
89 0.35
90 0.39
91 0.4
92 0.37
93 0.35
94 0.31
95 0.3
96 0.23
97 0.17
98 0.12
99 0.11
100 0.1
101 0.11
102 0.11
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.08
108 0.11
109 0.12
110 0.16
111 0.18
112 0.2
113 0.27
114 0.31
115 0.39
116 0.47
117 0.53
118 0.57
119 0.64
120 0.71
121 0.74
122 0.78
123 0.79
124 0.72
125 0.68
126 0.61
127 0.53
128 0.5
129 0.39
130 0.31
131 0.21
132 0.21
133 0.2
134 0.22
135 0.26
136 0.23
137 0.29
138 0.37
139 0.49
140 0.54
141 0.61
142 0.67
143 0.71
144 0.77
145 0.77
146 0.74
147 0.7
148 0.65
149 0.55
150 0.48
151 0.38
152 0.3
153 0.27
154 0.27
155 0.24
156 0.19
157 0.2
158 0.18
159 0.17
160 0.18
161 0.18
162 0.14
163 0.09
164 0.09
165 0.07
166 0.08
167 0.07
168 0.06
169 0.05
170 0.04
171 0.06
172 0.06
173 0.06
174 0.05
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.04
179 0.03
180 0.03
181 0.04
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.06
189 0.07
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.11
194 0.14
195 0.17
196 0.17
197 0.21
198 0.22
199 0.22
200 0.22
201 0.22
202 0.27
203 0.35
204 0.4
205 0.41
206 0.41
207 0.4
208 0.39
209 0.39
210 0.32
211 0.24
212 0.21
213 0.18
214 0.2
215 0.22
216 0.22
217 0.21
218 0.2
219 0.19
220 0.22
221 0.21
222 0.18
223 0.2
224 0.2
225 0.21
226 0.22
227 0.23
228 0.17
229 0.17
230 0.18
231 0.18
232 0.2
233 0.24
234 0.27
235 0.28
236 0.33
237 0.36
238 0.39
239 0.37
240 0.36
241 0.37
242 0.34
243 0.3
244 0.24
245 0.19
246 0.15
247 0.15
248 0.14
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.09
254 0.08
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.04
262 0.05
263 0.05
264 0.04
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.13
273 0.18
274 0.18
275 0.21
276 0.21
277 0.21
278 0.21
279 0.21
280 0.18
281 0.12
282 0.12
283 0.12
284 0.1
285 0.1
286 0.09
287 0.09
288 0.09
289 0.1
290 0.09
291 0.07
292 0.09
293 0.12
294 0.12
295 0.13
296 0.13
297 0.13
298 0.12
299 0.13
300 0.11
301 0.11
302 0.12
303 0.12
304 0.15
305 0.15
306 0.16
307 0.18
308 0.23
309 0.23
310 0.24
311 0.27
312 0.27
313 0.3
314 0.31
315 0.33
316 0.3
317 0.28
318 0.29
319 0.25
320 0.22
321 0.24
322 0.25
323 0.25
324 0.23
325 0.22
326 0.21
327 0.23
328 0.25
329 0.22
330 0.19
331 0.15
332 0.18
333 0.17
334 0.16
335 0.14
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.08
341 0.09
342 0.08
343 0.08
344 0.07
345 0.1
346 0.11
347 0.12
348 0.14
349 0.16
350 0.16
351 0.18
352 0.19
353 0.16
354 0.17
355 0.16
356 0.16
357 0.16
358 0.17
359 0.16
360 0.15
361 0.13
362 0.13
363 0.12
364 0.12
365 0.1
366 0.11
367 0.1
368 0.11
369 0.14
370 0.15
371 0.16
372 0.15
373 0.15
374 0.15
375 0.14
376 0.14
377 0.12
378 0.13
379 0.12
380 0.13
381 0.14
382 0.16
383 0.18
384 0.21
385 0.24
386 0.23
387 0.23
388 0.22
389 0.22
390 0.22
391 0.23
392 0.2
393 0.18
394 0.17
395 0.17
396 0.18
397 0.16
398 0.14
399 0.13
400 0.12
401 0.1
402 0.1
403 0.13
404 0.12
405 0.13
406 0.2
407 0.22
408 0.22
409 0.29
410 0.36
411 0.35
412 0.39
413 0.41
414 0.38
415 0.36
416 0.38
417 0.32
418 0.29
419 0.26
420 0.22
421 0.19
422 0.14
423 0.13
424 0.12
425 0.11
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.09
430 0.11
431 0.15
432 0.15
433 0.14
434 0.21
435 0.26
436 0.27
437 0.34
438 0.39
439 0.43
440 0.46
441 0.55
442 0.57
443 0.59
444 0.65
445 0.62
446 0.62
447 0.59
448 0.64
449 0.59