Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RQS5

Protein Details
Accession I1RQS5    Localization Confidence High Confidence Score 21.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
38-57KSAADAFKKQREKKGWQTTAHydrophilic
76-102ATKGVDSGKPKKKSSKKSSENKEEDVDHydrophilic
157-178SDSDSDKKPQAKKRKRASSSSSHydrophilic
279-302SDSDSDKNKKKKVKKETKDSSDSSHydrophilic
370-397LIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
84-92KPKKKSSKK
163-172KKPQAKKRKR
286-293NKKKKVKK
376-389KGFTKEKNKKKRGS
Subcellular Location(s) nucl 17, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
KEGG fgr:FGSG_06424  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MGKKSTKAVAANNDVASAPPPSQLMDLVENFLSDHSFKSAADAFKKQREKKGWQTTAATDEQANPSLVGVFQTWEATKGVDSGKPKKKSSKKSSENKEEDVDMKDAVSSSESSDSDSEEEAAKPTPSNNLKRKAPVESSSESSSDSDSNSDSSSSDSDSDSDKKPQAKKRKRASSSSSSSSGSSDSSDSSSDSSSDSSSDSDDESAESDSDSDSSDSSSDSSSDSDSDFDSDSDSDSDSDSSSSSGSEGKAAAKVPLPDSDGSSSDSDSSDSSDCDSDSDSDSDKNKKKKVKKETKDSSDSSVTLDKTSPEFQSNLANPPLPPDPIMNGNGKKKQNEPFSRIPKDIKVDPKFASNEYVSIAYSQRAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKRGSYRGGAIDISDKKGIYFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.35
3 0.29
4 0.23
5 0.16
6 0.13
7 0.13
8 0.13
9 0.14
10 0.15
11 0.17
12 0.19
13 0.2
14 0.21
15 0.2
16 0.19
17 0.18
18 0.17
19 0.15
20 0.11
21 0.12
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.17
26 0.22
27 0.26
28 0.3
29 0.37
30 0.41
31 0.5
32 0.61
33 0.63
34 0.67
35 0.71
36 0.75
37 0.77
38 0.82
39 0.79
40 0.75
41 0.73
42 0.67
43 0.63
44 0.56
45 0.46
46 0.36
47 0.32
48 0.29
49 0.26
50 0.23
51 0.17
52 0.16
53 0.15
54 0.14
55 0.12
56 0.09
57 0.08
58 0.08
59 0.1
60 0.1
61 0.11
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.13
66 0.14
67 0.16
68 0.22
69 0.31
70 0.4
71 0.47
72 0.52
73 0.6
74 0.68
75 0.75
76 0.8
77 0.81
78 0.82
79 0.85
80 0.91
81 0.91
82 0.87
83 0.8
84 0.71
85 0.62
86 0.55
87 0.48
88 0.38
89 0.27
90 0.21
91 0.17
92 0.14
93 0.12
94 0.11
95 0.08
96 0.08
97 0.12
98 0.12
99 0.13
100 0.13
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.13
105 0.11
106 0.11
107 0.11
108 0.12
109 0.11
110 0.1
111 0.11
112 0.18
113 0.25
114 0.34
115 0.41
116 0.48
117 0.51
118 0.57
119 0.59
120 0.57
121 0.54
122 0.49
123 0.47
124 0.42
125 0.42
126 0.37
127 0.35
128 0.3
129 0.25
130 0.22
131 0.17
132 0.14
133 0.11
134 0.1
135 0.11
136 0.1
137 0.1
138 0.08
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.09
144 0.1
145 0.13
146 0.16
147 0.16
148 0.2
149 0.23
150 0.29
151 0.36
152 0.45
153 0.53
154 0.6
155 0.69
156 0.75
157 0.82
158 0.81
159 0.81
160 0.8
161 0.78
162 0.73
163 0.67
164 0.59
165 0.49
166 0.44
167 0.37
168 0.3
169 0.2
170 0.15
171 0.11
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.08
184 0.07
185 0.07
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.07
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.05
203 0.05
204 0.06
205 0.06
206 0.06
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.07
213 0.07
214 0.08
215 0.08
216 0.07
217 0.08
218 0.07
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.07
226 0.07
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.07
234 0.07
235 0.08
236 0.08
237 0.1
238 0.11
239 0.11
240 0.12
241 0.14
242 0.14
243 0.15
244 0.17
245 0.15
246 0.17
247 0.17
248 0.16
249 0.17
250 0.17
251 0.15
252 0.14
253 0.13
254 0.12
255 0.1
256 0.11
257 0.1
258 0.09
259 0.1
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.11
264 0.1
265 0.12
266 0.13
267 0.12
268 0.16
269 0.19
270 0.28
271 0.34
272 0.41
273 0.46
274 0.54
275 0.63
276 0.7
277 0.77
278 0.8
279 0.83
280 0.86
281 0.89
282 0.89
283 0.87
284 0.79
285 0.73
286 0.65
287 0.55
288 0.46
289 0.4
290 0.31
291 0.25
292 0.23
293 0.19
294 0.19
295 0.22
296 0.21
297 0.19
298 0.19
299 0.19
300 0.26
301 0.27
302 0.28
303 0.28
304 0.27
305 0.24
306 0.28
307 0.29
308 0.22
309 0.21
310 0.18
311 0.18
312 0.21
313 0.24
314 0.27
315 0.31
316 0.38
317 0.45
318 0.49
319 0.5
320 0.52
321 0.58
322 0.62
323 0.64
324 0.64
325 0.67
326 0.72
327 0.75
328 0.72
329 0.68
330 0.63
331 0.6
332 0.6
333 0.6
334 0.56
335 0.55
336 0.52
337 0.54
338 0.51
339 0.46
340 0.44
341 0.35
342 0.3
343 0.27
344 0.26
345 0.2
346 0.19
347 0.19
348 0.16
349 0.17
350 0.17
351 0.18
352 0.18
353 0.18
354 0.18
355 0.2
356 0.2
357 0.24
358 0.27
359 0.24
360 0.25
361 0.29
362 0.3
363 0.35
364 0.37
365 0.4
366 0.48
367 0.59
368 0.67
369 0.74
370 0.82
371 0.83
372 0.9
373 0.91
374 0.9
375 0.9
376 0.88
377 0.86
378 0.84
379 0.78
380 0.67
381 0.57
382 0.55
383 0.48
384 0.43
385 0.36
386 0.27
387 0.25