Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

I1RDH0

Protein Details
Accession I1RDH0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
291-314AEYEKRETQKKARKEAKFKEKLLDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
298-320TQKKARKEAKFKEKLLDLKKKTR
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 13, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009061  DNA-bd_dom_put_sf  
IPR000465  XPA  
IPR022656  XPA_C  
IPR022658  XPA_CS  
IPR037129  XPA_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
KEGG fgr:FGSG_01666  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05181  XPA_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00753  XPA_2  
CDD cd21077  DBD_Rad14  
Amino Acid Sequences MERPSTPPRATKPAPVISPPTPEVTKRIEENRLRAKAIRDQREAEQRATGTVPEIPKSSGGFVPTDDVYISKTANGKRPYSSISTTEPKGTNRDGRNKGDEETLRPARKFTKFVDYNMSAMTDTKGGFLSTEDDPHNYALSGKKQDDAQQRPKHMSVQEWERLQLIRNLKRLKAGPYEPGLSVLADDETRKKCRDCKSLEIDFVWEEVFHLCVCNKCKEKYPEKYSLLTKTECKEDYLLTDPELRDPELLPHLSKPNPHKSHWHDMMLFLRCQVEEYAIKTKWGSAEALDAEYEKRETQKKARKEAKFKEKLLDLKKKTRTDAFRRQAGNLSKSGASKFGDAIGGGKHVHEWGRTVENEDGMTVKTCVDCGMEVEEMEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.59
3 0.59
4 0.53
5 0.56
6 0.49
7 0.46
8 0.41
9 0.38
10 0.39
11 0.37
12 0.39
13 0.39
14 0.44
15 0.48
16 0.52
17 0.6
18 0.65
19 0.64
20 0.62
21 0.6
22 0.58
23 0.58
24 0.62
25 0.61
26 0.57
27 0.56
28 0.6
29 0.67
30 0.65
31 0.57
32 0.52
33 0.43
34 0.39
35 0.37
36 0.29
37 0.21
38 0.21
39 0.22
40 0.19
41 0.2
42 0.19
43 0.2
44 0.21
45 0.22
46 0.19
47 0.19
48 0.17
49 0.16
50 0.19
51 0.17
52 0.16
53 0.13
54 0.12
55 0.12
56 0.12
57 0.12
58 0.12
59 0.17
60 0.21
61 0.3
62 0.34
63 0.35
64 0.37
65 0.4
66 0.41
67 0.41
68 0.4
69 0.35
70 0.36
71 0.39
72 0.38
73 0.4
74 0.39
75 0.36
76 0.38
77 0.39
78 0.42
79 0.44
80 0.53
81 0.54
82 0.57
83 0.61
84 0.58
85 0.54
86 0.53
87 0.47
88 0.42
89 0.43
90 0.46
91 0.44
92 0.42
93 0.43
94 0.43
95 0.45
96 0.45
97 0.39
98 0.42
99 0.41
100 0.43
101 0.49
102 0.43
103 0.39
104 0.35
105 0.33
106 0.22
107 0.2
108 0.18
109 0.11
110 0.1
111 0.09
112 0.09
113 0.08
114 0.08
115 0.08
116 0.11
117 0.1
118 0.13
119 0.13
120 0.13
121 0.14
122 0.15
123 0.14
124 0.11
125 0.12
126 0.13
127 0.17
128 0.21
129 0.21
130 0.22
131 0.23
132 0.31
133 0.38
134 0.44
135 0.49
136 0.51
137 0.53
138 0.55
139 0.55
140 0.52
141 0.44
142 0.39
143 0.34
144 0.35
145 0.36
146 0.33
147 0.32
148 0.29
149 0.28
150 0.25
151 0.25
152 0.26
153 0.27
154 0.33
155 0.36
156 0.35
157 0.39
158 0.4
159 0.4
160 0.38
161 0.34
162 0.31
163 0.31
164 0.32
165 0.28
166 0.27
167 0.22
168 0.16
169 0.14
170 0.1
171 0.08
172 0.06
173 0.07
174 0.1
175 0.13
176 0.16
177 0.18
178 0.2
179 0.26
180 0.34
181 0.42
182 0.43
183 0.48
184 0.53
185 0.56
186 0.56
187 0.49
188 0.42
189 0.34
190 0.28
191 0.2
192 0.11
193 0.08
194 0.06
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.06
199 0.1
200 0.13
201 0.2
202 0.23
203 0.24
204 0.33
205 0.41
206 0.5
207 0.56
208 0.6
209 0.63
210 0.62
211 0.65
212 0.61
213 0.59
214 0.53
215 0.45
216 0.42
217 0.34
218 0.36
219 0.32
220 0.3
221 0.24
222 0.21
223 0.22
224 0.23
225 0.21
226 0.18
227 0.21
228 0.2
229 0.21
230 0.22
231 0.19
232 0.15
233 0.15
234 0.16
235 0.16
236 0.17
237 0.15
238 0.17
239 0.21
240 0.22
241 0.27
242 0.32
243 0.39
244 0.43
245 0.44
246 0.51
247 0.54
248 0.63
249 0.62
250 0.6
251 0.49
252 0.48
253 0.52
254 0.46
255 0.38
256 0.29
257 0.25
258 0.2
259 0.2
260 0.17
261 0.15
262 0.13
263 0.17
264 0.23
265 0.23
266 0.24
267 0.22
268 0.24
269 0.21
270 0.21
271 0.18
272 0.11
273 0.15
274 0.15
275 0.16
276 0.14
277 0.14
278 0.13
279 0.13
280 0.14
281 0.11
282 0.16
283 0.21
284 0.27
285 0.37
286 0.46
287 0.53
288 0.63
289 0.72
290 0.76
291 0.81
292 0.86
293 0.87
294 0.87
295 0.81
296 0.77
297 0.74
298 0.73
299 0.72
300 0.72
301 0.68
302 0.68
303 0.75
304 0.73
305 0.72
306 0.72
307 0.72
308 0.71
309 0.75
310 0.74
311 0.73
312 0.7
313 0.67
314 0.67
315 0.65
316 0.59
317 0.49
318 0.44
319 0.39
320 0.38
321 0.37
322 0.32
323 0.26
324 0.23
325 0.22
326 0.2
327 0.18
328 0.16
329 0.16
330 0.14
331 0.14
332 0.13
333 0.13
334 0.12
335 0.14
336 0.16
337 0.16
338 0.17
339 0.19
340 0.25
341 0.26
342 0.29
343 0.29
344 0.28
345 0.27
346 0.25
347 0.22
348 0.18
349 0.19
350 0.15
351 0.14
352 0.12
353 0.12
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.12
358 0.15
359 0.15