Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RT33

Protein Details
Accession I1RT33    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
413-443KNETKRSGSPTRKQNKGEKRRRSESPNGAGSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
271-278KKSRKSKE
400-455GPRGPAGPSEKSQKNETKRSGSPTRKQNKGEKRRRSESPNGAGSPRRKAAALESKQ
458-458K
Subcellular Location(s) mito 14, mito_nucl 11.833, cyto_mito 8.833, nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR002501  PsdUridine_synth_N  
IPR014780  tRNA_psdUridine_synth_TruB  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
GO:0008033  P:tRNA processing  
KEGG fgr:FGSG_07326  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01509  TruB_N  
CDD cd02867  PseudoU_synth_TruB_4  
Amino Acid Sequences MATGIIREGVFAINKPCGQSSAQVIRECQQVFNPSEFFKPLIQSEVAKRMNENSGESARRKALKRASQVKIGHGGTLDPLATGVLILGIGCATKALPQFLECTKTYETTIVFGAATDSYDRVGRILTKRPYEHITRELVEKEIASFKGRQIQIPPLFSALKMNGKPLYEYAREGKPIPRQIEGREVDVKEIEMVEWYEPGEHNHRWPTEEAEAAERNLAEQVWRVKKQQESNKPLSPEEKQQDDKAIAAHETFKRNFEERQDALIKDAPSKKSRKSKEPRMMSGALGKLPQPTYSTKGQNLVPDAPDSSTPPPWSDQGPPACKVRLTVTSGFYVRSFCHDLGAKLDSAGLMAELSRTRQNHFEVGSENCLEYGDLAKGENVWGPKVAGMLKKWNEGLGAGPRGPAGPSEKSQKNETKRSGSPTRKQNKGEKRRRSESPNGAGSPRRKAAALESKQDSKPVKEPMKEPVKEAKEEATPDAGNRSDDEKSWNGIED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.24
3 0.24
4 0.24
5 0.25
6 0.26
7 0.32
8 0.36
9 0.41
10 0.42
11 0.42
12 0.43
13 0.49
14 0.46
15 0.39
16 0.34
17 0.35
18 0.35
19 0.37
20 0.36
21 0.31
22 0.33
23 0.33
24 0.31
25 0.27
26 0.27
27 0.24
28 0.26
29 0.26
30 0.27
31 0.31
32 0.39
33 0.4
34 0.37
35 0.37
36 0.36
37 0.4
38 0.39
39 0.36
40 0.32
41 0.35
42 0.4
43 0.4
44 0.41
45 0.41
46 0.46
47 0.46
48 0.49
49 0.53
50 0.56
51 0.65
52 0.7
53 0.69
54 0.71
55 0.7
56 0.66
57 0.64
58 0.55
59 0.46
60 0.36
61 0.32
62 0.23
63 0.22
64 0.17
65 0.09
66 0.09
67 0.07
68 0.07
69 0.06
70 0.05
71 0.03
72 0.03
73 0.03
74 0.03
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.07
81 0.09
82 0.1
83 0.11
84 0.12
85 0.16
86 0.18
87 0.23
88 0.2
89 0.24
90 0.24
91 0.25
92 0.25
93 0.24
94 0.22
95 0.19
96 0.19
97 0.15
98 0.13
99 0.11
100 0.11
101 0.08
102 0.09
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.09
107 0.09
108 0.08
109 0.09
110 0.14
111 0.18
112 0.27
113 0.32
114 0.38
115 0.4
116 0.43
117 0.47
118 0.47
119 0.48
120 0.44
121 0.42
122 0.37
123 0.38
124 0.36
125 0.32
126 0.27
127 0.22
128 0.19
129 0.18
130 0.17
131 0.16
132 0.17
133 0.17
134 0.24
135 0.25
136 0.26
137 0.25
138 0.34
139 0.36
140 0.36
141 0.35
142 0.3
143 0.3
144 0.27
145 0.27
146 0.2
147 0.23
148 0.21
149 0.24
150 0.23
151 0.23
152 0.24
153 0.23
154 0.26
155 0.21
156 0.23
157 0.24
158 0.24
159 0.26
160 0.27
161 0.3
162 0.32
163 0.37
164 0.36
165 0.36
166 0.36
167 0.36
168 0.44
169 0.4
170 0.36
171 0.35
172 0.33
173 0.3
174 0.28
175 0.25
176 0.16
177 0.15
178 0.11
179 0.06
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.09
187 0.13
188 0.14
189 0.17
190 0.21
191 0.22
192 0.23
193 0.24
194 0.25
195 0.22
196 0.23
197 0.2
198 0.19
199 0.19
200 0.17
201 0.17
202 0.13
203 0.11
204 0.1
205 0.09
206 0.06
207 0.07
208 0.15
209 0.2
210 0.23
211 0.24
212 0.28
213 0.34
214 0.42
215 0.49
216 0.52
217 0.54
218 0.59
219 0.61
220 0.59
221 0.55
222 0.5
223 0.43
224 0.4
225 0.35
226 0.34
227 0.32
228 0.3
229 0.32
230 0.29
231 0.27
232 0.19
233 0.16
234 0.12
235 0.1
236 0.14
237 0.14
238 0.18
239 0.18
240 0.2
241 0.22
242 0.23
243 0.25
244 0.25
245 0.29
246 0.25
247 0.3
248 0.31
249 0.28
250 0.28
251 0.3
252 0.26
253 0.24
254 0.28
255 0.27
256 0.3
257 0.34
258 0.4
259 0.46
260 0.51
261 0.57
262 0.62
263 0.7
264 0.74
265 0.77
266 0.74
267 0.71
268 0.66
269 0.56
270 0.51
271 0.41
272 0.31
273 0.24
274 0.2
275 0.16
276 0.15
277 0.15
278 0.13
279 0.14
280 0.18
281 0.23
282 0.26
283 0.25
284 0.29
285 0.3
286 0.3
287 0.31
288 0.29
289 0.24
290 0.21
291 0.2
292 0.17
293 0.16
294 0.16
295 0.15
296 0.16
297 0.16
298 0.16
299 0.17
300 0.18
301 0.2
302 0.2
303 0.24
304 0.29
305 0.32
306 0.33
307 0.34
308 0.34
309 0.32
310 0.3
311 0.27
312 0.24
313 0.26
314 0.27
315 0.26
316 0.28
317 0.28
318 0.28
319 0.25
320 0.21
321 0.16
322 0.18
323 0.2
324 0.17
325 0.2
326 0.2
327 0.21
328 0.22
329 0.24
330 0.19
331 0.15
332 0.15
333 0.11
334 0.09
335 0.09
336 0.06
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.08
342 0.12
343 0.14
344 0.16
345 0.2
346 0.23
347 0.26
348 0.26
349 0.26
350 0.24
351 0.26
352 0.28
353 0.24
354 0.21
355 0.17
356 0.16
357 0.14
358 0.12
359 0.11
360 0.08
361 0.08
362 0.08
363 0.08
364 0.08
365 0.09
366 0.11
367 0.1
368 0.1
369 0.11
370 0.11
371 0.11
372 0.13
373 0.16
374 0.17
375 0.19
376 0.27
377 0.29
378 0.33
379 0.32
380 0.31
381 0.28
382 0.24
383 0.26
384 0.23
385 0.24
386 0.21
387 0.21
388 0.2
389 0.2
390 0.2
391 0.19
392 0.17
393 0.17
394 0.21
395 0.3
396 0.35
397 0.38
398 0.46
399 0.53
400 0.57
401 0.62
402 0.66
403 0.65
404 0.64
405 0.69
406 0.72
407 0.73
408 0.72
409 0.74
410 0.76
411 0.77
412 0.79
413 0.81
414 0.82
415 0.83
416 0.86
417 0.86
418 0.86
419 0.85
420 0.86
421 0.85
422 0.84
423 0.83
424 0.81
425 0.77
426 0.7
427 0.67
428 0.66
429 0.61
430 0.59
431 0.52
432 0.44
433 0.37
434 0.36
435 0.42
436 0.45
437 0.47
438 0.47
439 0.49
440 0.54
441 0.54
442 0.6
443 0.54
444 0.48
445 0.49
446 0.52
447 0.54
448 0.54
449 0.56
450 0.59
451 0.66
452 0.62
453 0.6
454 0.6
455 0.56
456 0.54
457 0.53
458 0.48
459 0.42
460 0.44
461 0.42
462 0.36
463 0.32
464 0.3
465 0.32
466 0.29
467 0.25
468 0.24
469 0.26
470 0.22
471 0.23
472 0.28
473 0.27
474 0.29