Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4IQW0

Protein Details
Accession Q4IQW0    Localization Confidence High Confidence Score 22.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
124-150IDATEDKSNKERKRKRKNDNDDLEGKYBasic
417-436FPPMLPRKLRVTRAKDPRKTHydrophilic
521-552SARDGLPKDLKQKKGKGKKSGRPQNHGTKRASBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
133-140KERKRKRK
420-460MLPRKLRVTRAKDPRKTALAQERARGKHISTNGPKSTKYKH
486-491RHKKRP
518-559RRASARDGLPKDLKQKKGKGKKSGRPQNHGTKRASEWKKKKN
Subcellular Location(s) nucl 18, mito 5.5, cyto_mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG fgr:FGSG_00398  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
Amino Acid Sequences MAKGSKGLRASSKAVDPTLDALFASSAGPVQAPAKSKYSTLLDQKVREPAKPKVHLEEDDEVLSEISEELSFEEDGPSDEDEDEDEDEENSEQEDGSGDEQEEEESEDVDETMKDAPVELDDIIDATEDKSNKERKRKRKNDNDDLEGKYLDKVAAEEEADRAGKRQKNDALTKTEKPAVDEEDAGNESDIPVHETLVKDSKASDLDKAARTVFLANVSTEAISSKSAKKTLMAHLSSVLEKDATPPQTIESLRFRSVAFAGGSLPKRAAYITKSLMDSTTKSANAYVVYSTTAAARTAATKLNGTQVLDRHLRVDSVAHPSPTDHRRCVFVGNLGFVDDETVLNTNAEGDTTEKKKNKTPSDIEEGLWRTFSTQGKVENVRVVRDSKTRVGKGFAYVQFYDANDVEAALLLDGKKFPPMLPRKLRVTRAKDPRKTALAQERARGKHISTNGPKSTKYKHKATPEEQSMAGRTSKLLGRSAAVQQRHKKRPSAHGESREAEGQPAGIKGPEQFVFEGRRASARDGLPKDLKQKKGKGKKSGRPQNHGTKRASEWKKKKN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.38
3 0.33
4 0.31
5 0.27
6 0.23
7 0.16
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.1
12 0.07
13 0.07
14 0.07
15 0.07
16 0.07
17 0.09
18 0.13
19 0.17
20 0.2
21 0.24
22 0.25
23 0.26
24 0.3
25 0.34
26 0.38
27 0.42
28 0.48
29 0.51
30 0.53
31 0.56
32 0.6
33 0.56
34 0.54
35 0.51
36 0.51
37 0.55
38 0.59
39 0.6
40 0.59
41 0.63
42 0.61
43 0.61
44 0.56
45 0.48
46 0.4
47 0.37
48 0.29
49 0.22
50 0.19
51 0.13
52 0.08
53 0.07
54 0.06
55 0.06
56 0.06
57 0.08
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.1
63 0.12
64 0.12
65 0.11
66 0.11
67 0.11
68 0.11
69 0.12
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.09
74 0.1
75 0.1
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.07
80 0.06
81 0.07
82 0.07
83 0.08
84 0.09
85 0.09
86 0.09
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.1
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.07
96 0.08
97 0.07
98 0.07
99 0.08
100 0.08
101 0.07
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.08
107 0.07
108 0.07
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.06
113 0.06
114 0.09
115 0.1
116 0.12
117 0.19
118 0.28
119 0.36
120 0.47
121 0.56
122 0.63
123 0.75
124 0.84
125 0.88
126 0.9
127 0.93
128 0.93
129 0.91
130 0.87
131 0.82
132 0.75
133 0.65
134 0.54
135 0.44
136 0.33
137 0.26
138 0.19
139 0.13
140 0.09
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.18
151 0.21
152 0.23
153 0.3
154 0.34
155 0.42
156 0.49
157 0.52
158 0.53
159 0.55
160 0.57
161 0.53
162 0.52
163 0.44
164 0.39
165 0.36
166 0.31
167 0.27
168 0.25
169 0.21
170 0.19
171 0.2
172 0.17
173 0.15
174 0.11
175 0.09
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.07
180 0.07
181 0.09
182 0.1
183 0.12
184 0.16
185 0.17
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.18
190 0.18
191 0.17
192 0.16
193 0.21
194 0.23
195 0.24
196 0.22
197 0.19
198 0.18
199 0.18
200 0.14
201 0.12
202 0.11
203 0.09
204 0.1
205 0.1
206 0.09
207 0.08
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.1
212 0.13
213 0.16
214 0.17
215 0.18
216 0.2
217 0.23
218 0.29
219 0.35
220 0.31
221 0.29
222 0.29
223 0.3
224 0.28
225 0.24
226 0.17
227 0.09
228 0.08
229 0.1
230 0.13
231 0.13
232 0.14
233 0.14
234 0.14
235 0.18
236 0.19
237 0.2
238 0.21
239 0.22
240 0.23
241 0.24
242 0.23
243 0.2
244 0.2
245 0.19
246 0.14
247 0.11
248 0.11
249 0.14
250 0.15
251 0.14
252 0.14
253 0.11
254 0.11
255 0.11
256 0.12
257 0.1
258 0.14
259 0.16
260 0.18
261 0.18
262 0.18
263 0.19
264 0.18
265 0.17
266 0.15
267 0.15
268 0.13
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.11
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.06
282 0.06
283 0.06
284 0.07
285 0.08
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.11
290 0.14
291 0.15
292 0.15
293 0.15
294 0.14
295 0.19
296 0.2
297 0.19
298 0.17
299 0.16
300 0.15
301 0.13
302 0.14
303 0.12
304 0.17
305 0.18
306 0.17
307 0.17
308 0.18
309 0.24
310 0.29
311 0.31
312 0.27
313 0.27
314 0.3
315 0.3
316 0.32
317 0.27
318 0.25
319 0.22
320 0.2
321 0.19
322 0.16
323 0.15
324 0.13
325 0.12
326 0.07
327 0.06
328 0.05
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.06
333 0.06
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.11
339 0.15
340 0.22
341 0.26
342 0.29
343 0.35
344 0.44
345 0.49
346 0.53
347 0.56
348 0.55
349 0.59
350 0.59
351 0.53
352 0.49
353 0.45
354 0.36
355 0.3
356 0.24
357 0.17
358 0.2
359 0.21
360 0.18
361 0.18
362 0.2
363 0.25
364 0.28
365 0.29
366 0.3
367 0.29
368 0.28
369 0.27
370 0.27
371 0.25
372 0.27
373 0.3
374 0.32
375 0.39
376 0.4
377 0.39
378 0.4
379 0.38
380 0.37
381 0.41
382 0.36
383 0.33
384 0.3
385 0.3
386 0.28
387 0.27
388 0.26
389 0.18
390 0.17
391 0.11
392 0.11
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.05
397 0.06
398 0.05
399 0.06
400 0.07
401 0.07
402 0.08
403 0.09
404 0.1
405 0.19
406 0.27
407 0.37
408 0.45
409 0.51
410 0.59
411 0.66
412 0.74
413 0.74
414 0.74
415 0.74
416 0.76
417 0.81
418 0.79
419 0.78
420 0.76
421 0.72
422 0.66
423 0.64
424 0.63
425 0.62
426 0.58
427 0.58
428 0.6
429 0.56
430 0.57
431 0.5
432 0.41
433 0.38
434 0.41
435 0.45
436 0.45
437 0.52
438 0.55
439 0.57
440 0.58
441 0.56
442 0.6
443 0.6
444 0.59
445 0.59
446 0.61
447 0.68
448 0.75
449 0.76
450 0.77
451 0.73
452 0.69
453 0.62
454 0.55
455 0.47
456 0.39
457 0.34
458 0.24
459 0.18
460 0.18
461 0.2
462 0.2
463 0.21
464 0.2
465 0.2
466 0.24
467 0.31
468 0.35
469 0.38
470 0.45
471 0.52
472 0.61
473 0.69
474 0.71
475 0.71
476 0.72
477 0.76
478 0.77
479 0.78
480 0.77
481 0.77
482 0.78
483 0.72
484 0.68
485 0.61
486 0.51
487 0.42
488 0.32
489 0.24
490 0.18
491 0.17
492 0.14
493 0.11
494 0.11
495 0.11
496 0.16
497 0.17
498 0.18
499 0.18
500 0.21
501 0.26
502 0.27
503 0.28
504 0.25
505 0.28
506 0.28
507 0.31
508 0.34
509 0.34
510 0.42
511 0.42
512 0.49
513 0.51
514 0.54
515 0.6
516 0.62
517 0.66
518 0.66
519 0.73
520 0.76
521 0.8
522 0.85
523 0.86
524 0.89
525 0.89
526 0.91
527 0.92
528 0.91
529 0.89
530 0.88
531 0.89
532 0.88
533 0.86
534 0.79
535 0.75
536 0.72
537 0.74
538 0.75
539 0.75