FuNGI

E4V5Z5

Protein Details

Accession

E4V5Z5

Localization Confidence

High

Confidence Score

20.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
23-51	FMIRRRPKAADPLVRPKKRPIPRPTAPGQ	Hydrophilic
544-566	SGTDSSRKKPKNKHLSAQVPNSQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-46	IRRRPKAADPLVRPKKRPIPRP
518-535	PKHTDPLKRAQAAARKRP
550-554	RKKPK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0003743 F:translation initiation factor activity GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSSTTPPNPPLGRTPPGGPNGPFMIRRRPKAADPLVRPKKRPIPRPTAPGQPQGQGQPQGYGPGQVRPTTANGTSTLPLQPPRLQPPANTLPHPKPIPSADDLTTNGFSGPLLSETYSDYPLVTTKRALREGLRHHIAKLISKKSVDPRDESQFTRPVRLQRRDPRATTTPPAGNEKEDVNPRRGFRDPYAGLTEVERQEMEAKKEARAKEREDNLAQIAPSVNSGLKKVNAPKQRTQQVFKSTITPEEAAKSQIKYEEALPWHLEDFDNKNIWVGKYEAAMSETYATFVLERSGKMRMIPIDKWYKFTAKNQFKVLTIEEAEKHMARKIRDPRWFMEKEQARAQERELQRYARQRKIYTGQSRNAPVTDRFEGDDMDFDEDRFADDEEHVGLFDDDEDAKTAEKRIKQDQLKANIFDLKDEKDYDEEEHLERKQKEDLKSFGKQVRKALQRREKNFDYSSGSDANPYSDDESTDESELERQKEEQKKSEEDPKRKENQSDKPSGTSTKGTNTPSGRPKHTDPLKRAQAAARKRPGSPNLSDASGTDSSRKKPKNKHLSAQVPNSQPASRPISPAPQGQRKSSGAANANDAAASTTQASAGAKKRIRTGPGKAGSASDVEKAANSSAEISDSTMAKRMKLNVPGAKSKTGTPIGSRAGSPTPAGRALAGSRASSPESSRGISTPSGSGSRRGSVSGANPGAGASLPASFPTASEIHAAIPATGILSNDLLRMFRSRLGNSRENHRRFIGIVKDVSVFGKEDKLLRPGVIKEA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.47
3	0.51
4	0.53
5	0.45
6	0.43
7	0.43
8	0.44
9	0.44
10	0.41
11	0.47
12	0.5
13	0.54
14	0.56
15	0.57
16	0.58
17	0.64
18	0.7
19	0.69
20	0.69
21	0.75
22	0.79
23	0.81
24	0.79
25	0.78
26	0.78
27	0.77
28	0.79
29	0.78
30	0.77
31	0.78
32	0.83
33	0.78
34	0.79
35	0.75
36	0.73
37	0.67
38	0.6
39	0.55
40	0.52
41	0.53
42	0.48
43	0.43
44	0.37
45	0.34
46	0.35
47	0.31
48	0.3
49	0.25
50	0.26
51	0.28
52	0.27
53	0.28
54	0.26
55	0.29
56	0.29
57	0.29
58	0.25
59	0.24
60	0.26
61	0.25
62	0.25
63	0.24
64	0.23
65	0.25
66	0.28
67	0.32
68	0.35
69	0.41
70	0.47
71	0.46
72	0.44
73	0.49
74	0.54
75	0.53
76	0.51
77	0.51
78	0.49
79	0.56
80	0.56
81	0.49
82	0.44
83	0.42
84	0.43
85	0.4
86	0.39
87	0.31
88	0.33
89	0.33
90	0.32
91	0.29
92	0.24
93	0.2
94	0.16
95	0.14
96	0.12
97	0.11
98	0.08
99	0.09
100	0.09
101	0.1
102	0.13
103	0.16
104	0.16
105	0.15
106	0.14
107	0.13
108	0.17
109	0.19
110	0.17
111	0.19
112	0.24
113	0.31
114	0.34
115	0.36
116	0.37
117	0.43
118	0.49
119	0.54
120	0.55
121	0.5
122	0.47
123	0.49
124	0.46
125	0.45
126	0.45
127	0.42
128	0.39
129	0.4
130	0.44
131	0.49
132	0.56
133	0.52
134	0.49
135	0.49
136	0.54
137	0.56
138	0.54
139	0.5
140	0.48
141	0.45
142	0.46
143	0.45
144	0.45
145	0.52
146	0.57
147	0.62
148	0.65
149	0.74
150	0.75
151	0.73
152	0.72
153	0.68
154	0.66
155	0.6
156	0.57
157	0.51
158	0.46
159	0.5
160	0.44
161	0.39
162	0.34
163	0.32
164	0.31
165	0.36
166	0.36
167	0.35
168	0.38
169	0.38
170	0.41
171	0.43
172	0.42
173	0.36
174	0.43
175	0.39
176	0.38
177	0.41
178	0.38
179	0.34
180	0.31
181	0.33
182	0.24
183	0.24
184	0.19
185	0.15
186	0.2
187	0.23
188	0.25
189	0.26
190	0.27
191	0.31
192	0.37
193	0.4
194	0.43
195	0.45
196	0.48
197	0.5
198	0.54
199	0.55
200	0.51
201	0.5
202	0.43
203	0.39
204	0.33
205	0.25
206	0.2
207	0.14
208	0.12
209	0.11
210	0.11
211	0.09
212	0.11
213	0.13
214	0.14
215	0.18
216	0.25
217	0.32
218	0.39
219	0.45
220	0.51
221	0.58
222	0.66
223	0.67
224	0.65
225	0.64
226	0.63
227	0.62
228	0.55
229	0.51
230	0.43
231	0.4
232	0.37
233	0.31
234	0.23
235	0.21
236	0.21
237	0.19
238	0.2
239	0.19
240	0.17
241	0.18
242	0.18
243	0.17
244	0.18
245	0.2
246	0.19
247	0.21
248	0.2
249	0.19
250	0.18
251	0.18
252	0.16
253	0.14
254	0.17
255	0.18
256	0.19
257	0.18
258	0.19
259	0.2
260	0.2
261	0.19
262	0.16
263	0.13
264	0.13
265	0.14
266	0.12
267	0.12
268	0.11
269	0.1
270	0.1
271	0.09
272	0.09
273	0.08
274	0.08
275	0.07
276	0.07
277	0.09
278	0.08
279	0.09
280	0.1
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.15
285	0.17
286	0.2
287	0.21
288	0.26
289	0.34
290	0.34
291	0.37
292	0.36
293	0.37
294	0.36
295	0.42
296	0.46
297	0.45
298	0.48
299	0.5
300	0.49
301	0.45
302	0.45
303	0.39
304	0.3
305	0.23
306	0.21
307	0.17
308	0.17
309	0.17
310	0.15
311	0.15
312	0.15
313	0.18
314	0.17
315	0.25
316	0.33
317	0.4
318	0.47
319	0.49
320	0.49
321	0.54
322	0.55
323	0.48
324	0.49
325	0.45
326	0.4
327	0.42
328	0.45
329	0.4
330	0.38
331	0.39
332	0.37
333	0.34
334	0.37
335	0.34
336	0.3
337	0.32
338	0.41
339	0.47
340	0.46
341	0.49
342	0.44
343	0.47
344	0.51
345	0.55
346	0.55
347	0.54
348	0.51
349	0.5
350	0.51
351	0.47
352	0.42
353	0.35
354	0.26
355	0.25
356	0.22
357	0.19
358	0.17
359	0.17
360	0.17
361	0.14
362	0.14
363	0.1
364	0.11
365	0.1
366	0.1
367	0.09
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.05
373	0.05
374	0.06
375	0.06
376	0.06
377	0.06
378	0.05
379	0.05
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.04
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.08
390	0.12
391	0.15
392	0.18
393	0.24
394	0.32
395	0.35
396	0.43
397	0.48
398	0.53
399	0.53
400	0.51
401	0.46
402	0.41
403	0.37
404	0.31
405	0.26
406	0.19
407	0.17
408	0.17
409	0.16
410	0.13
411	0.15
412	0.14
413	0.14
414	0.14
415	0.13
416	0.16
417	0.17
418	0.23
419	0.22
420	0.22
421	0.27
422	0.31
423	0.35
424	0.37
425	0.41
426	0.4
427	0.43
428	0.46
429	0.46
430	0.46
431	0.44
432	0.44
433	0.48
434	0.51
435	0.54
436	0.59
437	0.64
438	0.67
439	0.7
440	0.72
441	0.66
442	0.63
443	0.58
444	0.51
445	0.46
446	0.39
447	0.36
448	0.3
449	0.26
450	0.22
451	0.21
452	0.18
453	0.13
454	0.13
455	0.12
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.13
460	0.13
461	0.13
462	0.12
463	0.11
464	0.15
465	0.17
466	0.17
467	0.15
468	0.15
469	0.23
470	0.32
471	0.36
472	0.39
473	0.41
474	0.44
475	0.47
476	0.56
477	0.57
478	0.58
479	0.61
480	0.63
481	0.66
482	0.66
483	0.7
484	0.68
485	0.69
486	0.68
487	0.69
488	0.62
489	0.56
490	0.55
491	0.49
492	0.43
493	0.36
494	0.29
495	0.26
496	0.29
497	0.28
498	0.32
499	0.33
500	0.37
501	0.42
502	0.45
503	0.45
504	0.45
505	0.47
506	0.51
507	0.57
508	0.59
509	0.57
510	0.62
511	0.65
512	0.61
513	0.59
514	0.54
515	0.54
516	0.55
517	0.58
518	0.56
519	0.51
520	0.52
521	0.57
522	0.58
523	0.55
524	0.49
525	0.45
526	0.38
527	0.37
528	0.34
529	0.28
530	0.27
531	0.23
532	0.21
533	0.21
534	0.23
535	0.26
536	0.36
537	0.43
538	0.46
539	0.55
540	0.65
541	0.71
542	0.76
543	0.8
544	0.81
545	0.84
546	0.83
547	0.8
548	0.77
549	0.68
550	0.62
551	0.56
552	0.46
553	0.37
554	0.34
555	0.35
556	0.29
557	0.29
558	0.29
559	0.34
560	0.36
561	0.41
562	0.44
563	0.45
564	0.47
565	0.46
566	0.5
567	0.45
568	0.45
569	0.4
570	0.39
571	0.36
572	0.34
573	0.35
574	0.3
575	0.28
576	0.25
577	0.23
578	0.17
579	0.11
580	0.1
581	0.08
582	0.07
583	0.07
584	0.08
585	0.09
586	0.13
587	0.18
588	0.26
589	0.28
590	0.3
591	0.38
592	0.42
593	0.49
594	0.5
595	0.53
596	0.55
597	0.57
598	0.57
599	0.5
600	0.46
601	0.4
602	0.36
603	0.29
604	0.2
605	0.15
606	0.13
607	0.13
608	0.13
609	0.12
610	0.1
611	0.09
612	0.09
613	0.09
614	0.1
615	0.1
616	0.1
617	0.12
618	0.12
619	0.13
620	0.18
621	0.18
622	0.19
623	0.22
624	0.27
625	0.31
626	0.37
627	0.45
628	0.45
629	0.5
630	0.56
631	0.57
632	0.55
633	0.5
634	0.45
635	0.44
636	0.42
637	0.39
638	0.33
639	0.36
640	0.35
641	0.36
642	0.34
643	0.3
644	0.28
645	0.27
646	0.25
647	0.21
648	0.21
649	0.21
650	0.21
651	0.18
652	0.17
653	0.17
654	0.21
655	0.2
656	0.18
657	0.18
658	0.2
659	0.22
660	0.21
661	0.22
662	0.23
663	0.24
664	0.25
665	0.25
666	0.24
667	0.25
668	0.25
669	0.24
670	0.2
671	0.2
672	0.24
673	0.23
674	0.28
675	0.28
676	0.3
677	0.29
678	0.28
679	0.27
680	0.26
681	0.28
682	0.32
683	0.29
684	0.26
685	0.25
686	0.23
687	0.23
688	0.18
689	0.15
690	0.07
691	0.07
692	0.07
693	0.08
694	0.1
695	0.09
696	0.09
697	0.13
698	0.13
699	0.13
700	0.15
701	0.15
702	0.14
703	0.16
704	0.16
705	0.12
706	0.12
707	0.11
708	0.09
709	0.1
710	0.09
711	0.08
712	0.09
713	0.1
714	0.11
715	0.12
716	0.11
717	0.12
718	0.16
719	0.17
720	0.21
721	0.27
722	0.3
723	0.38
724	0.46
725	0.51
726	0.51
727	0.6
728	0.65
729	0.64
730	0.65
731	0.58
732	0.53
733	0.47
734	0.51
735	0.49
736	0.45
737	0.42
738	0.39
739	0.38
740	0.36
741	0.36
742	0.29
743	0.22
744	0.17
745	0.2
746	0.2
747	0.24
748	0.26
749	0.29
750	0.3
751	0.3
752	0.33

E4V5Z5

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer