FuNGI

I1RT01

Protein Details

Accession

I1RT01

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
183-203	QEFNDPKRAKHPSKKNLKVVD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
157-157	K

Subcellular Location(s)

nucl 11.5, cyto_nucl 10, mito 8, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	fgr:FGSG_07289 -
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSTSRPGERMVHQDFIARIRYSNALPPPPHPPKLLDIPNTGLTSGQYTTPGFASRLAREQPLNIEADAELGMPLDLVGMPGVFDGDERSIQAPAHPPALHPHDRPLLRPIAALGKLKAAEANVSFLRRTEYISSGSSKRKDGGMPSAMLKKVNRIKRVPEPAADSPHAIKRKIDKGFEIAEQEFNDPKRAKHPSKKNLKVVDVSPLIPDLDAFPDTGAYVTIKFHQAPVVSAKQYDRRLLSGLFKPIDRTPDEEEAYEAAVAAHEQDPDNIPKPQNTMNYEYYLAASATAGERFRRKFDVEDADHNDDELYTHQSDAGGCFQFRRLRGYETAQEVEFEAATKYDEEIILSYNEDTFYPNQKAVYYYPVQQKSTVRPQRTKNIARNIGIAEEEQVIDQLDITVEDPTEEVREMIKAHHDHPLGGGPAEEEEEHHEGQDAEGEEDVDHRGSSPAARRSRSVSEERDAEGEDDD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.42
3	0.4
4	0.41
5	0.32
6	0.28
7	0.27
8	0.3
9	0.27
10	0.33
11	0.36
12	0.38
13	0.39
14	0.41
15	0.49
16	0.54
17	0.56
18	0.51
19	0.47
20	0.45
21	0.53
22	0.58
23	0.52
24	0.48
25	0.49
26	0.51
27	0.48
28	0.42
29	0.32
30	0.25
31	0.23
32	0.2
33	0.16
34	0.14
35	0.14
36	0.15
37	0.16
38	0.17
39	0.15
40	0.19
41	0.23
42	0.23
43	0.3
44	0.31
45	0.33
46	0.33
47	0.34
48	0.34
49	0.32
50	0.31
51	0.24
52	0.22
53	0.18
54	0.18
55	0.16
56	0.11
57	0.08
58	0.06
59	0.06
60	0.05
61	0.05
62	0.04
63	0.04
64	0.04
65	0.04
66	0.04
67	0.04
68	0.04
69	0.04
70	0.04
71	0.04
72	0.06
73	0.07
74	0.08
75	0.09
76	0.11
77	0.12
78	0.12
79	0.15
80	0.19
81	0.19
82	0.24
83	0.22
84	0.22
85	0.28
86	0.36
87	0.39
88	0.34
89	0.39
90	0.41
91	0.42
92	0.44
93	0.42
94	0.39
95	0.34
96	0.33
97	0.28
98	0.27
99	0.3
100	0.29
101	0.25
102	0.23
103	0.23
104	0.23
105	0.22
106	0.16
107	0.15
108	0.13
109	0.17
110	0.15
111	0.16
112	0.16
113	0.16
114	0.18
115	0.16
116	0.19
117	0.18
118	0.18
119	0.2
120	0.22
121	0.26
122	0.28
123	0.34
124	0.34
125	0.33
126	0.32
127	0.31
128	0.32
129	0.31
130	0.34
131	0.3
132	0.29
133	0.31
134	0.34
135	0.32
136	0.33
137	0.3
138	0.31
139	0.35
140	0.41
141	0.45
142	0.43
143	0.49
144	0.55
145	0.65
146	0.59
147	0.54
148	0.54
149	0.5
150	0.52
151	0.46
152	0.39
153	0.32
154	0.35
155	0.35
156	0.29
157	0.28
158	0.3
159	0.37
160	0.41
161	0.41
162	0.36
163	0.37
164	0.39
165	0.37
166	0.34
167	0.27
168	0.24
169	0.22
170	0.22
171	0.21
172	0.19
173	0.23
174	0.2
175	0.2
176	0.26
177	0.34
178	0.41
179	0.48
180	0.58
181	0.62
182	0.72
183	0.8
184	0.81
185	0.77
186	0.72
187	0.66
188	0.56
189	0.52
190	0.43
191	0.34
192	0.26
193	0.21
194	0.17
195	0.14
196	0.13
197	0.07
198	0.07
199	0.07
200	0.06
201	0.06
202	0.06
203	0.06
204	0.06
205	0.06
206	0.04
207	0.05
208	0.05
209	0.07
210	0.08
211	0.09
212	0.09
213	0.11
214	0.1
215	0.11
216	0.15
217	0.17
218	0.16
219	0.17
220	0.18
221	0.23
222	0.25
223	0.26
224	0.23
225	0.2
226	0.22
227	0.22
228	0.25
229	0.22
230	0.24
231	0.22
232	0.21
233	0.23
234	0.22
235	0.25
236	0.21
237	0.21
238	0.21
239	0.25
240	0.26
241	0.23
242	0.22
243	0.19
244	0.18
245	0.14
246	0.1
247	0.05
248	0.04
249	0.04
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.09
256	0.12
257	0.14
258	0.16
259	0.16
260	0.16
261	0.19
262	0.23
263	0.27
264	0.28
265	0.32
266	0.31
267	0.32
268	0.32
269	0.29
270	0.25
271	0.2
272	0.16
273	0.1
274	0.08
275	0.06
276	0.06
277	0.08
278	0.08
279	0.09
280	0.15
281	0.16
282	0.19
283	0.22
284	0.23
285	0.24
286	0.3
287	0.37
288	0.35
289	0.41
290	0.44
291	0.45
292	0.43
293	0.4
294	0.34
295	0.24
296	0.21
297	0.16
298	0.13
299	0.1
300	0.1
301	0.1
302	0.11
303	0.11
304	0.12
305	0.15
306	0.12
307	0.12
308	0.13
309	0.17
310	0.21
311	0.22
312	0.25
313	0.24
314	0.27
315	0.3
316	0.35
317	0.36
318	0.36
319	0.37
320	0.32
321	0.3
322	0.26
323	0.23
324	0.18
325	0.13
326	0.08
327	0.06
328	0.07
329	0.07
330	0.07
331	0.08
332	0.08
333	0.08
334	0.08
335	0.09
336	0.09
337	0.09
338	0.09
339	0.08
340	0.09
341	0.09
342	0.11
343	0.12
344	0.18
345	0.19
346	0.2
347	0.21
348	0.21
349	0.23
350	0.22
351	0.26
352	0.22
353	0.27
354	0.35
355	0.4
356	0.41
357	0.42
358	0.45
359	0.47
360	0.56
361	0.57
362	0.56
363	0.59
364	0.65
365	0.71
366	0.77
367	0.78
368	0.76
369	0.78
370	0.77
371	0.71
372	0.67
373	0.58
374	0.49
375	0.4
376	0.31
377	0.23
378	0.16
379	0.15
380	0.11
381	0.1
382	0.09
383	0.08
384	0.08
385	0.06
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.07
390	0.06
391	0.06
392	0.07
393	0.07
394	0.09
395	0.09
396	0.08
397	0.08
398	0.1
399	0.11
400	0.13
401	0.2
402	0.21
403	0.22
404	0.3
405	0.3
406	0.29
407	0.3
408	0.33
409	0.26
410	0.24
411	0.22
412	0.15
413	0.15
414	0.16
415	0.14
416	0.1
417	0.14
418	0.18
419	0.18
420	0.17
421	0.18
422	0.17
423	0.17
424	0.21
425	0.16
426	0.13
427	0.13
428	0.14
429	0.13
430	0.13
431	0.15
432	0.11
433	0.09
434	0.09
435	0.1
436	0.11
437	0.16
438	0.24
439	0.31
440	0.38
441	0.41
442	0.43
443	0.49
444	0.56
445	0.58
446	0.58
447	0.55
448	0.54
449	0.55
450	0.54
451	0.5
452	0.44

I1RT01

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer