Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RMT3

Protein Details
Accession I1RMT3    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
294-335RDFPDHSRDHRNKRKNDRHNRNHDNRQKKNQHPRQEQKPQDGBasic
560-580VERPLKRQRSRSSSNARRRGSHydrophilic
585-609SGSYDTYEPKRHKPRRESSEYRSTNHydrophilic
612-662NVDDHRRLDRHHRDRDRGRDRGRSRSRSRSRSRGRNRSRSRTRTPASRDSSBasic
689-717EESPRRKSSLSGLKPKRRQTKLDSAYSRRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
279-332KPPQPHQHGQPNRGRRDFPDHSRDHRNKRKNDRHNRNHDNRQKKNQHPRQEQKP
339-339R
341-353DPKAANLPKPPPR
618-654RLDRHHRDRDRGRDRGRSRSRSRSRSRGRNRSRSRTR
691-707SPRRKSSLSGLKPKRRQ
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
IPR036875  Znf_CCHC_sf  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG fgr:FGSG_05280  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MPNTAPGQPRPDEARCYNCGTAGHWAIACPEPTRETPAGLAAWRNSNTPGHGGNRDHHGGSKKSKGPIITKYAPAPVPAPAPGVARYGPPPNYGPPPTPYSVGPPSYPPHYPPYGSPASSYAPGYSPPGYSNPYPPPSYGGPPPGLPAHPHRPPGTYNSPSPPQPPGPSSYSRPYGHPPPHQDHAPYAHQPHYPSYPPPASAPYGHHAPPPSYPRPFPPHSAPPTYRHPPPPRPPVQSPAPPKAWPNRTSGSPPMPRQSPASILSLPASLPPKPSLPPKPPQPHQHGQPNRGRRDFPDHSRDHRNKRKNDRHNRNHDNRQKKNQHPRQEQKPQDGNSGRSDPKAANLPKPPPRQKQEQKISSISPAKQKSSTPSGTPEIKKAQVESPIIPDSSQRQEPKPNPELETVPEPEPEAEPELEPAPVPVEVPEKATEDDWEWEKETILKEAEPHHPPDEVGKPLPAEYNEEVLLPRKWDAQCIESVYVQADNIEEYVKPIHETPYWSDVEFDPAFVRDGKLPSGDTVSELPPRVNQRARSERSESGEVIEQHPKRGHSDDDTPVERPLKRQRSRSSSNARRRGSHDAYSGSYDTYEPKRHKPRRESSEYRSTNFHNVDDHRRLDRHHRDRDRGRDRGRSRSRSRSRSRGRNRSRSRTRTPASRDSSVVSAASSGLDSLEAELLGRDSKAKTPEESPRRKSSLSGLKPKRRQTKLDSAYSRRW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.53
2 0.51
3 0.55
4 0.51
5 0.46
6 0.42
7 0.37
8 0.39
9 0.34
10 0.32
11 0.26
12 0.25
13 0.25
14 0.27
15 0.27
16 0.2
17 0.21
18 0.22
19 0.24
20 0.31
21 0.29
22 0.28
23 0.27
24 0.28
25 0.27
26 0.25
27 0.27
28 0.23
29 0.28
30 0.28
31 0.28
32 0.28
33 0.29
34 0.29
35 0.29
36 0.31
37 0.3
38 0.36
39 0.38
40 0.39
41 0.43
42 0.44
43 0.41
44 0.42
45 0.43
46 0.43
47 0.47
48 0.53
49 0.52
50 0.53
51 0.56
52 0.57
53 0.57
54 0.58
55 0.6
56 0.56
57 0.54
58 0.52
59 0.54
60 0.49
61 0.44
62 0.37
63 0.3
64 0.27
65 0.23
66 0.23
67 0.19
68 0.2
69 0.19
70 0.21
71 0.19
72 0.19
73 0.22
74 0.26
75 0.26
76 0.28
77 0.29
78 0.31
79 0.38
80 0.39
81 0.39
82 0.37
83 0.41
84 0.39
85 0.38
86 0.35
87 0.34
88 0.36
89 0.36
90 0.32
91 0.31
92 0.32
93 0.34
94 0.36
95 0.32
96 0.32
97 0.33
98 0.33
99 0.31
100 0.35
101 0.36
102 0.34
103 0.33
104 0.29
105 0.28
106 0.29
107 0.28
108 0.21
109 0.17
110 0.18
111 0.2
112 0.18
113 0.17
114 0.17
115 0.19
116 0.22
117 0.23
118 0.29
119 0.33
120 0.36
121 0.37
122 0.35
123 0.37
124 0.36
125 0.38
126 0.36
127 0.33
128 0.3
129 0.29
130 0.31
131 0.29
132 0.27
133 0.26
134 0.29
135 0.33
136 0.36
137 0.41
138 0.4
139 0.4
140 0.41
141 0.46
142 0.48
143 0.44
144 0.43
145 0.44
146 0.46
147 0.45
148 0.46
149 0.43
150 0.39
151 0.38
152 0.37
153 0.35
154 0.37
155 0.39
156 0.41
157 0.42
158 0.45
159 0.42
160 0.43
161 0.44
162 0.48
163 0.51
164 0.54
165 0.56
166 0.54
167 0.58
168 0.57
169 0.53
170 0.47
171 0.45
172 0.42
173 0.39
174 0.37
175 0.36
176 0.36
177 0.36
178 0.35
179 0.35
180 0.32
181 0.29
182 0.33
183 0.31
184 0.3
185 0.3
186 0.3
187 0.27
188 0.27
189 0.28
190 0.25
191 0.27
192 0.26
193 0.27
194 0.26
195 0.25
196 0.28
197 0.33
198 0.35
199 0.35
200 0.36
201 0.4
202 0.46
203 0.48
204 0.47
205 0.47
206 0.5
207 0.52
208 0.58
209 0.54
210 0.52
211 0.57
212 0.56
213 0.55
214 0.55
215 0.58
216 0.61
217 0.67
218 0.72
219 0.72
220 0.74
221 0.72
222 0.69
223 0.67
224 0.66
225 0.63
226 0.59
227 0.55
228 0.49
229 0.5
230 0.53
231 0.53
232 0.48
233 0.46
234 0.43
235 0.42
236 0.45
237 0.46
238 0.46
239 0.45
240 0.45
241 0.44
242 0.44
243 0.42
244 0.4
245 0.36
246 0.32
247 0.27
248 0.27
249 0.23
250 0.21
251 0.2
252 0.18
253 0.16
254 0.15
255 0.15
256 0.12
257 0.13
258 0.14
259 0.15
260 0.17
261 0.25
262 0.3
263 0.34
264 0.41
265 0.49
266 0.57
267 0.62
268 0.68
269 0.69
270 0.68
271 0.68
272 0.72
273 0.68
274 0.67
275 0.69
276 0.69
277 0.67
278 0.64
279 0.58
280 0.5
281 0.54
282 0.51
283 0.51
284 0.51
285 0.48
286 0.51
287 0.6
288 0.65
289 0.66
290 0.7
291 0.72
292 0.73
293 0.8
294 0.85
295 0.86
296 0.89
297 0.9
298 0.9
299 0.92
300 0.93
301 0.91
302 0.9
303 0.88
304 0.88
305 0.84
306 0.84
307 0.83
308 0.82
309 0.85
310 0.83
311 0.85
312 0.84
313 0.85
314 0.85
315 0.85
316 0.81
317 0.78
318 0.77
319 0.67
320 0.65
321 0.59
322 0.51
323 0.45
324 0.45
325 0.36
326 0.3
327 0.3
328 0.21
329 0.2
330 0.26
331 0.24
332 0.25
333 0.29
334 0.35
335 0.42
336 0.52
337 0.58
338 0.58
339 0.61
340 0.66
341 0.7
342 0.74
343 0.75
344 0.71
345 0.67
346 0.62
347 0.58
348 0.53
349 0.49
350 0.41
351 0.39
352 0.35
353 0.33
354 0.32
355 0.32
356 0.31
357 0.33
358 0.32
359 0.26
360 0.28
361 0.3
362 0.34
363 0.34
364 0.34
365 0.3
366 0.31
367 0.3
368 0.27
369 0.26
370 0.25
371 0.26
372 0.23
373 0.23
374 0.22
375 0.21
376 0.19
377 0.18
378 0.16
379 0.18
380 0.23
381 0.22
382 0.23
383 0.32
384 0.36
385 0.44
386 0.46
387 0.45
388 0.43
389 0.42
390 0.41
391 0.35
392 0.34
393 0.29
394 0.23
395 0.21
396 0.18
397 0.17
398 0.16
399 0.14
400 0.12
401 0.1
402 0.09
403 0.1
404 0.1
405 0.09
406 0.09
407 0.08
408 0.07
409 0.06
410 0.06
411 0.06
412 0.08
413 0.08
414 0.1
415 0.11
416 0.12
417 0.13
418 0.13
419 0.13
420 0.12
421 0.15
422 0.15
423 0.15
424 0.15
425 0.14
426 0.14
427 0.16
428 0.15
429 0.15
430 0.14
431 0.13
432 0.14
433 0.17
434 0.24
435 0.24
436 0.26
437 0.25
438 0.24
439 0.24
440 0.26
441 0.26
442 0.23
443 0.21
444 0.19
445 0.18
446 0.19
447 0.21
448 0.17
449 0.18
450 0.16
451 0.17
452 0.16
453 0.16
454 0.16
455 0.17
456 0.17
457 0.13
458 0.12
459 0.17
460 0.16
461 0.2
462 0.22
463 0.21
464 0.23
465 0.25
466 0.26
467 0.2
468 0.2
469 0.17
470 0.15
471 0.13
472 0.11
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.05
478 0.06
479 0.08
480 0.08
481 0.09
482 0.1
483 0.12
484 0.13
485 0.16
486 0.19
487 0.24
488 0.24
489 0.23
490 0.24
491 0.21
492 0.26
493 0.23
494 0.2
495 0.15
496 0.14
497 0.15
498 0.14
499 0.15
500 0.12
501 0.14
502 0.14
503 0.15
504 0.15
505 0.15
506 0.16
507 0.15
508 0.14
509 0.15
510 0.16
511 0.18
512 0.18
513 0.17
514 0.2
515 0.25
516 0.3
517 0.33
518 0.38
519 0.44
520 0.54
521 0.59
522 0.6
523 0.61
524 0.59
525 0.59
526 0.56
527 0.47
528 0.39
529 0.39
530 0.34
531 0.31
532 0.35
533 0.3
534 0.31
535 0.34
536 0.33
537 0.32
538 0.33
539 0.34
540 0.3
541 0.36
542 0.38
543 0.41
544 0.42
545 0.39
546 0.4
547 0.41
548 0.36
549 0.37
550 0.42
551 0.47
552 0.51
553 0.6
554 0.66
555 0.7
556 0.76
557 0.79
558 0.8
559 0.8
560 0.84
561 0.84
562 0.78
563 0.73
564 0.72
565 0.72
566 0.66
567 0.61
568 0.55
569 0.48
570 0.47
571 0.46
572 0.41
573 0.31
574 0.26
575 0.2
576 0.21
577 0.24
578 0.3
579 0.31
580 0.4
581 0.51
582 0.6
583 0.7
584 0.76
585 0.8
586 0.82
587 0.88
588 0.87
589 0.84
590 0.86
591 0.8
592 0.71
593 0.65
594 0.58
595 0.57
596 0.5
597 0.43
598 0.39
599 0.39
600 0.46
601 0.48
602 0.49
603 0.46
604 0.46
605 0.48
606 0.53
607 0.59
608 0.59
609 0.64
610 0.69
611 0.74
612 0.82
613 0.89
614 0.87
615 0.86
616 0.83
617 0.83
618 0.79
619 0.8
620 0.81
621 0.8
622 0.8
623 0.81
624 0.84
625 0.84
626 0.88
627 0.88
628 0.88
629 0.89
630 0.92
631 0.92
632 0.92
633 0.93
634 0.94
635 0.94
636 0.94
637 0.92
638 0.9
639 0.9
640 0.86
641 0.85
642 0.83
643 0.82
644 0.78
645 0.72
646 0.65
647 0.57
648 0.52
649 0.44
650 0.35
651 0.25
652 0.18
653 0.14
654 0.13
655 0.1
656 0.08
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.07
662 0.06
663 0.06
664 0.07
665 0.08
666 0.09
667 0.09
668 0.11
669 0.12
670 0.18
671 0.24
672 0.26
673 0.29
674 0.36
675 0.46
676 0.54
677 0.63
678 0.65
679 0.68
680 0.71
681 0.68
682 0.64
683 0.63
684 0.64
685 0.63
686 0.67
687 0.69
688 0.74
689 0.81
690 0.89
691 0.89
692 0.86
693 0.84
694 0.82
695 0.83
696 0.81
697 0.83
698 0.82