Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A1C3YIC9

Protein Details
Accession A0A1C3YIC9    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MEPPTKKRRHGPSPPKAAQDEBasic
271-291ASIWGRKWTRKTKRAGSMKGSHydrophilic
656-676HLPESTKRKRGRPRKSVGATSBasic
898-925IEPPSSSQKPRTPRHKSIRTNQAPSSRRHydrophilic
949-974VKSHSKSASVRPSSRKIRRPATLTREHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
8-8R
276-294RKWTRKTKRAGSMKGSFKK
612-621KRKRGRPKGS
662-670KRKRGRPRK
959-967RPSSRKIRR
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR009072  Histone-fold  
IPR018465  Scm3/HJURP  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0042393  F:histone binding  
GO:0046982  F:protein heterodimerization activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF10384  Scm3  
Amino Acid Sequences MEPPTKKRRHGPSPPKAAQDEDDDDELASHPQEIKIRRDPDIQLALKRVNANQKLHATMAHIIEKYSRDFEGIGDEIDMATGEIVVNNGHLRNMRDEGDVEGLWVEGESNIDEDEGILLEDLTDEYSDNEEQANEIHHSQTDNENSQASSTKESDTETHRQDQNVIIDEASNNVSNIASSQNDAPHDETTVLPHGLPQDDSQLSPPSFGPGPPPGFGIPHPTFGPWGMMPGFPMQAWGRDDIPPYFNMPPSMPGPWFTGGRYDTASNNGQASIWGRKWTRKTKRAGSMKGSFKKVSDKRPSDAAVGVSSETPDNDRGSESKSAGGSPNRQEAPLSDQTTNASEEDEDFLCSGTSDATPIVQQKPSLVPSGDNALSKNYSSYDPPHETLEETNGNIGKVSQQPDENDDSGQRRSGRARKQTEYLGKISWGDAREFKRSGKTFTIQIHGADPSLREEYQSVDLANDETEGEVFLPSEQTRKGSRLLEEVGTKVTSEKLVVPDSQDTATSFNSSAPQAAQSKNVEEPSPLIQTMIPTMELSDDEAPLALSRIRVPKRQIAAPVAVSPVSSLLTEQDERSTEPANATSAPLKSNNEPSPEAEITVDVVDGTMQLLKRKRGRPKGSTSAAKATPSKTPVPVRTKEIEPTSPTFIVVSLADHLPESTKRKRGRPRKSVGATSTVQDEENNPTKELANVDDVVSESDHQGPVNEISSNEVSGKPPPLSNELKWLLKTKPKDFTTDRACDTFLYKFVHPRKPKEILQQAKDDEPGSQVTQETKEVPKDIEDDLKEQTILYKPQAPMQEADTSMEDVTETREDSESGQHDQTSPSSSSPPYHGDGTPGDDESPEVDEPIEHGTPIPHIISDDEAIESEGSLPPLPQDALIQEAPTLRKPKQMRSSFIEPPSSSQKPRTPRHKSIRTNQAPSSRRSLLSFVSDSESDNEGSRDELIRRVKSHSKSASVRPSSRKIRRPATLTREIYRTPSKNRVHEISSPIGTIKTPGGTIKICGVDGHHCGRDYCFTCI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.88
2 0.85
3 0.77
4 0.7
5 0.61
6 0.57
7 0.52
8 0.44
9 0.4
10 0.33
11 0.3
12 0.27
13 0.25
14 0.19
15 0.14
16 0.12
17 0.12
18 0.15
19 0.22
20 0.26
21 0.33
22 0.41
23 0.45
24 0.48
25 0.52
26 0.52
27 0.54
28 0.59
29 0.55
30 0.5
31 0.51
32 0.49
33 0.47
34 0.47
35 0.44
36 0.45
37 0.48
38 0.48
39 0.5
40 0.53
41 0.52
42 0.49
43 0.45
44 0.38
45 0.36
46 0.36
47 0.34
48 0.29
49 0.26
50 0.29
51 0.3
52 0.3
53 0.28
54 0.24
55 0.2
56 0.2
57 0.2
58 0.22
59 0.2
60 0.17
61 0.15
62 0.15
63 0.13
64 0.13
65 0.12
66 0.06
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.04
71 0.05
72 0.05
73 0.06
74 0.08
75 0.09
76 0.11
77 0.14
78 0.17
79 0.21
80 0.24
81 0.25
82 0.25
83 0.26
84 0.26
85 0.27
86 0.24
87 0.19
88 0.16
89 0.14
90 0.12
91 0.11
92 0.08
93 0.05
94 0.06
95 0.06
96 0.06
97 0.06
98 0.07
99 0.06
100 0.06
101 0.06
102 0.06
103 0.06
104 0.05
105 0.04
106 0.04
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.06
113 0.09
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.1
119 0.11
120 0.13
121 0.12
122 0.13
123 0.14
124 0.14
125 0.15
126 0.17
127 0.23
128 0.26
129 0.26
130 0.27
131 0.27
132 0.26
133 0.26
134 0.28
135 0.23
136 0.21
137 0.2
138 0.21
139 0.2
140 0.22
141 0.25
142 0.28
143 0.34
144 0.34
145 0.41
146 0.42
147 0.42
148 0.42
149 0.43
150 0.41
151 0.37
152 0.33
153 0.25
154 0.23
155 0.22
156 0.22
157 0.19
158 0.14
159 0.1
160 0.1
161 0.1
162 0.09
163 0.1
164 0.1
165 0.09
166 0.1
167 0.13
168 0.15
169 0.17
170 0.19
171 0.21
172 0.19
173 0.19
174 0.19
175 0.17
176 0.17
177 0.19
178 0.17
179 0.15
180 0.15
181 0.17
182 0.17
183 0.18
184 0.15
185 0.18
186 0.18
187 0.19
188 0.2
189 0.24
190 0.23
191 0.23
192 0.22
193 0.2
194 0.2
195 0.19
196 0.21
197 0.22
198 0.25
199 0.24
200 0.26
201 0.23
202 0.24
203 0.24
204 0.29
205 0.23
206 0.24
207 0.24
208 0.22
209 0.22
210 0.21
211 0.24
212 0.14
213 0.16
214 0.14
215 0.13
216 0.14
217 0.14
218 0.14
219 0.11
220 0.15
221 0.12
222 0.15
223 0.17
224 0.18
225 0.18
226 0.19
227 0.22
228 0.21
229 0.22
230 0.19
231 0.22
232 0.22
233 0.21
234 0.21
235 0.2
236 0.2
237 0.21
238 0.23
239 0.19
240 0.19
241 0.21
242 0.21
243 0.21
244 0.19
245 0.22
246 0.2
247 0.21
248 0.21
249 0.2
250 0.18
251 0.22
252 0.23
253 0.19
254 0.19
255 0.18
256 0.15
257 0.15
258 0.17
259 0.18
260 0.18
261 0.23
262 0.24
263 0.31
264 0.4
265 0.5
266 0.58
267 0.6
268 0.68
269 0.71
270 0.79
271 0.83
272 0.81
273 0.78
274 0.76
275 0.78
276 0.76
277 0.71
278 0.62
279 0.53
280 0.57
281 0.55
282 0.56
283 0.57
284 0.55
285 0.53
286 0.57
287 0.57
288 0.49
289 0.44
290 0.35
291 0.25
292 0.21
293 0.19
294 0.14
295 0.12
296 0.1
297 0.09
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.1
302 0.12
303 0.12
304 0.16
305 0.19
306 0.18
307 0.19
308 0.18
309 0.19
310 0.22
311 0.25
312 0.27
313 0.27
314 0.34
315 0.31
316 0.31
317 0.3
318 0.27
319 0.31
320 0.32
321 0.32
322 0.26
323 0.25
324 0.27
325 0.28
326 0.27
327 0.2
328 0.13
329 0.09
330 0.1
331 0.12
332 0.11
333 0.1
334 0.09
335 0.09
336 0.08
337 0.08
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.05
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.11
346 0.13
347 0.13
348 0.14
349 0.15
350 0.18
351 0.19
352 0.2
353 0.17
354 0.15
355 0.15
356 0.2
357 0.2
358 0.17
359 0.16
360 0.15
361 0.16
362 0.15
363 0.15
364 0.12
365 0.12
366 0.13
367 0.16
368 0.21
369 0.24
370 0.25
371 0.26
372 0.25
373 0.25
374 0.24
375 0.24
376 0.19
377 0.15
378 0.16
379 0.14
380 0.14
381 0.13
382 0.12
383 0.11
384 0.14
385 0.16
386 0.16
387 0.17
388 0.18
389 0.22
390 0.26
391 0.23
392 0.2
393 0.2
394 0.21
395 0.2
396 0.22
397 0.19
398 0.18
399 0.25
400 0.32
401 0.38
402 0.46
403 0.52
404 0.52
405 0.54
406 0.6
407 0.6
408 0.55
409 0.49
410 0.39
411 0.33
412 0.3
413 0.28
414 0.23
415 0.17
416 0.14
417 0.18
418 0.2
419 0.24
420 0.25
421 0.26
422 0.31
423 0.31
424 0.34
425 0.33
426 0.32
427 0.33
428 0.34
429 0.36
430 0.28
431 0.27
432 0.24
433 0.2
434 0.18
435 0.13
436 0.11
437 0.1
438 0.12
439 0.11
440 0.1
441 0.1
442 0.12
443 0.14
444 0.14
445 0.11
446 0.09
447 0.1
448 0.09
449 0.09
450 0.07
451 0.05
452 0.04
453 0.04
454 0.04
455 0.04
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.05
460 0.05
461 0.07
462 0.07
463 0.1
464 0.12
465 0.13
466 0.17
467 0.18
468 0.19
469 0.2
470 0.22
471 0.21
472 0.2
473 0.19
474 0.17
475 0.14
476 0.13
477 0.1
478 0.09
479 0.07
480 0.07
481 0.08
482 0.09
483 0.11
484 0.11
485 0.12
486 0.13
487 0.13
488 0.13
489 0.12
490 0.1
491 0.1
492 0.1
493 0.1
494 0.09
495 0.08
496 0.1
497 0.09
498 0.09
499 0.08
500 0.1
501 0.12
502 0.13
503 0.16
504 0.15
505 0.17
506 0.18
507 0.19
508 0.16
509 0.13
510 0.15
511 0.14
512 0.14
513 0.13
514 0.11
515 0.1
516 0.1
517 0.11
518 0.09
519 0.07
520 0.05
521 0.06
522 0.06
523 0.05
524 0.07
525 0.07
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.06
532 0.05
533 0.05
534 0.07
535 0.15
536 0.18
537 0.23
538 0.26
539 0.32
540 0.34
541 0.37
542 0.37
543 0.33
544 0.32
545 0.28
546 0.26
547 0.21
548 0.17
549 0.14
550 0.11
551 0.08
552 0.07
553 0.06
554 0.05
555 0.05
556 0.08
557 0.09
558 0.09
559 0.1
560 0.1
561 0.11
562 0.12
563 0.13
564 0.11
565 0.11
566 0.11
567 0.11
568 0.1
569 0.11
570 0.12
571 0.11
572 0.12
573 0.14
574 0.15
575 0.16
576 0.23
577 0.25
578 0.27
579 0.27
580 0.27
581 0.31
582 0.29
583 0.27
584 0.2
585 0.17
586 0.14
587 0.13
588 0.11
589 0.05
590 0.04
591 0.04
592 0.03
593 0.04
594 0.05
595 0.05
596 0.1
597 0.13
598 0.2
599 0.28
600 0.36
601 0.46
602 0.54
603 0.63
604 0.67
605 0.72
606 0.75
607 0.75
608 0.73
609 0.66
610 0.62
611 0.55
612 0.49
613 0.43
614 0.35
615 0.32
616 0.3
617 0.29
618 0.28
619 0.32
620 0.38
621 0.43
622 0.44
623 0.45
624 0.46
625 0.46
626 0.45
627 0.43
628 0.38
629 0.34
630 0.34
631 0.33
632 0.29
633 0.27
634 0.22
635 0.19
636 0.16
637 0.13
638 0.1
639 0.08
640 0.08
641 0.08
642 0.08
643 0.07
644 0.08
645 0.12
646 0.18
647 0.22
648 0.3
649 0.36
650 0.45
651 0.56
652 0.65
653 0.72
654 0.77
655 0.79
656 0.82
657 0.82
658 0.8
659 0.72
660 0.66
661 0.56
662 0.46
663 0.41
664 0.31
665 0.25
666 0.18
667 0.17
668 0.18
669 0.25
670 0.25
671 0.23
672 0.23
673 0.24
674 0.24
675 0.24
676 0.19
677 0.15
678 0.14
679 0.13
680 0.13
681 0.13
682 0.12
683 0.11
684 0.1
685 0.08
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.09
690 0.1
691 0.1
692 0.11
693 0.1
694 0.09
695 0.12
696 0.13
697 0.13
698 0.13
699 0.13
700 0.13
701 0.15
702 0.18
703 0.15
704 0.16
705 0.18
706 0.23
707 0.27
708 0.27
709 0.33
710 0.34
711 0.35
712 0.35
713 0.37
714 0.36
715 0.38
716 0.44
717 0.42
718 0.47
719 0.46
720 0.52
721 0.52
722 0.56
723 0.57
724 0.56
725 0.52
726 0.44
727 0.43
728 0.37
729 0.35
730 0.28
731 0.24
732 0.22
733 0.21
734 0.28
735 0.35
736 0.45
737 0.49
738 0.54
739 0.58
740 0.61
741 0.66
742 0.67
743 0.7
744 0.69
745 0.67
746 0.67
747 0.62
748 0.56
749 0.53
750 0.42
751 0.33
752 0.25
753 0.23
754 0.16
755 0.15
756 0.14
757 0.15
758 0.16
759 0.17
760 0.18
761 0.19
762 0.21
763 0.22
764 0.22
765 0.21
766 0.22
767 0.22
768 0.25
769 0.24
770 0.23
771 0.24
772 0.24
773 0.22
774 0.19
775 0.21
776 0.18
777 0.19
778 0.2
779 0.25
780 0.24
781 0.29
782 0.33
783 0.32
784 0.29
785 0.3
786 0.31
787 0.25
788 0.26
789 0.22
790 0.2
791 0.18
792 0.16
793 0.13
794 0.09
795 0.11
796 0.1
797 0.1
798 0.1
799 0.11
800 0.12
801 0.13
802 0.18
803 0.18
804 0.21
805 0.21
806 0.21
807 0.21
808 0.22
809 0.22
810 0.21
811 0.2
812 0.17
813 0.19
814 0.2
815 0.22
816 0.24
817 0.26
818 0.24
819 0.26
820 0.25
821 0.25
822 0.25
823 0.28
824 0.26
825 0.23
826 0.2
827 0.17
828 0.17
829 0.15
830 0.17
831 0.12
832 0.1
833 0.09
834 0.09
835 0.1
836 0.15
837 0.14
838 0.1
839 0.11
840 0.11
841 0.12
842 0.14
843 0.14
844 0.09
845 0.1
846 0.11
847 0.12
848 0.12
849 0.12
850 0.1
851 0.1
852 0.11
853 0.1
854 0.09
855 0.09
856 0.09
857 0.09
858 0.09
859 0.09
860 0.09
861 0.11
862 0.11
863 0.1
864 0.1
865 0.1
866 0.14
867 0.15
868 0.14
869 0.14
870 0.17
871 0.19
872 0.24
873 0.28
874 0.25
875 0.33
876 0.38
877 0.47
878 0.54
879 0.6
880 0.6
881 0.63
882 0.7
883 0.69
884 0.69
885 0.66
886 0.56
887 0.53
888 0.55
889 0.53
890 0.49
891 0.48
892 0.51
893 0.54
894 0.63
895 0.69
896 0.71
897 0.76
898 0.83
899 0.86
900 0.88
901 0.89
902 0.9
903 0.89
904 0.86
905 0.81
906 0.81
907 0.74
908 0.69
909 0.67
910 0.59
911 0.52
912 0.48
913 0.44
914 0.37
915 0.39
916 0.36
917 0.29
918 0.3
919 0.28
920 0.27
921 0.27
922 0.26
923 0.2
924 0.2
925 0.19
926 0.15
927 0.15
928 0.16
929 0.16
930 0.16
931 0.23
932 0.29
933 0.34
934 0.36
935 0.42
936 0.49
937 0.51
938 0.59
939 0.58
940 0.6
941 0.61
942 0.68
943 0.71
944 0.71
945 0.74
946 0.72
947 0.75
948 0.77
949 0.81
950 0.81
951 0.79
952 0.8
953 0.81
954 0.79
955 0.8
956 0.78
957 0.79
958 0.76
959 0.71
960 0.67
961 0.6
962 0.6
963 0.6
964 0.57
965 0.55
966 0.59
967 0.63
968 0.65
969 0.71
970 0.7
971 0.66
972 0.66
973 0.64
974 0.61
975 0.54
976 0.47
977 0.4
978 0.35
979 0.29
980 0.25
981 0.21
982 0.16
983 0.16
984 0.16
985 0.2
986 0.2
987 0.22
988 0.25
989 0.25
990 0.24
991 0.23
992 0.24
993 0.25
994 0.29
995 0.34
996 0.32
997 0.31
998 0.32
999 0.34
1000 0.4