Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RKQ5

Protein Details
Accession I1RKQ5    Localization Confidence High Confidence Score 21
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
5-30DHAAAKAEKKARKEKKRAREEDAAVEBasic
46-73VATEDLKADKKKKKSKKDKHADDTTAPQHydrophilic
78-104VAADEAKPEKKHKKKKHHDAEVAAPTEBasic
108-134AEAPVDGEKKKRKNKKNKDTEDSDNDDAcidic
400-424ETAKMRQGKKGVQRGRRRHIPEFAMHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
10-39KAEKKARKEKKRAREEDAAVETDRKHKKSK
52-64KADKKKKKSKKDK
84-94KPEKKHKKKKH
115-125EKKKRKNKKNK
406-417QGKKGVQRGRRR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041901  RNAP_I_Rpa43_N  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG fgr:FGSG_04470  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
CDD cd04328  RNAP_I_Rpa43_N  
Amino Acid Sequences MAPIDHAAAKAEKKARKEKKRAREEDAAVETDRKHKKSKSVVAADVATEDLKADKKKKKSKKDKHADDTTAPQESDDVAADEAKPEKKHKKKKHHDAEVAAPTEEAEAEAPVDGEKKKRKNKKNKDTEDSDNDDKQKQSEDAAPSDADAMDIDMPPPAKPSKSSDNIYQPPDIPANPQFPFFTQTVSLYEPLFPIGWAQPVTNCQFQHLQHLQNKYVPSLRGVLLDYRNVAFGENPGRHGAATDDEMPATVMAKGEAAVGWGWITAEVDLFVPSRGAWMEGSVNLQTEGHIGVVCFGKFNASIEARRLPPDWKWVPNESPEAQGFEETASVITADDHGVVRQIHSTGFWADGSGDKVKGKIRFRIRNFDVGTSGEISYLSLEGTMLDRAGEKAVVAEEAETAKMRQGKKGVQRGRRRHIPEFAMTRFADEQEQTQDNEEEKREVLALPEDQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.64
3 0.7
4 0.8
5 0.83
6 0.85
7 0.92
8 0.91
9 0.89
10 0.88
11 0.81
12 0.79
13 0.73
14 0.65
15 0.55
16 0.5
17 0.43
18 0.42
19 0.46
20 0.41
21 0.44
22 0.47
23 0.55
24 0.62
25 0.71
26 0.72
27 0.72
28 0.72
29 0.68
30 0.64
31 0.54
32 0.44
33 0.35
34 0.24
35 0.16
36 0.12
37 0.1
38 0.14
39 0.21
40 0.29
41 0.36
42 0.47
43 0.58
44 0.68
45 0.78
46 0.84
47 0.89
48 0.91
49 0.94
50 0.95
51 0.94
52 0.93
53 0.88
54 0.81
55 0.77
56 0.7
57 0.62
58 0.51
59 0.41
60 0.31
61 0.26
62 0.22
63 0.15
64 0.12
65 0.09
66 0.1
67 0.1
68 0.11
69 0.15
70 0.18
71 0.2
72 0.28
73 0.38
74 0.48
75 0.59
76 0.68
77 0.76
78 0.83
79 0.91
80 0.94
81 0.94
82 0.92
83 0.86
84 0.85
85 0.81
86 0.71
87 0.6
88 0.48
89 0.37
90 0.29
91 0.23
92 0.14
93 0.07
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.05
98 0.05
99 0.08
100 0.09
101 0.17
102 0.25
103 0.35
104 0.45
105 0.55
106 0.66
107 0.75
108 0.85
109 0.89
110 0.92
111 0.92
112 0.91
113 0.87
114 0.84
115 0.81
116 0.76
117 0.7
118 0.63
119 0.55
120 0.5
121 0.43
122 0.36
123 0.31
124 0.25
125 0.23
126 0.24
127 0.25
128 0.23
129 0.24
130 0.23
131 0.2
132 0.2
133 0.17
134 0.11
135 0.08
136 0.07
137 0.06
138 0.06
139 0.06
140 0.07
141 0.07
142 0.07
143 0.1
144 0.11
145 0.11
146 0.13
147 0.18
148 0.26
149 0.31
150 0.34
151 0.38
152 0.46
153 0.5
154 0.51
155 0.47
156 0.39
157 0.36
158 0.34
159 0.28
160 0.22
161 0.21
162 0.23
163 0.22
164 0.22
165 0.21
166 0.2
167 0.23
168 0.19
169 0.17
170 0.13
171 0.14
172 0.14
173 0.15
174 0.15
175 0.13
176 0.13
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.08
184 0.09
185 0.09
186 0.09
187 0.12
188 0.15
189 0.18
190 0.17
191 0.18
192 0.21
193 0.21
194 0.29
195 0.3
196 0.33
197 0.34
198 0.38
199 0.37
200 0.36
201 0.36
202 0.29
203 0.28
204 0.22
205 0.19
206 0.18
207 0.17
208 0.15
209 0.15
210 0.17
211 0.15
212 0.15
213 0.14
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.1
218 0.07
219 0.08
220 0.13
221 0.13
222 0.14
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.14
227 0.13
228 0.08
229 0.1
230 0.1
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.08
236 0.07
237 0.06
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.04
250 0.04
251 0.04
252 0.03
253 0.03
254 0.04
255 0.04
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.06
262 0.06
263 0.06
264 0.05
265 0.06
266 0.07
267 0.08
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.07
275 0.07
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.07
280 0.08
281 0.08
282 0.08
283 0.07
284 0.08
285 0.08
286 0.1
287 0.13
288 0.14
289 0.15
290 0.19
291 0.23
292 0.23
293 0.25
294 0.26
295 0.23
296 0.23
297 0.32
298 0.33
299 0.34
300 0.38
301 0.4
302 0.42
303 0.44
304 0.47
305 0.38
306 0.38
307 0.33
308 0.31
309 0.26
310 0.23
311 0.19
312 0.14
313 0.13
314 0.09
315 0.08
316 0.05
317 0.05
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.06
323 0.06
324 0.06
325 0.09
326 0.09
327 0.1
328 0.11
329 0.11
330 0.1
331 0.11
332 0.12
333 0.1
334 0.12
335 0.11
336 0.1
337 0.09
338 0.11
339 0.14
340 0.14
341 0.15
342 0.15
343 0.18
344 0.23
345 0.3
346 0.33
347 0.39
348 0.47
349 0.55
350 0.61
351 0.69
352 0.68
353 0.7
354 0.67
355 0.6
356 0.52
357 0.43
358 0.39
359 0.31
360 0.27
361 0.17
362 0.15
363 0.13
364 0.11
365 0.1
366 0.08
367 0.05
368 0.05
369 0.05
370 0.07
371 0.07
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.07
379 0.08
380 0.09
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.09
386 0.1
387 0.1
388 0.1
389 0.14
390 0.2
391 0.21
392 0.25
393 0.31
394 0.39
395 0.48
396 0.58
397 0.64
398 0.68
399 0.78
400 0.82
401 0.86
402 0.88
403 0.85
404 0.82
405 0.82
406 0.77
407 0.76
408 0.73
409 0.65
410 0.61
411 0.53
412 0.5
413 0.43
414 0.38
415 0.33
416 0.26
417 0.27
418 0.27
419 0.29
420 0.26
421 0.28
422 0.29
423 0.28
424 0.32
425 0.31
426 0.27
427 0.25
428 0.25
429 0.23
430 0.21
431 0.21