Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RC16

Protein Details
Accession I1RC16    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
360-379AVNPRKRKGTGIFHKPKRRABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
274-289RPSSSAPRRPAPGPSK
363-379PRKRKGTGIFHKPKRRA
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 10, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010684  RNA_pol_II_trans_fac_SIII_A  
Gene Ontology GO:0070449  C:elongin complex  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
KEGG fgr:FGSG_01117  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06881  Elongin_A  
Amino Acid Sequences MPVKSLAELAIAACIKNIRSVDSVGDFLLYKTVRTLLLKIDNPKLLRKIEINSPQIQGETGEVWLKLIKQHFPMELKQKAFKPPDPTQWYRVYDKYKAAHQKALDESEAKLRNDLLGLQQAKHKTTIIEDRRLLPQGGRVGTKKPWGAPRDSNGSTLAFTRGSRTKTNNGASVMRKVRRETKEIASIHGKLSRPTQASNAITKLRKAPIAMVNDYQRASQPAIRAPSKPTPSDVVAAHEERAQYISDLDSDDDNGGGDDLFDDDPSPPRKVASRPSSSAPRRPAPGPSKPATNVKRSGLLSNSYKGPQPKAATTPSQPRASRPVKQEKRSLSPEQTVLSSSPEPGPSSSPPAPVARPFSAVNPRKRKGTGIFHKPKRRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.14
3 0.19
4 0.19
5 0.18
6 0.2
7 0.22
8 0.24
9 0.25
10 0.26
11 0.21
12 0.21
13 0.18
14 0.15
15 0.2
16 0.16
17 0.14
18 0.14
19 0.16
20 0.18
21 0.2
22 0.21
23 0.23
24 0.31
25 0.36
26 0.41
27 0.45
28 0.48
29 0.48
30 0.53
31 0.51
32 0.45
33 0.44
34 0.42
35 0.4
36 0.44
37 0.51
38 0.49
39 0.48
40 0.47
41 0.44
42 0.4
43 0.36
44 0.27
45 0.19
46 0.15
47 0.12
48 0.12
49 0.11
50 0.11
51 0.12
52 0.12
53 0.15
54 0.18
55 0.21
56 0.23
57 0.27
58 0.31
59 0.34
60 0.4
61 0.44
62 0.48
63 0.47
64 0.49
65 0.5
66 0.54
67 0.56
68 0.55
69 0.55
70 0.55
71 0.62
72 0.64
73 0.65
74 0.61
75 0.63
76 0.62
77 0.58
78 0.58
79 0.53
80 0.49
81 0.51
82 0.48
83 0.49
84 0.55
85 0.54
86 0.52
87 0.47
88 0.49
89 0.46
90 0.46
91 0.39
92 0.3
93 0.28
94 0.31
95 0.35
96 0.29
97 0.26
98 0.23
99 0.22
100 0.21
101 0.2
102 0.14
103 0.17
104 0.18
105 0.18
106 0.22
107 0.24
108 0.25
109 0.26
110 0.24
111 0.17
112 0.2
113 0.3
114 0.31
115 0.36
116 0.37
117 0.38
118 0.4
119 0.41
120 0.38
121 0.28
122 0.26
123 0.24
124 0.24
125 0.25
126 0.23
127 0.24
128 0.26
129 0.31
130 0.28
131 0.27
132 0.33
133 0.33
134 0.38
135 0.39
136 0.41
137 0.44
138 0.43
139 0.4
140 0.34
141 0.31
142 0.26
143 0.22
144 0.19
145 0.12
146 0.11
147 0.14
148 0.17
149 0.2
150 0.24
151 0.27
152 0.31
153 0.37
154 0.4
155 0.39
156 0.37
157 0.39
158 0.36
159 0.4
160 0.4
161 0.37
162 0.37
163 0.36
164 0.43
165 0.42
166 0.45
167 0.42
168 0.4
169 0.45
170 0.43
171 0.43
172 0.37
173 0.34
174 0.31
175 0.31
176 0.26
177 0.19
178 0.21
179 0.23
180 0.21
181 0.21
182 0.22
183 0.24
184 0.26
185 0.27
186 0.27
187 0.27
188 0.26
189 0.27
190 0.28
191 0.24
192 0.23
193 0.21
194 0.23
195 0.23
196 0.27
197 0.28
198 0.27
199 0.27
200 0.28
201 0.28
202 0.24
203 0.19
204 0.16
205 0.16
206 0.15
207 0.15
208 0.17
209 0.22
210 0.24
211 0.24
212 0.28
213 0.34
214 0.35
215 0.34
216 0.32
217 0.3
218 0.3
219 0.31
220 0.27
221 0.23
222 0.22
223 0.22
224 0.21
225 0.19
226 0.18
227 0.15
228 0.15
229 0.12
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.04
244 0.04
245 0.03
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.06
250 0.07
251 0.12
252 0.16
253 0.17
254 0.16
255 0.17
256 0.21
257 0.26
258 0.35
259 0.39
260 0.42
261 0.44
262 0.49
263 0.58
264 0.6
265 0.63
266 0.6
267 0.56
268 0.53
269 0.52
270 0.56
271 0.53
272 0.56
273 0.56
274 0.52
275 0.53
276 0.52
277 0.6
278 0.56
279 0.55
280 0.52
281 0.47
282 0.51
283 0.46
284 0.47
285 0.4
286 0.41
287 0.37
288 0.35
289 0.36
290 0.31
291 0.33
292 0.33
293 0.34
294 0.35
295 0.35
296 0.36
297 0.38
298 0.42
299 0.43
300 0.46
301 0.52
302 0.52
303 0.56
304 0.53
305 0.52
306 0.57
307 0.58
308 0.59
309 0.59
310 0.64
311 0.66
312 0.72
313 0.76
314 0.74
315 0.76
316 0.76
317 0.74
318 0.69
319 0.65
320 0.61
321 0.54
322 0.47
323 0.41
324 0.34
325 0.31
326 0.25
327 0.22
328 0.21
329 0.22
330 0.22
331 0.22
332 0.25
333 0.23
334 0.31
335 0.31
336 0.31
337 0.32
338 0.35
339 0.37
340 0.38
341 0.42
342 0.36
343 0.37
344 0.35
345 0.39
346 0.46
347 0.51
348 0.56
349 0.6
350 0.62
351 0.65
352 0.66
353 0.67
354 0.65
355 0.68
356 0.68
357 0.69
358 0.76
359 0.79