Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RB87

Protein Details
Accession I1RB87    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
512-531QEKADRRREEIKKDLEKKVABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
421-436PLAKKRGLGRIGGAKS
505-541PKARETSQEKADRRREEIKKDLEKKVAAGPAKKKRRF
Subcellular Location(s) nucl 14.5, mito 9, cyto_nucl 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015381  XLF_N  
IPR038051  XRCC4-like_N_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006302  P:double-strand break repair  
KEGG fgr:FGSG_00796  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09302  XLF  
CDD cd22285  HD_XLF_N  
Amino Acid Sequences MSLNKSWRPLPLQPSPDLPVLLVSFHTETSAYTIHITDMANMWTESLDRKQISMRGWNENTSIDPSETQDNMAKFLASISTALDSSQPGHYETSLCLDHDDRSEAGEDDLVLRITCEIPELQPLQWPMYLKKLPAINIATNLVLPLIQTHHAKDLEIASLIQSLGQKDAVLTRLLDKLEAMGTGMEHIFNALSGKKKVSRAVAAEKVPGLAPFDRRRWKADLLYKQDSPNNPQSLVESVFENGGLEFEPMSNSTESPQLDQWWQNFEGVSSVAYQQQHKAAVADSSLIPKGAGIIPVEDGDDDFQVQSTPPHLTSKRKSIDAKETLAADDASTEGESAGSVSPVRNAQRVDKPTRRLGALGKKKQSTPPPSPGPVLSQRRSDSKNQQQDDSETASEAEEDDAVVSPPAKDPTPSSVSPARPLAKKRGLGRIGGAKSKLPVEKSSALDEPEVIEISESSTAAVSHRPPRKLGIIGRQTTKVDESTPNSDERGQRGRSAVKEATPEPKARETSQEKADRRREEIKKDLEKKVAAGPAKKKRRF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.57
2 0.55
3 0.5
4 0.43
5 0.35
6 0.28
7 0.23
8 0.21
9 0.17
10 0.16
11 0.15
12 0.14
13 0.15
14 0.12
15 0.12
16 0.15
17 0.15
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.16
23 0.16
24 0.13
25 0.14
26 0.14
27 0.15
28 0.14
29 0.14
30 0.11
31 0.12
32 0.14
33 0.16
34 0.22
35 0.21
36 0.22
37 0.27
38 0.31
39 0.35
40 0.4
41 0.42
42 0.45
43 0.47
44 0.48
45 0.45
46 0.42
47 0.39
48 0.35
49 0.32
50 0.23
51 0.22
52 0.22
53 0.25
54 0.24
55 0.24
56 0.25
57 0.23
58 0.24
59 0.23
60 0.21
61 0.15
62 0.16
63 0.14
64 0.1
65 0.1
66 0.08
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.1
71 0.1
72 0.11
73 0.14
74 0.14
75 0.14
76 0.15
77 0.16
78 0.16
79 0.16
80 0.18
81 0.17
82 0.16
83 0.17
84 0.17
85 0.18
86 0.18
87 0.2
88 0.16
89 0.16
90 0.17
91 0.16
92 0.15
93 0.13
94 0.11
95 0.1
96 0.11
97 0.1
98 0.08
99 0.07
100 0.08
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.08
105 0.09
106 0.14
107 0.16
108 0.15
109 0.18
110 0.2
111 0.2
112 0.21
113 0.22
114 0.19
115 0.26
116 0.28
117 0.25
118 0.28
119 0.29
120 0.29
121 0.33
122 0.36
123 0.28
124 0.29
125 0.3
126 0.25
127 0.22
128 0.2
129 0.13
130 0.09
131 0.07
132 0.06
133 0.07
134 0.1
135 0.11
136 0.13
137 0.18
138 0.18
139 0.18
140 0.19
141 0.18
142 0.16
143 0.15
144 0.14
145 0.09
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.1
150 0.09
151 0.1
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.11
156 0.1
157 0.1
158 0.1
159 0.11
160 0.14
161 0.14
162 0.14
163 0.12
164 0.11
165 0.11
166 0.1
167 0.08
168 0.05
169 0.05
170 0.06
171 0.06
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.04
176 0.04
177 0.06
178 0.07
179 0.1
180 0.12
181 0.15
182 0.19
183 0.22
184 0.26
185 0.29
186 0.31
187 0.33
188 0.39
189 0.42
190 0.38
191 0.37
192 0.33
193 0.29
194 0.25
195 0.2
196 0.16
197 0.12
198 0.17
199 0.21
200 0.28
201 0.35
202 0.37
203 0.41
204 0.43
205 0.45
206 0.47
207 0.51
208 0.53
209 0.53
210 0.56
211 0.54
212 0.52
213 0.52
214 0.46
215 0.43
216 0.41
217 0.35
218 0.31
219 0.29
220 0.27
221 0.26
222 0.25
223 0.2
224 0.13
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.09
229 0.06
230 0.05
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.08
241 0.11
242 0.11
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.15
247 0.17
248 0.17
249 0.18
250 0.18
251 0.17
252 0.16
253 0.14
254 0.13
255 0.1
256 0.09
257 0.06
258 0.07
259 0.09
260 0.1
261 0.11
262 0.11
263 0.13
264 0.14
265 0.13
266 0.13
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.09
271 0.07
272 0.08
273 0.08
274 0.08
275 0.07
276 0.06
277 0.07
278 0.07
279 0.08
280 0.06
281 0.07
282 0.07
283 0.08
284 0.08
285 0.06
286 0.06
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.04
291 0.04
292 0.04
293 0.05
294 0.05
295 0.06
296 0.07
297 0.08
298 0.14
299 0.17
300 0.25
301 0.29
302 0.38
303 0.4
304 0.44
305 0.47
306 0.47
307 0.54
308 0.5
309 0.49
310 0.41
311 0.38
312 0.33
313 0.3
314 0.24
315 0.14
316 0.1
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.04
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.04
327 0.05
328 0.05
329 0.07
330 0.1
331 0.12
332 0.15
333 0.16
334 0.22
335 0.29
336 0.36
337 0.44
338 0.48
339 0.51
340 0.54
341 0.55
342 0.5
343 0.45
344 0.45
345 0.47
346 0.5
347 0.54
348 0.55
349 0.55
350 0.56
351 0.61
352 0.63
353 0.6
354 0.57
355 0.58
356 0.57
357 0.57
358 0.56
359 0.51
360 0.47
361 0.48
362 0.49
363 0.43
364 0.42
365 0.42
366 0.46
367 0.49
368 0.52
369 0.53
370 0.55
371 0.62
372 0.58
373 0.59
374 0.55
375 0.54
376 0.5
377 0.43
378 0.33
379 0.23
380 0.21
381 0.18
382 0.16
383 0.13
384 0.1
385 0.06
386 0.05
387 0.05
388 0.05
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.08
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.13
398 0.2
399 0.25
400 0.25
401 0.28
402 0.33
403 0.34
404 0.37
405 0.41
406 0.4
407 0.4
408 0.44
409 0.49
410 0.5
411 0.54
412 0.55
413 0.59
414 0.56
415 0.52
416 0.53
417 0.52
418 0.48
419 0.47
420 0.43
421 0.34
422 0.33
423 0.37
424 0.36
425 0.29
426 0.28
427 0.3
428 0.35
429 0.36
430 0.38
431 0.36
432 0.33
433 0.31
434 0.28
435 0.23
436 0.18
437 0.16
438 0.12
439 0.1
440 0.08
441 0.09
442 0.1
443 0.08
444 0.07
445 0.07
446 0.07
447 0.08
448 0.12
449 0.16
450 0.24
451 0.32
452 0.34
453 0.36
454 0.4
455 0.45
456 0.49
457 0.51
458 0.52
459 0.54
460 0.58
461 0.6
462 0.59
463 0.55
464 0.5
465 0.45
466 0.36
467 0.3
468 0.31
469 0.32
470 0.35
471 0.36
472 0.35
473 0.34
474 0.38
475 0.38
476 0.39
477 0.42
478 0.38
479 0.39
480 0.43
481 0.48
482 0.46
483 0.5
484 0.46
485 0.42
486 0.45
487 0.44
488 0.47
489 0.45
490 0.46
491 0.44
492 0.47
493 0.48
494 0.44
495 0.51
496 0.5
497 0.53
498 0.58
499 0.63
500 0.62
501 0.68
502 0.75
503 0.71
504 0.71
505 0.74
506 0.73
507 0.72
508 0.76
509 0.76
510 0.77
511 0.8
512 0.81
513 0.78
514 0.71
515 0.64
516 0.62
517 0.59
518 0.54
519 0.54
520 0.57
521 0.61