Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C3YIJ2

Protein Details
Accession A0A1C3YIJ2    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
36-58SPSPSMSAKKPPPSAKQPPHSASHydrophilic
373-394MSHPKHSQPPPQPKTRKRTRAEBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24, mito 1.5, cyto_mito 1.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MAPVGPIVQQNVAHKVKRPIPPGIQTNGAMISSKSSPSPSMSAKKPPPSAKQPPHSASDRAITASSVRPINRARRETASQMQGRHSRNSAGLRSASMVADQIAHDAEPRPYVVTDTYILNKFAGQPPSLIIHLHPTHFRFDNQDGMFSYKSPMKIFLEHVKARTVPHDLLPYLNEGGVSFYDGCLIVQIHDHKSLAEAKDVAKPKSAKGSAVLSSIHNYNQWLTPSPNVPFPQENSSTVDGKAKVGNTVEKEHSPMPPPEDQKEKSKKPLVFTVVLHQTPESLHMDLLIKASTPQGTSDMSGQPPSTPMSLIPPTPTAANMPPPAKRQKREKTELDGSNIHEAEGQILLATNAPLVLSPTRTIEENIILLEAMSHPKHSQPPPQPKTRKRTRAEMAADEAQAADTERFMLVADPRAASSANGAQNGGTADVDASTGASTFEPRFERFKVIDEIIAKHTERKEQEKAKQQEADRKLQQQRAQVQQEASQSALKMAQEDRNRNEAAAAAAREKSMRQAEQQRQAQAQAQAQAQAQQARVQAAAQATQANQNAQRLNVNQQHAHPQNNAITNGANSASAGTPQLANNMPPQAQPRFQAQISQPPASSPVARQGTPQHMSSPMVGSVPMQQTNSGMANSPPRPSSVVQNPAAMAVPMAHAMSSRGSQHSHPSGTPRMPHTTPNMTQGTPINRPTMIGTPRMTQVSPPPAMMAQNSQPGQGIMMNNQGMNQQNPHFAQQLAQQRALQQQQQQQQLAAMQNSINNGNMSQMSPQQQQQMMQMMQRQLIAQQQAQQQGNMMSPQQQQQQQQMAAQYAQQMQNMSGNQMRQFPPQMQAQLQQMMRLNQMNGQMGNSPMQRQASEQMMNGNNINMQTYQAMQQAQQQQAQQQQAQQQQQQQQSQHQMGQMGQMGQMGQGTVQAQVQQHARIVYQKMVAHAITKHGSVDKIPPDLMLKIKTASMNQATSAVQQNLQRRQQAQQQQQQQMIMHQQQQHQQQMQQMQQQQQQQMQQQQLQQQIQQQQQIQQQHLQQQQMQGMNGMMGGQGM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.48
3 0.53
4 0.59
5 0.6
6 0.6
7 0.62
8 0.68
9 0.69
10 0.64
11 0.6
12 0.53
13 0.49
14 0.42
15 0.34
16 0.26
17 0.2
18 0.19
19 0.16
20 0.17
21 0.17
22 0.18
23 0.19
24 0.22
25 0.28
26 0.32
27 0.38
28 0.42
29 0.51
30 0.57
31 0.64
32 0.69
33 0.72
34 0.73
35 0.75
36 0.81
37 0.81
38 0.82
39 0.83
40 0.78
41 0.76
42 0.72
43 0.65
44 0.57
45 0.52
46 0.44
47 0.36
48 0.33
49 0.27
50 0.25
51 0.26
52 0.27
53 0.27
54 0.26
55 0.3
56 0.37
57 0.47
58 0.54
59 0.55
60 0.55
61 0.57
62 0.62
63 0.64
64 0.65
65 0.64
66 0.59
67 0.57
68 0.6
69 0.61
70 0.59
71 0.57
72 0.51
73 0.45
74 0.46
75 0.5
76 0.45
77 0.42
78 0.4
79 0.36
80 0.36
81 0.34
82 0.28
83 0.21
84 0.18
85 0.13
86 0.13
87 0.12
88 0.11
89 0.09
90 0.09
91 0.1
92 0.12
93 0.13
94 0.13
95 0.14
96 0.15
97 0.14
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.23
104 0.23
105 0.24
106 0.22
107 0.22
108 0.23
109 0.28
110 0.29
111 0.24
112 0.22
113 0.24
114 0.26
115 0.26
116 0.23
117 0.17
118 0.22
119 0.23
120 0.25
121 0.28
122 0.27
123 0.32
124 0.34
125 0.34
126 0.32
127 0.32
128 0.39
129 0.34
130 0.36
131 0.32
132 0.34
133 0.33
134 0.27
135 0.28
136 0.23
137 0.25
138 0.23
139 0.26
140 0.25
141 0.28
142 0.32
143 0.38
144 0.43
145 0.43
146 0.44
147 0.43
148 0.41
149 0.4
150 0.38
151 0.35
152 0.28
153 0.28
154 0.31
155 0.28
156 0.28
157 0.27
158 0.27
159 0.22
160 0.2
161 0.16
162 0.11
163 0.13
164 0.11
165 0.12
166 0.09
167 0.09
168 0.1
169 0.1
170 0.09
171 0.09
172 0.09
173 0.07
174 0.12
175 0.16
176 0.18
177 0.2
178 0.2
179 0.19
180 0.21
181 0.27
182 0.23
183 0.23
184 0.21
185 0.21
186 0.29
187 0.34
188 0.32
189 0.33
190 0.33
191 0.33
192 0.41
193 0.41
194 0.34
195 0.33
196 0.37
197 0.31
198 0.32
199 0.31
200 0.22
201 0.23
202 0.23
203 0.21
204 0.17
205 0.16
206 0.16
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.2
211 0.22
212 0.25
213 0.26
214 0.3
215 0.29
216 0.31
217 0.3
218 0.31
219 0.34
220 0.33
221 0.33
222 0.32
223 0.33
224 0.31
225 0.29
226 0.31
227 0.25
228 0.24
229 0.25
230 0.21
231 0.2
232 0.21
233 0.25
234 0.23
235 0.27
236 0.29
237 0.27
238 0.3
239 0.29
240 0.3
241 0.3
242 0.29
243 0.29
244 0.33
245 0.35
246 0.37
247 0.43
248 0.43
249 0.49
250 0.56
251 0.57
252 0.6
253 0.64
254 0.63
255 0.59
256 0.64
257 0.59
258 0.53
259 0.48
260 0.47
261 0.45
262 0.42
263 0.38
264 0.3
265 0.25
266 0.21
267 0.23
268 0.18
269 0.12
270 0.11
271 0.13
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.11
276 0.09
277 0.09
278 0.11
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.1
283 0.11
284 0.12
285 0.15
286 0.16
287 0.16
288 0.17
289 0.17
290 0.15
291 0.15
292 0.16
293 0.13
294 0.11
295 0.1
296 0.14
297 0.16
298 0.16
299 0.17
300 0.16
301 0.17
302 0.16
303 0.17
304 0.14
305 0.14
306 0.18
307 0.21
308 0.22
309 0.25
310 0.3
311 0.4
312 0.45
313 0.51
314 0.57
315 0.62
316 0.7
317 0.75
318 0.75
319 0.74
320 0.75
321 0.72
322 0.66
323 0.58
324 0.5
325 0.47
326 0.41
327 0.32
328 0.24
329 0.2
330 0.16
331 0.13
332 0.11
333 0.05
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.05
338 0.04
339 0.03
340 0.03
341 0.03
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.1
347 0.11
348 0.12
349 0.13
350 0.12
351 0.13
352 0.12
353 0.11
354 0.09
355 0.08
356 0.07
357 0.07
358 0.06
359 0.08
360 0.08
361 0.09
362 0.09
363 0.12
364 0.2
365 0.23
366 0.31
367 0.38
368 0.5
369 0.55
370 0.65
371 0.72
372 0.74
373 0.81
374 0.82
375 0.83
376 0.76
377 0.79
378 0.74
379 0.73
380 0.69
381 0.62
382 0.56
383 0.48
384 0.44
385 0.34
386 0.28
387 0.18
388 0.14
389 0.12
390 0.07
391 0.04
392 0.05
393 0.05
394 0.05
395 0.05
396 0.06
397 0.06
398 0.1
399 0.11
400 0.1
401 0.11
402 0.11
403 0.11
404 0.1
405 0.11
406 0.13
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.13
411 0.14
412 0.14
413 0.13
414 0.07
415 0.05
416 0.05
417 0.05
418 0.05
419 0.04
420 0.04
421 0.03
422 0.03
423 0.04
424 0.04
425 0.06
426 0.06
427 0.09
428 0.12
429 0.14
430 0.17
431 0.18
432 0.22
433 0.21
434 0.25
435 0.25
436 0.23
437 0.24
438 0.22
439 0.23
440 0.21
441 0.22
442 0.19
443 0.19
444 0.2
445 0.23
446 0.25
447 0.29
448 0.35
449 0.4
450 0.47
451 0.54
452 0.57
453 0.57
454 0.59
455 0.55
456 0.57
457 0.54
458 0.54
459 0.47
460 0.51
461 0.52
462 0.52
463 0.53
464 0.51
465 0.52
466 0.53
467 0.52
468 0.46
469 0.41
470 0.39
471 0.37
472 0.3
473 0.25
474 0.18
475 0.14
476 0.13
477 0.13
478 0.09
479 0.09
480 0.1
481 0.16
482 0.2
483 0.25
484 0.27
485 0.3
486 0.3
487 0.29
488 0.27
489 0.21
490 0.17
491 0.15
492 0.12
493 0.09
494 0.1
495 0.1
496 0.1
497 0.1
498 0.13
499 0.14
500 0.14
501 0.18
502 0.27
503 0.34
504 0.42
505 0.46
506 0.44
507 0.42
508 0.42
509 0.4
510 0.33
511 0.28
512 0.23
513 0.2
514 0.19
515 0.19
516 0.21
517 0.19
518 0.18
519 0.17
520 0.16
521 0.16
522 0.15
523 0.15
524 0.11
525 0.12
526 0.1
527 0.11
528 0.08
529 0.09
530 0.08
531 0.12
532 0.12
533 0.12
534 0.13
535 0.15
536 0.15
537 0.14
538 0.17
539 0.14
540 0.21
541 0.25
542 0.26
543 0.25
544 0.25
545 0.34
546 0.34
547 0.35
548 0.29
549 0.26
550 0.27
551 0.29
552 0.28
553 0.2
554 0.17
555 0.15
556 0.15
557 0.13
558 0.09
559 0.06
560 0.06
561 0.06
562 0.06
563 0.06
564 0.05
565 0.06
566 0.06
567 0.09
568 0.09
569 0.09
570 0.11
571 0.12
572 0.13
573 0.13
574 0.17
575 0.17
576 0.19
577 0.2
578 0.22
579 0.24
580 0.23
581 0.27
582 0.25
583 0.31
584 0.33
585 0.33
586 0.29
587 0.25
588 0.28
589 0.24
590 0.23
591 0.15
592 0.19
593 0.2
594 0.2
595 0.22
596 0.24
597 0.29
598 0.31
599 0.31
600 0.24
601 0.23
602 0.24
603 0.23
604 0.2
605 0.13
606 0.11
607 0.1
608 0.09
609 0.13
610 0.14
611 0.14
612 0.13
613 0.13
614 0.13
615 0.15
616 0.16
617 0.11
618 0.09
619 0.09
620 0.16
621 0.17
622 0.18
623 0.17
624 0.17
625 0.2
626 0.2
627 0.26
628 0.27
629 0.33
630 0.33
631 0.33
632 0.32
633 0.3
634 0.29
635 0.21
636 0.14
637 0.07
638 0.06
639 0.05
640 0.05
641 0.04
642 0.04
643 0.05
644 0.06
645 0.07
646 0.09
647 0.1
648 0.12
649 0.13
650 0.19
651 0.23
652 0.23
653 0.23
654 0.27
655 0.3
656 0.31
657 0.34
658 0.31
659 0.33
660 0.32
661 0.35
662 0.35
663 0.37
664 0.36
665 0.39
666 0.38
667 0.32
668 0.33
669 0.34
670 0.33
671 0.3
672 0.31
673 0.26
674 0.23
675 0.24
676 0.24
677 0.27
678 0.23
679 0.23
680 0.23
681 0.23
682 0.26
683 0.27
684 0.24
685 0.19
686 0.23
687 0.26
688 0.25
689 0.23
690 0.22
691 0.21
692 0.21
693 0.21
694 0.18
695 0.14
696 0.19
697 0.2
698 0.19
699 0.18
700 0.18
701 0.17
702 0.17
703 0.15
704 0.1
705 0.14
706 0.15
707 0.14
708 0.15
709 0.17
710 0.15
711 0.16
712 0.18
713 0.15
714 0.19
715 0.2
716 0.23
717 0.22
718 0.2
719 0.2
720 0.24
721 0.32
722 0.31
723 0.31
724 0.29
725 0.3
726 0.36
727 0.38
728 0.35
729 0.32
730 0.36
731 0.42
732 0.47
733 0.45
734 0.39
735 0.37
736 0.36
737 0.33
738 0.26
739 0.2
740 0.15
741 0.15
742 0.16
743 0.16
744 0.13
745 0.11
746 0.1
747 0.11
748 0.11
749 0.1
750 0.11
751 0.14
752 0.18
753 0.2
754 0.23
755 0.26
756 0.27
757 0.28
758 0.29
759 0.31
760 0.28
761 0.27
762 0.3
763 0.26
764 0.26
765 0.25
766 0.22
767 0.17
768 0.2
769 0.21
770 0.18
771 0.22
772 0.26
773 0.32
774 0.33
775 0.31
776 0.29
777 0.27
778 0.27
779 0.22
780 0.18
781 0.16
782 0.18
783 0.23
784 0.27
785 0.31
786 0.34
787 0.39
788 0.44
789 0.4
790 0.39
791 0.37
792 0.33
793 0.28
794 0.25
795 0.23
796 0.21
797 0.22
798 0.21
799 0.2
800 0.19
801 0.23
802 0.22
803 0.21
804 0.19
805 0.19
806 0.2
807 0.26
808 0.27
809 0.27
810 0.3
811 0.29
812 0.31
813 0.33
814 0.35
815 0.31
816 0.33
817 0.32
818 0.36
819 0.33
820 0.33
821 0.32
822 0.3
823 0.31
824 0.29
825 0.26
826 0.23
827 0.27
828 0.26
829 0.23
830 0.22
831 0.2
832 0.19
833 0.23
834 0.2
835 0.18
836 0.19
837 0.21
838 0.2
839 0.21
840 0.23
841 0.25
842 0.25
843 0.24
844 0.28
845 0.29
846 0.3
847 0.28
848 0.25
849 0.21
850 0.19
851 0.2
852 0.13
853 0.12
854 0.11
855 0.12
856 0.14
857 0.16
858 0.16
859 0.16
860 0.23
861 0.29
862 0.32
863 0.34
864 0.33
865 0.34
866 0.4
867 0.44
868 0.39
869 0.36
870 0.4
871 0.45
872 0.5
873 0.5
874 0.51
875 0.54
876 0.59
877 0.61
878 0.57
879 0.57
880 0.59
881 0.57
882 0.52
883 0.47
884 0.41
885 0.35
886 0.35
887 0.3
888 0.23
889 0.2
890 0.17
891 0.15
892 0.13
893 0.13
894 0.09
895 0.06
896 0.07
897 0.08
898 0.08
899 0.09
900 0.12
901 0.12
902 0.17
903 0.19
904 0.19
905 0.21
906 0.21
907 0.22
908 0.24
909 0.26
910 0.26
911 0.29
912 0.28
913 0.28
914 0.3
915 0.29
916 0.27
917 0.25
918 0.27
919 0.24
920 0.23
921 0.23
922 0.22
923 0.23
924 0.22
925 0.28
926 0.27
927 0.28
928 0.28
929 0.27
930 0.27
931 0.29
932 0.32
933 0.27
934 0.24
935 0.22
936 0.25
937 0.26
938 0.25
939 0.3
940 0.3
941 0.29
942 0.28
943 0.29
944 0.27
945 0.28
946 0.32
947 0.26
948 0.25
949 0.29
950 0.37
951 0.44
952 0.49
953 0.52
954 0.48
955 0.53
956 0.59
957 0.64
958 0.66
959 0.66
960 0.7
961 0.7
962 0.71
963 0.68
964 0.6
965 0.54
966 0.52
967 0.49
968 0.46
969 0.44
970 0.46
971 0.5
972 0.57
973 0.6
974 0.56
975 0.53
976 0.53
977 0.55
978 0.56
979 0.57
980 0.56
981 0.55
982 0.56
983 0.6
984 0.59
985 0.56
986 0.57
987 0.56
988 0.57
989 0.57
990 0.56
991 0.54
992 0.56
993 0.59
994 0.55
995 0.51
996 0.51
997 0.53
998 0.53
999 0.54
1000 0.51
1001 0.5
1002 0.54
1003 0.57
1004 0.54
1005 0.52
1006 0.52
1007 0.55
1008 0.57
1009 0.55
1010 0.51
1011 0.5
1012 0.52
1013 0.49
1014 0.44
1015 0.36
1016 0.3
1017 0.25
1018 0.22
1019 0.17