Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RMP0

Protein Details
Accession I1RMP0    Localization Confidence High Confidence Score 22.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-152GRWPHDTKKGWKCKTKQLVDAHydrophilic
253-279TTGGKKTKARKATTKGRKTKAKKETSVHydrophilic
498-522QIPKKGRKADTKKATKQTKSKKTKABasic
626-647DAPPKRGRGRPSKKSLEARKSMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
256-275GKKTKARKATTKGRKTKAKK
347-358KKGSKKKTTGKP
500-521PKKGRKADTKKATKQTKSKKTK
567-576GKRGRGRPSK
601-606RGRGRP
628-644PPKRGRGRPSKKSLEAR
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13.5, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR001370  BIR_rpt  
IPR000116  HMGA  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
KEGG fgr:FGSG_05233  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF00653  BIR  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50143  BIR_REPEAT_2  
CDD cd00022  BIR  
Amino Acid Sequences MSFDDITDQFITYESRLASFQKNSKKRGSAASGRGTKALNWPHKSITPDSLARAGLFFNPTLENPDNAQCFLCHKGLDGWEANDDPLVEHLTHAPECGWAVVAAIESNVGDYAQQAPDQPYLKEARKATFAGRWPHDTKKGWKCKTKQLVDAGWKYTPTEESDDMATCTYCQLALDGWEPTDKPLDEHYNRSPNCPFFILLEAKKSSKTKTARASKASRLSVQSVATIASEAPSMNDSTAAIDDSVMTTASTTTGGKKTKARKATTKGRKTKAKKETSVVEDTEASLQYEEPSKLSRGRKRDSSAVEDVSMGISDVPPGKKRAMRAVNESTVVQDEDSDMAEAPVSKKGSKKKTTGKPAAKSSHDVSIVSVTEEVAPAGYEVTPGTFPDDDEIERQLEADLENQLTEDEELTFDSDSERRQKKERGSRTSQAKAEQQEYSRDFAMLNPEPIEPDEDEIDDDLKALQAEMEVNNTEPEQEHEPQQESDAEPEAEPQQLQIPKKGRKADTKKATKQTKSKKTKAAPEVDEEHDAEPEEQTHVDETGHDDSLASTDTVVKKSAVARLSTGKRGRGRPSKASLASRASANEIELVEAPEEQPVKRGRGRPSKASLASRPSVGANDSQLSDAPPKRGRGRPSKKSLEARKSMEAAASQESTQTFSQPVEDRMQEDVEIYASEGPVPRAASVESAQQSPVPSSPPPSAAHLANPPSTPGRVISPAPSARQAAISPSQSPQASDAENEPPSSRPTSGANPKRVALAPVITTPTRTSPSKLSPSKRNVIAGLRSTAPWTELDLDTVFGTPVKDSDKENDMERYLKQGQALTSPEKQMTVQEWIYHNASEAEKQLKYECEAIVSRFESEGTRAMHVLEGLVVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.15
2 0.15
3 0.17
4 0.21
5 0.26
6 0.32
7 0.39
8 0.47
9 0.54
10 0.6
11 0.67
12 0.69
13 0.67
14 0.68
15 0.69
16 0.68
17 0.69
18 0.72
19 0.7
20 0.65
21 0.64
22 0.55
23 0.48
24 0.47
25 0.49
26 0.49
27 0.47
28 0.49
29 0.51
30 0.54
31 0.57
32 0.53
33 0.49
34 0.46
35 0.43
36 0.43
37 0.42
38 0.38
39 0.33
40 0.29
41 0.24
42 0.21
43 0.2
44 0.17
45 0.15
46 0.17
47 0.17
48 0.24
49 0.24
50 0.23
51 0.24
52 0.3
53 0.3
54 0.29
55 0.29
56 0.23
57 0.24
58 0.27
59 0.26
60 0.2
61 0.2
62 0.23
63 0.25
64 0.3
65 0.29
66 0.26
67 0.27
68 0.27
69 0.26
70 0.22
71 0.2
72 0.14
73 0.13
74 0.14
75 0.1
76 0.11
77 0.13
78 0.16
79 0.16
80 0.16
81 0.15
82 0.14
83 0.14
84 0.13
85 0.12
86 0.08
87 0.08
88 0.08
89 0.08
90 0.07
91 0.06
92 0.06
93 0.05
94 0.06
95 0.05
96 0.05
97 0.04
98 0.05
99 0.09
100 0.1
101 0.11
102 0.12
103 0.15
104 0.21
105 0.23
106 0.22
107 0.23
108 0.29
109 0.32
110 0.37
111 0.38
112 0.36
113 0.38
114 0.4
115 0.39
116 0.39
117 0.42
118 0.44
119 0.45
120 0.49
121 0.5
122 0.55
123 0.59
124 0.59
125 0.62
126 0.64
127 0.71
128 0.72
129 0.77
130 0.77
131 0.79
132 0.84
133 0.81
134 0.77
135 0.74
136 0.74
137 0.73
138 0.72
139 0.64
140 0.55
141 0.48
142 0.42
143 0.35
144 0.29
145 0.23
146 0.23
147 0.21
148 0.21
149 0.22
150 0.22
151 0.22
152 0.2
153 0.17
154 0.12
155 0.11
156 0.09
157 0.07
158 0.07
159 0.06
160 0.06
161 0.09
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.13
166 0.13
167 0.14
168 0.18
169 0.15
170 0.15
171 0.2
172 0.3
173 0.31
174 0.37
175 0.44
176 0.49
177 0.49
178 0.52
179 0.52
180 0.44
181 0.44
182 0.4
183 0.33
184 0.25
185 0.3
186 0.31
187 0.27
188 0.3
189 0.3
190 0.29
191 0.33
192 0.34
193 0.32
194 0.34
195 0.38
196 0.41
197 0.49
198 0.58
199 0.61
200 0.67
201 0.71
202 0.7
203 0.73
204 0.69
205 0.62
206 0.55
207 0.51
208 0.46
209 0.4
210 0.32
211 0.24
212 0.2
213 0.16
214 0.13
215 0.1
216 0.07
217 0.07
218 0.06
219 0.06
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.07
225 0.07
226 0.08
227 0.08
228 0.07
229 0.06
230 0.06
231 0.06
232 0.07
233 0.06
234 0.05
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.06
239 0.06
240 0.1
241 0.16
242 0.18
243 0.22
244 0.29
245 0.37
246 0.45
247 0.53
248 0.56
249 0.6
250 0.67
251 0.75
252 0.79
253 0.8
254 0.82
255 0.82
256 0.86
257 0.84
258 0.85
259 0.85
260 0.83
261 0.78
262 0.74
263 0.72
264 0.67
265 0.64
266 0.54
267 0.45
268 0.36
269 0.31
270 0.27
271 0.2
272 0.15
273 0.1
274 0.09
275 0.09
276 0.11
277 0.11
278 0.1
279 0.12
280 0.14
281 0.21
282 0.29
283 0.35
284 0.4
285 0.46
286 0.52
287 0.55
288 0.6
289 0.58
290 0.56
291 0.54
292 0.47
293 0.42
294 0.34
295 0.3
296 0.22
297 0.17
298 0.1
299 0.06
300 0.04
301 0.05
302 0.08
303 0.1
304 0.12
305 0.14
306 0.18
307 0.2
308 0.23
309 0.32
310 0.36
311 0.38
312 0.44
313 0.48
314 0.46
315 0.45
316 0.43
317 0.33
318 0.26
319 0.23
320 0.15
321 0.09
322 0.07
323 0.07
324 0.07
325 0.07
326 0.05
327 0.05
328 0.05
329 0.06
330 0.07
331 0.1
332 0.11
333 0.12
334 0.17
335 0.26
336 0.36
337 0.42
338 0.49
339 0.56
340 0.64
341 0.73
342 0.79
343 0.79
344 0.76
345 0.78
346 0.75
347 0.67
348 0.62
349 0.53
350 0.47
351 0.39
352 0.32
353 0.25
354 0.21
355 0.18
356 0.15
357 0.13
358 0.08
359 0.07
360 0.07
361 0.07
362 0.04
363 0.04
364 0.04
365 0.04
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.07
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.09
378 0.1
379 0.11
380 0.09
381 0.09
382 0.09
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.07
387 0.07
388 0.06
389 0.06
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.06
394 0.05
395 0.04
396 0.04
397 0.04
398 0.05
399 0.05
400 0.05
401 0.06
402 0.07
403 0.09
404 0.17
405 0.21
406 0.23
407 0.28
408 0.34
409 0.42
410 0.52
411 0.6
412 0.59
413 0.63
414 0.68
415 0.71
416 0.71
417 0.64
418 0.57
419 0.52
420 0.46
421 0.41
422 0.36
423 0.3
424 0.29
425 0.29
426 0.27
427 0.22
428 0.2
429 0.17
430 0.15
431 0.2
432 0.16
433 0.15
434 0.14
435 0.14
436 0.14
437 0.14
438 0.15
439 0.09
440 0.09
441 0.09
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.08
446 0.06
447 0.06
448 0.05
449 0.05
450 0.04
451 0.04
452 0.04
453 0.03
454 0.04
455 0.05
456 0.06
457 0.06
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.06
463 0.08
464 0.11
465 0.12
466 0.14
467 0.16
468 0.18
469 0.18
470 0.19
471 0.18
472 0.14
473 0.14
474 0.13
475 0.12
476 0.1
477 0.11
478 0.11
479 0.1
480 0.09
481 0.08
482 0.12
483 0.15
484 0.16
485 0.21
486 0.29
487 0.34
488 0.41
489 0.47
490 0.47
491 0.54
492 0.62
493 0.66
494 0.69
495 0.73
496 0.75
497 0.78
498 0.82
499 0.79
500 0.79
501 0.8
502 0.81
503 0.8
504 0.8
505 0.79
506 0.77
507 0.79
508 0.77
509 0.75
510 0.66
511 0.61
512 0.58
513 0.5
514 0.46
515 0.37
516 0.29
517 0.21
518 0.2
519 0.15
520 0.11
521 0.09
522 0.08
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.07
527 0.07
528 0.07
529 0.1
530 0.11
531 0.11
532 0.11
533 0.1
534 0.1
535 0.1
536 0.11
537 0.07
538 0.05
539 0.09
540 0.11
541 0.12
542 0.13
543 0.12
544 0.13
545 0.15
546 0.2
547 0.19
548 0.18
549 0.19
550 0.26
551 0.29
552 0.35
553 0.37
554 0.39
555 0.42
556 0.48
557 0.55
558 0.56
559 0.6
560 0.59
561 0.62
562 0.63
563 0.62
564 0.6
565 0.56
566 0.5
567 0.45
568 0.38
569 0.33
570 0.27
571 0.23
572 0.19
573 0.16
574 0.12
575 0.12
576 0.11
577 0.11
578 0.09
579 0.09
580 0.08
581 0.09
582 0.1
583 0.09
584 0.14
585 0.16
586 0.21
587 0.26
588 0.33
589 0.4
590 0.5
591 0.55
592 0.58
593 0.61
594 0.64
595 0.63
596 0.62
597 0.58
598 0.53
599 0.5
600 0.42
601 0.37
602 0.3
603 0.26
604 0.22
605 0.18
606 0.14
607 0.14
608 0.14
609 0.13
610 0.13
611 0.13
612 0.19
613 0.19
614 0.24
615 0.26
616 0.31
617 0.38
618 0.44
619 0.5
620 0.55
621 0.64
622 0.68
623 0.73
624 0.77
625 0.78
626 0.82
627 0.84
628 0.82
629 0.79
630 0.74
631 0.69
632 0.62
633 0.54
634 0.45
635 0.36
636 0.29
637 0.24
638 0.2
639 0.16
640 0.15
641 0.15
642 0.17
643 0.16
644 0.15
645 0.13
646 0.12
647 0.16
648 0.17
649 0.2
650 0.21
651 0.22
652 0.22
653 0.23
654 0.24
655 0.19
656 0.17
657 0.15
658 0.11
659 0.1
660 0.09
661 0.08
662 0.07
663 0.08
664 0.09
665 0.09
666 0.11
667 0.11
668 0.11
669 0.11
670 0.11
671 0.13
672 0.13
673 0.18
674 0.18
675 0.18
676 0.19
677 0.19
678 0.19
679 0.18
680 0.19
681 0.15
682 0.14
683 0.18
684 0.19
685 0.22
686 0.23
687 0.26
688 0.28
689 0.26
690 0.29
691 0.3
692 0.32
693 0.31
694 0.29
695 0.27
696 0.26
697 0.25
698 0.23
699 0.18
700 0.19
701 0.2
702 0.21
703 0.21
704 0.27
705 0.29
706 0.3
707 0.32
708 0.3
709 0.27
710 0.28
711 0.25
712 0.23
713 0.25
714 0.25
715 0.24
716 0.24
717 0.28
718 0.26
719 0.27
720 0.24
721 0.22
722 0.2
723 0.2
724 0.22
725 0.23
726 0.23
727 0.24
728 0.23
729 0.21
730 0.24
731 0.26
732 0.23
733 0.2
734 0.23
735 0.31
736 0.41
737 0.48
738 0.53
739 0.52
740 0.52
741 0.54
742 0.51
743 0.44
744 0.36
745 0.3
746 0.24
747 0.24
748 0.28
749 0.23
750 0.24
751 0.24
752 0.24
753 0.26
754 0.26
755 0.27
756 0.3
757 0.38
758 0.47
759 0.54
760 0.58
761 0.63
762 0.7
763 0.74
764 0.72
765 0.67
766 0.61
767 0.59
768 0.57
769 0.51
770 0.47
771 0.4
772 0.36
773 0.34
774 0.3
775 0.25
776 0.18
777 0.17
778 0.18
779 0.17
780 0.19
781 0.17
782 0.18
783 0.17
784 0.17
785 0.14
786 0.11
787 0.11
788 0.09
789 0.11
790 0.14
791 0.15
792 0.17
793 0.23
794 0.27
795 0.29
796 0.32
797 0.35
798 0.33
799 0.35
800 0.33
801 0.35
802 0.33
803 0.33
804 0.32
805 0.3
806 0.29
807 0.32
808 0.36
809 0.34
810 0.36
811 0.37
812 0.36
813 0.33
814 0.32
815 0.31
816 0.29
817 0.31
818 0.28
819 0.29
820 0.31
821 0.34
822 0.36
823 0.32
824 0.29
825 0.26
826 0.26
827 0.23
828 0.25
829 0.27
830 0.25
831 0.27
832 0.3
833 0.29
834 0.31
835 0.32
836 0.28
837 0.27
838 0.29
839 0.29
840 0.31
841 0.3
842 0.28
843 0.24
844 0.25
845 0.21
846 0.21
847 0.25
848 0.22
849 0.22
850 0.21
851 0.22
852 0.22
853 0.2
854 0.18