Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4IJH1

Protein Details
Accession Q4IJH1    Localization Confidence High Confidence Score 21.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-51SEDRPTKKTKVDSEEKARLKAEKRERKEKKKSQESEPSAENBasic
54-82ADRAAEKERKKAKKAKKLEKKQKLAEAEABasic
90-112VSDEAPKKSKKEKKTTTTEASSNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-43KVDSEEKARLKAEKRERKEKKKSQ
56-76RAAEKERKKAKKAKKLEKKQK
96-102KKSKKEK
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.833, mito_nucl 12.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG fgr:FGSG_02637  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd00268  DEADc  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MAATKHSLADSEDRPTKKTKVDSEEKARLKAEKRERKEKKKSQESEPSAENSDADRAAEKERKKAKKAKKLEKKQKLAEAEASAEPAAEVSDEAPKKSKKEKKTTTTEASSNSEAPSSGSYIQTIALSNVPQAEIDEFLSKNEIHITDPKTENVTLRPVLEFHQLPATNLLEKKPSPFANYKAPTPIQSASWPFTLSGRDVIGVAETGSGKTMAFALPCVEAISALKHKHTKAVVVSPTRELAMQTYEQMASVAALNRMKCVCLYGGASKDDQRNLLNRGADIIVATPGRLKDFMSDGTVDLSHSAFAVLDEADRMLDKGFEEDIKMILSSCPPREKRQTLMFTATWPQSVQTLAATFMVSPVKIAIGSGGKETAGGAVELQANARISQSVEVLEPRGKEFRLLEVLKEHQQGSKKNDRILVFCLYKKEATRIENFLSRKGIRVGGIHGDLRQEQRTRSLEAFKSGQTPVLVATDVAARGLDIPEVKLVINVTFPLTIEDYVHRIGRTGRAGKTGQAITFFTVEDKSHSGSLVNILRGANQPVPEDLLKFGTTVKKKAHDMYGAFFKDVDMNAKSTKITFD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.4
2 0.45
3 0.47
4 0.48
5 0.54
6 0.55
7 0.57
8 0.65
9 0.72
10 0.76
11 0.81
12 0.77
13 0.73
14 0.67
15 0.64
16 0.61
17 0.62
18 0.63
19 0.64
20 0.68
21 0.75
22 0.83
23 0.87
24 0.92
25 0.92
26 0.92
27 0.92
28 0.9
29 0.89
30 0.89
31 0.85
32 0.8
33 0.74
34 0.66
35 0.58
36 0.52
37 0.42
38 0.33
39 0.28
40 0.22
41 0.19
42 0.17
43 0.16
44 0.23
45 0.29
46 0.3
47 0.37
48 0.47
49 0.55
50 0.63
51 0.71
52 0.75
53 0.79
54 0.87
55 0.89
56 0.9
57 0.92
58 0.94
59 0.95
60 0.94
61 0.91
62 0.89
63 0.83
64 0.77
65 0.71
66 0.62
67 0.55
68 0.45
69 0.39
70 0.29
71 0.23
72 0.18
73 0.12
74 0.1
75 0.06
76 0.06
77 0.05
78 0.13
79 0.14
80 0.16
81 0.23
82 0.26
83 0.31
84 0.42
85 0.5
86 0.53
87 0.63
88 0.72
89 0.75
90 0.82
91 0.86
92 0.83
93 0.8
94 0.73
95 0.66
96 0.61
97 0.53
98 0.45
99 0.36
100 0.28
101 0.22
102 0.2
103 0.17
104 0.15
105 0.14
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.13
110 0.13
111 0.12
112 0.1
113 0.1
114 0.1
115 0.1
116 0.11
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.09
121 0.09
122 0.1
123 0.12
124 0.11
125 0.11
126 0.14
127 0.13
128 0.13
129 0.14
130 0.14
131 0.13
132 0.2
133 0.23
134 0.27
135 0.29
136 0.3
137 0.3
138 0.31
139 0.3
140 0.26
141 0.28
142 0.22
143 0.22
144 0.21
145 0.19
146 0.2
147 0.24
148 0.22
149 0.18
150 0.24
151 0.23
152 0.23
153 0.25
154 0.24
155 0.22
156 0.23
157 0.23
158 0.2
159 0.2
160 0.23
161 0.25
162 0.26
163 0.28
164 0.31
165 0.34
166 0.4
167 0.42
168 0.41
169 0.41
170 0.41
171 0.37
172 0.36
173 0.33
174 0.24
175 0.26
176 0.27
177 0.24
178 0.23
179 0.22
180 0.18
181 0.18
182 0.18
183 0.15
184 0.14
185 0.12
186 0.11
187 0.1
188 0.1
189 0.09
190 0.07
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.05
195 0.06
196 0.06
197 0.05
198 0.05
199 0.06
200 0.06
201 0.06
202 0.06
203 0.07
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.06
209 0.06
210 0.09
211 0.12
212 0.13
213 0.16
214 0.2
215 0.2
216 0.25
217 0.26
218 0.26
219 0.25
220 0.31
221 0.34
222 0.34
223 0.35
224 0.31
225 0.31
226 0.27
227 0.24
228 0.17
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.1
233 0.1
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.08
238 0.06
239 0.07
240 0.07
241 0.08
242 0.1
243 0.1
244 0.12
245 0.12
246 0.12
247 0.11
248 0.11
249 0.09
250 0.09
251 0.11
252 0.12
253 0.14
254 0.15
255 0.16
256 0.19
257 0.21
258 0.2
259 0.2
260 0.18
261 0.19
262 0.21
263 0.24
264 0.21
265 0.18
266 0.18
267 0.17
268 0.15
269 0.12
270 0.09
271 0.07
272 0.06
273 0.06
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.09
288 0.08
289 0.07
290 0.05
291 0.05
292 0.05
293 0.04
294 0.04
295 0.04
296 0.04
297 0.04
298 0.04
299 0.04
300 0.04
301 0.04
302 0.04
303 0.04
304 0.04
305 0.04
306 0.05
307 0.06
308 0.06
309 0.07
310 0.07
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.06
316 0.09
317 0.11
318 0.14
319 0.21
320 0.24
321 0.3
322 0.38
323 0.41
324 0.44
325 0.5
326 0.52
327 0.47
328 0.5
329 0.44
330 0.37
331 0.38
332 0.33
333 0.24
334 0.2
335 0.17
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.07
340 0.07
341 0.07
342 0.08
343 0.07
344 0.06
345 0.08
346 0.08
347 0.07
348 0.07
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.08
361 0.07
362 0.06
363 0.05
364 0.04
365 0.06
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.08
370 0.08
371 0.08
372 0.09
373 0.07
374 0.07
375 0.08
376 0.09
377 0.08
378 0.08
379 0.09
380 0.11
381 0.13
382 0.13
383 0.14
384 0.16
385 0.15
386 0.17
387 0.17
388 0.19
389 0.25
390 0.25
391 0.24
392 0.25
393 0.29
394 0.31
395 0.33
396 0.3
397 0.25
398 0.3
399 0.35
400 0.39
401 0.46
402 0.45
403 0.46
404 0.51
405 0.49
406 0.47
407 0.44
408 0.43
409 0.37
410 0.35
411 0.35
412 0.32
413 0.33
414 0.32
415 0.33
416 0.32
417 0.33
418 0.35
419 0.37
420 0.38
421 0.41
422 0.41
423 0.39
424 0.4
425 0.36
426 0.34
427 0.32
428 0.3
429 0.25
430 0.26
431 0.25
432 0.23
433 0.25
434 0.23
435 0.22
436 0.22
437 0.23
438 0.24
439 0.27
440 0.25
441 0.24
442 0.31
443 0.33
444 0.35
445 0.36
446 0.4
447 0.37
448 0.39
449 0.4
450 0.34
451 0.35
452 0.31
453 0.3
454 0.22
455 0.21
456 0.17
457 0.15
458 0.14
459 0.1
460 0.1
461 0.1
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.06
466 0.07
467 0.08
468 0.09
469 0.08
470 0.09
471 0.09
472 0.1
473 0.1
474 0.1
475 0.11
476 0.1
477 0.1
478 0.1
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.12
483 0.13
484 0.12
485 0.13
486 0.15
487 0.16
488 0.18
489 0.2
490 0.18
491 0.18
492 0.2
493 0.24
494 0.31
495 0.34
496 0.34
497 0.38
498 0.39
499 0.4
500 0.45
501 0.42
502 0.34
503 0.31
504 0.3
505 0.26
506 0.26
507 0.23
508 0.18
509 0.17
510 0.16
511 0.17
512 0.18
513 0.18
514 0.18
515 0.18
516 0.17
517 0.16
518 0.23
519 0.24
520 0.23
521 0.23
522 0.22
523 0.24
524 0.27
525 0.3
526 0.26
527 0.23
528 0.24
529 0.23
530 0.27
531 0.26
532 0.24
533 0.22
534 0.21
535 0.2
536 0.18
537 0.22
538 0.26
539 0.3
540 0.35
541 0.41
542 0.44
543 0.49
544 0.55
545 0.58
546 0.56
547 0.54
548 0.54
549 0.57
550 0.52
551 0.48
552 0.42
553 0.35
554 0.31
555 0.29
556 0.28
557 0.21
558 0.22
559 0.23
560 0.25
561 0.25