Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RC27

Protein Details
Accession I1RC27    Localization Confidence High Confidence Score 23
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-49SGKYQTFSKLNKKPRLDEKKVKKQPVKESEDSDHydrophilic
105-132DEVQRTKKLWEKLRRKSHVPKEERQTLVHydrophilic
616-638GEAGALKKTLKKNKKALEKAATEHydrophilic
649-676AHEATPKDAKKGKKKGDKKPVGNAGSKLBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-39NKKPRLDEKKVKK
111-120KKLWEKLRRK
622-635KKTLKKNKKALEKA
643-670QKAAREAHEATPKDAKKGKKKGDKKPVG
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto 6, mito 3, cyto_pero 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011989  ARM-like  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR012959  CPL_dom  
IPR033133  PUM-HD  
IPR040059  PUM3  
IPR001313  Pumilio_RNA-bd_rpt  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG fgr:FGSG_01128  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08144  CPL  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50303  PUM_HD  
Amino Acid Sequences MATKSAAVGDKRKSASSGKYQTFSKLNKKPRLDEKKVKKQPVKESEDSDEEDGGADLSEEAPKRSSNGAGDGKTFERTSGQTSRESHAKQKQLAQERKAAKPLADEVQRTKKLWEKLRRKSHVPKEERQTLVTELFTIITGRIKDFVLKHDAVRAVQTAIKYASPEQKKQIARELTGTYAQLAESRYAKFLIGKLLVQNDEEIRDIIIPEFYGRVRKMINHPEASWILDDVYRGVATKEQKAILLREWYGPEFSIRELTKDTNPTSDLKAILEAEPSKRGPIMKSLVDIIGSLVNKKMTGFTMLHDAMFQYFSATQPGTEEFTEFFEMVKGDEGGDLLKNMAFTRNGAKLTCLLLAHGSSKDRKQILKTYKDTFLLMSGDIWAHLVILTAYDVVDDTKLTAKTIFPEILGEGENLAQNVVAAANNPFARTTILYLFEGLAKSLFPPSQSAEVEILKEVHEIRQTTSKKDEEIRRSELVTAISPQLISVIAEVPSDITATAFGCQFVTDVLLSGVGDKQQALEAIAQSASGNPSEEPSEDDLQPQVHISRTPHGGRMLKSLIQGGKYDKTAGKIIPVDPPLEFSNILYPVIKEHIMDWATGPSSFVVVGLLEAGDFGEAGALKKTLKKNKKALEKAATEETPEQKAAREAHEATPKDAKKGKKKGDKKPVGNAGSKLLLEKL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.48
3 0.52
4 0.56
5 0.54
6 0.56
7 0.56
8 0.59
9 0.61
10 0.61
11 0.61
12 0.61
13 0.66
14 0.71
15 0.76
16 0.79
17 0.82
18 0.85
19 0.84
20 0.86
21 0.86
22 0.88
23 0.91
24 0.93
25 0.89
26 0.88
27 0.88
28 0.88
29 0.86
30 0.8
31 0.76
32 0.71
33 0.68
34 0.62
35 0.53
36 0.42
37 0.33
38 0.28
39 0.22
40 0.15
41 0.11
42 0.07
43 0.06
44 0.06
45 0.1
46 0.11
47 0.12
48 0.14
49 0.14
50 0.17
51 0.19
52 0.22
53 0.21
54 0.28
55 0.33
56 0.33
57 0.35
58 0.36
59 0.35
60 0.35
61 0.32
62 0.24
63 0.21
64 0.22
65 0.26
66 0.3
67 0.31
68 0.34
69 0.37
70 0.41
71 0.46
72 0.47
73 0.5
74 0.52
75 0.57
76 0.55
77 0.59
78 0.64
79 0.66
80 0.72
81 0.66
82 0.67
83 0.66
84 0.66
85 0.65
86 0.57
87 0.48
88 0.43
89 0.43
90 0.42
91 0.4
92 0.39
93 0.4
94 0.49
95 0.51
96 0.49
97 0.48
98 0.48
99 0.51
100 0.58
101 0.61
102 0.62
103 0.69
104 0.79
105 0.82
106 0.84
107 0.86
108 0.87
109 0.87
110 0.84
111 0.82
112 0.8
113 0.82
114 0.75
115 0.66
116 0.58
117 0.5
118 0.45
119 0.36
120 0.27
121 0.18
122 0.16
123 0.15
124 0.12
125 0.1
126 0.11
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.13
131 0.17
132 0.18
133 0.22
134 0.25
135 0.26
136 0.26
137 0.3
138 0.31
139 0.27
140 0.28
141 0.24
142 0.19
143 0.19
144 0.19
145 0.16
146 0.15
147 0.15
148 0.15
149 0.18
150 0.26
151 0.29
152 0.33
153 0.37
154 0.44
155 0.47
156 0.48
157 0.53
158 0.49
159 0.45
160 0.45
161 0.42
162 0.36
163 0.34
164 0.31
165 0.22
166 0.17
167 0.16
168 0.13
169 0.12
170 0.12
171 0.13
172 0.14
173 0.14
174 0.15
175 0.15
176 0.15
177 0.15
178 0.18
179 0.17
180 0.17
181 0.19
182 0.21
183 0.22
184 0.2
185 0.2
186 0.15
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.1
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.08
195 0.07
196 0.06
197 0.08
198 0.08
199 0.13
200 0.13
201 0.15
202 0.16
203 0.2
204 0.28
205 0.36
206 0.43
207 0.4
208 0.4
209 0.43
210 0.42
211 0.39
212 0.31
213 0.22
214 0.15
215 0.13
216 0.12
217 0.08
218 0.08
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.11
223 0.13
224 0.16
225 0.18
226 0.18
227 0.2
228 0.22
229 0.24
230 0.23
231 0.24
232 0.21
233 0.21
234 0.22
235 0.21
236 0.2
237 0.18
238 0.16
239 0.13
240 0.12
241 0.16
242 0.14
243 0.15
244 0.16
245 0.19
246 0.21
247 0.25
248 0.25
249 0.21
250 0.23
251 0.23
252 0.24
253 0.23
254 0.2
255 0.16
256 0.16
257 0.15
258 0.14
259 0.14
260 0.13
261 0.13
262 0.15
263 0.15
264 0.14
265 0.15
266 0.16
267 0.14
268 0.18
269 0.21
270 0.19
271 0.19
272 0.2
273 0.19
274 0.18
275 0.17
276 0.11
277 0.1
278 0.09
279 0.09
280 0.09
281 0.09
282 0.09
283 0.09
284 0.09
285 0.07
286 0.1
287 0.1
288 0.1
289 0.16
290 0.16
291 0.16
292 0.15
293 0.15
294 0.12
295 0.12
296 0.11
297 0.06
298 0.06
299 0.06
300 0.08
301 0.08
302 0.07
303 0.08
304 0.09
305 0.1
306 0.09
307 0.1
308 0.08
309 0.1
310 0.11
311 0.1
312 0.09
313 0.08
314 0.08
315 0.08
316 0.08
317 0.06
318 0.05
319 0.05
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.04
325 0.04
326 0.05
327 0.05
328 0.07
329 0.06
330 0.07
331 0.11
332 0.13
333 0.14
334 0.14
335 0.14
336 0.14
337 0.15
338 0.16
339 0.12
340 0.09
341 0.09
342 0.1
343 0.11
344 0.1
345 0.11
346 0.12
347 0.14
348 0.19
349 0.21
350 0.23
351 0.25
352 0.33
353 0.4
354 0.46
355 0.49
356 0.48
357 0.49
358 0.47
359 0.44
360 0.35
361 0.28
362 0.2
363 0.15
364 0.11
365 0.08
366 0.07
367 0.07
368 0.07
369 0.05
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.03
374 0.03
375 0.03
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.04
382 0.03
383 0.04
384 0.08
385 0.08
386 0.09
387 0.1
388 0.1
389 0.12
390 0.14
391 0.14
392 0.1
393 0.11
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.09
398 0.07
399 0.07
400 0.07
401 0.07
402 0.06
403 0.05
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.03
408 0.04
409 0.05
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.1
416 0.1
417 0.12
418 0.11
419 0.13
420 0.13
421 0.14
422 0.13
423 0.14
424 0.13
425 0.11
426 0.09
427 0.06
428 0.07
429 0.08
430 0.09
431 0.08
432 0.1
433 0.12
434 0.16
435 0.17
436 0.18
437 0.18
438 0.18
439 0.18
440 0.17
441 0.16
442 0.11
443 0.12
444 0.11
445 0.11
446 0.14
447 0.14
448 0.15
449 0.24
450 0.26
451 0.28
452 0.34
453 0.33
454 0.33
455 0.4
456 0.47
457 0.46
458 0.51
459 0.52
460 0.48
461 0.47
462 0.45
463 0.39
464 0.31
465 0.24
466 0.2
467 0.15
468 0.14
469 0.12
470 0.11
471 0.1
472 0.08
473 0.07
474 0.06
475 0.06
476 0.06
477 0.06
478 0.07
479 0.07
480 0.06
481 0.07
482 0.06
483 0.04
484 0.05
485 0.05
486 0.07
487 0.06
488 0.06
489 0.06
490 0.07
491 0.07
492 0.06
493 0.07
494 0.06
495 0.06
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.06
504 0.07
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.1
509 0.09
510 0.1
511 0.1
512 0.1
513 0.09
514 0.09
515 0.09
516 0.08
517 0.09
518 0.08
519 0.09
520 0.11
521 0.11
522 0.13
523 0.17
524 0.2
525 0.19
526 0.2
527 0.21
528 0.2
529 0.2
530 0.18
531 0.15
532 0.13
533 0.16
534 0.17
535 0.2
536 0.27
537 0.28
538 0.3
539 0.36
540 0.39
541 0.38
542 0.42
543 0.41
544 0.36
545 0.36
546 0.37
547 0.33
548 0.3
549 0.31
550 0.28
551 0.28
552 0.27
553 0.3
554 0.26
555 0.27
556 0.29
557 0.27
558 0.28
559 0.28
560 0.29
561 0.31
562 0.31
563 0.29
564 0.25
565 0.28
566 0.24
567 0.23
568 0.22
569 0.16
570 0.2
571 0.19
572 0.2
573 0.18
574 0.16
575 0.16
576 0.19
577 0.18
578 0.13
579 0.13
580 0.19
581 0.19
582 0.19
583 0.18
584 0.18
585 0.18
586 0.18
587 0.18
588 0.11
589 0.11
590 0.11
591 0.09
592 0.07
593 0.06
594 0.06
595 0.05
596 0.05
597 0.04
598 0.04
599 0.04
600 0.04
601 0.03
602 0.03
603 0.04
604 0.05
605 0.06
606 0.08
607 0.09
608 0.11
609 0.18
610 0.27
611 0.37
612 0.47
613 0.56
614 0.64
615 0.73
616 0.83
617 0.85
618 0.86
619 0.85
620 0.79
621 0.75
622 0.72
623 0.63
624 0.56
625 0.53
626 0.47
627 0.4
628 0.38
629 0.33
630 0.27
631 0.32
632 0.31
633 0.3
634 0.32
635 0.32
636 0.38
637 0.47
638 0.46
639 0.45
640 0.52
641 0.49
642 0.5
643 0.53
644 0.55
645 0.57
646 0.66
647 0.73
648 0.74
649 0.83
650 0.86
651 0.92
652 0.93
653 0.9
654 0.9
655 0.9
656 0.85
657 0.81
658 0.72
659 0.66
660 0.59
661 0.51