Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4IJ56

Protein Details
Accession Q4IJ56    Localization Confidence High Confidence Score 16
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
374-398DAETEAKRPKKKAKKSKGGDKEYGVBasic
576-615VGFVAMRKDKKGKGKKGRGFKVGSRKRDPLKTFKARRKTKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
380-392KRPKKKAKKSKGG
582-615RKDKKGKGKKGRGFKVGSRKRDPLKTFKARRKTK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, mito 7, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG fgr:FGSG_02752  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17961  DEADc_DDX56  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MSASTKRKRDQAEESVPAENPASTDVEKAIKPAQKQEEETSFVDLGLDPRLLQAIAQQKFAKPTLVQRKAIPLALNGQDVLAKADCGSGKTAAYVLPLLSSILKRKATDSTAFTTALILVPTRELADQVSKAIEQFASFCAKDISTAKLTDKVSSKVQRALLSNSPDIVISTPSTAWQNVNSSALSIDKLTHLILDEADLVLSYGYSEDLENLSRSVPKGVQVMMMSATLSDEVDTLKGIFRRDPTLLDLKEKEAEGEGITQFVAKCGEDEKFLLAYVIFKLKLIKGKCIIFVSDIDRCYRLKLFFEQFGIRSCILNSELPLNSRVHVVEEFNRHVYDIIIAADEKNEMLGDDEEPAETAEAQDDAKKSNEGDDAETEAKRPKKKAKKSKGGDKEYGVSRGVDFKKVSAVINFDLPTTASAYTHRIGRTARAGQTGMALSFVVPKDLYRKHMPTSTPACENDEKIMARIIRQQAKRDKEVKPYNFNMKQVDPFRYRMNDALRAVTKVAIREARTRELRQELLKSEKLKRYFEENPTELSHLRHDGELRTARQQAHLKHIPEYLMPKDGKQALTEDVGFVAMRKDKKGKGKKGRGFKVGSRKRDPLKTFKARRKTK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.63
3 0.56
4 0.5
5 0.41
6 0.3
7 0.21
8 0.16
9 0.17
10 0.14
11 0.15
12 0.17
13 0.2
14 0.2
15 0.23
16 0.28
17 0.29
18 0.31
19 0.39
20 0.46
21 0.48
22 0.53
23 0.57
24 0.55
25 0.56
26 0.54
27 0.49
28 0.4
29 0.33
30 0.29
31 0.23
32 0.18
33 0.16
34 0.15
35 0.1
36 0.1
37 0.11
38 0.1
39 0.1
40 0.14
41 0.21
42 0.23
43 0.28
44 0.3
45 0.31
46 0.36
47 0.37
48 0.35
49 0.28
50 0.37
51 0.43
52 0.5
53 0.5
54 0.48
55 0.56
56 0.55
57 0.56
58 0.47
59 0.37
60 0.36
61 0.36
62 0.34
63 0.25
64 0.22
65 0.2
66 0.19
67 0.2
68 0.13
69 0.1
70 0.1
71 0.13
72 0.13
73 0.13
74 0.15
75 0.14
76 0.14
77 0.14
78 0.15
79 0.12
80 0.13
81 0.12
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.13
88 0.16
89 0.22
90 0.26
91 0.26
92 0.28
93 0.33
94 0.35
95 0.38
96 0.38
97 0.36
98 0.36
99 0.35
100 0.33
101 0.28
102 0.24
103 0.19
104 0.15
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.13
114 0.14
115 0.14
116 0.15
117 0.14
118 0.14
119 0.15
120 0.13
121 0.09
122 0.1
123 0.11
124 0.15
125 0.14
126 0.15
127 0.15
128 0.14
129 0.17
130 0.18
131 0.21
132 0.18
133 0.21
134 0.22
135 0.27
136 0.27
137 0.29
138 0.31
139 0.29
140 0.35
141 0.4
142 0.41
143 0.41
144 0.44
145 0.43
146 0.43
147 0.45
148 0.42
149 0.4
150 0.38
151 0.32
152 0.29
153 0.25
154 0.22
155 0.18
156 0.13
157 0.09
158 0.09
159 0.09
160 0.1
161 0.12
162 0.12
163 0.12
164 0.13
165 0.15
166 0.16
167 0.17
168 0.16
169 0.14
170 0.14
171 0.14
172 0.12
173 0.09
174 0.09
175 0.08
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.08
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.06
185 0.06
186 0.05
187 0.05
188 0.04
189 0.04
190 0.03
191 0.03
192 0.03
193 0.04
194 0.04
195 0.05
196 0.06
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.09
202 0.1
203 0.12
204 0.11
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.16
209 0.14
210 0.14
211 0.13
212 0.12
213 0.1
214 0.08
215 0.07
216 0.05
217 0.05
218 0.04
219 0.04
220 0.04
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.07
225 0.09
226 0.1
227 0.12
228 0.14
229 0.17
230 0.18
231 0.19
232 0.21
233 0.26
234 0.26
235 0.28
236 0.28
237 0.26
238 0.27
239 0.25
240 0.21
241 0.14
242 0.14
243 0.1
244 0.11
245 0.09
246 0.08
247 0.08
248 0.08
249 0.08
250 0.08
251 0.08
252 0.06
253 0.06
254 0.07
255 0.08
256 0.08
257 0.09
258 0.1
259 0.09
260 0.09
261 0.09
262 0.07
263 0.07
264 0.07
265 0.09
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.11
270 0.17
271 0.17
272 0.2
273 0.23
274 0.24
275 0.26
276 0.25
277 0.24
278 0.19
279 0.2
280 0.19
281 0.18
282 0.17
283 0.16
284 0.17
285 0.16
286 0.17
287 0.18
288 0.16
289 0.15
290 0.19
291 0.21
292 0.21
293 0.24
294 0.23
295 0.21
296 0.22
297 0.23
298 0.18
299 0.16
300 0.14
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.11
305 0.12
306 0.12
307 0.12
308 0.15
309 0.13
310 0.12
311 0.13
312 0.12
313 0.11
314 0.11
315 0.12
316 0.14
317 0.18
318 0.19
319 0.19
320 0.19
321 0.18
322 0.17
323 0.15
324 0.12
325 0.08
326 0.07
327 0.06
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.05
333 0.04
334 0.04
335 0.03
336 0.05
337 0.05
338 0.05
339 0.06
340 0.07
341 0.06
342 0.07
343 0.07
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.07
351 0.07
352 0.09
353 0.1
354 0.11
355 0.1
356 0.12
357 0.15
358 0.14
359 0.15
360 0.15
361 0.17
362 0.19
363 0.19
364 0.18
365 0.2
366 0.25
367 0.28
368 0.32
369 0.39
370 0.48
371 0.59
372 0.69
373 0.75
374 0.8
375 0.85
376 0.9
377 0.9
378 0.87
379 0.81
380 0.72
381 0.66
382 0.58
383 0.51
384 0.41
385 0.3
386 0.23
387 0.27
388 0.26
389 0.25
390 0.22
391 0.2
392 0.23
393 0.24
394 0.24
395 0.17
396 0.19
397 0.16
398 0.19
399 0.19
400 0.15
401 0.14
402 0.13
403 0.13
404 0.11
405 0.11
406 0.08
407 0.09
408 0.12
409 0.14
410 0.17
411 0.17
412 0.18
413 0.19
414 0.22
415 0.27
416 0.3
417 0.31
418 0.3
419 0.3
420 0.27
421 0.29
422 0.26
423 0.19
424 0.13
425 0.11
426 0.08
427 0.11
428 0.11
429 0.1
430 0.09
431 0.1
432 0.16
433 0.19
434 0.25
435 0.28
436 0.32
437 0.35
438 0.41
439 0.42
440 0.43
441 0.48
442 0.46
443 0.44
444 0.42
445 0.43
446 0.4
447 0.4
448 0.34
449 0.31
450 0.27
451 0.23
452 0.26
453 0.21
454 0.21
455 0.27
456 0.32
457 0.36
458 0.39
459 0.47
460 0.52
461 0.58
462 0.65
463 0.66
464 0.63
465 0.65
466 0.72
467 0.71
468 0.7
469 0.7
470 0.72
471 0.69
472 0.67
473 0.61
474 0.54
475 0.54
476 0.51
477 0.52
478 0.45
479 0.43
480 0.45
481 0.44
482 0.44
483 0.42
484 0.43
485 0.43
486 0.4
487 0.44
488 0.4
489 0.38
490 0.36
491 0.33
492 0.29
493 0.23
494 0.27
495 0.25
496 0.27
497 0.33
498 0.37
499 0.42
500 0.47
501 0.49
502 0.5
503 0.51
504 0.52
505 0.5
506 0.5
507 0.47
508 0.48
509 0.51
510 0.5
511 0.53
512 0.56
513 0.57
514 0.55
515 0.53
516 0.54
517 0.57
518 0.59
519 0.6
520 0.54
521 0.52
522 0.51
523 0.51
524 0.44
525 0.38
526 0.34
527 0.28
528 0.28
529 0.26
530 0.26
531 0.24
532 0.32
533 0.36
534 0.35
535 0.37
536 0.41
537 0.39
538 0.45
539 0.5
540 0.46
541 0.5
542 0.54
543 0.5
544 0.49
545 0.5
546 0.44
547 0.41
548 0.42
549 0.35
550 0.35
551 0.34
552 0.31
553 0.35
554 0.39
555 0.36
556 0.32
557 0.32
558 0.27
559 0.3
560 0.29
561 0.22
562 0.18
563 0.17
564 0.16
565 0.13
566 0.15
567 0.17
568 0.2
569 0.25
570 0.32
571 0.39
572 0.5
573 0.61
574 0.67
575 0.73
576 0.81
577 0.84
578 0.88
579 0.9
580 0.88
581 0.84
582 0.82
583 0.82
584 0.81
585 0.81
586 0.79
587 0.78
588 0.78
589 0.81
590 0.79
591 0.79
592 0.8
593 0.82
594 0.84
595 0.85