Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RDA0

Protein Details
Accession I1RDA0    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-296QMGINKKTKKSKKAYDKAVDKVKRSERKKNKPHPLNFSALHydrophilic
617-640VDKALGSRRKRQKELEDRHRDDGLBasic
684-724MQAQGKSTSNREKARNKNIFMTMGKAKSKHKRSLVETRKVLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
262-288KKTKKSKKAYDKAVDKVKRSERKKNKP
505-506KK
663-717AKEGKPDRDEHKSTQAIRKSKMQAQGKSTSNREKARNKNIFMTMGKAKSKHKRSL
Subcellular Location(s) nucl 19.5, mito_nucl 13, mito 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
IPR012977  SDA1_N  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
KEGG fgr:FGSG_01592  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08158  NUC130_3NT  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MVKRKVAALEKIDADFAALQQKIRRDPRSYKEEFLKQLEQYEAQREIFLVSPSTASADSVESFHNIIDLIAHVADCYKEETATFPDDLKEILTQHHVVLHPDLREKIVGSLVLLRRKEVIDSTSVLTTLFPILVSSPSKTLRETLFQKILADLRNSNNKTINHPLNRTVQTVLYNLITADRDSPRAIWAIKLTREMWKRQFWTDAKPVDVMKEACLSNNEKVVVGAVRFFLGGDKEREDLEDESSDEEVDLSQVKHQMGINKKTKKSKKAYDKAVDKVKRSERKKNKPHPLNFSALHLLHDPQSFAEELFSKHLQNTKAKLSLDTKILVTQLVTRLVGLHKLTIVALYSWFIKFLTPKQHSVTSFLASLAQAVHNLVPPDVLEPLITKIANEFVSEASAAEVAAAGLNSIREICARQPLAMTDTLLQDLVQYRKSKDKGVMMAAKGLLSLYREVGAELLKKRDRGKKATIDMKAGIQAQRKFGEEEAGGIEGLDLLEKWKEDEKKKKRLAMGLPEDAATDEEEEENKDDEWEVDSDDSSDSGEWINVYHSSDEEDDDDEPAPKKQKTEADIAADERAKKALEEKEAEIDRISKLATTTILTPADLAKLQELRMSSQVDKALGSRRKRQKELEDRHRDDGLTAEQIEAPARLRKLTKEERAELAKEGKPDRDEHKSTQAIRKSKMQAQGKSTSNREKARNKNIFMTMGKAKSKHKRSLVETRKVLTRHVTRSTRGGRRQNGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.29
2 0.22
3 0.18
4 0.19
5 0.18
6 0.19
7 0.23
8 0.29
9 0.37
10 0.46
11 0.52
12 0.53
13 0.62
14 0.69
15 0.74
16 0.74
17 0.72
18 0.72
19 0.73
20 0.71
21 0.69
22 0.66
23 0.57
24 0.56
25 0.52
26 0.46
27 0.41
28 0.41
29 0.37
30 0.32
31 0.3
32 0.27
33 0.25
34 0.23
35 0.21
36 0.17
37 0.14
38 0.14
39 0.13
40 0.15
41 0.14
42 0.12
43 0.12
44 0.12
45 0.12
46 0.13
47 0.14
48 0.13
49 0.13
50 0.13
51 0.12
52 0.1
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.08
57 0.08
58 0.08
59 0.07
60 0.08
61 0.08
62 0.09
63 0.11
64 0.1
65 0.1
66 0.1
67 0.14
68 0.17
69 0.2
70 0.2
71 0.18
72 0.19
73 0.19
74 0.19
75 0.17
76 0.15
77 0.13
78 0.14
79 0.18
80 0.18
81 0.18
82 0.22
83 0.22
84 0.22
85 0.26
86 0.27
87 0.25
88 0.29
89 0.29
90 0.26
91 0.26
92 0.25
93 0.22
94 0.19
95 0.17
96 0.14
97 0.2
98 0.24
99 0.3
100 0.29
101 0.28
102 0.29
103 0.29
104 0.3
105 0.25
106 0.22
107 0.19
108 0.21
109 0.22
110 0.2
111 0.2
112 0.18
113 0.15
114 0.14
115 0.11
116 0.09
117 0.06
118 0.06
119 0.07
120 0.1
121 0.12
122 0.13
123 0.16
124 0.2
125 0.21
126 0.22
127 0.25
128 0.24
129 0.31
130 0.34
131 0.38
132 0.39
133 0.39
134 0.38
135 0.37
136 0.37
137 0.33
138 0.31
139 0.27
140 0.29
141 0.38
142 0.39
143 0.4
144 0.43
145 0.41
146 0.44
147 0.49
148 0.53
149 0.5
150 0.52
151 0.53
152 0.55
153 0.56
154 0.52
155 0.44
156 0.37
157 0.32
158 0.29
159 0.26
160 0.18
161 0.15
162 0.13
163 0.13
164 0.12
165 0.1
166 0.14
167 0.14
168 0.15
169 0.16
170 0.16
171 0.16
172 0.19
173 0.19
174 0.16
175 0.2
176 0.24
177 0.26
178 0.29
179 0.29
180 0.34
181 0.38
182 0.44
183 0.45
184 0.47
185 0.48
186 0.47
187 0.55
188 0.49
189 0.52
190 0.53
191 0.49
192 0.42
193 0.41
194 0.39
195 0.31
196 0.33
197 0.26
198 0.19
199 0.21
200 0.19
201 0.18
202 0.21
203 0.23
204 0.2
205 0.23
206 0.22
207 0.18
208 0.18
209 0.18
210 0.16
211 0.13
212 0.12
213 0.09
214 0.08
215 0.08
216 0.08
217 0.08
218 0.09
219 0.11
220 0.13
221 0.14
222 0.15
223 0.15
224 0.16
225 0.18
226 0.16
227 0.16
228 0.14
229 0.13
230 0.14
231 0.14
232 0.13
233 0.1
234 0.09
235 0.06
236 0.06
237 0.07
238 0.06
239 0.08
240 0.11
241 0.11
242 0.13
243 0.15
244 0.21
245 0.27
246 0.37
247 0.44
248 0.49
249 0.55
250 0.63
251 0.7
252 0.73
253 0.75
254 0.76
255 0.78
256 0.79
257 0.83
258 0.83
259 0.81
260 0.78
261 0.79
262 0.73
263 0.65
264 0.64
265 0.63
266 0.63
267 0.63
268 0.67
269 0.68
270 0.74
271 0.83
272 0.85
273 0.87
274 0.88
275 0.89
276 0.87
277 0.81
278 0.75
279 0.65
280 0.57
281 0.5
282 0.4
283 0.34
284 0.25
285 0.21
286 0.18
287 0.18
288 0.15
289 0.1
290 0.11
291 0.1
292 0.09
293 0.1
294 0.08
295 0.08
296 0.12
297 0.13
298 0.12
299 0.14
300 0.18
301 0.21
302 0.25
303 0.28
304 0.28
305 0.31
306 0.31
307 0.33
308 0.31
309 0.3
310 0.28
311 0.25
312 0.22
313 0.18
314 0.18
315 0.15
316 0.12
317 0.11
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.12
325 0.11
326 0.09
327 0.08
328 0.08
329 0.08
330 0.07
331 0.07
332 0.05
333 0.05
334 0.05
335 0.06
336 0.06
337 0.06
338 0.06
339 0.07
340 0.08
341 0.12
342 0.21
343 0.23
344 0.26
345 0.29
346 0.33
347 0.33
348 0.37
349 0.34
350 0.25
351 0.23
352 0.2
353 0.18
354 0.13
355 0.13
356 0.08
357 0.07
358 0.05
359 0.05
360 0.06
361 0.06
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.05
370 0.05
371 0.06
372 0.08
373 0.08
374 0.07
375 0.07
376 0.09
377 0.09
378 0.09
379 0.08
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.07
384 0.05
385 0.05
386 0.04
387 0.04
388 0.03
389 0.03
390 0.03
391 0.03
392 0.02
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.03
398 0.04
399 0.05
400 0.06
401 0.12
402 0.13
403 0.13
404 0.14
405 0.14
406 0.16
407 0.16
408 0.15
409 0.1
410 0.11
411 0.11
412 0.1
413 0.09
414 0.08
415 0.1
416 0.11
417 0.14
418 0.15
419 0.17
420 0.25
421 0.26
422 0.29
423 0.3
424 0.33
425 0.33
426 0.37
427 0.4
428 0.33
429 0.34
430 0.31
431 0.26
432 0.21
433 0.17
434 0.11
435 0.07
436 0.08
437 0.06
438 0.07
439 0.07
440 0.07
441 0.08
442 0.08
443 0.12
444 0.13
445 0.19
446 0.21
447 0.24
448 0.31
449 0.39
450 0.44
451 0.47
452 0.53
453 0.55
454 0.61
455 0.66
456 0.62
457 0.57
458 0.51
459 0.45
460 0.39
461 0.33
462 0.29
463 0.27
464 0.27
465 0.27
466 0.27
467 0.28
468 0.26
469 0.24
470 0.24
471 0.17
472 0.17
473 0.14
474 0.13
475 0.11
476 0.1
477 0.09
478 0.06
479 0.06
480 0.04
481 0.03
482 0.04
483 0.05
484 0.05
485 0.07
486 0.13
487 0.2
488 0.29
489 0.4
490 0.49
491 0.59
492 0.65
493 0.7
494 0.69
495 0.7
496 0.69
497 0.68
498 0.66
499 0.58
500 0.52
501 0.46
502 0.42
503 0.34
504 0.27
505 0.16
506 0.1
507 0.07
508 0.07
509 0.08
510 0.09
511 0.1
512 0.1
513 0.1
514 0.09
515 0.09
516 0.09
517 0.11
518 0.1
519 0.1
520 0.09
521 0.09
522 0.1
523 0.1
524 0.09
525 0.08
526 0.07
527 0.06
528 0.06
529 0.06
530 0.05
531 0.06
532 0.07
533 0.08
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.11
538 0.12
539 0.12
540 0.12
541 0.13
542 0.12
543 0.13
544 0.13
545 0.13
546 0.14
547 0.16
548 0.21
549 0.21
550 0.22
551 0.27
552 0.33
553 0.34
554 0.41
555 0.41
556 0.41
557 0.42
558 0.41
559 0.39
560 0.35
561 0.32
562 0.25
563 0.22
564 0.17
565 0.16
566 0.21
567 0.22
568 0.26
569 0.3
570 0.31
571 0.37
572 0.38
573 0.38
574 0.32
575 0.28
576 0.22
577 0.19
578 0.18
579 0.11
580 0.1
581 0.11
582 0.11
583 0.11
584 0.12
585 0.16
586 0.16
587 0.15
588 0.15
589 0.14
590 0.15
591 0.15
592 0.14
593 0.13
594 0.14
595 0.15
596 0.16
597 0.17
598 0.17
599 0.21
600 0.24
601 0.21
602 0.24
603 0.26
604 0.24
605 0.24
606 0.24
607 0.3
608 0.33
609 0.38
610 0.45
611 0.53
612 0.62
613 0.68
614 0.74
615 0.76
616 0.79
617 0.84
618 0.85
619 0.86
620 0.82
621 0.8
622 0.73
623 0.62
624 0.51
625 0.44
626 0.36
627 0.28
628 0.23
629 0.19
630 0.18
631 0.18
632 0.18
633 0.15
634 0.15
635 0.16
636 0.17
637 0.2
638 0.22
639 0.26
640 0.35
641 0.45
642 0.52
643 0.55
644 0.58
645 0.61
646 0.64
647 0.61
648 0.56
649 0.53
650 0.46
651 0.44
652 0.43
653 0.41
654 0.39
655 0.42
656 0.44
657 0.46
658 0.49
659 0.49
660 0.55
661 0.57
662 0.6
663 0.65
664 0.67
665 0.64
666 0.63
667 0.66
668 0.64
669 0.64
670 0.67
671 0.67
672 0.65
673 0.65
674 0.69
675 0.67
676 0.67
677 0.68
678 0.68
679 0.68
680 0.68
681 0.71
682 0.73
683 0.76
684 0.8
685 0.82
686 0.77
687 0.76
688 0.73
689 0.7
690 0.61
691 0.57
692 0.53
693 0.51
694 0.51
695 0.48
696 0.53
697 0.57
698 0.65
699 0.68
700 0.69
701 0.71
702 0.75
703 0.82
704 0.83
705 0.83
706 0.79
707 0.74
708 0.72
709 0.64
710 0.6
711 0.59
712 0.57
713 0.54
714 0.59
715 0.6
716 0.57
717 0.66
718 0.72
719 0.72
720 0.73
721 0.75