Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q4HZ47

Protein Details
Accession Q4HZ47    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
73-94EDKKEDQPEKPKRKSKDTTSTEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
267-274KAKAKKRK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 13, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039119  ABT1/Esf2  
IPR034353  ABT1/ESF2_RRM  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG fgr:FGSG_09761  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12263  RRM_ABT1_like  
Amino Acid Sequences MAPETKNDFLEIADSDADSDIGYNSEEDDMQKGGRGAKRRKVESDDEDDPGSDIGSDDEDEATEKDSKKTQEEDKKEDQPEKPKRKSKDTTSTELPDVTRTLTKKNLVASEAAIKKSGVVYLSRIPPFMKPAKLRSLLEPYGTINRIFLAPEDPASHARRVRAGGNKKRSYTEGWVEFTKKKDAKAVCDLLNARTIGGKKGSYYHDDLWNLLYLKGFKWHNLTEQIAAENAERSSRMRAEISKSTKENKEFVRNVEKAKMLDGMAVKAKAKKRKAETHTEGQEDESVRQVKRSFKQVPLAKKKMDGEDQPAEVTRVLSKIF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.12
3 0.12
4 0.12
5 0.09
6 0.08
7 0.07
8 0.07
9 0.07
10 0.07
11 0.07
12 0.08
13 0.09
14 0.1
15 0.11
16 0.12
17 0.11
18 0.13
19 0.14
20 0.2
21 0.24
22 0.33
23 0.4
24 0.48
25 0.57
26 0.61
27 0.66
28 0.66
29 0.7
30 0.67
31 0.67
32 0.61
33 0.55
34 0.49
35 0.43
36 0.36
37 0.27
38 0.2
39 0.12
40 0.08
41 0.06
42 0.07
43 0.07
44 0.07
45 0.07
46 0.07
47 0.08
48 0.09
49 0.11
50 0.14
51 0.15
52 0.17
53 0.22
54 0.25
55 0.28
56 0.33
57 0.41
58 0.47
59 0.53
60 0.59
61 0.61
62 0.67
63 0.68
64 0.69
65 0.65
66 0.65
67 0.69
68 0.71
69 0.74
70 0.74
71 0.75
72 0.79
73 0.81
74 0.8
75 0.8
76 0.76
77 0.73
78 0.71
79 0.68
80 0.59
81 0.52
82 0.42
83 0.33
84 0.27
85 0.22
86 0.2
87 0.17
88 0.2
89 0.23
90 0.25
91 0.26
92 0.29
93 0.29
94 0.26
95 0.26
96 0.23
97 0.27
98 0.27
99 0.25
100 0.22
101 0.19
102 0.19
103 0.18
104 0.18
105 0.11
106 0.08
107 0.11
108 0.15
109 0.21
110 0.21
111 0.21
112 0.21
113 0.21
114 0.26
115 0.27
116 0.29
117 0.27
118 0.31
119 0.38
120 0.41
121 0.41
122 0.4
123 0.43
124 0.37
125 0.35
126 0.31
127 0.25
128 0.24
129 0.24
130 0.2
131 0.13
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.08
137 0.07
138 0.08
139 0.09
140 0.1
141 0.14
142 0.16
143 0.19
144 0.18
145 0.19
146 0.2
147 0.21
148 0.24
149 0.29
150 0.37
151 0.43
152 0.52
153 0.55
154 0.54
155 0.55
156 0.52
157 0.47
158 0.42
159 0.4
160 0.33
161 0.31
162 0.32
163 0.34
164 0.34
165 0.32
166 0.35
167 0.3
168 0.27
169 0.31
170 0.32
171 0.34
172 0.39
173 0.41
174 0.33
175 0.36
176 0.36
177 0.3
178 0.31
179 0.26
180 0.18
181 0.17
182 0.17
183 0.14
184 0.16
185 0.15
186 0.12
187 0.17
188 0.19
189 0.21
190 0.25
191 0.26
192 0.29
193 0.3
194 0.29
195 0.26
196 0.26
197 0.23
198 0.19
199 0.17
200 0.12
201 0.12
202 0.18
203 0.17
204 0.16
205 0.21
206 0.22
207 0.25
208 0.29
209 0.3
210 0.26
211 0.27
212 0.25
213 0.2
214 0.2
215 0.16
216 0.13
217 0.11
218 0.1
219 0.09
220 0.1
221 0.14
222 0.14
223 0.16
224 0.18
225 0.21
226 0.27
227 0.36
228 0.4
229 0.43
230 0.45
231 0.5
232 0.53
233 0.53
234 0.53
235 0.51
236 0.55
237 0.51
238 0.54
239 0.57
240 0.53
241 0.54
242 0.53
243 0.49
244 0.39
245 0.38
246 0.34
247 0.24
248 0.25
249 0.22
250 0.2
251 0.21
252 0.22
253 0.23
254 0.27
255 0.34
256 0.39
257 0.45
258 0.52
259 0.57
260 0.66
261 0.71
262 0.75
263 0.76
264 0.77
265 0.77
266 0.71
267 0.62
268 0.53
269 0.51
270 0.41
271 0.34
272 0.31
273 0.29
274 0.26
275 0.3
276 0.32
277 0.37
278 0.41
279 0.5
280 0.5
281 0.52
282 0.62
283 0.64
284 0.71
285 0.74
286 0.76
287 0.69
288 0.69
289 0.67
290 0.65
291 0.65
292 0.59
293 0.56
294 0.55
295 0.53
296 0.48
297 0.44
298 0.38
299 0.31
300 0.27
301 0.21