Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RT05

Protein Details
Accession I1RT05    Localization Confidence Low Confidence Score 9.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
194-213ATLIPPRKANSKKRGRGGGRBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
199-218PRKANSKKRGRGGGRGGGAR
Subcellular Location(s) mito 10, cyto 9.5, cyto_nucl 8.5, nucl 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020103  PsdUridine_synth_cat_dom_sf  
IPR001656  PsdUridine_synth_TruD  
IPR011760  PsdUridine_synth_TruD_insert  
IPR042214  TruD_catalytic  
Gene Ontology GO:0009982  F:pseudouridine synthase activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0001522  P:pseudouridine synthesis  
KEGG fgr:FGSG_07294  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01142  TruD  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50984  TRUD  
CDD cd02576  PseudoU_synth_ScPUS7  
Amino Acid Sequences MAEQNHHTARGTTSYTRSIGISQRVTPLAISWTGEMRTRFSDFQVNEISEDGSVLHLQQIGIAGEETPATETKKEANGESGVKETKHEEPAQDAEKQPSNETAAETKPAAQPEQVNEVSAEDAAILEGLTDQRFARELIEVYKAGSGPDNDKRKTVTSEAMDDRAKRGQVHQEIRRIFKSRVDTNTGDDGAIIATLIPPRKANSKKRGRGGGRGGGARDEKPAGEYLHFTLFKENRDTMDAVNQISRFLKVKPQVIGYAGTKDRRASTVQRCSVRYMRPRNLAGINGRIWGVSTGDYEYKDKPIYLGQLLGNEFVIAIKSCQMVGENSDESIAEQVEKLKKNVDSSLSHMNEHGWINYFGHQRFGTHEVGTHQIGQLILGDKYEEAVKSLLHYDDEIAQKAEAGEIPEEPSKRDEYLRNQACMLFLTNKDVRRAIDIMPRRFSAENCIFRHLNRQGAQSRRDFIGSLVHITRGLRSMYLHAYQSYVWNHAVSRRWELHGENVIPGDLIIAPAETTPLVSGQDQDGDDIINPVEDDEDTPVRARPLTAEEAASGNYTIFDIVLPTPGYDVVYPENDMGEFYKEFMGRDENGNLDPYKMRRMRREFSLPGRYRKIMNRFLATPSAEVRAYSDDTEQMHPTDLDNIKASKSANRKRSRDDAESDSTAKKAKVEDSTEIEMTDASGQAGEGETGPSENTSEATPAVQEPSKIAVIVKFQLGRSAYATVALRELMGDPPADSE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.36
3 0.36
4 0.34
5 0.33
6 0.35
7 0.38
8 0.37
9 0.35
10 0.38
11 0.38
12 0.37
13 0.33
14 0.27
15 0.23
16 0.21
17 0.19
18 0.16
19 0.18
20 0.19
21 0.24
22 0.23
23 0.23
24 0.26
25 0.29
26 0.29
27 0.29
28 0.36
29 0.32
30 0.36
31 0.39
32 0.36
33 0.32
34 0.31
35 0.29
36 0.2
37 0.19
38 0.14
39 0.1
40 0.09
41 0.08
42 0.09
43 0.1
44 0.1
45 0.1
46 0.12
47 0.11
48 0.11
49 0.11
50 0.09
51 0.08
52 0.09
53 0.08
54 0.08
55 0.1
56 0.12
57 0.12
58 0.13
59 0.18
60 0.24
61 0.26
62 0.25
63 0.28
64 0.3
65 0.32
66 0.32
67 0.32
68 0.3
69 0.28
70 0.28
71 0.28
72 0.29
73 0.33
74 0.34
75 0.3
76 0.32
77 0.38
78 0.39
79 0.4
80 0.37
81 0.36
82 0.39
83 0.39
84 0.36
85 0.33
86 0.33
87 0.29
88 0.3
89 0.28
90 0.24
91 0.25
92 0.24
93 0.24
94 0.24
95 0.26
96 0.24
97 0.23
98 0.25
99 0.26
100 0.33
101 0.3
102 0.27
103 0.25
104 0.24
105 0.22
106 0.18
107 0.14
108 0.07
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.03
114 0.04
115 0.05
116 0.06
117 0.07
118 0.07
119 0.08
120 0.1
121 0.1
122 0.11
123 0.12
124 0.13
125 0.15
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.19
130 0.18
131 0.16
132 0.17
133 0.16
134 0.19
135 0.27
136 0.35
137 0.34
138 0.36
139 0.38
140 0.39
141 0.42
142 0.4
143 0.38
144 0.33
145 0.39
146 0.4
147 0.42
148 0.41
149 0.37
150 0.36
151 0.33
152 0.32
153 0.26
154 0.28
155 0.33
156 0.39
157 0.48
158 0.51
159 0.56
160 0.58
161 0.62
162 0.63
163 0.58
164 0.5
165 0.46
166 0.48
167 0.46
168 0.47
169 0.49
170 0.45
171 0.44
172 0.48
173 0.42
174 0.34
175 0.27
176 0.22
177 0.15
178 0.13
179 0.08
180 0.04
181 0.04
182 0.07
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.13
187 0.23
188 0.32
189 0.41
190 0.49
191 0.59
192 0.66
193 0.73
194 0.81
195 0.76
196 0.76
197 0.74
198 0.7
199 0.63
200 0.57
201 0.5
202 0.44
203 0.42
204 0.33
205 0.28
206 0.22
207 0.17
208 0.16
209 0.18
210 0.15
211 0.14
212 0.15
213 0.15
214 0.21
215 0.21
216 0.2
217 0.26
218 0.26
219 0.28
220 0.31
221 0.3
222 0.25
223 0.27
224 0.28
225 0.21
226 0.25
227 0.23
228 0.2
229 0.21
230 0.2
231 0.18
232 0.18
233 0.19
234 0.14
235 0.14
236 0.2
237 0.22
238 0.27
239 0.28
240 0.29
241 0.29
242 0.29
243 0.31
244 0.25
245 0.26
246 0.24
247 0.24
248 0.23
249 0.23
250 0.23
251 0.22
252 0.25
253 0.27
254 0.34
255 0.42
256 0.47
257 0.51
258 0.51
259 0.54
260 0.56
261 0.56
262 0.56
263 0.55
264 0.56
265 0.58
266 0.58
267 0.56
268 0.52
269 0.48
270 0.41
271 0.36
272 0.29
273 0.23
274 0.22
275 0.17
276 0.16
277 0.13
278 0.11
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.11
284 0.13
285 0.13
286 0.15
287 0.15
288 0.14
289 0.13
290 0.14
291 0.15
292 0.14
293 0.16
294 0.14
295 0.16
296 0.17
297 0.16
298 0.14
299 0.11
300 0.1
301 0.07
302 0.07
303 0.04
304 0.04
305 0.05
306 0.05
307 0.05
308 0.06
309 0.07
310 0.06
311 0.08
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.1
316 0.1
317 0.09
318 0.09
319 0.08
320 0.05
321 0.05
322 0.09
323 0.14
324 0.16
325 0.16
326 0.19
327 0.2
328 0.22
329 0.24
330 0.24
331 0.2
332 0.23
333 0.31
334 0.29
335 0.28
336 0.26
337 0.24
338 0.23
339 0.21
340 0.18
341 0.11
342 0.11
343 0.11
344 0.16
345 0.19
346 0.17
347 0.19
348 0.19
349 0.17
350 0.19
351 0.23
352 0.19
353 0.16
354 0.17
355 0.15
356 0.17
357 0.18
358 0.15
359 0.11
360 0.1
361 0.1
362 0.09
363 0.09
364 0.08
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.05
369 0.06
370 0.07
371 0.06
372 0.05
373 0.06
374 0.06
375 0.07
376 0.08
377 0.08
378 0.07
379 0.08
380 0.07
381 0.11
382 0.13
383 0.12
384 0.12
385 0.11
386 0.11
387 0.11
388 0.1
389 0.07
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.08
394 0.11
395 0.11
396 0.12
397 0.13
398 0.13
399 0.14
400 0.17
401 0.2
402 0.25
403 0.35
404 0.38
405 0.38
406 0.37
407 0.36
408 0.33
409 0.28
410 0.23
411 0.16
412 0.12
413 0.17
414 0.2
415 0.21
416 0.23
417 0.23
418 0.22
419 0.22
420 0.24
421 0.21
422 0.25
423 0.31
424 0.34
425 0.35
426 0.35
427 0.34
428 0.33
429 0.31
430 0.32
431 0.33
432 0.37
433 0.36
434 0.4
435 0.38
436 0.37
437 0.46
438 0.4
439 0.38
440 0.33
441 0.37
442 0.39
443 0.45
444 0.49
445 0.43
446 0.43
447 0.37
448 0.35
449 0.29
450 0.23
451 0.23
452 0.19
453 0.19
454 0.17
455 0.16
456 0.17
457 0.16
458 0.17
459 0.13
460 0.12
461 0.1
462 0.1
463 0.13
464 0.15
465 0.17
466 0.17
467 0.15
468 0.16
469 0.15
470 0.19
471 0.18
472 0.17
473 0.16
474 0.15
475 0.16
476 0.19
477 0.24
478 0.22
479 0.27
480 0.27
481 0.28
482 0.3
483 0.31
484 0.32
485 0.33
486 0.31
487 0.25
488 0.23
489 0.21
490 0.19
491 0.17
492 0.12
493 0.06
494 0.05
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.05
500 0.04
501 0.04
502 0.04
503 0.05
504 0.06
505 0.06
506 0.07
507 0.08
508 0.11
509 0.11
510 0.11
511 0.1
512 0.09
513 0.09
514 0.09
515 0.08
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.05
520 0.05
521 0.06
522 0.09
523 0.1
524 0.1
525 0.11
526 0.12
527 0.13
528 0.13
529 0.13
530 0.11
531 0.15
532 0.19
533 0.19
534 0.18
535 0.18
536 0.19
537 0.19
538 0.17
539 0.13
540 0.08
541 0.07
542 0.07
543 0.06
544 0.05
545 0.05
546 0.06
547 0.06
548 0.08
549 0.08
550 0.08
551 0.09
552 0.09
553 0.1
554 0.09
555 0.1
556 0.1
557 0.12
558 0.12
559 0.12
560 0.12
561 0.11
562 0.12
563 0.11
564 0.12
565 0.11
566 0.11
567 0.14
568 0.15
569 0.15
570 0.16
571 0.19
572 0.17
573 0.2
574 0.21
575 0.19
576 0.2
577 0.22
578 0.21
579 0.19
580 0.21
581 0.2
582 0.28
583 0.32
584 0.37
585 0.45
586 0.53
587 0.57
588 0.61
589 0.68
590 0.65
591 0.69
592 0.74
593 0.7
594 0.7
595 0.71
596 0.65
597 0.61
598 0.63
599 0.63
600 0.61
601 0.6
602 0.57
603 0.53
604 0.54
605 0.54
606 0.47
607 0.39
608 0.32
609 0.29
610 0.24
611 0.22
612 0.2
613 0.19
614 0.2
615 0.19
616 0.19
617 0.18
618 0.21
619 0.24
620 0.24
621 0.21
622 0.21
623 0.19
624 0.19
625 0.24
626 0.23
627 0.22
628 0.24
629 0.24
630 0.23
631 0.25
632 0.25
633 0.24
634 0.34
635 0.41
636 0.48
637 0.58
638 0.63
639 0.68
640 0.77
641 0.78
642 0.74
643 0.71
644 0.68
645 0.65
646 0.62
647 0.58
648 0.49
649 0.43
650 0.39
651 0.33
652 0.29
653 0.25
654 0.27
655 0.31
656 0.35
657 0.39
658 0.42
659 0.46
660 0.43
661 0.4
662 0.35
663 0.27
664 0.23
665 0.18
666 0.12
667 0.07
668 0.07
669 0.07
670 0.07
671 0.08
672 0.07
673 0.06
674 0.07
675 0.07
676 0.07
677 0.08
678 0.08
679 0.08
680 0.08
681 0.09
682 0.09
683 0.1
684 0.1
685 0.1
686 0.11
687 0.12
688 0.16
689 0.17
690 0.16
691 0.17
692 0.2
693 0.21
694 0.2
695 0.2
696 0.18
697 0.21
698 0.23
699 0.27
700 0.26
701 0.25
702 0.31
703 0.31
704 0.3
705 0.28
706 0.28
707 0.23
708 0.24
709 0.25
710 0.2
711 0.2
712 0.18
713 0.15
714 0.14
715 0.15
716 0.12
717 0.12
718 0.12