Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1C3YKT6

Protein Details
Accession A0A1C3YKT6    Localization Confidence High Confidence Score 22.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
50-69QPPKDASPPPRKRSPSPPHEBasic
319-341GEEKRKRRDYRQMRKEQFKRPEPBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
30-63KKPVAKSKKGIQKYFSKVKEQPPKDASPPPRKRS
301-304KAKK
319-338GEEKRKRRDYRQMRKEQFKR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028942  WHIM1_dom  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF15612  WHIM1  
Amino Acid Sequences MSAEDDSSDLSSLSSLSPAPSDIELEEPVKKPVAKSKKGIQKYFSKVKEQPPKDASPPPRKRSPSPPHEYVLADNPDIAFIVMFRSRFNDAFPKSLAHFGPQEIERDVVESIPGDRAEHFLCALLGLLLNRKQDVKCGRTLTSKVQYANEYPVRPGHYGRALEDAISSHKNQWAPAWNDKSPLSGGATFTSMDPTQRLTLLRYLIMWTLSSSESVKGLINQSYKQNRHEDDLNQPRSVQPWGSDGDKRRYFLIEGQDDTAFRVYRESNPAGTNRTWYSVAGTIEELRALAEKLEAKDGGPKAKKLAQKMYTAIPRFEAGEEKRKRRDYRQMRKEQFKRPEPGFSLYEGRTRGKKMKYTYSDDEDVFTTDSTTRRSTRNTGTHTPVETGPLTTASGRQIKAPTRLNPTTGSSAPGSVQGDTSEVEKESSVGPTGRPRRSAAVNHGTSGWAEPKKTSRRNASDDSDEESEAEFGDDEEDADEHVPEGSEDEDELDEDEVMADDDLDEQNQSLVVKLSVTPPKLRNVLEPNAQAGNKLPTPSSDKAAEESRPLGETVVEMEDAPAATPSKESQPTAQQSPSQDPDFAECQNSTPGTIHATSLAFRGSPEKTHAQPVPRPLEKQQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.08
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.13
7 0.13
8 0.14
9 0.13
10 0.15
11 0.17
12 0.19
13 0.23
14 0.22
15 0.24
16 0.26
17 0.27
18 0.27
19 0.35
20 0.44
21 0.47
22 0.52
23 0.6
24 0.66
25 0.74
26 0.78
27 0.74
28 0.74
29 0.76
30 0.79
31 0.74
32 0.73
33 0.7
34 0.74
35 0.78
36 0.72
37 0.73
38 0.69
39 0.7
40 0.67
41 0.7
42 0.69
43 0.7
44 0.76
45 0.74
46 0.77
47 0.77
48 0.78
49 0.8
50 0.8
51 0.8
52 0.78
53 0.76
54 0.69
55 0.66
56 0.61
57 0.53
58 0.5
59 0.43
60 0.34
61 0.29
62 0.26
63 0.22
64 0.21
65 0.17
66 0.09
67 0.05
68 0.09
69 0.11
70 0.12
71 0.12
72 0.15
73 0.19
74 0.2
75 0.24
76 0.29
77 0.29
78 0.33
79 0.33
80 0.33
81 0.31
82 0.36
83 0.33
84 0.27
85 0.26
86 0.23
87 0.27
88 0.26
89 0.27
90 0.22
91 0.23
92 0.19
93 0.19
94 0.18
95 0.12
96 0.12
97 0.09
98 0.09
99 0.11
100 0.11
101 0.11
102 0.11
103 0.14
104 0.14
105 0.15
106 0.14
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.1
111 0.07
112 0.07
113 0.07
114 0.11
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.2
119 0.19
120 0.27
121 0.34
122 0.34
123 0.37
124 0.4
125 0.43
126 0.46
127 0.49
128 0.5
129 0.5
130 0.5
131 0.46
132 0.45
133 0.44
134 0.4
135 0.44
136 0.41
137 0.34
138 0.31
139 0.32
140 0.33
141 0.31
142 0.31
143 0.28
144 0.29
145 0.29
146 0.29
147 0.3
148 0.26
149 0.25
150 0.24
151 0.2
152 0.17
153 0.18
154 0.18
155 0.16
156 0.19
157 0.2
158 0.2
159 0.24
160 0.29
161 0.32
162 0.4
163 0.44
164 0.41
165 0.43
166 0.43
167 0.4
168 0.32
169 0.28
170 0.22
171 0.16
172 0.17
173 0.14
174 0.15
175 0.14
176 0.13
177 0.15
178 0.12
179 0.12
180 0.11
181 0.12
182 0.12
183 0.14
184 0.15
185 0.14
186 0.17
187 0.17
188 0.17
189 0.15
190 0.16
191 0.15
192 0.14
193 0.12
194 0.09
195 0.1
196 0.1
197 0.1
198 0.1
199 0.09
200 0.09
201 0.1
202 0.1
203 0.1
204 0.12
205 0.15
206 0.17
207 0.18
208 0.26
209 0.34
210 0.37
211 0.4
212 0.44
213 0.41
214 0.43
215 0.46
216 0.4
217 0.42
218 0.49
219 0.48
220 0.42
221 0.4
222 0.37
223 0.34
224 0.33
225 0.23
226 0.14
227 0.13
228 0.15
229 0.17
230 0.22
231 0.25
232 0.32
233 0.34
234 0.34
235 0.32
236 0.32
237 0.3
238 0.3
239 0.33
240 0.26
241 0.25
242 0.26
243 0.25
244 0.24
245 0.23
246 0.21
247 0.13
248 0.1
249 0.11
250 0.11
251 0.14
252 0.2
253 0.2
254 0.21
255 0.22
256 0.24
257 0.26
258 0.24
259 0.25
260 0.19
261 0.2
262 0.19
263 0.17
264 0.17
265 0.17
266 0.17
267 0.14
268 0.14
269 0.12
270 0.11
271 0.11
272 0.09
273 0.05
274 0.06
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.08
279 0.08
280 0.1
281 0.1
282 0.09
283 0.15
284 0.16
285 0.22
286 0.22
287 0.22
288 0.23
289 0.29
290 0.32
291 0.31
292 0.38
293 0.35
294 0.37
295 0.38
296 0.4
297 0.41
298 0.39
299 0.34
300 0.27
301 0.23
302 0.2
303 0.19
304 0.19
305 0.15
306 0.25
307 0.3
308 0.35
309 0.42
310 0.48
311 0.52
312 0.54
313 0.63
314 0.64
315 0.7
316 0.75
317 0.79
318 0.8
319 0.86
320 0.86
321 0.85
322 0.83
323 0.79
324 0.74
325 0.65
326 0.63
327 0.56
328 0.52
329 0.44
330 0.36
331 0.34
332 0.28
333 0.3
334 0.26
335 0.25
336 0.23
337 0.26
338 0.31
339 0.31
340 0.36
341 0.37
342 0.45
343 0.49
344 0.54
345 0.55
346 0.53
347 0.51
348 0.45
349 0.42
350 0.32
351 0.27
352 0.2
353 0.15
354 0.11
355 0.1
356 0.11
357 0.12
358 0.15
359 0.17
360 0.19
361 0.23
362 0.27
363 0.34
364 0.41
365 0.45
366 0.47
367 0.5
368 0.5
369 0.48
370 0.45
371 0.36
372 0.31
373 0.25
374 0.19
375 0.14
376 0.12
377 0.11
378 0.1
379 0.11
380 0.12
381 0.16
382 0.16
383 0.19
384 0.23
385 0.26
386 0.33
387 0.38
388 0.39
389 0.44
390 0.45
391 0.44
392 0.42
393 0.41
394 0.38
395 0.32
396 0.29
397 0.21
398 0.2
399 0.19
400 0.19
401 0.17
402 0.13
403 0.13
404 0.1
405 0.11
406 0.1
407 0.11
408 0.09
409 0.08
410 0.09
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.1
416 0.09
417 0.11
418 0.2
419 0.28
420 0.31
421 0.33
422 0.34
423 0.37
424 0.42
425 0.45
426 0.45
427 0.47
428 0.44
429 0.42
430 0.4
431 0.36
432 0.31
433 0.28
434 0.25
435 0.17
436 0.17
437 0.19
438 0.27
439 0.37
440 0.44
441 0.5
442 0.54
443 0.59
444 0.66
445 0.7
446 0.67
447 0.63
448 0.57
449 0.54
450 0.46
451 0.38
452 0.32
453 0.25
454 0.2
455 0.14
456 0.12
457 0.07
458 0.05
459 0.06
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.05
464 0.06
465 0.06
466 0.06
467 0.06
468 0.06
469 0.06
470 0.05
471 0.06
472 0.06
473 0.06
474 0.06
475 0.07
476 0.07
477 0.07
478 0.08
479 0.07
480 0.07
481 0.06
482 0.06
483 0.05
484 0.06
485 0.05
486 0.04
487 0.04
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.06
494 0.07
495 0.07
496 0.06
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.16
502 0.21
503 0.24
504 0.3
505 0.32
506 0.38
507 0.42
508 0.43
509 0.44
510 0.45
511 0.48
512 0.49
513 0.47
514 0.44
515 0.44
516 0.42
517 0.35
518 0.3
519 0.3
520 0.25
521 0.25
522 0.22
523 0.21
524 0.29
525 0.31
526 0.32
527 0.3
528 0.29
529 0.32
530 0.36
531 0.34
532 0.3
533 0.29
534 0.26
535 0.24
536 0.23
537 0.2
538 0.15
539 0.14
540 0.13
541 0.12
542 0.11
543 0.1
544 0.1
545 0.1
546 0.1
547 0.1
548 0.09
549 0.09
550 0.08
551 0.1
552 0.12
553 0.19
554 0.23
555 0.25
556 0.28
557 0.37
558 0.43
559 0.47
560 0.49
561 0.46
562 0.46
563 0.52
564 0.53
565 0.45
566 0.41
567 0.36
568 0.38
569 0.37
570 0.33
571 0.29
572 0.24
573 0.24
574 0.27
575 0.26
576 0.22
577 0.2
578 0.2
579 0.21
580 0.22
581 0.2
582 0.18
583 0.19
584 0.18
585 0.18
586 0.18
587 0.13
588 0.14
589 0.18
590 0.18
591 0.2
592 0.26
593 0.31
594 0.32
595 0.41
596 0.46
597 0.48
598 0.52
599 0.58
600 0.62
601 0.61