Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

I1RAT5

Protein Details
Accession I1RAT5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
29-57QERLRCRRFFVSKSKPKSQPTPKPQAKESHydrophilic
157-181ESPSPSLTTKKRKRESLPKFRPESEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
167-169KRK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 13.5, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001357  BRCT_dom  
IPR036420  BRCT_dom_sf  
IPR002054  DNA-dir_DNA_pol_X  
IPR019843  DNA_pol-X_BS  
IPR010996  DNA_pol_b-like_N  
IPR028207  DNA_pol_B_palm_palm  
IPR018944  DNA_pol_lambd_fingers_domain  
IPR027421  DNA_pol_lamdba_lyase_dom_sf  
IPR037160  DNA_Pol_thumb_sf  
IPR022312  DNA_pol_X  
IPR002008  DNA_pol_X_beta-like  
IPR043519  NT_sf  
IPR029398  PolB_thumb  
Gene Ontology GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003887  F:DNA-directed DNA polymerase activity  
GO:0006281  P:DNA repair  
KEGG fgr:FGSG_00621  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14792  DNA_pol_B_palm  
PF14791  DNA_pol_B_thumb  
PF10391  DNA_pol_lambd_f  
PF14716  HHH_8  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50172  BRCT  
PS00522  DNA_POLYMERASE_X  
CDD cd00141  NT_POLXc  
Amino Acid Sequences MASLEEKEAWFKQLQTPDSDDEFDTEEEQERLRCRRFFVSKSKPKSQPTPKPQAKESLVLDITNDESQYSRVTPRRVASAPSPAPAQGPTIIKGTPMTALGQKSRPATLLNQRGDGAILVDDTPVPDTARPTQRILPRSDSSPLLASLRSLGQAVVESPSPSLTTKKRKRESLPKFRPESEQILKGITFFYVPDDDIAPVRRLRITRAREFGATWVRAPHLATHIVVEKHIKFHELEGILKKINRTLPPKVVNDEYFIDCARFKTLLQSNQKQYCLIGQPVTAENESSVVPRSPLESAHSLPLKPLVKNSRRWDHVPIQGTPERSEQSPHQSQIPETPASSDSQPVILNLQDMVSSRPGSAAHSRNTSLSAVQDTDSARRVQKEDEQKDELSEYIKIMAEYKDLPLDADDEDAQTVTYMGDMEPEEQCLSGSEDEITNARKSRRKTRSSGKYIAFEDRFSCNSAGAKDAKAGNPNARTIEVLQKMSDYYNRIDDHWRTTAYRKAISTLKRQETKITSAEEAQRLPSVGTRLAQKIEEIVTTDRLQRLEFAQKEPMDEALQLFLSIYGVGNSQAQQWLAQGFRTLEDLKAKAKLSPNQSLGIEHYADLNTRIPRSEVEALGLVVKRTAQHIDPEVELIIGGSYRRGAETSGDIDLIITKSNTESSADLRPFLDSLVQRLETEGFLVARLASSRSTSDGSKWHGCCVLPKVSGFSDDDYKPVWRRIDFLLVPESERGAALLYFTGNDIFNRSMRLLASKKGMRLNQRGLYKDVMRGPQRVKVTEGELVEGRDERKIFDILGVKWREPHERWC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.38
3 0.42
4 0.43
5 0.44
6 0.44
7 0.37
8 0.31
9 0.31
10 0.27
11 0.23
12 0.2
13 0.19
14 0.18
15 0.19
16 0.21
17 0.24
18 0.31
19 0.37
20 0.38
21 0.4
22 0.49
23 0.56
24 0.6
25 0.66
26 0.69
27 0.73
28 0.79
29 0.84
30 0.83
31 0.82
32 0.85
33 0.85
34 0.85
35 0.85
36 0.87
37 0.85
38 0.83
39 0.79
40 0.78
41 0.71
42 0.67
43 0.59
44 0.56
45 0.49
46 0.42
47 0.39
48 0.3
49 0.29
50 0.23
51 0.21
52 0.12
53 0.12
54 0.13
55 0.15
56 0.16
57 0.21
58 0.26
59 0.31
60 0.36
61 0.39
62 0.45
63 0.44
64 0.47
65 0.44
66 0.48
67 0.46
68 0.42
69 0.41
70 0.34
71 0.33
72 0.29
73 0.27
74 0.21
75 0.21
76 0.21
77 0.21
78 0.21
79 0.2
80 0.2
81 0.19
82 0.15
83 0.14
84 0.14
85 0.16
86 0.2
87 0.24
88 0.27
89 0.3
90 0.31
91 0.31
92 0.3
93 0.28
94 0.32
95 0.38
96 0.44
97 0.42
98 0.42
99 0.41
100 0.4
101 0.38
102 0.3
103 0.21
104 0.12
105 0.1
106 0.08
107 0.08
108 0.07
109 0.07
110 0.08
111 0.08
112 0.09
113 0.1
114 0.13
115 0.21
116 0.3
117 0.32
118 0.35
119 0.41
120 0.48
121 0.52
122 0.54
123 0.53
124 0.48
125 0.48
126 0.47
127 0.42
128 0.36
129 0.33
130 0.29
131 0.23
132 0.2
133 0.17
134 0.15
135 0.15
136 0.13
137 0.12
138 0.1
139 0.09
140 0.09
141 0.1
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.09
146 0.1
147 0.11
148 0.11
149 0.17
150 0.24
151 0.34
152 0.44
153 0.54
154 0.62
155 0.69
156 0.78
157 0.83
158 0.86
159 0.86
160 0.88
161 0.87
162 0.84
163 0.78
164 0.75
165 0.68
166 0.66
167 0.6
168 0.53
169 0.44
170 0.4
171 0.37
172 0.31
173 0.26
174 0.18
175 0.13
176 0.08
177 0.1
178 0.09
179 0.1
180 0.1
181 0.11
182 0.11
183 0.13
184 0.16
185 0.15
186 0.15
187 0.16
188 0.19
189 0.19
190 0.25
191 0.33
192 0.38
193 0.43
194 0.47
195 0.48
196 0.45
197 0.45
198 0.45
199 0.43
200 0.36
201 0.3
202 0.27
203 0.25
204 0.25
205 0.25
206 0.21
207 0.16
208 0.17
209 0.16
210 0.16
211 0.2
212 0.19
213 0.2
214 0.22
215 0.2
216 0.21
217 0.22
218 0.21
219 0.17
220 0.18
221 0.23
222 0.2
223 0.23
224 0.23
225 0.25
226 0.26
227 0.27
228 0.26
229 0.24
230 0.28
231 0.31
232 0.34
233 0.37
234 0.44
235 0.49
236 0.52
237 0.51
238 0.5
239 0.44
240 0.41
241 0.38
242 0.3
243 0.25
244 0.22
245 0.2
246 0.16
247 0.16
248 0.15
249 0.13
250 0.11
251 0.18
252 0.24
253 0.32
254 0.4
255 0.47
256 0.53
257 0.57
258 0.58
259 0.5
260 0.44
261 0.4
262 0.35
263 0.29
264 0.22
265 0.17
266 0.18
267 0.19
268 0.21
269 0.16
270 0.13
271 0.11
272 0.11
273 0.11
274 0.09
275 0.1
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.13
283 0.15
284 0.16
285 0.2
286 0.22
287 0.2
288 0.2
289 0.26
290 0.25
291 0.22
292 0.28
293 0.33
294 0.37
295 0.45
296 0.53
297 0.55
298 0.56
299 0.59
300 0.59
301 0.56
302 0.57
303 0.52
304 0.46
305 0.44
306 0.42
307 0.41
308 0.36
309 0.31
310 0.26
311 0.22
312 0.24
313 0.2
314 0.26
315 0.29
316 0.27
317 0.29
318 0.28
319 0.28
320 0.31
321 0.32
322 0.24
323 0.2
324 0.2
325 0.17
326 0.18
327 0.18
328 0.14
329 0.11
330 0.11
331 0.11
332 0.1
333 0.1
334 0.08
335 0.08
336 0.07
337 0.07
338 0.06
339 0.06
340 0.07
341 0.08
342 0.09
343 0.08
344 0.09
345 0.09
346 0.12
347 0.18
348 0.21
349 0.22
350 0.24
351 0.25
352 0.24
353 0.26
354 0.23
355 0.17
356 0.14
357 0.12
358 0.1
359 0.1
360 0.12
361 0.11
362 0.12
363 0.13
364 0.14
365 0.14
366 0.15
367 0.16
368 0.16
369 0.22
370 0.31
371 0.33
372 0.37
373 0.39
374 0.37
375 0.37
376 0.35
377 0.28
378 0.19
379 0.15
380 0.1
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.08
390 0.08
391 0.08
392 0.07
393 0.08
394 0.06
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.06
399 0.06
400 0.05
401 0.04
402 0.04
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.03
407 0.04
408 0.05
409 0.06
410 0.06
411 0.07
412 0.07
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.08
417 0.07
418 0.07
419 0.07
420 0.07
421 0.07
422 0.08
423 0.1
424 0.1
425 0.13
426 0.17
427 0.21
428 0.26
429 0.36
430 0.45
431 0.5
432 0.56
433 0.63
434 0.7
435 0.74
436 0.77
437 0.69
438 0.64
439 0.59
440 0.59
441 0.49
442 0.39
443 0.33
444 0.27
445 0.25
446 0.23
447 0.21
448 0.15
449 0.15
450 0.15
451 0.16
452 0.14
453 0.14
454 0.15
455 0.16
456 0.17
457 0.19
458 0.21
459 0.23
460 0.24
461 0.25
462 0.23
463 0.21
464 0.21
465 0.19
466 0.25
467 0.22
468 0.21
469 0.2
470 0.19
471 0.19
472 0.19
473 0.2
474 0.15
475 0.13
476 0.18
477 0.19
478 0.2
479 0.25
480 0.25
481 0.27
482 0.28
483 0.28
484 0.24
485 0.27
486 0.31
487 0.29
488 0.31
489 0.26
490 0.27
491 0.32
492 0.35
493 0.41
494 0.45
495 0.49
496 0.51
497 0.51
498 0.54
499 0.52
500 0.51
501 0.45
502 0.39
503 0.32
504 0.3
505 0.34
506 0.3
507 0.27
508 0.23
509 0.2
510 0.18
511 0.17
512 0.15
513 0.13
514 0.12
515 0.13
516 0.15
517 0.17
518 0.18
519 0.18
520 0.16
521 0.16
522 0.15
523 0.14
524 0.13
525 0.12
526 0.14
527 0.15
528 0.18
529 0.18
530 0.18
531 0.17
532 0.17
533 0.19
534 0.24
535 0.25
536 0.25
537 0.3
538 0.3
539 0.31
540 0.3
541 0.28
542 0.2
543 0.19
544 0.16
545 0.11
546 0.1
547 0.09
548 0.08
549 0.06
550 0.06
551 0.05
552 0.05
553 0.04
554 0.05
555 0.05
556 0.06
557 0.07
558 0.08
559 0.09
560 0.09
561 0.09
562 0.09
563 0.11
564 0.11
565 0.1
566 0.11
567 0.11
568 0.11
569 0.14
570 0.14
571 0.14
572 0.18
573 0.2
574 0.19
575 0.23
576 0.23
577 0.24
578 0.3
579 0.34
580 0.37
581 0.43
582 0.43
583 0.42
584 0.42
585 0.39
586 0.35
587 0.31
588 0.25
589 0.18
590 0.17
591 0.14
592 0.14
593 0.14
594 0.16
595 0.16
596 0.16
597 0.17
598 0.16
599 0.17
600 0.23
601 0.25
602 0.21
603 0.2
604 0.2
605 0.2
606 0.22
607 0.22
608 0.15
609 0.11
610 0.12
611 0.1
612 0.12
613 0.15
614 0.13
615 0.17
616 0.21
617 0.23
618 0.22
619 0.23
620 0.2
621 0.17
622 0.16
623 0.11
624 0.07
625 0.06
626 0.05
627 0.05
628 0.06
629 0.06
630 0.07
631 0.07
632 0.08
633 0.1
634 0.13
635 0.15
636 0.15
637 0.15
638 0.14
639 0.13
640 0.14
641 0.13
642 0.11
643 0.08
644 0.08
645 0.09
646 0.1
647 0.11
648 0.11
649 0.12
650 0.14
651 0.22
652 0.22
653 0.23
654 0.22
655 0.22
656 0.2
657 0.2
658 0.22
659 0.15
660 0.18
661 0.21
662 0.22
663 0.21
664 0.22
665 0.23
666 0.17
667 0.17
668 0.15
669 0.1
670 0.1
671 0.1
672 0.08
673 0.08
674 0.09
675 0.09
676 0.09
677 0.1
678 0.11
679 0.14
680 0.17
681 0.17
682 0.2
683 0.24
684 0.3
685 0.37
686 0.36
687 0.36
688 0.37
689 0.37
690 0.39
691 0.39
692 0.4
693 0.34
694 0.33
695 0.34
696 0.32
697 0.34
698 0.31
699 0.28
700 0.27
701 0.25
702 0.26
703 0.24
704 0.28
705 0.29
706 0.33
707 0.35
708 0.3
709 0.33
710 0.35
711 0.43
712 0.38
713 0.38
714 0.38
715 0.33
716 0.34
717 0.32
718 0.29
719 0.2
720 0.18
721 0.15
722 0.1
723 0.09
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.08
728 0.08
729 0.1
730 0.09
731 0.1
732 0.13
733 0.15
734 0.15
735 0.18
736 0.18
737 0.19
738 0.19
739 0.27
740 0.26
741 0.29
742 0.37
743 0.38
744 0.42
745 0.48
746 0.53
747 0.55
748 0.61
749 0.66
750 0.64
751 0.66
752 0.65
753 0.61
754 0.61
755 0.54
756 0.52
757 0.49
758 0.5
759 0.48
760 0.52
761 0.52
762 0.52
763 0.55
764 0.51
765 0.48
766 0.43
767 0.42
768 0.4
769 0.37
770 0.34
771 0.3
772 0.29
773 0.28
774 0.27
775 0.23
776 0.23
777 0.23
778 0.21
779 0.23
780 0.23
781 0.21
782 0.24
783 0.3
784 0.27
785 0.36
786 0.39
787 0.36
788 0.4
789 0.44
790 0.47