FuNGI

E5A8Q8

Protein Details

Accession

E5A8Q8

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
32-61	AAANNGRPPARRRRPQSNPLRAPKRPLQNI	Hydrophilic
536-562	EASGNESSRKKHKKNRDKLTDPSRKSS	Hydrophilic
577-600	MTDAGRIRKEKKKKSRLVLGASPS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
38-56	RPPARRRRPQSNPLRAPKR
525-531	KKKRPGS
540-557	NESSRKKHKKNRDKLTDP
582-592	RIRKEKKKKSR

Subcellular Location(s)

nucl 16, mito 9

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MNGTTLNQTPAAAPAAPTTAPASAGVGSAAAAAANNGRPPARRRRPQSNPLRAPKRPLQNITRPLVSLATMNESKKPAPGLVNDGTQTKEALRQEFIAQGATTFPLVVTRRDLKELRHHVMRLQSKGRVDIEDKMQFTPPIKLHRRDPRAPPSGAGSHFEEEDTKEDLDEIKERERIEQQKEERRKIRDENQAKIAPSGTKKPNAFQKKTEQKYRPDDTPEAKKRQLLRYEETLPWHLEDFENKQTWVGTYESELSEAHVMLTTTDPNNPLAGAIQLAPMERWYRFNVKNKLKPTGDDVDKLMYKIEHVPGFLKNIEARAIKREAQENERGNSGLRTRVGGGGDDEGRIRQPRLDEDGNFVKQEADADDIDFNLEEDFADDEEGLNGLFEGEEEEVKEATEKLKRDQLQAALWERPDELTMERREELEAKLAGEIKAMEKIYRKTLVKREKQYDYADSDPENPYVTESESDTDSETERQRAKEEEEKKAAEQNGKTVEGGNVPSGTSTKGSNTPSGINKLADSNKKKRPGSPNLSEASGNESSRKKHKKNRDKLTDPSRKSSLAALKGAGSGSDSEMTDAGRIRKEKKKKSRLVLGASPSGTPGPSRAGSPSAPNLNGSRAGSPSGAVKQLPTAKEIHDSIPPQGMNLKDLILKFKSRVEHSNTKQFIKLVKAVSSFDKQNSWLTPLAEMPSDENEIYDSIPPQGMNLRDFLPEFKSCFKHTNAKQFIKLVKTVSSFDKQNMWLTPLAEMPSGWNR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.14
2	0.16
3	0.16
4	0.16
5	0.16
6	0.14
7	0.14
8	0.14
9	0.14
10	0.12
11	0.12
12	0.1
13	0.08
14	0.08
15	0.07
16	0.06
17	0.05
18	0.04
19	0.05
20	0.07
21	0.09
22	0.1
23	0.12
24	0.15
25	0.2
26	0.27
27	0.38
28	0.47
29	0.55
30	0.63
31	0.72
32	0.8
33	0.86
34	0.9
35	0.9
36	0.9
37	0.91
38	0.92
39	0.85
40	0.83
41	0.81
42	0.8
43	0.78
44	0.76
45	0.74
46	0.75
47	0.79
48	0.76
49	0.69
50	0.59
51	0.51
52	0.44
53	0.35
54	0.27
55	0.2
56	0.21
57	0.23
58	0.24
59	0.26
60	0.28
61	0.28
62	0.29
63	0.3
64	0.27
65	0.27
66	0.29
67	0.32
68	0.32
69	0.35
70	0.33
71	0.33
72	0.31
73	0.27
74	0.25
75	0.19
76	0.21
77	0.22
78	0.24
79	0.24
80	0.24
81	0.26
82	0.27
83	0.27
84	0.23
85	0.19
86	0.16
87	0.15
88	0.14
89	0.12
90	0.09
91	0.08
92	0.12
93	0.14
94	0.16
95	0.21
96	0.27
97	0.29
98	0.36
99	0.38
100	0.38
101	0.47
102	0.54
103	0.54
104	0.54
105	0.52
106	0.5
107	0.57
108	0.59
109	0.55
110	0.52
111	0.51
112	0.46
113	0.5
114	0.48
115	0.43
116	0.39
117	0.37
118	0.39
119	0.39
120	0.39
121	0.36
122	0.35
123	0.33
124	0.32
125	0.34
126	0.31
127	0.35
128	0.42
129	0.45
130	0.53
131	0.61
132	0.68
133	0.69
134	0.75
135	0.74
136	0.74
137	0.7
138	0.62
139	0.57
140	0.53
141	0.47
142	0.41
143	0.35
144	0.28
145	0.27
146	0.26
147	0.22
148	0.18
149	0.19
150	0.18
151	0.15
152	0.13
153	0.13
154	0.14
155	0.15
156	0.18
157	0.18
158	0.2
159	0.23
160	0.23
161	0.27
162	0.34
163	0.39
164	0.42
165	0.48
166	0.52
167	0.6
168	0.68
169	0.74
170	0.73
171	0.71
172	0.71
173	0.71
174	0.72
175	0.72
176	0.7
177	0.66
178	0.67
179	0.66
180	0.59
181	0.51
182	0.44
183	0.38
184	0.34
185	0.37
186	0.34
187	0.37
188	0.38
189	0.42
190	0.51
191	0.57
192	0.58
193	0.55
194	0.61
195	0.64
196	0.71
197	0.76
198	0.72
199	0.71
200	0.75
201	0.75
202	0.69
203	0.65
204	0.63
205	0.6
206	0.64
207	0.64
208	0.62
209	0.59
210	0.58
211	0.58
212	0.6
213	0.62
214	0.57
215	0.53
216	0.53
217	0.55
218	0.52
219	0.49
220	0.43
221	0.36
222	0.31
223	0.26
224	0.21
225	0.16
226	0.18
227	0.19
228	0.22
229	0.23
230	0.22
231	0.21
232	0.21
233	0.21
234	0.19
235	0.15
236	0.1
237	0.1
238	0.13
239	0.12
240	0.13
241	0.12
242	0.11
243	0.11
244	0.1
245	0.09
246	0.07
247	0.07
248	0.07
249	0.08
250	0.09
251	0.09
252	0.1
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.1
257	0.1
258	0.08
259	0.07
260	0.06
261	0.06
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.06
266	0.08
267	0.09
268	0.09
269	0.12
270	0.14
271	0.22
272	0.29
273	0.38
274	0.47
275	0.55
276	0.62
277	0.63
278	0.68
279	0.61
280	0.56
281	0.52
282	0.5
283	0.43
284	0.37
285	0.34
286	0.29
287	0.29
288	0.27
289	0.22
290	0.14
291	0.13
292	0.14
293	0.16
294	0.13
295	0.14
296	0.15
297	0.16
298	0.18
299	0.17
300	0.15
301	0.12
302	0.13
303	0.16
304	0.16
305	0.16
306	0.18
307	0.21
308	0.22
309	0.24
310	0.29
311	0.29
312	0.31
313	0.39
314	0.37
315	0.35
316	0.33
317	0.31
318	0.26
319	0.25
320	0.21
321	0.16
322	0.14
323	0.13
324	0.13
325	0.15
326	0.15
327	0.13
328	0.13
329	0.11
330	0.11
331	0.11
332	0.1
333	0.08
334	0.09
335	0.1
336	0.1
337	0.09
338	0.1
339	0.12
340	0.18
341	0.21
342	0.2
343	0.24
344	0.28
345	0.28
346	0.26
347	0.24
348	0.18
349	0.15
350	0.15
351	0.11
352	0.08
353	0.07
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.08
358	0.07
359	0.06
360	0.04
361	0.04
362	0.03
363	0.03
364	0.04
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.03
372	0.03
373	0.03
374	0.02
375	0.02
376	0.02
377	0.03
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.05
382	0.05
383	0.05
384	0.06
385	0.05
386	0.08
387	0.12
388	0.13
389	0.14
390	0.21
391	0.23
392	0.26
393	0.28
394	0.28
395	0.26
396	0.3
397	0.3
398	0.25
399	0.24
400	0.21
401	0.18
402	0.16
403	0.14
404	0.11
405	0.09
406	0.13
407	0.15
408	0.17
409	0.17
410	0.17
411	0.18
412	0.18
413	0.18
414	0.16
415	0.15
416	0.13
417	0.13
418	0.14
419	0.13
420	0.12
421	0.12
422	0.08
423	0.11
424	0.11
425	0.12
426	0.14
427	0.16
428	0.2
429	0.25
430	0.27
431	0.3
432	0.4
433	0.48
434	0.53
435	0.6
436	0.63
437	0.61
438	0.64
439	0.61
440	0.56
441	0.51
442	0.44
443	0.37
444	0.31
445	0.3
446	0.26
447	0.23
448	0.19
449	0.14
450	0.13
451	0.12
452	0.12
453	0.1
454	0.09
455	0.1
456	0.1
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.1
461	0.13
462	0.14
463	0.18
464	0.2
465	0.21
466	0.22
467	0.24
468	0.28
469	0.33
470	0.38
471	0.41
472	0.43
473	0.43
474	0.42
475	0.45
476	0.44
477	0.41
478	0.35
479	0.32
480	0.3
481	0.3
482	0.29
483	0.24
484	0.22
485	0.18
486	0.18
487	0.14
488	0.11
489	0.1
490	0.1
491	0.1
492	0.1
493	0.09
494	0.09
495	0.1
496	0.15
497	0.17
498	0.19
499	0.2
500	0.24
501	0.26
502	0.29
503	0.29
504	0.24
505	0.23
506	0.26
507	0.3
508	0.35
509	0.4
510	0.44
511	0.5
512	0.59
513	0.6
514	0.63
515	0.67
516	0.69
517	0.7
518	0.69
519	0.67
520	0.6
521	0.6
522	0.52
523	0.42
524	0.38
525	0.31
526	0.25
527	0.23
528	0.24
529	0.26
530	0.36
531	0.46
532	0.49
533	0.56
534	0.67
535	0.74
536	0.82
537	0.89
538	0.9
539	0.86
540	0.87
541	0.88
542	0.87
543	0.8
544	0.76
545	0.67
546	0.57
547	0.52
548	0.48
549	0.44
550	0.39
551	0.36
552	0.31
553	0.28
554	0.28
555	0.27
556	0.2
557	0.13
558	0.09
559	0.09
560	0.1
561	0.09
562	0.09
563	0.09
564	0.1
565	0.1
566	0.13
567	0.14
568	0.17
569	0.21
570	0.28
571	0.37
572	0.48
573	0.57
574	0.66
575	0.74
576	0.79
577	0.84
578	0.88
579	0.87
580	0.84
581	0.8
582	0.74
583	0.68
584	0.59
585	0.49
586	0.4
587	0.32
588	0.24
589	0.17
590	0.14
591	0.13
592	0.13
593	0.14
594	0.16
595	0.19
596	0.2
597	0.23
598	0.28
599	0.28
600	0.28
601	0.29
602	0.29
603	0.28
604	0.3
605	0.27
606	0.23
607	0.19
608	0.21
609	0.18
610	0.18
611	0.19
612	0.18
613	0.19
614	0.17
615	0.16
616	0.21
617	0.27
618	0.27
619	0.25
620	0.25
621	0.24
622	0.29
623	0.3
624	0.26
625	0.26
626	0.27
627	0.27
628	0.31
629	0.29
630	0.25
631	0.27
632	0.26
633	0.21
634	0.21
635	0.2
636	0.17
637	0.18
638	0.23
639	0.22
640	0.24
641	0.25
642	0.29
643	0.34
644	0.35
645	0.42
646	0.45
647	0.53
648	0.57
649	0.66
650	0.65
651	0.62
652	0.6
653	0.55
654	0.51
655	0.46
656	0.45
657	0.38
658	0.38
659	0.38
660	0.37
661	0.4
662	0.4
663	0.38
664	0.35
665	0.34
666	0.31
667	0.34
668	0.34
669	0.33
670	0.31
671	0.28
672	0.27
673	0.26
674	0.26
675	0.22
676	0.21
677	0.19
678	0.18
679	0.2
680	0.19
681	0.17
682	0.16
683	0.15
684	0.16
685	0.15
686	0.13
687	0.12
688	0.14
689	0.14
690	0.14
691	0.19
692	0.21
693	0.2
694	0.21
695	0.21
696	0.22
697	0.23
698	0.24
699	0.24
700	0.24
701	0.27
702	0.31
703	0.34
704	0.36
705	0.4
706	0.44
707	0.49
708	0.54
709	0.62
710	0.65
711	0.67
712	0.69
713	0.7
714	0.7
715	0.65
716	0.61
717	0.53
718	0.49
719	0.45
720	0.43
721	0.43
722	0.42
723	0.39
724	0.38
725	0.42
726	0.39
727	0.41
728	0.4
729	0.37
730	0.34
731	0.32
732	0.31
733	0.27
734	0.27
735	0.21
736	0.19

E5A8Q8

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer