FuNGI

A0A194X1T2

Protein Details

Accession

A0A194X1T2

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
24-53	IRKAKAADPLRPRKKPVKRLQPPQKGSIIK	Hydrophilic
499-549	TPSGRPKHTDPLKKKNLKRPGSPNRSESSGNESSRKKIKKKHSSQPISATS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
25-63	RKAKAADPLRPRKKPVKRLQPPQKGSIIKPNGLKPAGRP
428-438	LSKGVKKMLKK
473-488	KKEEEAKAKAKEDAKL
495-540	KGTNTPSGRPKHTDPLKKKNLKRPGSPNRSESSGNESSRKKIKKKH

Subcellular Location(s)

nucl 21, cyto_nucl 14, cyto 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	psco:LY89DRAFT_720527 -
Pfam	View protein in Pfam PF05793 TFIIF_alpha

Amino Acid Sequences

MSASPSGLSNGQTPTPNGGPPQYIRKAKAADPLRPRKKPVKRLQPPQKGSIIKPNGLKPAGRPPNQIPRNGIAPASNGQLPTLVNSSGLVAEPGGWTNPPTGEYMDFPLFTTKRALREGLRYHVARFSSKKDVDPSNQEEFTRPVVLHRRDPKQPAPGKGMKDEDMMPEGPIDSKERERQEILKAEKEKQRAADLAQIAPTGNNASAMAAKKNQAFRNEKTTQVYRLDKTAEQKKASDLRYEEALPWHLEDADNKNTWVGNYEAALSDTNVIFFIDGDKFKMIPVEKWYKFTAKAQFKTLTLEEVEAQMNKKYVAPRWMPEKAAEIKSQGGGGAHKLFTVKSESNTFKNSTKRETEDMDDLDFAEDDLFQDDDEQVTMEPDNDEETKDAQERIKREQLGANVFDQANEADVDMEFLKEEKEAEEQKKLSKGVKKMLKKREQTHLYDSDSDHPYSSSSEDFTSDEEKLNEQDKKKEEEAKAKAKEDAKLASGTSSKGTNTPSGRPKHTDPLKKKNLKRPGSPNRSESSGNESSRKKIKKKHSSQPISATSAPGSRQISPAPSGSGSVRKSSIVKLSVNSSKLSDIQSAPPNPSPTTAMSDGEATGGEMSDGGTKKTKIKLRIGGTSPTGSRAGSPAPGRSAGGSRAGSPANQPQSGTAGSPLAQSPGSGPIQPHEIVAALPAAGIKIGELMKIFQRRVGDTKGQTDKKEFIRLVKENAAFGPDKLLRPK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.3
3	0.3
4	0.29
5	0.3
6	0.31
7	0.33
8	0.41
9	0.44
10	0.49
11	0.5
12	0.54
13	0.55
14	0.54
15	0.6
16	0.57
17	0.57
18	0.61
19	0.69
20	0.72
21	0.74
22	0.78
23	0.79
24	0.83
25	0.85
26	0.85
27	0.85
28	0.85
29	0.9
30	0.94
31	0.94
32	0.89
33	0.85
34	0.83
35	0.76
36	0.7
37	0.69
38	0.65
39	0.59
40	0.59
41	0.58
42	0.57
43	0.54
44	0.51
45	0.45
46	0.49
47	0.54
48	0.52
49	0.53
50	0.53
51	0.62
52	0.65
53	0.66
54	0.6
55	0.54
56	0.54
57	0.49
58	0.42
59	0.32
60	0.31
61	0.28
62	0.26
63	0.23
64	0.19
65	0.18
66	0.18
67	0.17
68	0.17
69	0.17
70	0.14
71	0.12
72	0.12
73	0.13
74	0.12
75	0.12
76	0.09
77	0.07
78	0.07
79	0.08
80	0.09
81	0.09
82	0.08
83	0.09
84	0.11
85	0.11
86	0.12
87	0.13
88	0.14
89	0.15
90	0.16
91	0.21
92	0.21
93	0.2
94	0.2
95	0.26
96	0.24
97	0.23
98	0.29
99	0.27
100	0.3
101	0.33
102	0.36
103	0.32
104	0.41
105	0.46
106	0.45
107	0.49
108	0.46
109	0.44
110	0.45
111	0.43
112	0.4
113	0.38
114	0.38
115	0.4
116	0.42
117	0.44
118	0.45
119	0.5
120	0.5
121	0.55
122	0.55
123	0.51
124	0.51
125	0.48
126	0.44
127	0.4
128	0.36
129	0.3
130	0.24
131	0.24
132	0.32
133	0.36
134	0.43
135	0.49
136	0.52
137	0.57
138	0.64
139	0.64
140	0.65
141	0.67
142	0.63
143	0.64
144	0.63
145	0.6
146	0.58
147	0.55
148	0.47
149	0.42
150	0.38
151	0.31
152	0.28
153	0.25
154	0.2
155	0.16
156	0.15
157	0.13
158	0.13
159	0.14
160	0.14
161	0.19
162	0.26
163	0.29
164	0.33
165	0.35
166	0.37
167	0.42
168	0.47
169	0.46
170	0.47
171	0.47
172	0.51
173	0.54
174	0.54
175	0.5
176	0.44
177	0.43
178	0.37
179	0.35
180	0.35
181	0.31
182	0.28
183	0.25
184	0.23
185	0.19
186	0.17
187	0.16
188	0.1
189	0.08
190	0.07
191	0.07
192	0.07
193	0.1
194	0.12
195	0.14
196	0.15
197	0.18
198	0.21
199	0.28
200	0.32
201	0.37
202	0.42
203	0.43
204	0.51
205	0.5
206	0.5
207	0.49
208	0.48
209	0.44
210	0.45
211	0.47
212	0.38
213	0.39
214	0.38
215	0.35
216	0.4
217	0.44
218	0.43
219	0.4
220	0.4
221	0.43
222	0.47
223	0.46
224	0.44
225	0.37
226	0.32
227	0.33
228	0.33
229	0.28
230	0.23
231	0.23
232	0.18
233	0.16
234	0.15
235	0.12
236	0.12
237	0.13
238	0.17
239	0.19
240	0.19
241	0.19
242	0.19
243	0.19
244	0.18
245	0.18
246	0.13
247	0.09
248	0.09
249	0.1
250	0.09
251	0.1
252	0.1
253	0.08
254	0.09
255	0.08
256	0.08
257	0.07
258	0.07
259	0.06
260	0.05
261	0.07
262	0.08
263	0.09
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.11
268	0.15
269	0.13
270	0.13
271	0.2
272	0.29
273	0.29
274	0.32
275	0.35
276	0.33
277	0.34
278	0.38
279	0.41
280	0.4
281	0.41
282	0.43
283	0.43
284	0.41
285	0.43
286	0.37
287	0.29
288	0.2
289	0.19
290	0.14
291	0.14
292	0.14
293	0.11
294	0.12
295	0.11
296	0.11
297	0.1
298	0.12
299	0.13
300	0.16
301	0.22
302	0.24
303	0.26
304	0.33
305	0.35
306	0.33
307	0.32
308	0.34
309	0.32
310	0.32
311	0.3
312	0.24
313	0.22
314	0.22
315	0.21
316	0.16
317	0.11
318	0.08
319	0.09
320	0.1
321	0.09
322	0.09
323	0.09
324	0.09
325	0.1
326	0.14
327	0.13
328	0.13
329	0.19
330	0.22
331	0.24
332	0.27
333	0.28
334	0.28
335	0.33
336	0.34
337	0.33
338	0.34
339	0.35
340	0.35
341	0.35
342	0.33
343	0.3
344	0.28
345	0.23
346	0.2
347	0.16
348	0.14
349	0.11
350	0.08
351	0.05
352	0.04
353	0.04
354	0.04
355	0.04
356	0.04
357	0.05
358	0.05
359	0.04
360	0.05
361	0.05
362	0.04
363	0.04
364	0.05
365	0.04
366	0.04
367	0.04
368	0.06
369	0.06
370	0.07
371	0.07
372	0.08
373	0.09
374	0.11
375	0.12
376	0.13
377	0.17
378	0.19
379	0.24
380	0.29
381	0.28
382	0.28
383	0.3
384	0.31
385	0.31
386	0.3
387	0.25
388	0.22
389	0.21
390	0.19
391	0.16
392	0.12
393	0.09
394	0.08
395	0.07
396	0.05
397	0.05
398	0.06
399	0.05
400	0.05
401	0.05
402	0.05
403	0.05
404	0.05
405	0.05
406	0.05
407	0.09
408	0.15
409	0.18
410	0.23
411	0.23
412	0.26
413	0.3
414	0.31
415	0.32
416	0.33
417	0.36
418	0.4
419	0.47
420	0.53
421	0.59
422	0.68
423	0.71
424	0.73
425	0.74
426	0.75
427	0.74
428	0.7
429	0.67
430	0.62
431	0.55
432	0.5
433	0.45
434	0.41
435	0.37
436	0.32
437	0.25
438	0.2
439	0.18
440	0.16
441	0.16
442	0.11
443	0.1
444	0.1
445	0.11
446	0.11
447	0.12
448	0.14
449	0.13
450	0.14
451	0.13
452	0.14
453	0.15
454	0.2
455	0.24
456	0.24
457	0.3
458	0.32
459	0.37
460	0.4
461	0.46
462	0.45
463	0.5
464	0.55
465	0.58
466	0.59
467	0.54
468	0.56
469	0.5
470	0.49
471	0.42
472	0.36
473	0.28
474	0.25
475	0.23
476	0.2
477	0.18
478	0.16
479	0.14
480	0.14
481	0.12
482	0.14
483	0.16
484	0.2
485	0.22
486	0.28
487	0.35
488	0.39
489	0.43
490	0.46
491	0.48
492	0.52
493	0.58
494	0.62
495	0.63
496	0.68
497	0.75
498	0.79
499	0.83
500	0.83
501	0.85
502	0.82
503	0.81
504	0.82
505	0.82
506	0.83
507	0.8
508	0.75
509	0.67
510	0.64
511	0.56
512	0.47
513	0.44
514	0.41
515	0.38
516	0.4
517	0.39
518	0.4
519	0.48
520	0.54
521	0.54
522	0.56
523	0.65
524	0.69
525	0.77
526	0.82
527	0.85
528	0.85
529	0.83
530	0.83
531	0.77
532	0.71
533	0.62
534	0.53
535	0.43
536	0.37
537	0.31
538	0.27
539	0.25
540	0.2
541	0.21
542	0.22
543	0.23
544	0.23
545	0.23
546	0.2
547	0.18
548	0.18
549	0.19
550	0.24
551	0.22
552	0.23
553	0.23
554	0.23
555	0.24
556	0.26
557	0.3
558	0.28
559	0.28
560	0.27
561	0.33
562	0.36
563	0.36
564	0.34
565	0.29
566	0.26
567	0.27
568	0.28
569	0.25
570	0.21
571	0.26
572	0.32
573	0.33
574	0.35
575	0.37
576	0.38
577	0.35
578	0.35
579	0.31
580	0.26
581	0.3
582	0.28
583	0.24
584	0.22
585	0.22
586	0.2
587	0.18
588	0.15
589	0.09
590	0.08
591	0.06
592	0.05
593	0.04
594	0.05
595	0.1
596	0.1
597	0.12
598	0.16
599	0.18
600	0.24
601	0.32
602	0.38
603	0.41
604	0.49
605	0.56
606	0.58
607	0.65
608	0.64
609	0.61
610	0.57
611	0.53
612	0.45
613	0.39
614	0.34
615	0.25
616	0.22
617	0.2
618	0.18
619	0.2
620	0.22
621	0.22
622	0.24
623	0.25
624	0.25
625	0.25
626	0.26
627	0.22
628	0.26
629	0.24
630	0.22
631	0.24
632	0.25
633	0.23
634	0.25
635	0.31
636	0.31
637	0.31
638	0.3
639	0.28
640	0.31
641	0.31
642	0.27
643	0.2
644	0.16
645	0.15
646	0.16
647	0.16
648	0.14
649	0.13
650	0.12
651	0.12
652	0.16
653	0.18
654	0.18
655	0.18
656	0.18
657	0.23
658	0.23
659	0.22
660	0.17
661	0.15
662	0.13
663	0.14
664	0.12
665	0.07
666	0.07
667	0.07
668	0.06
669	0.06
670	0.05
671	0.04
672	0.08
673	0.08
674	0.09
675	0.1
676	0.12
677	0.2
678	0.27
679	0.27
680	0.27
681	0.3
682	0.34
683	0.39
684	0.44
685	0.46
686	0.44
687	0.53
688	0.6
689	0.62
690	0.62
691	0.61
692	0.61
693	0.58
694	0.63
695	0.56
696	0.53
697	0.57
698	0.58
699	0.59
700	0.61
701	0.57
702	0.49
703	0.48
704	0.45
705	0.36
706	0.31
707	0.33
708	0.29

A0A194X1T2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer