Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E4ZVM6

Protein Details
Accession E4ZVM6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
228-254GGRGFRGNWDHKKRGRGRGRGRGRGNYBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
229-252GRGFRGNWDHKKRGRGRGRGRGRG
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 7, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045348  CPSF4/Yth1  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
Pfam View protein in Pfam  
PF00642  zf-CCCH  
PF18345  zf_CCCH_4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MAEVMTPVAAETPNQAQEEPGLPTYTFKFSDFLRREYRFGLNPDRPTCKAFMQGHCPDGNRCPNKHHVTSSYNNLVCKHWLRGLCKKGDTCEFLHEYNLRRMPECSYYARTQTCSNGDDCLYLHIDPEAKRPACPHYDRGFCPLGPHCALKHNKKDKLCPYYLCGFCPEGKGCKYGAHPRYPTDLKKPEVRVEKSPEELEAEKVEREREMMRREEEDRERDERNGHQGGRGFRGNWDHKKRGRGRGRGRGRGNY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.2
3 0.19
4 0.21
5 0.23
6 0.23
7 0.2
8 0.18
9 0.17
10 0.19
11 0.22
12 0.24
13 0.23
14 0.2
15 0.21
16 0.2
17 0.31
18 0.33
19 0.36
20 0.41
21 0.43
22 0.44
23 0.46
24 0.5
25 0.44
26 0.47
27 0.5
28 0.48
29 0.53
30 0.56
31 0.59
32 0.55
33 0.52
34 0.49
35 0.41
36 0.43
37 0.42
38 0.42
39 0.45
40 0.46
41 0.47
42 0.47
43 0.46
44 0.4
45 0.41
46 0.45
47 0.42
48 0.41
49 0.42
50 0.5
51 0.55
52 0.57
53 0.54
54 0.5
55 0.5
56 0.53
57 0.55
58 0.53
59 0.48
60 0.45
61 0.42
62 0.38
63 0.36
64 0.34
65 0.29
66 0.26
67 0.29
68 0.33
69 0.41
70 0.46
71 0.47
72 0.48
73 0.47
74 0.46
75 0.45
76 0.43
77 0.35
78 0.34
79 0.32
80 0.28
81 0.29
82 0.29
83 0.27
84 0.3
85 0.33
86 0.28
87 0.26
88 0.27
89 0.27
90 0.28
91 0.28
92 0.25
93 0.25
94 0.26
95 0.3
96 0.3
97 0.29
98 0.26
99 0.26
100 0.25
101 0.22
102 0.21
103 0.18
104 0.17
105 0.15
106 0.14
107 0.12
108 0.11
109 0.09
110 0.09
111 0.08
112 0.1
113 0.1
114 0.14
115 0.19
116 0.18
117 0.19
118 0.2
119 0.24
120 0.27
121 0.3
122 0.33
123 0.32
124 0.37
125 0.38
126 0.41
127 0.39
128 0.33
129 0.33
130 0.28
131 0.26
132 0.22
133 0.23
134 0.19
135 0.25
136 0.32
137 0.36
138 0.45
139 0.51
140 0.56
141 0.58
142 0.66
143 0.67
144 0.68
145 0.64
146 0.56
147 0.51
148 0.53
149 0.5
150 0.42
151 0.36
152 0.3
153 0.27
154 0.29
155 0.26
156 0.22
157 0.22
158 0.23
159 0.21
160 0.23
161 0.27
162 0.33
163 0.37
164 0.41
165 0.42
166 0.43
167 0.5
168 0.52
169 0.51
170 0.51
171 0.52
172 0.47
173 0.52
174 0.54
175 0.54
176 0.58
177 0.58
178 0.56
179 0.56
180 0.57
181 0.53
182 0.49
183 0.42
184 0.37
185 0.34
186 0.29
187 0.24
188 0.22
189 0.2
190 0.2
191 0.21
192 0.17
193 0.18
194 0.2
195 0.24
196 0.28
197 0.31
198 0.34
199 0.37
200 0.4
201 0.46
202 0.49
203 0.47
204 0.47
205 0.46
206 0.46
207 0.43
208 0.45
209 0.41
210 0.42
211 0.43
212 0.38
213 0.38
214 0.41
215 0.42
216 0.44
217 0.43
218 0.36
219 0.33
220 0.42
221 0.47
222 0.53
223 0.59
224 0.62
225 0.65
226 0.75
227 0.8
228 0.81
229 0.82
230 0.82
231 0.83
232 0.85
233 0.9
234 0.89