FuNGI

G0W9P4

Protein Details

Accession

G0W9P4

Localization Confidence

High

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
26-58	GTDKSPFIKRDRLKRNFLRSRFNGKNRPIVKKD	Hydrophilic
129-148	RTHLLKFQSKKKINPNESFH	Hydrophilic
326-345	DGGGRSKRGNSRRKTRQLKV	Basic
589-616	VDKGSLSKKSSPRKQKSPSANNIPKQPK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
37-41	RLKRN
44-44	R
330-341	RSKRGNSRRKTR
582-616	KKIKKEEVDKGSLSKKSSPRKQKSPSANNIPKQPK

Subcellular Location(s)

nucl 26

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	ndi:NDAI_0D01910 -

Amino Acid Sequences

MNNTSNRNGTGLAGRNRTDTAGGGGGTDKSPFIKRDRLKRNFLRSRFNGKNRPIVKKDDPELIAKREEELLSGTTDTMGSTPDGSVKVKSEGNITANMTNNTKKDDEVEEQFNEFPLRAISKDDLENMRTHLLKFQSKKKINPNESFHLPIRLHRKDTRNLQFQLTRAEIVQRQKEIADYKKTQQQQQGQQQGNFVPTSAGKNQPLLSTAGTPINATIASTPSTTMTTTTTATAITSDSNTTNLLSTTTPTPTPTPLNATNTQSSAKNPQQQGMPEQPVKLVTQLEEAGIAEDPTKVGMVKYDGQEDLNTTFEPGTTDPLADVAPDGGGRSKRGNSRRKTRQLKVLDENAKKLRFEEFYPWVMEDYDGYNTWVGSYEAGNSDSYVMLSVEDDGSFTMIPADKVYKFTARNKYATLTIEEAEKRMDKKSGEVPRWLMKHLDNIGTTTTRYDRTKRRLKAVSNAGDEDEAHDDNSEIELDYDEEFDDDEEAPIIDGNEQENKESEQRIKREMLQANAMGLRDDEIIPDDDEDDLFSKKKIDVEGERIKKALQKTELAALYSSDDEEINPYLSESETEIKEEDEKKIKKEEVDKGSLSKKSSPRKQKSPSANNIPKQPKLKVKSINDCVVVLQGDKKILKNFPQGEWNPNAPKRKRQEPTPEESTTSEIGVKQEINNNPRLATAPSSPTPTIMKQEGENEEPLSKKVKTEFSADNSTAIPLITEADIIAAIGDGKVNVKDFGKTIRKKYPGPENKKLMFAIVKKLCRKVDNEHMELKK

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.41
2	0.41
3	0.42
4	0.41
5	0.34
6	0.27
7	0.22
8	0.19
9	0.18
10	0.16
11	0.16
12	0.16
13	0.16
14	0.15
15	0.13
16	0.13
17	0.18
18	0.22
19	0.26
20	0.35
21	0.43
22	0.53
23	0.64
24	0.69
25	0.75
26	0.81
27	0.87
28	0.87
29	0.86
30	0.85
31	0.82
32	0.84
33	0.84
34	0.84
35	0.82
36	0.78
37	0.81
38	0.78
39	0.81
40	0.75
41	0.74
42	0.73
43	0.72
44	0.7
45	0.68
46	0.62
47	0.6
48	0.6
49	0.55
50	0.5
51	0.42
52	0.39
53	0.35
54	0.33
55	0.26
56	0.23
57	0.2
58	0.17
59	0.17
60	0.16
61	0.12
62	0.12
63	0.11
64	0.09
65	0.09
66	0.08
67	0.08
68	0.08
69	0.11
70	0.13
71	0.14
72	0.16
73	0.18
74	0.21
75	0.22
76	0.22
77	0.24
78	0.26
79	0.27
80	0.29
81	0.29
82	0.29
83	0.31
84	0.33
85	0.32
86	0.32
87	0.31
88	0.32
89	0.3
90	0.27
91	0.27
92	0.3
93	0.32
94	0.33
95	0.37
96	0.34
97	0.35
98	0.35
99	0.32
100	0.27
101	0.22
102	0.16
103	0.14
104	0.14
105	0.12
106	0.16
107	0.17
108	0.2
109	0.21
110	0.26
111	0.27
112	0.27
113	0.28
114	0.27
115	0.29
116	0.27
117	0.26
118	0.26
119	0.29
120	0.35
121	0.4
122	0.47
123	0.54
124	0.59
125	0.67
126	0.72
127	0.77
128	0.78
129	0.81
130	0.79
131	0.75
132	0.73
133	0.7
134	0.61
135	0.57
136	0.48
137	0.45
138	0.48
139	0.47
140	0.49
141	0.51
142	0.56
143	0.57
144	0.67
145	0.71
146	0.7
147	0.67
148	0.67
149	0.62
150	0.57
151	0.55
152	0.46
153	0.37
154	0.28
155	0.31
156	0.29
157	0.33
158	0.36
159	0.31
160	0.31
161	0.3
162	0.33
163	0.35
164	0.37
165	0.38
166	0.37
167	0.41
168	0.47
169	0.52
170	0.54
171	0.56
172	0.58
173	0.6
174	0.66
175	0.7
176	0.67
177	0.64
178	0.6
179	0.53
180	0.47
181	0.36
182	0.27
183	0.18
184	0.15
185	0.18
186	0.19
187	0.23
188	0.22
189	0.24
190	0.25
191	0.25
192	0.25
193	0.22
194	0.2
195	0.16
196	0.17
197	0.16
198	0.15
199	0.14
200	0.12
201	0.11
202	0.1
203	0.09
204	0.08
205	0.07
206	0.08
207	0.08
208	0.09
209	0.09
210	0.1
211	0.1
212	0.1
213	0.11
214	0.11
215	0.12
216	0.12
217	0.11
218	0.11
219	0.1
220	0.1
221	0.09
222	0.08
223	0.08
224	0.08
225	0.09
226	0.09
227	0.1
228	0.1
229	0.1
230	0.09
231	0.1
232	0.08
233	0.1
234	0.11
235	0.12
236	0.12
237	0.14
238	0.15
239	0.16
240	0.19
241	0.19
242	0.22
243	0.25
244	0.3
245	0.32
246	0.34
247	0.33
248	0.32
249	0.32
250	0.27
251	0.25
252	0.28
253	0.3
254	0.34
255	0.33
256	0.35
257	0.36
258	0.37
259	0.4
260	0.39
261	0.39
262	0.33
263	0.32
264	0.3
265	0.28
266	0.26
267	0.23
268	0.16
269	0.11
270	0.12
271	0.12
272	0.11
273	0.1
274	0.09
275	0.08
276	0.08
277	0.07
278	0.05
279	0.05
280	0.05
281	0.05
282	0.05
283	0.04
284	0.04
285	0.05
286	0.08
287	0.12
288	0.13
289	0.15
290	0.15
291	0.15
292	0.16
293	0.16
294	0.14
295	0.12
296	0.11
297	0.09
298	0.09
299	0.08
300	0.1
301	0.08
302	0.1
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.09
307	0.09
308	0.08
309	0.07
310	0.04
311	0.04
312	0.04
313	0.04
314	0.06
315	0.07
316	0.09
317	0.11
318	0.16
319	0.23
320	0.33
321	0.42
322	0.47
323	0.57
324	0.67
325	0.75
326	0.8
327	0.78
328	0.78
329	0.77
330	0.75
331	0.71
332	0.69
333	0.67
334	0.6
335	0.59
336	0.55
337	0.49
338	0.42
339	0.36
340	0.31
341	0.23
342	0.24
343	0.25
344	0.23
345	0.24
346	0.24
347	0.24
348	0.21
349	0.19
350	0.17
351	0.12
352	0.09
353	0.08
354	0.08
355	0.08
356	0.08
357	0.07
358	0.07
359	0.07
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.06
364	0.07
365	0.08
366	0.08
367	0.07
368	0.07
369	0.07
370	0.06
371	0.06
372	0.05
373	0.04
374	0.04
375	0.05
376	0.04
377	0.04
378	0.04
379	0.04
380	0.04
381	0.04
382	0.04
383	0.04
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.08
388	0.08
389	0.1
390	0.12
391	0.16
392	0.19
393	0.27
394	0.36
395	0.37
396	0.39
397	0.38
398	0.38
399	0.36
400	0.34
401	0.28
402	0.2
403	0.17
404	0.18
405	0.17
406	0.16
407	0.15
408	0.15
409	0.14
410	0.14
411	0.17
412	0.14
413	0.17
414	0.25
415	0.32
416	0.33
417	0.35
418	0.37
419	0.39
420	0.4
421	0.38
422	0.32
423	0.24
424	0.27
425	0.27
426	0.26
427	0.21
428	0.2
429	0.21
430	0.19
431	0.18
432	0.14
433	0.14
434	0.15
435	0.17
436	0.23
437	0.31
438	0.4
439	0.5
440	0.52
441	0.6
442	0.63
443	0.64
444	0.66
445	0.67
446	0.64
447	0.57
448	0.53
449	0.45
450	0.37
451	0.34
452	0.26
453	0.19
454	0.12
455	0.09
456	0.09
457	0.08
458	0.08
459	0.09
460	0.07
461	0.05
462	0.05
463	0.05
464	0.06
465	0.06
466	0.06
467	0.06
468	0.05
469	0.05
470	0.05
471	0.06
472	0.06
473	0.05
474	0.05
475	0.05
476	0.05
477	0.05
478	0.05
479	0.05
480	0.05
481	0.06
482	0.1
483	0.11
484	0.11
485	0.12
486	0.14
487	0.16
488	0.19
489	0.25
490	0.27
491	0.3
492	0.34
493	0.35
494	0.37
495	0.43
496	0.44
497	0.4
498	0.36
499	0.34
500	0.31
501	0.3
502	0.26
503	0.17
504	0.13
505	0.12
506	0.09
507	0.09
508	0.08
509	0.08
510	0.09
511	0.09
512	0.1
513	0.09
514	0.08
515	0.08
516	0.08
517	0.08
518	0.08
519	0.08
520	0.09
521	0.1
522	0.11
523	0.14
524	0.15
525	0.19
526	0.23
527	0.31
528	0.41
529	0.44
530	0.44
531	0.42
532	0.41
533	0.4
534	0.39
535	0.37
536	0.31
537	0.29
538	0.3
539	0.36
540	0.35
541	0.32
542	0.28
543	0.21
544	0.19
545	0.16
546	0.15
547	0.09
548	0.08
549	0.07
550	0.09
551	0.1
552	0.09
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.08
557	0.09
558	0.09
559	0.12
560	0.12
561	0.13
562	0.13
563	0.14
564	0.19
565	0.2
566	0.24
567	0.3
568	0.32
569	0.34
570	0.4
571	0.42
572	0.42
573	0.49
574	0.53
575	0.51
576	0.54
577	0.52
578	0.5
579	0.54
580	0.52
581	0.46
582	0.45
583	0.46
584	0.5
585	0.59
586	0.65
587	0.69
588	0.76
589	0.81
590	0.83
591	0.86
592	0.86
593	0.86
594	0.86
595	0.86
596	0.8
597	0.82
598	0.78
599	0.74
600	0.69
601	0.66
602	0.64
603	0.61
604	0.65
605	0.64
606	0.67
607	0.71
608	0.73
609	0.71
610	0.63
611	0.57
612	0.49
613	0.41
614	0.32
615	0.23
616	0.19
617	0.15
618	0.18
619	0.19
620	0.22
621	0.25
622	0.29
623	0.35
624	0.41
625	0.44
626	0.42
627	0.5
628	0.5
629	0.51
630	0.52
631	0.52
632	0.51
633	0.54
634	0.61
635	0.56
636	0.62
637	0.64
638	0.7
639	0.7
640	0.71
641	0.76
642	0.74
643	0.78
644	0.76
645	0.7
646	0.62
647	0.57
648	0.51
649	0.4
650	0.33
651	0.26
652	0.2
653	0.19
654	0.18
655	0.18
656	0.17
657	0.24
658	0.3
659	0.33
660	0.38
661	0.38
662	0.35
663	0.35
664	0.34
665	0.29
666	0.26
667	0.26
668	0.26
669	0.27
670	0.33
671	0.32
672	0.32
673	0.33
674	0.32
675	0.34
676	0.31
677	0.31
678	0.28
679	0.34
680	0.37
681	0.36
682	0.36
683	0.32
684	0.31
685	0.31
686	0.3
687	0.28
688	0.24
689	0.25
690	0.29
691	0.34
692	0.33
693	0.39
694	0.44
695	0.45
696	0.52
697	0.49
698	0.45
699	0.38
700	0.36
701	0.3
702	0.23
703	0.16
704	0.08
705	0.09
706	0.08
707	0.07
708	0.07
709	0.07
710	0.07
711	0.06
712	0.06
713	0.04
714	0.04
715	0.04
716	0.05
717	0.05
718	0.07
719	0.08
720	0.1
721	0.13
722	0.14
723	0.16
724	0.17
725	0.27
726	0.36
727	0.42
728	0.49
729	0.56
730	0.62
731	0.65
732	0.72
733	0.73
734	0.74
735	0.76
736	0.78
737	0.78
738	0.75
739	0.74
740	0.66
741	0.6
742	0.57
743	0.5
744	0.51
745	0.49
746	0.55
747	0.56
748	0.63
749	0.64
750	0.62
751	0.63
752	0.62
753	0.64
754	0.65
755	0.64

G0W9P4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer