Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A194XCZ5

Protein Details
Accession A0A194XCZ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
11-68MSPETPKHRSKADKKSKSSTHGEKKRKRDHHHDEDDPKTTKKSKKQRRDKHVSSAHSTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
17-60KHRSKADKKSKSSTHGEKKRKRDHHHDEDDPKTTKKSKKQRRDK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036898  RNA_pol_Rpb7-like_N_sf  
IPR041178  RPA43_OB  
IPR045113  Rpb7-like  
Gene Ontology GO:0000428  C:DNA-directed RNA polymerase complex  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006352  P:DNA-templated transcription initiation  
KEGG psco:LY89DRAFT_643881  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17875  RPA43_OB  
Amino Acid Sequences MSIEKLTPSTMSPETPKHRSKADKKSKSSTHGEKKRKRDHHHDEDDPKTTKKSKKQRRDKHVSSAHSTVTQAPKTDPSLSPFHLQTSSLYLPLAPVAQKYPLEGLCAEHLSPLLLTYYPPFRGVILSYTNPRLSETAFGSSAPNPNSEEEGNGLLLHNIDEYAVSWTWLTADFLLFKPERGVELEGYVNLQNEGHLGVVCWNLFNASVARERMPADWVWKDVSEMQNKEGGGNEGYAEDGQGCWVDGNGEKVEGVVRFRVKEIESSHDRERGFLSIEGTMLGVEEERELVERERVGEGGGRDKAGRRLGGEKALGATILGVVSEESAEKENKGDGKRPRQRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.49
3 0.54
4 0.52
5 0.59
6 0.66
7 0.71
8 0.74
9 0.78
10 0.79
11 0.81
12 0.87
13 0.86
14 0.82
15 0.82
16 0.81
17 0.81
18 0.81
19 0.84
20 0.84
21 0.87
22 0.9
23 0.91
24 0.89
25 0.89
26 0.89
27 0.89
28 0.9
29 0.88
30 0.86
31 0.81
32 0.79
33 0.72
34 0.63
35 0.58
36 0.57
37 0.56
38 0.58
39 0.63
40 0.67
41 0.74
42 0.83
43 0.88
44 0.91
45 0.93
46 0.9
47 0.9
48 0.88
49 0.83
50 0.77
51 0.7
52 0.61
53 0.51
54 0.45
55 0.4
56 0.38
57 0.33
58 0.28
59 0.27
60 0.28
61 0.3
62 0.33
63 0.29
64 0.27
65 0.3
66 0.31
67 0.33
68 0.3
69 0.29
70 0.26
71 0.25
72 0.22
73 0.23
74 0.21
75 0.18
76 0.17
77 0.15
78 0.14
79 0.14
80 0.14
81 0.08
82 0.08
83 0.09
84 0.12
85 0.12
86 0.13
87 0.16
88 0.14
89 0.16
90 0.15
91 0.15
92 0.14
93 0.16
94 0.15
95 0.11
96 0.11
97 0.09
98 0.09
99 0.08
100 0.06
101 0.05
102 0.06
103 0.07
104 0.11
105 0.11
106 0.12
107 0.12
108 0.12
109 0.12
110 0.13
111 0.14
112 0.14
113 0.16
114 0.18
115 0.2
116 0.21
117 0.2
118 0.2
119 0.18
120 0.15
121 0.16
122 0.15
123 0.15
124 0.14
125 0.14
126 0.15
127 0.16
128 0.19
129 0.17
130 0.16
131 0.15
132 0.15
133 0.17
134 0.16
135 0.14
136 0.12
137 0.12
138 0.11
139 0.09
140 0.09
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.03
148 0.04
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.07
157 0.04
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.11
167 0.11
168 0.13
169 0.09
170 0.11
171 0.11
172 0.1
173 0.11
174 0.11
175 0.09
176 0.07
177 0.07
178 0.05
179 0.05
180 0.06
181 0.05
182 0.04
183 0.04
184 0.05
185 0.06
186 0.06
187 0.06
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.07
192 0.06
193 0.07
194 0.1
195 0.11
196 0.12
197 0.14
198 0.15
199 0.14
200 0.16
201 0.15
202 0.17
203 0.17
204 0.17
205 0.17
206 0.16
207 0.16
208 0.19
209 0.24
210 0.26
211 0.26
212 0.26
213 0.28
214 0.28
215 0.27
216 0.24
217 0.2
218 0.13
219 0.12
220 0.11
221 0.08
222 0.09
223 0.08
224 0.07
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.04
229 0.05
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.06
234 0.09
235 0.09
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.12
240 0.11
241 0.12
242 0.14
243 0.16
244 0.16
245 0.17
246 0.21
247 0.2
248 0.24
249 0.25
250 0.29
251 0.32
252 0.37
253 0.4
254 0.42
255 0.41
256 0.37
257 0.35
258 0.3
259 0.27
260 0.23
261 0.21
262 0.16
263 0.16
264 0.15
265 0.13
266 0.11
267 0.08
268 0.07
269 0.05
270 0.04
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.08
276 0.1
277 0.13
278 0.13
279 0.15
280 0.16
281 0.16
282 0.15
283 0.17
284 0.17
285 0.21
286 0.22
287 0.21
288 0.22
289 0.25
290 0.3
291 0.32
292 0.32
293 0.29
294 0.32
295 0.35
296 0.39
297 0.37
298 0.32
299 0.28
300 0.26
301 0.23
302 0.18
303 0.14
304 0.08
305 0.07
306 0.06
307 0.05
308 0.04
309 0.05
310 0.05
311 0.06
312 0.07
313 0.1
314 0.12
315 0.12
316 0.14
317 0.18
318 0.24
319 0.29
320 0.35
321 0.42
322 0.53