FuNGI

A0A194XC88

Protein Details

Accession

A0A194XC88

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
386-405	REKMRAEKRREEERKLRQSR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
224-239	PKFKHKKIPRGPPSPP
386-405	REKMRAEKRREEERKLRQSR

Subcellular Location(s)

nucl 14.5, cyto_nucl 12.5, cyto 9.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR017862 SKI-int_prot_SKIP IPR004015 SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0000398 P:mRNA splicing, via spliceosome
KEGG	psco:LY89DRAFT_684429 -
Pfam	View protein in Pfam PF02731 SKIP_SNW

Amino Acid Sequences

MTSIAASLTRALPKPKYTGEEEEIPQHAQQRGPRILGAGALDDTQIVLKKSGPPPYGNRAGWRPRGQEDFGDGGAFPEIPVAQYPLDMGRKSQSTSTALAVQVDAEGKVKYDAIARQGHNDKRIVHASFKDLIPLRQRADAGHINLDRPSEEEVAASTQKTKDALAKLVSGAVAAQKPKNVNVGTRKDPTYVRYTPANQMGDNTRKNDRIMKIVERQQDPMEPPKFKHKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALFTADRHAREEVKQRALMQQRLAEKEKSQKEEHLRMLAQKAREERAGAGAVRRASRSSRSRSGSYSESESERSGSDDEEVREREKMRAEKRREEERKLRQSRMGAERRVQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTASSESMFDSRLFNRTSGFDSGFNEDQAYDKPLFAAQDAVNSIYRPRHNMDDGDDEEAADAEMGKIQKSSRFAEALGKGTFKGSADVEAREGPVQFEKDVADPFNVDSFLNNLGEGSGSGAGKRGYGLQDGEEEERGKKRARVDEDED

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.46
3	0.47
4	0.48
5	0.52
6	0.52
7	0.53
8	0.51
9	0.5
10	0.47
11	0.44
12	0.39
13	0.37
14	0.34
15	0.32
16	0.34
17	0.38
18	0.4
19	0.4
20	0.39
21	0.35
22	0.33
23	0.3
24	0.27
25	0.19
26	0.15
27	0.13
28	0.12
29	0.1
30	0.1
31	0.1
32	0.11
33	0.11
34	0.11
35	0.13
36	0.22
37	0.27
38	0.36
39	0.38
40	0.41
41	0.47
42	0.55
43	0.62
44	0.55
45	0.56
46	0.56
47	0.62
48	0.65
49	0.66
50	0.63
51	0.59
52	0.63
53	0.59
54	0.53
55	0.49
56	0.43
57	0.36
58	0.31
59	0.25
60	0.2
61	0.18
62	0.15
63	0.09
64	0.07
65	0.07
66	0.07
67	0.08
68	0.09
69	0.09
70	0.09
71	0.1
72	0.14
73	0.19
74	0.18
75	0.19
76	0.22
77	0.24
78	0.26
79	0.27
80	0.27
81	0.25
82	0.27
83	0.28
84	0.27
85	0.25
86	0.24
87	0.22
88	0.17
89	0.15
90	0.13
91	0.11
92	0.09
93	0.08
94	0.08
95	0.09
96	0.09
97	0.09
98	0.13
99	0.15
100	0.19
101	0.27
102	0.27
103	0.34
104	0.43
105	0.46
106	0.47
107	0.48
108	0.43
109	0.42
110	0.47
111	0.42
112	0.38
113	0.36
114	0.36
115	0.36
116	0.35
117	0.35
118	0.31
119	0.33
120	0.35
121	0.37
122	0.35
123	0.34
124	0.35
125	0.29
126	0.34
127	0.35
128	0.3
129	0.33
130	0.31
131	0.29
132	0.3
133	0.3
134	0.23
135	0.19
136	0.2
137	0.14
138	0.14
139	0.13
140	0.12
141	0.15
142	0.16
143	0.14
144	0.14
145	0.13
146	0.15
147	0.15
148	0.15
149	0.18
150	0.2
151	0.24
152	0.22
153	0.23
154	0.21
155	0.22
156	0.2
157	0.14
158	0.12
159	0.11
160	0.11
161	0.13
162	0.14
163	0.16
164	0.17
165	0.19
166	0.25
167	0.23
168	0.28
169	0.34
170	0.4
171	0.43
172	0.46
173	0.46
174	0.43
175	0.43
176	0.4
177	0.39
178	0.34
179	0.31
180	0.32
181	0.34
182	0.36
183	0.41
184	0.39
185	0.31
186	0.32
187	0.35
188	0.37
189	0.37
190	0.35
191	0.33
192	0.33
193	0.35
194	0.4
195	0.35
196	0.34
197	0.36
198	0.38
199	0.41
200	0.46
201	0.51
202	0.46
203	0.46
204	0.4
205	0.39
206	0.36
207	0.38
208	0.37
209	0.32
210	0.31
211	0.41
212	0.46
213	0.44
214	0.52
215	0.53
216	0.59
217	0.67
218	0.77
219	0.75
220	0.77
221	0.79
222	0.78
223	0.76
224	0.72
225	0.65
226	0.56
227	0.52
228	0.49
229	0.49
230	0.49
231	0.49
232	0.47
233	0.48
234	0.5
235	0.46
236	0.42
237	0.42
238	0.41
239	0.39
240	0.36
241	0.34
242	0.32
243	0.32
244	0.3
245	0.28
246	0.21
247	0.16
248	0.18
249	0.19
250	0.28
251	0.3
252	0.38
253	0.42
254	0.47
255	0.52
256	0.49
257	0.49
258	0.42
259	0.41
260	0.37
261	0.4
262	0.38
263	0.38
264	0.39
265	0.35
266	0.33
267	0.32
268	0.28
269	0.19
270	0.17
271	0.14
272	0.14
273	0.14
274	0.14
275	0.11
276	0.12
277	0.12
278	0.15
279	0.13
280	0.12
281	0.12
282	0.12
283	0.13
284	0.11
285	0.11
286	0.06
287	0.06
288	0.07
289	0.07
290	0.07
291	0.07
292	0.07
293	0.07
294	0.09
295	0.1
296	0.1
297	0.11
298	0.12
299	0.16
300	0.25
301	0.3
302	0.31
303	0.32
304	0.32
305	0.37
306	0.41
307	0.4
308	0.34
309	0.32
310	0.32
311	0.35
312	0.37
313	0.32
314	0.29
315	0.35
316	0.39
317	0.39
318	0.37
319	0.39
320	0.43
321	0.49
322	0.48
323	0.44
324	0.39
325	0.37
326	0.4
327	0.37
328	0.31
329	0.28
330	0.28
331	0.26
332	0.26
333	0.24
334	0.2
335	0.2
336	0.2
337	0.16
338	0.15
339	0.16
340	0.17
341	0.17
342	0.17
343	0.16
344	0.16
345	0.24
346	0.3
347	0.34
348	0.4
349	0.44
350	0.46
351	0.46
352	0.48
353	0.43
354	0.38
355	0.35
356	0.29
357	0.26
358	0.25
359	0.23
360	0.2
361	0.17
362	0.16
363	0.13
364	0.11
365	0.11
366	0.13
367	0.14
368	0.17
369	0.18
370	0.18
371	0.21
372	0.21
373	0.23
374	0.26
375	0.34
376	0.39
377	0.47
378	0.53
379	0.6
380	0.66
381	0.74
382	0.74
383	0.75
384	0.75
385	0.76
386	0.8
387	0.77
388	0.74
389	0.68
390	0.66
391	0.65
392	0.65
393	0.62
394	0.55
395	0.53
396	0.54
397	0.51
398	0.48
399	0.4
400	0.32
401	0.32
402	0.36
403	0.37
404	0.37
405	0.35
406	0.39
407	0.4
408	0.41
409	0.33
410	0.27
411	0.23
412	0.19
413	0.19
414	0.16
415	0.14
416	0.12
417	0.13
418	0.11
419	0.1
420	0.1
421	0.1
422	0.1
423	0.11
424	0.11
425	0.11
426	0.15
427	0.16
428	0.18
429	0.18
430	0.19
431	0.2
432	0.24
433	0.24
434	0.19
435	0.19
436	0.2
437	0.23
438	0.24
439	0.24
440	0.21
441	0.22
442	0.28
443	0.27
444	0.25
445	0.22
446	0.18
447	0.17
448	0.17
449	0.19
450	0.14
451	0.13
452	0.13
453	0.14
454	0.15
455	0.13
456	0.16
457	0.12
458	0.15
459	0.16
460	0.18
461	0.17
462	0.17
463	0.19
464	0.21
465	0.23
466	0.24
467	0.27
468	0.31
469	0.33
470	0.35
471	0.38
472	0.39
473	0.38
474	0.37
475	0.34
476	0.28
477	0.24
478	0.22
479	0.17
480	0.09
481	0.08
482	0.04
483	0.07
484	0.08
485	0.08
486	0.1
487	0.11
488	0.16
489	0.2
490	0.24
491	0.25
492	0.26
493	0.27
494	0.34
495	0.36
496	0.36
497	0.34
498	0.31
499	0.27
500	0.27
501	0.27
502	0.19
503	0.18
504	0.14
505	0.18
506	0.19
507	0.2
508	0.22
509	0.22
510	0.23
511	0.22
512	0.21
513	0.18
514	0.2
515	0.21
516	0.19
517	0.19
518	0.19
519	0.2
520	0.22
521	0.21
522	0.18
523	0.17
524	0.18
525	0.19
526	0.18
527	0.16
528	0.14
529	0.14
530	0.16
531	0.15
532	0.13
533	0.11
534	0.1
535	0.11
536	0.1
537	0.1
538	0.1
539	0.1
540	0.1
541	0.13
542	0.13
543	0.13
544	0.14
545	0.16
546	0.15
547	0.19
548	0.2
549	0.19
550	0.22
551	0.25
552	0.27
553	0.26
554	0.26
555	0.26
556	0.3
557	0.32
558	0.34
559	0.35
560	0.41
561	0.48
562	0.54

A0A194XC88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer