Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A7TGW7

Protein Details
Accession A7TGW7    Localization Confidence High Confidence Score 23.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
59-80DEEDTKKKPKSSNKTLTDNNSFHydrophilic
388-413EDNKGKQNSRKSKKGKFQKLKVSASNHydrophilic
689-710MQKRRKQIAPIQRKARKRQELLHydrophilic
755-775EQESSRKKKSKTFRDPNFFISHydrophilic
812-838QVHKQTATVKWDKKRKKYVNMQGIDNKHydrophilic
892-919GSQRGPGGRFKHKQNKAPRLPDKFRDDYBasic
949-977KTTAQIRKERMAKEKKRQKNARPTKKRKFBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
393-405KQNSRKSKKGKFQ
691-706KRRKQIAPIQRKARKR
955-977RKERMAKEKKRQKNARPTKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012541  DBP10_C  
IPR033517  DDX54/DBP10_DEAD-box_helicase  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
IPR000629  RNA-helicase_DEAD-box_CS  
IPR014014  RNA_helicase_DEAD_Q_motif  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016887  F:ATP hydrolysis activity  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG vpo:Kpol_1032p11  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08147  DBP10CT  
PF00270  DEAD  
PF00271  Helicase_C  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00039  DEAD_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
PS51195  Q_MOTIF  
CDD cd17959  DEADc_DDX54  
cd18787  SF2_C_DEAD  
Amino Acid Sequences MGIISKRKRHVEDSNSSSDDDDGFDITSNIGLNTADSSDESESSGDDEEEVQDIVDFSDEEDTKKKPKSSNKTLTDNNSFPSLEISDDEDSNNKGDHEDDDDDLNDYFSINNSEKSKHKKGSFPSFGFSKLILSNVHKKGFRQPTPIQRKTIPLILQKRDIVGMARTGSGKTAAFVLPMIEKLKSHSSKIGARAVILSPSRELALQTHRVFKEFSKGTHLRSVLLTGGDSLEDQFSMMMSNPDVIVATPGRFLHLKVEMSLDLKTVEYVVFDEADRLFEMGFQEQLNELLAALPMNRQTLLFSATLPSSLVDFAKAGLTNPVLVRLDAETKISENLEILFLSTKNEERENNLLYLLQDVIKIPLGTDDQIKKLSDFNKSLSDSDSEDEDNKGKQNSRKSKKGKFQKLKVSASNELPTEKSTIVFAPTRHHVEYITQLLKDSGFLVSYLYGTLDQHARKRQLLNFRAGLTSILVVTDVAARGVDIPMLANVINYSLPASSKIFIHRVGRTARAGNRGWAYSIVSETELPYMLDLELFLGKKILLTSMYEASCKLMKSKWIADGNTESSFEDPKISYTNRLVLGSAPRYDIESVGDLYKNIIESNFDLQMAKKVSLKAEKLYCRTRTAASPESIKRSKEVIASGWDEQNIRFGRNLEKEKLNFLAKFQNRRNKETVFEFGKNPNDDTAILMQKRRKQIAPIQRKARKRQELLDKERVAGLTHKIEDEILKGEDHEAGYSVPEEALKSFEDADKILEEQESSRKKKSKTFRDPNFFISHYAPAGDIQDKQLQITSGFTNDAAQAAYDLNDDDKVQVHKQTATVKWDKKRKKYVNMQGIDNKKYIIGESGQKIPASFKSGKFAEWSKSRNIKGIKTGARETSIPTNLLSDPTTDSGSQRGPGGRFKHKQNKAPRLPDKFRDDYQSQKKKVQSAIERGVSVKGFGGSSGNTELKTTAQIRKERMAKEKKRQKNARPTKKRKF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.67
3 0.62
4 0.54
5 0.45
6 0.36
7 0.27
8 0.2
9 0.13
10 0.12
11 0.11
12 0.11
13 0.1
14 0.11
15 0.09
16 0.08
17 0.08
18 0.07
19 0.08
20 0.09
21 0.09
22 0.09
23 0.09
24 0.12
25 0.13
26 0.13
27 0.14
28 0.13
29 0.12
30 0.13
31 0.14
32 0.11
33 0.1
34 0.1
35 0.1
36 0.11
37 0.11
38 0.09
39 0.08
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.07
44 0.06
45 0.13
46 0.14
47 0.16
48 0.19
49 0.23
50 0.3
51 0.36
52 0.42
53 0.44
54 0.55
55 0.63
56 0.71
57 0.78
58 0.79
59 0.81
60 0.82
61 0.83
62 0.8
63 0.71
64 0.62
65 0.55
66 0.47
67 0.38
68 0.34
69 0.26
70 0.19
71 0.18
72 0.2
73 0.18
74 0.19
75 0.19
76 0.18
77 0.19
78 0.19
79 0.19
80 0.15
81 0.13
82 0.14
83 0.15
84 0.18
85 0.2
86 0.19
87 0.2
88 0.21
89 0.21
90 0.2
91 0.19
92 0.13
93 0.1
94 0.09
95 0.09
96 0.14
97 0.13
98 0.19
99 0.21
100 0.25
101 0.33
102 0.42
103 0.51
104 0.54
105 0.59
106 0.62
107 0.68
108 0.75
109 0.78
110 0.71
111 0.67
112 0.6
113 0.56
114 0.5
115 0.41
116 0.32
117 0.23
118 0.23
119 0.22
120 0.25
121 0.33
122 0.37
123 0.43
124 0.42
125 0.43
126 0.51
127 0.58
128 0.58
129 0.57
130 0.59
131 0.64
132 0.74
133 0.77
134 0.72
135 0.65
136 0.65
137 0.6
138 0.59
139 0.54
140 0.52
141 0.56
142 0.55
143 0.57
144 0.53
145 0.49
146 0.43
147 0.38
148 0.3
149 0.23
150 0.21
151 0.17
152 0.18
153 0.17
154 0.17
155 0.17
156 0.16
157 0.15
158 0.12
159 0.13
160 0.12
161 0.11
162 0.11
163 0.12
164 0.11
165 0.13
166 0.14
167 0.12
168 0.12
169 0.16
170 0.25
171 0.27
172 0.28
173 0.31
174 0.35
175 0.4
176 0.46
177 0.48
178 0.39
179 0.37
180 0.36
181 0.32
182 0.32
183 0.27
184 0.23
185 0.17
186 0.17
187 0.17
188 0.15
189 0.15
190 0.14
191 0.19
192 0.27
193 0.28
194 0.36
195 0.36
196 0.37
197 0.37
198 0.35
199 0.38
200 0.32
201 0.32
202 0.33
203 0.35
204 0.37
205 0.43
206 0.42
207 0.34
208 0.32
209 0.32
210 0.24
211 0.21
212 0.18
213 0.11
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.08
218 0.06
219 0.06
220 0.06
221 0.05
222 0.05
223 0.05
224 0.06
225 0.06
226 0.06
227 0.07
228 0.06
229 0.07
230 0.07
231 0.06
232 0.08
233 0.08
234 0.09
235 0.1
236 0.1
237 0.13
238 0.13
239 0.13
240 0.15
241 0.19
242 0.19
243 0.18
244 0.21
245 0.2
246 0.2
247 0.2
248 0.16
249 0.12
250 0.11
251 0.1
252 0.08
253 0.07
254 0.06
255 0.07
256 0.07
257 0.07
258 0.07
259 0.09
260 0.08
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.08
266 0.09
267 0.09
268 0.1
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.09
274 0.07
275 0.06
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.05
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.08
285 0.08
286 0.09
287 0.12
288 0.11
289 0.1
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.1
294 0.09
295 0.07
296 0.08
297 0.08
298 0.07
299 0.07
300 0.07
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.11
307 0.11
308 0.13
309 0.12
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.14
314 0.13
315 0.14
316 0.11
317 0.12
318 0.13
319 0.12
320 0.11
321 0.08
322 0.08
323 0.08
324 0.07
325 0.07
326 0.07
327 0.07
328 0.08
329 0.09
330 0.11
331 0.12
332 0.15
333 0.16
334 0.19
335 0.23
336 0.24
337 0.23
338 0.21
339 0.2
340 0.17
341 0.17
342 0.13
343 0.09
344 0.08
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.08
349 0.07
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.14
354 0.15
355 0.16
356 0.18
357 0.19
358 0.18
359 0.21
360 0.24
361 0.25
362 0.25
363 0.26
364 0.3
365 0.31
366 0.31
367 0.28
368 0.26
369 0.21
370 0.2
371 0.19
372 0.14
373 0.13
374 0.14
375 0.14
376 0.13
377 0.14
378 0.16
379 0.19
380 0.23
381 0.33
382 0.43
383 0.49
384 0.58
385 0.65
386 0.72
387 0.77
388 0.83
389 0.84
390 0.83
391 0.84
392 0.84
393 0.84
394 0.81
395 0.76
396 0.71
397 0.63
398 0.56
399 0.5
400 0.4
401 0.32
402 0.27
403 0.22
404 0.18
405 0.15
406 0.12
407 0.1
408 0.1
409 0.12
410 0.13
411 0.13
412 0.15
413 0.18
414 0.22
415 0.21
416 0.21
417 0.19
418 0.18
419 0.21
420 0.23
421 0.21
422 0.17
423 0.17
424 0.17
425 0.17
426 0.15
427 0.12
428 0.07
429 0.05
430 0.05
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.1
440 0.11
441 0.16
442 0.21
443 0.23
444 0.26
445 0.3
446 0.34
447 0.4
448 0.42
449 0.43
450 0.4
451 0.38
452 0.35
453 0.31
454 0.27
455 0.17
456 0.13
457 0.08
458 0.05
459 0.04
460 0.04
461 0.04
462 0.04
463 0.04
464 0.04
465 0.03
466 0.03
467 0.04
468 0.04
469 0.04
470 0.03
471 0.03
472 0.03
473 0.04
474 0.04
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.04
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.09
487 0.11
488 0.12
489 0.15
490 0.19
491 0.18
492 0.22
493 0.23
494 0.25
495 0.24
496 0.27
497 0.27
498 0.29
499 0.28
500 0.27
501 0.27
502 0.24
503 0.23
504 0.19
505 0.17
506 0.11
507 0.11
508 0.09
509 0.08
510 0.08
511 0.08
512 0.07
513 0.07
514 0.06
515 0.06
516 0.06
517 0.05
518 0.05
519 0.04
520 0.04
521 0.06
522 0.06
523 0.06
524 0.06
525 0.06
526 0.06
527 0.06
528 0.06
529 0.05
530 0.06
531 0.08
532 0.12
533 0.12
534 0.12
535 0.12
536 0.13
537 0.14
538 0.13
539 0.13
540 0.11
541 0.14
542 0.18
543 0.21
544 0.27
545 0.3
546 0.3
547 0.31
548 0.33
549 0.32
550 0.29
551 0.27
552 0.2
553 0.16
554 0.17
555 0.14
556 0.12
557 0.09
558 0.09
559 0.13
560 0.13
561 0.16
562 0.16
563 0.2
564 0.2
565 0.2
566 0.19
567 0.17
568 0.21
569 0.2
570 0.2
571 0.16
572 0.15
573 0.16
574 0.16
575 0.15
576 0.11
577 0.1
578 0.1
579 0.1
580 0.1
581 0.09
582 0.09
583 0.09
584 0.08
585 0.07
586 0.07
587 0.07
588 0.08
589 0.11
590 0.11
591 0.11
592 0.11
593 0.11
594 0.16
595 0.16
596 0.16
597 0.16
598 0.17
599 0.21
600 0.26
601 0.28
602 0.28
603 0.33
604 0.38
605 0.41
606 0.47
607 0.46
608 0.44
609 0.44
610 0.41
611 0.38
612 0.39
613 0.39
614 0.34
615 0.38
616 0.37
617 0.43
618 0.44
619 0.4
620 0.35
621 0.32
622 0.32
623 0.28
624 0.27
625 0.21
626 0.22
627 0.24
628 0.24
629 0.23
630 0.22
631 0.2
632 0.18
633 0.23
634 0.19
635 0.17
636 0.17
637 0.17
638 0.24
639 0.31
640 0.36
641 0.34
642 0.39
643 0.39
644 0.41
645 0.44
646 0.41
647 0.33
648 0.3
649 0.35
650 0.35
651 0.43
652 0.48
653 0.53
654 0.54
655 0.6
656 0.63
657 0.55
658 0.54
659 0.49
660 0.49
661 0.45
662 0.43
663 0.4
664 0.4
665 0.43
666 0.4
667 0.37
668 0.3
669 0.25
670 0.23
671 0.22
672 0.22
673 0.22
674 0.22
675 0.26
676 0.3
677 0.34
678 0.41
679 0.43
680 0.41
681 0.41
682 0.49
683 0.56
684 0.62
685 0.65
686 0.69
687 0.72
688 0.79
689 0.82
690 0.84
691 0.82
692 0.76
693 0.76
694 0.76
695 0.79
696 0.8
697 0.8
698 0.7
699 0.61
700 0.58
701 0.49
702 0.39
703 0.31
704 0.26
705 0.21
706 0.2
707 0.2
708 0.18
709 0.19
710 0.18
711 0.17
712 0.15
713 0.12
714 0.11
715 0.11
716 0.12
717 0.13
718 0.12
719 0.11
720 0.09
721 0.08
722 0.08
723 0.08
724 0.08
725 0.06
726 0.07
727 0.07
728 0.07
729 0.08
730 0.08
731 0.09
732 0.1
733 0.11
734 0.12
735 0.12
736 0.13
737 0.12
738 0.12
739 0.12
740 0.11
741 0.1
742 0.11
743 0.19
744 0.26
745 0.3
746 0.37
747 0.44
748 0.47
749 0.55
750 0.64
751 0.67
752 0.7
753 0.77
754 0.8
755 0.83
756 0.83
757 0.79
758 0.74
759 0.64
760 0.55
761 0.47
762 0.38
763 0.28
764 0.25
765 0.2
766 0.15
767 0.17
768 0.15
769 0.14
770 0.15
771 0.2
772 0.19
773 0.19
774 0.2
775 0.18
776 0.17
777 0.19
778 0.16
779 0.13
780 0.14
781 0.13
782 0.13
783 0.12
784 0.12
785 0.09
786 0.08
787 0.08
788 0.07
789 0.08
790 0.07
791 0.07
792 0.07
793 0.08
794 0.09
795 0.08
796 0.12
797 0.15
798 0.17
799 0.2
800 0.22
801 0.23
802 0.27
803 0.34
804 0.35
805 0.4
806 0.47
807 0.51
808 0.58
809 0.67
810 0.72
811 0.76
812 0.82
813 0.84
814 0.85
815 0.88
816 0.89
817 0.9
818 0.84
819 0.81
820 0.79
821 0.76
822 0.69
823 0.59
824 0.48
825 0.38
826 0.34
827 0.27
828 0.22
829 0.18
830 0.21
831 0.24
832 0.3
833 0.31
834 0.31
835 0.3
836 0.3
837 0.29
838 0.29
839 0.31
840 0.27
841 0.33
842 0.33
843 0.34
844 0.36
845 0.37
846 0.38
847 0.41
848 0.43
849 0.45
850 0.53
851 0.53
852 0.56
853 0.58
854 0.55
855 0.56
856 0.62
857 0.59
858 0.57
859 0.6
860 0.55
861 0.53
862 0.48
863 0.44
864 0.43
865 0.38
866 0.33
867 0.29
868 0.28
869 0.26
870 0.27
871 0.23
872 0.17
873 0.17
874 0.18
875 0.2
876 0.18
877 0.19
878 0.2
879 0.22
880 0.21
881 0.22
882 0.25
883 0.26
884 0.33
885 0.39
886 0.46
887 0.5
888 0.6
889 0.67
890 0.71
891 0.77
892 0.8
893 0.84
894 0.84
895 0.89
896 0.88
897 0.88
898 0.87
899 0.87
900 0.84
901 0.79
902 0.72
903 0.7
904 0.64
905 0.64
906 0.67
907 0.69
908 0.65
909 0.66
910 0.68
911 0.67
912 0.69
913 0.68
914 0.67
915 0.66
916 0.7
917 0.67
918 0.62
919 0.57
920 0.54
921 0.44
922 0.35
923 0.27
924 0.19
925 0.15
926 0.14
927 0.15
928 0.12
929 0.15
930 0.2
931 0.2
932 0.19
933 0.19
934 0.2
935 0.19
936 0.25
937 0.27
938 0.29
939 0.35
940 0.42
941 0.47
942 0.55
943 0.62
944 0.63
945 0.68
946 0.72
947 0.74
948 0.79
949 0.84
950 0.86
951 0.89
952 0.92
953 0.93
954 0.93
955 0.94
956 0.94
957 0.95