Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E4ZMP6

Protein Details
Accession E4ZMP6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-23MWDSRGVRWPPPRPNARQPTGRLHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 18.5, cyto_nucl 11.5, mito 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011709  DEAD-box_helicase_OB_fold  
IPR011545  DEAD/DEAH_box_helicase_dom  
IPR044756  DHX15_DEXHc  
IPR002464  DNA/RNA_helicase_DEAH_CS  
IPR007502  Helicase-assoc_dom  
IPR014001  Helicase_ATP-bd  
IPR001650  Helicase_C  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0071014  C:post-mRNA release spliceosomal complex  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0005684  C:U2-type spliceosomal complex  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0003724  F:RNA helicase activity  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000463  P:maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000390  P:spliceosomal complex disassembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF00270  DEAD  
PF04408  HA2  
PF00271  Helicase_C  
PF07717  OB_NTP_bind  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00690  DEAH_ATP_HELICASE  
PS51192  HELICASE_ATP_BIND_1  
PS51194  HELICASE_CTER  
CDD cd17973  DEXHc_DHX15  
cd18791  SF2_C_RHA  
Amino Acid Sequences MWDSRGVRWPPPRPNARQPTGRLDRHFPFLPLLTYSFDSFDSFDSFDSNGSRNTLTVTGQSRQPSQGTGDSLEMTAMTKRDSHDDDSARVKRVKTEGNGEESKANPYLAHWDSEQAGKSENSEYSAIGAGLAGFKRHATTTKQATAAEDGPDNPFTGRPLSSKYMSILKTRRGLPVHQQRDEFLKLYQESQILVFVGETGSGKTTQIPQFVLFDDLPQQSAQMVACTQPRRVAAMSVAQRVAEEMDVELGEEVGYSIRFEDRTGPNTILKYMTDGMLLREAMHDNNLTRYSTIILDEAHERTLATDILMGLLKEVVLRRKDLKLIIMSATLDATKFQKYFHNAPLLAVPGRTHPVEVFYTPAPERDYVEAALRTVLQIHATEPEGDILLFLTGEEEIEDACRKINLEAQDLTREGGAGPLVVYPLYGTLPPAQQQKIFSPAPPPSTPGGRPGRKVIVSTNIAETSLTIDGIVYVVDPGFSKQKVYNPRIRVESLLVSPISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEQAFKKELIEQTYPEILRSNLASTVLELKKLGVDDLVHFDLMDPPAPETLMRALEELNYLACLDDEGELTQLGSLASQFPLDPALAVMLITSPEFYCSNEILSLTALLSVPQIFVRPANNRKRADEMKQFFAHPKGDHLTMLNVYHAFKGEEAQANPKQWCHDHFLSYRALQQADNVRLQLKRIMEREELELMSTPFENKTYYENIQRALVAGFFMQVAKRDGNSKSYITVKDEQNVLLHPSTVLAEDSEWVIYNEFVLTTKNYIRTVTSVKPEWLLDISPNYYDLSQFKKGEIRQALQAVVTKIQRKELQKAGRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.83
2 0.85
3 0.84
4 0.83
5 0.79
6 0.79
7 0.8
8 0.78
9 0.73
10 0.7
11 0.65
12 0.63
13 0.6
14 0.5
15 0.45
16 0.39
17 0.36
18 0.31
19 0.29
20 0.25
21 0.25
22 0.25
23 0.22
24 0.21
25 0.2
26 0.18
27 0.18
28 0.17
29 0.16
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.16
34 0.17
35 0.17
36 0.16
37 0.18
38 0.19
39 0.17
40 0.19
41 0.19
42 0.18
43 0.22
44 0.25
45 0.26
46 0.3
47 0.34
48 0.34
49 0.36
50 0.36
51 0.32
52 0.31
53 0.33
54 0.31
55 0.29
56 0.27
57 0.25
58 0.23
59 0.21
60 0.17
61 0.13
62 0.13
63 0.12
64 0.11
65 0.13
66 0.14
67 0.21
68 0.25
69 0.29
70 0.35
71 0.37
72 0.4
73 0.48
74 0.51
75 0.5
76 0.5
77 0.46
78 0.44
79 0.48
80 0.51
81 0.47
82 0.52
83 0.5
84 0.54
85 0.55
86 0.51
87 0.48
88 0.41
89 0.39
90 0.31
91 0.27
92 0.19
93 0.18
94 0.24
95 0.22
96 0.23
97 0.2
98 0.21
99 0.22
100 0.26
101 0.26
102 0.19
103 0.2
104 0.18
105 0.19
106 0.2
107 0.19
108 0.19
109 0.18
110 0.17
111 0.16
112 0.17
113 0.14
114 0.11
115 0.1
116 0.07
117 0.1
118 0.1
119 0.09
120 0.08
121 0.09
122 0.11
123 0.12
124 0.16
125 0.19
126 0.27
127 0.35
128 0.4
129 0.42
130 0.41
131 0.42
132 0.42
133 0.38
134 0.32
135 0.25
136 0.21
137 0.21
138 0.21
139 0.19
140 0.15
141 0.14
142 0.13
143 0.15
144 0.16
145 0.15
146 0.2
147 0.25
148 0.26
149 0.27
150 0.28
151 0.33
152 0.33
153 0.4
154 0.39
155 0.41
156 0.45
157 0.46
158 0.51
159 0.47
160 0.48
161 0.5
162 0.56
163 0.59
164 0.57
165 0.55
166 0.5
167 0.53
168 0.52
169 0.42
170 0.32
171 0.29
172 0.26
173 0.26
174 0.27
175 0.22
176 0.2
177 0.19
178 0.19
179 0.13
180 0.12
181 0.1
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.16
192 0.19
193 0.21
194 0.22
195 0.22
196 0.23
197 0.24
198 0.26
199 0.19
200 0.16
201 0.19
202 0.17
203 0.17
204 0.16
205 0.15
206 0.11
207 0.12
208 0.11
209 0.08
210 0.08
211 0.09
212 0.15
213 0.17
214 0.18
215 0.21
216 0.22
217 0.24
218 0.24
219 0.23
220 0.19
221 0.25
222 0.28
223 0.27
224 0.27
225 0.23
226 0.22
227 0.21
228 0.2
229 0.12
230 0.09
231 0.05
232 0.06
233 0.06
234 0.06
235 0.05
236 0.05
237 0.04
238 0.04
239 0.04
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.14
248 0.17
249 0.21
250 0.24
251 0.26
252 0.27
253 0.28
254 0.28
255 0.22
256 0.19
257 0.18
258 0.16
259 0.14
260 0.13
261 0.12
262 0.12
263 0.13
264 0.13
265 0.1
266 0.11
267 0.11
268 0.1
269 0.12
270 0.12
271 0.1
272 0.13
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.13
278 0.12
279 0.12
280 0.1
281 0.09
282 0.1
283 0.12
284 0.12
285 0.11
286 0.11
287 0.1
288 0.09
289 0.11
290 0.09
291 0.07
292 0.07
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.06
301 0.08
302 0.12
303 0.13
304 0.16
305 0.19
306 0.21
307 0.24
308 0.24
309 0.26
310 0.23
311 0.23
312 0.22
313 0.19
314 0.17
315 0.15
316 0.14
317 0.1
318 0.08
319 0.07
320 0.08
321 0.1
322 0.1
323 0.11
324 0.16
325 0.21
326 0.26
327 0.3
328 0.35
329 0.32
330 0.33
331 0.33
332 0.3
333 0.24
334 0.2
335 0.15
336 0.1
337 0.12
338 0.12
339 0.11
340 0.09
341 0.11
342 0.13
343 0.13
344 0.13
345 0.11
346 0.14
347 0.14
348 0.15
349 0.14
350 0.13
351 0.15
352 0.14
353 0.15
354 0.13
355 0.15
356 0.14
357 0.12
358 0.12
359 0.1
360 0.09
361 0.08
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.06
366 0.07
367 0.08
368 0.08
369 0.08
370 0.08
371 0.07
372 0.07
373 0.06
374 0.05
375 0.04
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.05
390 0.06
391 0.1
392 0.11
393 0.14
394 0.16
395 0.16
396 0.18
397 0.18
398 0.17
399 0.13
400 0.11
401 0.08
402 0.07
403 0.06
404 0.04
405 0.04
406 0.04
407 0.04
408 0.04
409 0.03
410 0.03
411 0.04
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.06
416 0.07
417 0.1
418 0.14
419 0.15
420 0.16
421 0.18
422 0.18
423 0.23
424 0.22
425 0.2
426 0.21
427 0.23
428 0.26
429 0.24
430 0.26
431 0.21
432 0.24
433 0.24
434 0.28
435 0.34
436 0.32
437 0.34
438 0.35
439 0.37
440 0.35
441 0.36
442 0.29
443 0.27
444 0.26
445 0.25
446 0.24
447 0.19
448 0.18
449 0.17
450 0.15
451 0.11
452 0.08
453 0.07
454 0.05
455 0.05
456 0.05
457 0.05
458 0.05
459 0.03
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.03
464 0.05
465 0.08
466 0.08
467 0.09
468 0.12
469 0.18
470 0.27
471 0.33
472 0.4
473 0.42
474 0.46
475 0.48
476 0.47
477 0.42
478 0.35
479 0.31
480 0.23
481 0.21
482 0.17
483 0.14
484 0.13
485 0.12
486 0.1
487 0.08
488 0.09
489 0.12
490 0.2
491 0.22
492 0.27
493 0.29
494 0.35
495 0.36
496 0.38
497 0.37
498 0.34
499 0.38
500 0.42
501 0.42
502 0.44
503 0.5
504 0.5
505 0.48
506 0.49
507 0.47
508 0.47
509 0.48
510 0.46
511 0.49
512 0.5
513 0.5
514 0.47
515 0.43
516 0.35
517 0.36
518 0.32
519 0.27
520 0.24
521 0.22
522 0.24
523 0.28
524 0.26
525 0.22
526 0.21
527 0.16
528 0.15
529 0.15
530 0.13
531 0.09
532 0.1
533 0.09
534 0.09
535 0.17
536 0.16
537 0.16
538 0.15
539 0.15
540 0.15
541 0.15
542 0.15
543 0.07
544 0.08
545 0.09
546 0.13
547 0.14
548 0.12
549 0.12
550 0.12
551 0.14
552 0.14
553 0.14
554 0.1
555 0.1
556 0.1
557 0.1
558 0.1
559 0.08
560 0.1
561 0.1
562 0.1
563 0.1
564 0.1
565 0.11
566 0.11
567 0.1
568 0.08
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.05
584 0.04
585 0.04
586 0.05
587 0.05
588 0.06
589 0.06
590 0.06
591 0.07
592 0.07
593 0.06
594 0.05
595 0.05
596 0.05
597 0.05
598 0.05
599 0.04
600 0.04
601 0.04
602 0.05
603 0.05
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.11
608 0.11
609 0.13
610 0.13
611 0.13
612 0.11
613 0.11
614 0.11
615 0.08
616 0.08
617 0.07
618 0.06
619 0.07
620 0.07
621 0.07
622 0.07
623 0.08
624 0.07
625 0.09
626 0.15
627 0.22
628 0.32
629 0.42
630 0.51
631 0.53
632 0.55
633 0.62
634 0.63
635 0.63
636 0.64
637 0.59
638 0.57
639 0.56
640 0.55
641 0.5
642 0.48
643 0.44
644 0.34
645 0.34
646 0.3
647 0.29
648 0.28
649 0.26
650 0.24
651 0.22
652 0.22
653 0.19
654 0.16
655 0.16
656 0.16
657 0.16
658 0.13
659 0.11
660 0.12
661 0.15
662 0.2
663 0.2
664 0.27
665 0.3
666 0.34
667 0.35
668 0.35
669 0.34
670 0.32
671 0.34
672 0.36
673 0.35
674 0.37
675 0.38
676 0.4
677 0.4
678 0.38
679 0.39
680 0.33
681 0.31
682 0.24
683 0.28
684 0.32
685 0.32
686 0.33
687 0.3
688 0.3
689 0.3
690 0.31
691 0.31
692 0.27
693 0.3
694 0.32
695 0.36
696 0.36
697 0.37
698 0.4
699 0.38
700 0.33
701 0.28
702 0.26
703 0.21
704 0.19
705 0.17
706 0.15
707 0.12
708 0.13
709 0.13
710 0.12
711 0.16
712 0.21
713 0.25
714 0.31
715 0.33
716 0.34
717 0.34
718 0.33
719 0.3
720 0.24
721 0.2
722 0.13
723 0.1
724 0.09
725 0.08
726 0.09
727 0.09
728 0.1
729 0.13
730 0.14
731 0.16
732 0.21
733 0.23
734 0.27
735 0.3
736 0.29
737 0.3
738 0.35
739 0.37
740 0.38
741 0.43
742 0.41
743 0.42
744 0.42
745 0.39
746 0.35
747 0.34
748 0.32
749 0.25
750 0.22
751 0.17
752 0.16
753 0.15
754 0.14
755 0.13
756 0.09
757 0.09
758 0.09
759 0.1
760 0.1
761 0.1
762 0.1
763 0.1
764 0.09
765 0.09
766 0.09
767 0.08
768 0.08
769 0.09
770 0.11
771 0.15
772 0.2
773 0.23
774 0.25
775 0.26
776 0.27
777 0.3
778 0.35
779 0.37
780 0.4
781 0.39
782 0.39
783 0.41
784 0.39
785 0.37
786 0.32
787 0.27
788 0.23
789 0.24
790 0.24
791 0.22
792 0.23
793 0.22
794 0.2
795 0.21
796 0.21
797 0.24
798 0.29
799 0.3
800 0.32
801 0.38
802 0.4
803 0.47
804 0.51
805 0.47
806 0.46
807 0.49
808 0.47
809 0.41
810 0.43
811 0.36
812 0.34
813 0.37
814 0.37
815 0.35
816 0.42
817 0.47
818 0.49
819 0.55
820 0.59