Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139A3B3

Protein Details
Accession A0A139A3B3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
236-260HIEEEPKKRVPKKPKKEEEPEVKMDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
241-251PKKRVPKKPKK
388-442KFGPKGGRGGRGGRGGRGRGGRGGRGGRGGRGGGGGRGGKRKAEDDGERREKKQR
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 13, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR014886  La_xRRM  
IPR002344  Lupus_La  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
PS51939  XRRM  
Amino Acid Sequences MTADGHSDVAAKILAQTEFYFGDSNIVKDKFLVGEIQKDKDGWVPIETLLKFNRLRQISDDAKVIADALRKSKEMLEVKEDGSAVRRITQVALNPKYNSRTILVTGFPHDLASPVDTIAEHFASLNPANVHPQRSKDHATKIWSFNGSAFVEFASVAIATEALALTTYKTASGAEHPLTTQLRKDWIEDNRRQRGLPPTSEKEEKEELKKDEEDHPDPKSRGLFTLHYLPGGMMHHIEEEPKKRVPKKPKKEEEPEVKMDEDDAPAEMEKVEVTRVEGGLLRAENFSSVAHRNDVKPFFSQFGLVKWVEYDHVARVAFVLFDDAGRGVDLVAAWERAKNGEEVMIGGSKVATKLHEMDIGVREPTADETEAFYTGYAERLTTIRHNEKFGPKGGRGGRGGRGGRGRGGRGGRGGRGGRGGGGGRGGKRKAEDDGERREKKQRED
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.13
3 0.14
4 0.16
5 0.16
6 0.18
7 0.17
8 0.14
9 0.19
10 0.18
11 0.19
12 0.24
13 0.24
14 0.22
15 0.22
16 0.24
17 0.19
18 0.19
19 0.23
20 0.18
21 0.27
22 0.31
23 0.34
24 0.33
25 0.32
26 0.32
27 0.31
28 0.33
29 0.25
30 0.23
31 0.21
32 0.22
33 0.29
34 0.28
35 0.27
36 0.25
37 0.3
38 0.3
39 0.33
40 0.4
41 0.35
42 0.37
43 0.37
44 0.44
45 0.43
46 0.44
47 0.42
48 0.34
49 0.31
50 0.29
51 0.25
52 0.19
53 0.18
54 0.18
55 0.21
56 0.23
57 0.23
58 0.25
59 0.27
60 0.33
61 0.35
62 0.36
63 0.36
64 0.37
65 0.37
66 0.38
67 0.35
68 0.27
69 0.24
70 0.23
71 0.18
72 0.18
73 0.18
74 0.17
75 0.19
76 0.22
77 0.24
78 0.31
79 0.36
80 0.37
81 0.38
82 0.41
83 0.43
84 0.41
85 0.37
86 0.29
87 0.26
88 0.24
89 0.25
90 0.23
91 0.21
92 0.23
93 0.22
94 0.2
95 0.18
96 0.15
97 0.14
98 0.13
99 0.12
100 0.1
101 0.08
102 0.08
103 0.08
104 0.09
105 0.1
106 0.09
107 0.08
108 0.08
109 0.08
110 0.11
111 0.12
112 0.14
113 0.12
114 0.13
115 0.19
116 0.22
117 0.26
118 0.25
119 0.3
120 0.31
121 0.35
122 0.41
123 0.4
124 0.45
125 0.45
126 0.49
127 0.51
128 0.51
129 0.5
130 0.45
131 0.4
132 0.33
133 0.33
134 0.28
135 0.21
136 0.17
137 0.13
138 0.12
139 0.11
140 0.1
141 0.05
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.04
146 0.03
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.06
158 0.06
159 0.09
160 0.12
161 0.13
162 0.13
163 0.13
164 0.17
165 0.18
166 0.18
167 0.17
168 0.14
169 0.18
170 0.19
171 0.21
172 0.23
173 0.3
174 0.38
175 0.45
176 0.52
177 0.55
178 0.56
179 0.54
180 0.51
181 0.52
182 0.48
183 0.47
184 0.45
185 0.42
186 0.46
187 0.49
188 0.46
189 0.41
190 0.42
191 0.38
192 0.36
193 0.38
194 0.35
195 0.34
196 0.35
197 0.33
198 0.35
199 0.38
200 0.36
201 0.34
202 0.35
203 0.36
204 0.35
205 0.35
206 0.29
207 0.24
208 0.21
209 0.21
210 0.2
211 0.17
212 0.23
213 0.21
214 0.2
215 0.19
216 0.17
217 0.15
218 0.15
219 0.13
220 0.06
221 0.06
222 0.07
223 0.07
224 0.09
225 0.11
226 0.14
227 0.18
228 0.21
229 0.27
230 0.33
231 0.41
232 0.51
233 0.59
234 0.66
235 0.74
236 0.8
237 0.84
238 0.86
239 0.87
240 0.86
241 0.81
242 0.74
243 0.65
244 0.55
245 0.45
246 0.38
247 0.29
248 0.19
249 0.13
250 0.09
251 0.07
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.05
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.06
261 0.07
262 0.07
263 0.07
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.09
275 0.12
276 0.12
277 0.15
278 0.17
279 0.19
280 0.25
281 0.28
282 0.26
283 0.26
284 0.27
285 0.26
286 0.24
287 0.25
288 0.18
289 0.18
290 0.21
291 0.18
292 0.17
293 0.15
294 0.15
295 0.13
296 0.14
297 0.14
298 0.1
299 0.13
300 0.13
301 0.13
302 0.13
303 0.12
304 0.1
305 0.09
306 0.09
307 0.06
308 0.06
309 0.06
310 0.06
311 0.06
312 0.06
313 0.06
314 0.04
315 0.05
316 0.05
317 0.06
318 0.06
319 0.08
320 0.08
321 0.09
322 0.1
323 0.11
324 0.12
325 0.11
326 0.11
327 0.11
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.11
332 0.1
333 0.09
334 0.09
335 0.08
336 0.08
337 0.09
338 0.08
339 0.1
340 0.13
341 0.15
342 0.18
343 0.17
344 0.2
345 0.23
346 0.24
347 0.21
348 0.18
349 0.16
350 0.14
351 0.16
352 0.15
353 0.12
354 0.11
355 0.13
356 0.15
357 0.15
358 0.15
359 0.13
360 0.11
361 0.11
362 0.13
363 0.1
364 0.09
365 0.1
366 0.11
367 0.14
368 0.18
369 0.27
370 0.34
371 0.37
372 0.41
373 0.47
374 0.54
375 0.55
376 0.57
377 0.56
378 0.48
379 0.54
380 0.54
381 0.54
382 0.5
383 0.5
384 0.49
385 0.5
386 0.51
387 0.48
388 0.5
389 0.45
390 0.48
391 0.48
392 0.45
393 0.43
394 0.46
395 0.43
396 0.44
397 0.46
398 0.42
399 0.45
400 0.44
401 0.39
402 0.39
403 0.36
404 0.29
405 0.28
406 0.26
407 0.19
408 0.23
409 0.25
410 0.27
411 0.34
412 0.35
413 0.35
414 0.37
415 0.39
416 0.4
417 0.44
418 0.49
419 0.49
420 0.58
421 0.65
422 0.67
423 0.69
424 0.73