Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139AS73

Protein Details
Accession A0A139AS73    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
279-300SAVHIKRQRTYRQYMNRKGGFNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-200DRDRDRDRAGDRDRPRGDRDRGGDKDRSRGDAGGSGGARRDYDRRNDRRGDDGRDRRDDGRKDDGRVRRDDGGRDRRDDGRRDDGGSDRRDDVGRDRRDDGRDRRDDRRDDPRDRKDDSRDTKVKREETPRDKDRRDDPRDRRDDPRDRRDGARDRRDAKDRRD
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013957  SNRNP27  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0006397  P:mRNA processing  
GO:0008380  P:RNA splicing  
Pfam View protein in Pfam  
PF08648  SNRNP27  
Amino Acid Sequences MSARDDRRGDRMSRSKSPDSARQRRDDHYDRDRRTADRDRDRDRAGDRDRPRGDRDRGGDKDRSRGDAGGSGGARRDYDRRNDRRGDDGRDRRDDGRKDDGRVRRDDGGRDRRDDGRRDDGGSDRRDDVGRDRRDDGRDRRDDRRDDPRDRKDDSRDTKVKREETPRDKDRRDDPRDRRDDPRDRRDGARDRRDAKDRRDDTRDHRDDRDRDRRAGLHASPAPPNGHDRQDRQASAAPSEDPDADVMDVDDDEQAMMLAMGFAGFGSTKGKKVAGTDHSAVHIKRQRTYRQYMNRKGGFNRPLDPVK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.68
2 0.66
3 0.68
4 0.71
5 0.7
6 0.72
7 0.74
8 0.73
9 0.74
10 0.73
11 0.72
12 0.75
13 0.73
14 0.71
15 0.71
16 0.74
17 0.69
18 0.73
19 0.71
20 0.64
21 0.64
22 0.65
23 0.64
24 0.65
25 0.69
26 0.68
27 0.71
28 0.71
29 0.68
30 0.62
31 0.61
32 0.57
33 0.58
34 0.56
35 0.59
36 0.62
37 0.61
38 0.64
39 0.63
40 0.63
41 0.61
42 0.62
43 0.61
44 0.61
45 0.62
46 0.63
47 0.56
48 0.59
49 0.53
50 0.52
51 0.44
52 0.4
53 0.35
54 0.31
55 0.3
56 0.25
57 0.23
58 0.19
59 0.19
60 0.18
61 0.17
62 0.16
63 0.2
64 0.21
65 0.31
66 0.41
67 0.47
68 0.54
69 0.6
70 0.6
71 0.64
72 0.65
73 0.63
74 0.63
75 0.65
76 0.64
77 0.63
78 0.64
79 0.59
80 0.62
81 0.58
82 0.53
83 0.54
84 0.51
85 0.5
86 0.55
87 0.57
88 0.54
89 0.53
90 0.51
91 0.47
92 0.46
93 0.49
94 0.5
95 0.53
96 0.52
97 0.51
98 0.51
99 0.52
100 0.55
101 0.53
102 0.48
103 0.46
104 0.44
105 0.42
106 0.4
107 0.38
108 0.39
109 0.36
110 0.33
111 0.26
112 0.26
113 0.25
114 0.24
115 0.27
116 0.3
117 0.32
118 0.33
119 0.35
120 0.37
121 0.41
122 0.49
123 0.48
124 0.49
125 0.53
126 0.55
127 0.6
128 0.63
129 0.63
130 0.6
131 0.63
132 0.61
133 0.62
134 0.66
135 0.67
136 0.65
137 0.65
138 0.64
139 0.59
140 0.61
141 0.58
142 0.57
143 0.56
144 0.55
145 0.58
146 0.6
147 0.58
148 0.54
149 0.57
150 0.58
151 0.59
152 0.65
153 0.66
154 0.68
155 0.66
156 0.65
157 0.65
158 0.65
159 0.65
160 0.67
161 0.67
162 0.69
163 0.75
164 0.74
165 0.73
166 0.72
167 0.74
168 0.73
169 0.73
170 0.69
171 0.65
172 0.64
173 0.65
174 0.66
175 0.65
176 0.66
177 0.63
178 0.61
179 0.64
180 0.7
181 0.68
182 0.65
183 0.65
184 0.6
185 0.59
186 0.6
187 0.59
188 0.58
189 0.62
190 0.62
191 0.55
192 0.57
193 0.6
194 0.61
195 0.67
196 0.69
197 0.63
198 0.58
199 0.58
200 0.54
201 0.49
202 0.49
203 0.4
204 0.37
205 0.37
206 0.36
207 0.34
208 0.35
209 0.32
210 0.27
211 0.31
212 0.26
213 0.29
214 0.32
215 0.34
216 0.39
217 0.45
218 0.44
219 0.42
220 0.44
221 0.38
222 0.35
223 0.33
224 0.26
225 0.2
226 0.21
227 0.18
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.07
235 0.06
236 0.06
237 0.06
238 0.05
239 0.05
240 0.04
241 0.04
242 0.04
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.03
247 0.03
248 0.03
249 0.02
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.09
254 0.11
255 0.13
256 0.15
257 0.17
258 0.18
259 0.21
260 0.29
261 0.3
262 0.36
263 0.36
264 0.36
265 0.38
266 0.42
267 0.39
268 0.4
269 0.41
270 0.37
271 0.42
272 0.49
273 0.55
274 0.59
275 0.67
276 0.68
277 0.72
278 0.8
279 0.84
280 0.86
281 0.82
282 0.8
283 0.76
284 0.76
285 0.72
286 0.66
287 0.6