Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139A4F0

Protein Details
Accession A0A139A4F0    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-40LEQAVKRKKAEVKRPPPSRPTASHydrophilic
82-106SDIPREKGGKRKRGKKVPQFQVDEEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
23-34KRKKAEVKRPPP
86-97REKGGKRKRGKK
Subcellular Location(s) cyto 13.5, cyto_mito 11, mito 7.5, nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR040052  RBM17  
IPR000504  RRM_dom  
IPR003954  RRM_dom_euk  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0045292  P:mRNA cis splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
Amino Acid Sequences MDLKKPISGAWSASTSFLEQAVKRKKAEVKRPPPSRPTASLLPSFQPLPATSRDVNENPQTSAIPQPSFPPASIFTTSPTVSDIPREKGGKRKRGKKVPQFQVDEEYDPARPNDFDTMKMEYRRRKEEEKQRLLAEALRGPGTASPTSVAVDAESGEEAFLRRGRLSQPEAPYNAIDLDVSGEDAYLRRGQLSFGGAPPESHDGATATTVVLLKNMVGPGQVDDHLHEDVAEEAEKFGKVERCLVFEVPGGNTPPEEAVRVFVKFSNLDGAKKAKAAFDGRFFGGRPVSATYYPVRKFDALDLAPSEDET
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.21
3 0.2
4 0.19
5 0.2
6 0.19
7 0.28
8 0.37
9 0.41
10 0.41
11 0.48
12 0.55
13 0.6
14 0.69
15 0.71
16 0.72
17 0.77
18 0.86
19 0.86
20 0.85
21 0.83
22 0.79
23 0.73
24 0.69
25 0.65
26 0.6
27 0.57
28 0.52
29 0.45
30 0.41
31 0.36
32 0.3
33 0.25
34 0.21
35 0.2
36 0.2
37 0.24
38 0.23
39 0.24
40 0.3
41 0.3
42 0.35
43 0.38
44 0.36
45 0.32
46 0.32
47 0.3
48 0.26
49 0.29
50 0.28
51 0.22
52 0.2
53 0.22
54 0.25
55 0.26
56 0.24
57 0.22
58 0.2
59 0.23
60 0.25
61 0.23
62 0.21
63 0.23
64 0.23
65 0.2
66 0.2
67 0.17
68 0.15
69 0.21
70 0.22
71 0.22
72 0.28
73 0.31
74 0.31
75 0.4
76 0.49
77 0.53
78 0.59
79 0.65
80 0.7
81 0.78
82 0.87
83 0.88
84 0.89
85 0.89
86 0.89
87 0.83
88 0.74
89 0.7
90 0.61
91 0.52
92 0.42
93 0.33
94 0.25
95 0.21
96 0.19
97 0.14
98 0.12
99 0.12
100 0.17
101 0.16
102 0.17
103 0.19
104 0.24
105 0.26
106 0.31
107 0.35
108 0.36
109 0.41
110 0.47
111 0.49
112 0.51
113 0.58
114 0.63
115 0.69
116 0.69
117 0.67
118 0.6
119 0.57
120 0.5
121 0.42
122 0.34
123 0.24
124 0.17
125 0.14
126 0.13
127 0.12
128 0.12
129 0.13
130 0.11
131 0.09
132 0.08
133 0.09
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.05
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.04
145 0.04
146 0.05
147 0.06
148 0.07
149 0.07
150 0.08
151 0.1
152 0.15
153 0.2
154 0.25
155 0.27
156 0.3
157 0.31
158 0.31
159 0.29
160 0.25
161 0.2
162 0.14
163 0.1
164 0.07
165 0.06
166 0.05
167 0.05
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.05
172 0.06
173 0.07
174 0.07
175 0.07
176 0.07
177 0.08
178 0.1
179 0.12
180 0.12
181 0.11
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.15
186 0.17
187 0.14
188 0.13
189 0.13
190 0.11
191 0.11
192 0.11
193 0.09
194 0.06
195 0.06
196 0.07
197 0.07
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.06
205 0.07
206 0.08
207 0.1
208 0.1
209 0.09
210 0.1
211 0.13
212 0.13
213 0.12
214 0.11
215 0.09
216 0.09
217 0.1
218 0.09
219 0.07
220 0.07
221 0.08
222 0.08
223 0.08
224 0.12
225 0.15
226 0.16
227 0.23
228 0.24
229 0.26
230 0.29
231 0.29
232 0.26
233 0.23
234 0.24
235 0.18
236 0.2
237 0.18
238 0.16
239 0.15
240 0.14
241 0.15
242 0.14
243 0.14
244 0.12
245 0.13
246 0.15
247 0.16
248 0.17
249 0.16
250 0.19
251 0.18
252 0.18
253 0.24
254 0.24
255 0.25
256 0.27
257 0.3
258 0.28
259 0.31
260 0.31
261 0.24
262 0.28
263 0.32
264 0.33
265 0.35
266 0.37
267 0.36
268 0.37
269 0.35
270 0.33
271 0.3
272 0.25
273 0.22
274 0.22
275 0.25
276 0.23
277 0.26
278 0.28
279 0.35
280 0.37
281 0.37
282 0.37
283 0.34
284 0.36
285 0.37
286 0.41
287 0.33
288 0.34
289 0.33
290 0.32