Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E5ADG1

Protein Details
Accession E5ADG1    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
401-421DKISNKLLGASKKRRKVRRKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
409-421GASKKRRKVRRKA
Subcellular Location(s) nucl 11, mito 10, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010997  HRDC-like_sf  
IPR005574  Rpb4/RPC9  
IPR038324  Rpb4/RPC9_sf  
IPR038846  RPC9  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0000166  F:nucleotide binding  
GO:0006384  P:transcription initiation at RNA polymerase III promoter  
Pfam View protein in Pfam  
PF03874  RNA_pol_Rpb4  
Amino Acid Sequences MSSLQSCISDRGPASTRYVCAVLISTPVAHVSVRQRSPTCEILVRPSIECACATRFTAKPVPVLYEEAPFSECCTYFGAPWRLLGRILCDSLLRESPFGLGRQSNLPDTRKSWQIIRGSYRGSYGQGRSLRPTRAAASVEGTGRTVEPMQTWPTNSSKKHPVTKSGTWTRDEPGLLDPSVETLQTHDLIRLHRRRQATSAKNFPFCLHLFPREPPITAAVDNEASTRNYKAISNLTLILHPSIKTPQSALLSNHELLLHLRQEEAEYSGTDGILDENGRSRKRAKPAGLNHMLRDGLTYLQTPDYTTSRLADTHPTRPMTLYRGPNSLFRALAPKYRLNKAEYLQLYNLRPSTQVMLELVIEEAGTRFTEDELHDILAITQHVFDEEEANIPQGVEDMKMDKISNKLLGASKKRRKVRRKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.35
3 0.35
4 0.33
5 0.33
6 0.27
7 0.24
8 0.23
9 0.17
10 0.16
11 0.16
12 0.12
13 0.12
14 0.12
15 0.12
16 0.11
17 0.15
18 0.21
19 0.29
20 0.33
21 0.39
22 0.41
23 0.45
24 0.51
25 0.5
26 0.46
27 0.42
28 0.4
29 0.41
30 0.45
31 0.42
32 0.37
33 0.36
34 0.33
35 0.29
36 0.28
37 0.23
38 0.21
39 0.21
40 0.22
41 0.25
42 0.25
43 0.3
44 0.36
45 0.35
46 0.36
47 0.35
48 0.37
49 0.33
50 0.36
51 0.31
52 0.28
53 0.26
54 0.23
55 0.23
56 0.19
57 0.19
58 0.18
59 0.17
60 0.15
61 0.18
62 0.18
63 0.18
64 0.27
65 0.3
66 0.27
67 0.31
68 0.31
69 0.28
70 0.29
71 0.27
72 0.23
73 0.21
74 0.22
75 0.19
76 0.18
77 0.19
78 0.2
79 0.24
80 0.2
81 0.17
82 0.17
83 0.18
84 0.2
85 0.19
86 0.19
87 0.15
88 0.16
89 0.21
90 0.23
91 0.25
92 0.29
93 0.31
94 0.31
95 0.33
96 0.36
97 0.36
98 0.36
99 0.35
100 0.37
101 0.4
102 0.43
103 0.45
104 0.45
105 0.42
106 0.4
107 0.38
108 0.33
109 0.29
110 0.28
111 0.23
112 0.27
113 0.3
114 0.31
115 0.35
116 0.39
117 0.38
118 0.36
119 0.37
120 0.32
121 0.31
122 0.31
123 0.25
124 0.23
125 0.23
126 0.21
127 0.19
128 0.17
129 0.13
130 0.12
131 0.12
132 0.1
133 0.08
134 0.08
135 0.11
136 0.14
137 0.15
138 0.16
139 0.18
140 0.24
141 0.3
142 0.3
143 0.34
144 0.4
145 0.44
146 0.52
147 0.51
148 0.54
149 0.56
150 0.59
151 0.63
152 0.62
153 0.59
154 0.52
155 0.52
156 0.44
157 0.4
158 0.34
159 0.26
160 0.2
161 0.19
162 0.16
163 0.15
164 0.13
165 0.12
166 0.12
167 0.1
168 0.08
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.1
173 0.09
174 0.11
175 0.14
176 0.23
177 0.29
178 0.31
179 0.35
180 0.38
181 0.38
182 0.43
183 0.5
184 0.5
185 0.5
186 0.57
187 0.56
188 0.55
189 0.53
190 0.47
191 0.41
192 0.33
193 0.3
194 0.23
195 0.23
196 0.23
197 0.24
198 0.3
199 0.26
200 0.26
201 0.22
202 0.21
203 0.19
204 0.17
205 0.16
206 0.11
207 0.11
208 0.1
209 0.1
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.09
215 0.1
216 0.1
217 0.12
218 0.14
219 0.14
220 0.15
221 0.16
222 0.16
223 0.16
224 0.16
225 0.14
226 0.12
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.12
232 0.12
233 0.15
234 0.16
235 0.19
236 0.19
237 0.21
238 0.24
239 0.23
240 0.23
241 0.19
242 0.18
243 0.16
244 0.17
245 0.13
246 0.1
247 0.1
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.11
252 0.09
253 0.08
254 0.09
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.06
260 0.06
261 0.06
262 0.05
263 0.1
264 0.15
265 0.16
266 0.18
267 0.23
268 0.28
269 0.37
270 0.45
271 0.46
272 0.51
273 0.58
274 0.67
275 0.72
276 0.67
277 0.59
278 0.53
279 0.47
280 0.37
281 0.3
282 0.21
283 0.12
284 0.11
285 0.11
286 0.1
287 0.11
288 0.11
289 0.11
290 0.13
291 0.14
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.15
296 0.16
297 0.17
298 0.24
299 0.26
300 0.3
301 0.35
302 0.35
303 0.35
304 0.36
305 0.37
306 0.33
307 0.37
308 0.39
309 0.36
310 0.39
311 0.4
312 0.43
313 0.44
314 0.4
315 0.33
316 0.26
317 0.3
318 0.27
319 0.32
320 0.32
321 0.36
322 0.39
323 0.45
324 0.48
325 0.45
326 0.49
327 0.44
328 0.49
329 0.44
330 0.43
331 0.4
332 0.42
333 0.4
334 0.38
335 0.38
336 0.29
337 0.27
338 0.24
339 0.24
340 0.2
341 0.19
342 0.16
343 0.16
344 0.15
345 0.15
346 0.13
347 0.09
348 0.08
349 0.06
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.06
354 0.06
355 0.07
356 0.11
357 0.11
358 0.15
359 0.15
360 0.16
361 0.15
362 0.15
363 0.15
364 0.13
365 0.13
366 0.1
367 0.09
368 0.08
369 0.09
370 0.1
371 0.1
372 0.1
373 0.1
374 0.12
375 0.12
376 0.14
377 0.13
378 0.12
379 0.12
380 0.11
381 0.11
382 0.09
383 0.1
384 0.11
385 0.13
386 0.15
387 0.16
388 0.18
389 0.21
390 0.25
391 0.27
392 0.26
393 0.29
394 0.34
395 0.42
396 0.5
397 0.57
398 0.63
399 0.68
400 0.77
401 0.83