Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139APH1

Protein Details
Accession A0A139APH1    Localization Confidence Low Confidence Score 9.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MIRTPKPKTARGRRILDDRAPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
337-364KKGNPGAKGKGKRAAEGGDAGVKKRKKA
Subcellular Location(s) mito 17, nucl 5, cyto 5, cyto_nucl 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR039770  Rpf2  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0019843  F:rRNA binding  
GO:0000470  P:maturation of LSU-rRNA  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MIRTPKPKTARGRRILDDRAPKLVENTKKCVFVRGSTTSLAVTEALRDFYLLKKPHAIHLPRRHAIHPFDDLAPLHDMCRKHDSSLALVATHSKKRPDGLTFARLFDGEVLDMVEVGVSGWAGLDMFKVPKPPLGTRPLLVFSGPLFTSLPALRTLRSMLIDLYRGDAADHLAIPEGVQYVVTVTADPAFEPTEDGDGSGCRVHLRTYKTALKRVEGVKTLPRVELEEMGPRADMVVRRWREGDSDVMREAMKVPKEIKNQTAKTKNITHTPLGDRVGTVHMRSQQLNKLELRKMKAFKKTAASGRGSGKAVEGGSAAGAAVEAGEVAGAVVEASAKKGNPGAKGKGKRAAEGGDAGVKKRKKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.81
3 0.79
4 0.78
5 0.71
6 0.68
7 0.61
8 0.54
9 0.51
10 0.52
11 0.52
12 0.48
13 0.52
14 0.5
15 0.55
16 0.55
17 0.57
18 0.51
19 0.47
20 0.48
21 0.46
22 0.45
23 0.39
24 0.4
25 0.32
26 0.29
27 0.25
28 0.18
29 0.12
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.12
35 0.12
36 0.15
37 0.24
38 0.23
39 0.25
40 0.31
41 0.33
42 0.39
43 0.47
44 0.51
45 0.53
46 0.61
47 0.68
48 0.66
49 0.68
50 0.64
51 0.61
52 0.58
53 0.52
54 0.45
55 0.38
56 0.34
57 0.33
58 0.31
59 0.27
60 0.26
61 0.22
62 0.18
63 0.2
64 0.2
65 0.21
66 0.29
67 0.28
68 0.26
69 0.3
70 0.3
71 0.29
72 0.34
73 0.3
74 0.22
75 0.21
76 0.26
77 0.26
78 0.3
79 0.3
80 0.28
81 0.28
82 0.32
83 0.36
84 0.34
85 0.38
86 0.38
87 0.44
88 0.42
89 0.42
90 0.39
91 0.34
92 0.31
93 0.23
94 0.18
95 0.09
96 0.08
97 0.07
98 0.06
99 0.06
100 0.05
101 0.04
102 0.03
103 0.03
104 0.03
105 0.02
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.03
111 0.03
112 0.04
113 0.06
114 0.07
115 0.1
116 0.1
117 0.13
118 0.18
119 0.21
120 0.26
121 0.3
122 0.32
123 0.3
124 0.32
125 0.31
126 0.27
127 0.24
128 0.18
129 0.12
130 0.13
131 0.12
132 0.1
133 0.09
134 0.08
135 0.11
136 0.1
137 0.11
138 0.11
139 0.12
140 0.11
141 0.12
142 0.13
143 0.12
144 0.12
145 0.12
146 0.1
147 0.11
148 0.12
149 0.11
150 0.11
151 0.1
152 0.09
153 0.08
154 0.08
155 0.07
156 0.06
157 0.06
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.04
162 0.05
163 0.04
164 0.04
165 0.03
166 0.03
167 0.03
168 0.04
169 0.04
170 0.04
171 0.03
172 0.04
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.06
184 0.06
185 0.07
186 0.06
187 0.06
188 0.05
189 0.06
190 0.08
191 0.13
192 0.18
193 0.2
194 0.26
195 0.34
196 0.37
197 0.44
198 0.43
199 0.4
200 0.41
201 0.4
202 0.38
203 0.32
204 0.31
205 0.29
206 0.32
207 0.31
208 0.27
209 0.24
210 0.22
211 0.22
212 0.21
213 0.17
214 0.18
215 0.17
216 0.17
217 0.16
218 0.14
219 0.13
220 0.13
221 0.13
222 0.12
223 0.21
224 0.22
225 0.24
226 0.25
227 0.26
228 0.26
229 0.26
230 0.3
231 0.24
232 0.26
233 0.25
234 0.25
235 0.24
236 0.22
237 0.22
238 0.19
239 0.17
240 0.18
241 0.21
242 0.27
243 0.35
244 0.38
245 0.43
246 0.48
247 0.52
248 0.58
249 0.63
250 0.58
251 0.57
252 0.62
253 0.58
254 0.55
255 0.55
256 0.47
257 0.45
258 0.46
259 0.45
260 0.39
261 0.35
262 0.28
263 0.25
264 0.27
265 0.23
266 0.2
267 0.19
268 0.23
269 0.25
270 0.27
271 0.31
272 0.32
273 0.35
274 0.39
275 0.39
276 0.4
277 0.44
278 0.47
279 0.49
280 0.5
281 0.54
282 0.56
283 0.61
284 0.59
285 0.59
286 0.61
287 0.63
288 0.62
289 0.62
290 0.59
291 0.54
292 0.55
293 0.54
294 0.47
295 0.39
296 0.33
297 0.28
298 0.24
299 0.2
300 0.15
301 0.1
302 0.09
303 0.09
304 0.08
305 0.04
306 0.04
307 0.03
308 0.03
309 0.02
310 0.02
311 0.02
312 0.02
313 0.02
314 0.02
315 0.02
316 0.02
317 0.02
318 0.02
319 0.04
320 0.04
321 0.07
322 0.09
323 0.1
324 0.11
325 0.16
326 0.21
327 0.27
328 0.35
329 0.42
330 0.5
331 0.58
332 0.64
333 0.68
334 0.66
335 0.61
336 0.58
337 0.53
338 0.46
339 0.4
340 0.36
341 0.35
342 0.34
343 0.33
344 0.37