Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139AJN0

Protein Details
Accession A0A139AJN0    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
240-313NANGRDRSPPRRRRSYSRSRSRSPPRHRRSPSPSSHRRRRTPSRSRSRSRSPPLRDRRRSPSHRDRRDRDGDRWBasic
362-383AGAGDKKKDRGDRREDRRDEGKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
225-391AKSRSPARSVGNKGANANGRDRSPPRRRRSYSRSRSRSPPRHRRSPSPSSHRRRRTPSRSRSRSRSPPLRDRRRSPSHRDRRDRDGDRWQAQASPPRSGRDSEGKGKDLYEERAERKKADRAALEKKVGKMFKSGSGAGAGDKKKDRGDRREDRRDEGKGSAGKGGG
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045347  HIND  
IPR005037  PRP38  
Gene Ontology GO:0071011  C:precatalytic spliceosome  
GO:0046540  C:U4/U6 x U5 tri-snRNP complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF19252  HIND  
PF03371  PRP38  
Amino Acid Sequences MANRTVYDAKSVHGTNPQYLVEKILRARIYESLFWKEHCFALTAETLIDKAVQLNAIGGHFGGNMKPTEFICLILKMLQIQPDRSICLEYLRQEDFKYLRALGAYYWRLTQRAEDVYKELEPLLEDFRKLRERNKDGGLIITHMDEFIDALLREERVCDVQLPRLTKREVLEEQGVLEMRDVEAEVAKLGVEDEEDADRRNEDESGSGSGSGEESGSEDGEWSRAKSRSPARSVGNKGANANGRDRSPPRRRRSYSRSRSRSPPRHRRSPSPSSHRRRRTPSRSRSRSRSPPLRDRRRSPSHRDRRDRDGDRWQAQASPPRSGRDSEGKGKDLYEERAERKKADRAALEKKVGKMFKSGSGAGAGDKKKDRGDRREDRRDEGKGSAGKGGGGGGGGDGMSIEETNKLRASLGLKPLKM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.32
3 0.35
4 0.36
5 0.33
6 0.32
7 0.34
8 0.29
9 0.31
10 0.3
11 0.33
12 0.33
13 0.31
14 0.33
15 0.34
16 0.35
17 0.36
18 0.38
19 0.38
20 0.38
21 0.39
22 0.41
23 0.37
24 0.34
25 0.29
26 0.26
27 0.19
28 0.22
29 0.21
30 0.17
31 0.16
32 0.14
33 0.13
34 0.12
35 0.12
36 0.08
37 0.08
38 0.08
39 0.08
40 0.08
41 0.09
42 0.1
43 0.1
44 0.1
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.1
51 0.1
52 0.11
53 0.13
54 0.13
55 0.17
56 0.17
57 0.18
58 0.18
59 0.18
60 0.18
61 0.18
62 0.18
63 0.16
64 0.17
65 0.22
66 0.22
67 0.23
68 0.27
69 0.27
70 0.28
71 0.26
72 0.26
73 0.2
74 0.22
75 0.24
76 0.22
77 0.26
78 0.27
79 0.27
80 0.26
81 0.31
82 0.27
83 0.27
84 0.27
85 0.22
86 0.2
87 0.19
88 0.19
89 0.15
90 0.22
91 0.21
92 0.19
93 0.21
94 0.22
95 0.22
96 0.22
97 0.23
98 0.2
99 0.25
100 0.26
101 0.25
102 0.26
103 0.27
104 0.27
105 0.26
106 0.21
107 0.14
108 0.12
109 0.12
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.15
114 0.2
115 0.27
116 0.29
117 0.34
118 0.4
119 0.45
120 0.5
121 0.53
122 0.52
123 0.45
124 0.46
125 0.39
126 0.3
127 0.24
128 0.19
129 0.15
130 0.1
131 0.1
132 0.06
133 0.06
134 0.04
135 0.05
136 0.05
137 0.06
138 0.07
139 0.08
140 0.08
141 0.08
142 0.09
143 0.09
144 0.09
145 0.11
146 0.11
147 0.17
148 0.21
149 0.24
150 0.25
151 0.29
152 0.29
153 0.3
154 0.29
155 0.3
156 0.28
157 0.28
158 0.28
159 0.23
160 0.22
161 0.21
162 0.2
163 0.13
164 0.11
165 0.08
166 0.06
167 0.05
168 0.05
169 0.04
170 0.04
171 0.04
172 0.04
173 0.04
174 0.04
175 0.04
176 0.04
177 0.03
178 0.03
179 0.03
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.07
184 0.07
185 0.07
186 0.08
187 0.08
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.08
192 0.09
193 0.09
194 0.09
195 0.08
196 0.08
197 0.08
198 0.07
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.04
205 0.04
206 0.04
207 0.06
208 0.07
209 0.07
210 0.11
211 0.12
212 0.13
213 0.2
214 0.28
215 0.34
216 0.38
217 0.42
218 0.43
219 0.5
220 0.53
221 0.54
222 0.51
223 0.44
224 0.41
225 0.4
226 0.39
227 0.33
228 0.32
229 0.26
230 0.23
231 0.26
232 0.3
233 0.36
234 0.42
235 0.51
236 0.56
237 0.65
238 0.69
239 0.75
240 0.81
241 0.82
242 0.82
243 0.83
244 0.83
245 0.77
246 0.82
247 0.83
248 0.84
249 0.84
250 0.84
251 0.81
252 0.84
253 0.84
254 0.84
255 0.82
256 0.81
257 0.8
258 0.79
259 0.82
260 0.81
261 0.86
262 0.86
263 0.85
264 0.85
265 0.86
266 0.87
267 0.87
268 0.87
269 0.88
270 0.89
271 0.89
272 0.88
273 0.87
274 0.86
275 0.85
276 0.84
277 0.82
278 0.82
279 0.85
280 0.88
281 0.87
282 0.84
283 0.83
284 0.84
285 0.83
286 0.83
287 0.83
288 0.83
289 0.85
290 0.88
291 0.84
292 0.83
293 0.85
294 0.81
295 0.76
296 0.75
297 0.74
298 0.66
299 0.64
300 0.55
301 0.48
302 0.45
303 0.47
304 0.4
305 0.39
306 0.38
307 0.38
308 0.39
309 0.38
310 0.39
311 0.4
312 0.44
313 0.45
314 0.47
315 0.47
316 0.46
317 0.44
318 0.44
319 0.38
320 0.36
321 0.33
322 0.35
323 0.38
324 0.46
325 0.48
326 0.47
327 0.49
328 0.52
329 0.5
330 0.51
331 0.52
332 0.51
333 0.59
334 0.62
335 0.65
336 0.61
337 0.6
338 0.61
339 0.56
340 0.5
341 0.46
342 0.42
343 0.41
344 0.42
345 0.38
346 0.31
347 0.31
348 0.3
349 0.26
350 0.31
351 0.26
352 0.27
353 0.3
354 0.33
355 0.37
356 0.47
357 0.53
358 0.56
359 0.65
360 0.7
361 0.77
362 0.84
363 0.82
364 0.8
365 0.78
366 0.73
367 0.66
368 0.59
369 0.56
370 0.48
371 0.46
372 0.42
373 0.35
374 0.29
375 0.26
376 0.23
377 0.15
378 0.11
379 0.09
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.05
388 0.05
389 0.1
390 0.11
391 0.15
392 0.16
393 0.16
394 0.16
395 0.2
396 0.23
397 0.26
398 0.36