Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139A8N1

Protein Details
Accession A0A139A8N1    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
233-259GKDEGSVARKWRKRIKACRRLPTCSVQHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
244-245RK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 12.5, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MDYIDIASTATKTRAVQEIRMDRTGDSSDNDLAIMQGHPKRRGCLPKTSTTLNTVVAMTAPALFVLFGSEKHLEVKEAFPDLSFAMILETVGNMWKALSDSERQIINKSDTVQGKWIAVAEAMKMEDPVAYSGVTHVNADRKVPALVEQWEQTGLLWEKRTGEDKVETILDSLVASYARDRTKYEMENAEEREKRCAEAEKDLQIAASLCKEATETLSEKRALEDVDQNTADGKDEGSVARKWRKRIKACRRLPTCSVQTKSKVKDC
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.28
3 0.32
4 0.4
5 0.47
6 0.5
7 0.52
8 0.49
9 0.41
10 0.42
11 0.39
12 0.31
13 0.24
14 0.23
15 0.21
16 0.2
17 0.19
18 0.15
19 0.13
20 0.12
21 0.11
22 0.14
23 0.17
24 0.24
25 0.31
26 0.33
27 0.36
28 0.43
29 0.53
30 0.51
31 0.58
32 0.57
33 0.6
34 0.62
35 0.64
36 0.58
37 0.52
38 0.49
39 0.4
40 0.35
41 0.26
42 0.21
43 0.16
44 0.14
45 0.1
46 0.08
47 0.06
48 0.05
49 0.05
50 0.04
51 0.04
52 0.06
53 0.06
54 0.06
55 0.1
56 0.11
57 0.12
58 0.14
59 0.15
60 0.14
61 0.15
62 0.17
63 0.15
64 0.16
65 0.15
66 0.13
67 0.14
68 0.12
69 0.11
70 0.09
71 0.07
72 0.05
73 0.05
74 0.05
75 0.04
76 0.04
77 0.04
78 0.05
79 0.05
80 0.04
81 0.04
82 0.04
83 0.05
84 0.06
85 0.08
86 0.09
87 0.11
88 0.14
89 0.16
90 0.16
91 0.18
92 0.2
93 0.21
94 0.2
95 0.2
96 0.23
97 0.23
98 0.23
99 0.24
100 0.22
101 0.19
102 0.18
103 0.16
104 0.11
105 0.09
106 0.08
107 0.06
108 0.06
109 0.06
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.05
114 0.05
115 0.05
116 0.05
117 0.05
118 0.05
119 0.06
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.11
125 0.11
126 0.12
127 0.11
128 0.11
129 0.11
130 0.11
131 0.12
132 0.11
133 0.13
134 0.14
135 0.14
136 0.13
137 0.13
138 0.13
139 0.11
140 0.13
141 0.12
142 0.12
143 0.13
144 0.13
145 0.14
146 0.16
147 0.19
148 0.16
149 0.17
150 0.17
151 0.17
152 0.18
153 0.17
154 0.16
155 0.13
156 0.12
157 0.09
158 0.07
159 0.06
160 0.05
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.1
165 0.12
166 0.13
167 0.15
168 0.19
169 0.25
170 0.27
171 0.31
172 0.31
173 0.34
174 0.38
175 0.4
176 0.43
177 0.42
178 0.4
179 0.41
180 0.36
181 0.33
182 0.31
183 0.34
184 0.29
185 0.34
186 0.37
187 0.35
188 0.35
189 0.34
190 0.31
191 0.25
192 0.23
193 0.15
194 0.12
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.09
199 0.08
200 0.09
201 0.13
202 0.14
203 0.17
204 0.22
205 0.23
206 0.23
207 0.23
208 0.24
209 0.21
210 0.21
211 0.26
212 0.23
213 0.27
214 0.27
215 0.26
216 0.25
217 0.24
218 0.23
219 0.15
220 0.13
221 0.09
222 0.1
223 0.11
224 0.14
225 0.17
226 0.24
227 0.33
228 0.38
229 0.47
230 0.56
231 0.65
232 0.72
233 0.8
234 0.84
235 0.85
236 0.9
237 0.92
238 0.89
239 0.86
240 0.81
241 0.79
242 0.77
243 0.76
244 0.71
245 0.68
246 0.69
247 0.71