Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139AZZ1

Protein Details
Accession A0A139AZZ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-62DDFSSASPTRKRPKVKLPKDTFAAEEKPKANRKRAPQNRVCEYCGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-52RKRPKVKLPKDTFAAEEKPKANRKRA
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027353  NET_dom  
IPR038336  NET_sf  
IPR000679  Znf_GATA  
IPR013088  Znf_NHR/GATA  
Gene Ontology GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF17035  BET  
PF00320  GATA  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50114  GATA_ZN_FINGER_2  
PS51525  NET  
CDD cd00202  ZnF_GATA  
Amino Acid Sequences MSPRGNASVKRGKADDDDDFSSASPTRKRPKVKLPKDTFAAEEKPKANRKRAPQNRVCEYCGATETPIWRRGPHGKGTLCNRCGVKWMTGKIVLDEEGNLKYIGGAPQYAQRKQMRVMNRSGSSKKKSEGSSADDLTRSKQIPSTKPNQPIRPIPPIRAGLPSTYLNEAAELLSYERKKLLSDAIGHLSDDHIDEVVEIIKMRMPDLPTSQQPNDDEEEEIELDMDTIDQGTLQLLYTYVEKIGIIKDGRLEPSLLLGPENPLSGSYTPGFETNGLNTVGSQMGGIHVQSNTNPATHGAARAALGAAHLSGPRMGVFEGNGGLAGIDGRGSSEDRDTSEGSLRESGSLKDDDMSVGGDEEVEGEDRDDGDEEEGADL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.45
3 0.42
4 0.41
5 0.37
6 0.36
7 0.33
8 0.29
9 0.27
10 0.26
11 0.26
12 0.32
13 0.42
14 0.5
15 0.59
16 0.66
17 0.74
18 0.8
19 0.85
20 0.87
21 0.86
22 0.85
23 0.81
24 0.74
25 0.66
26 0.61
27 0.57
28 0.5
29 0.48
30 0.45
31 0.49
32 0.55
33 0.6
34 0.63
35 0.64
36 0.69
37 0.74
38 0.81
39 0.83
40 0.83
41 0.84
42 0.85
43 0.82
44 0.75
45 0.67
46 0.58
47 0.49
48 0.43
49 0.34
50 0.26
51 0.23
52 0.26
53 0.28
54 0.32
55 0.3
56 0.29
57 0.34
58 0.41
59 0.44
60 0.47
61 0.5
62 0.47
63 0.53
64 0.62
65 0.65
66 0.58
67 0.57
68 0.51
69 0.43
70 0.45
71 0.41
72 0.38
73 0.35
74 0.36
75 0.35
76 0.37
77 0.37
78 0.32
79 0.31
80 0.24
81 0.18
82 0.17
83 0.15
84 0.12
85 0.13
86 0.11
87 0.09
88 0.09
89 0.1
90 0.11
91 0.09
92 0.09
93 0.09
94 0.16
95 0.22
96 0.23
97 0.29
98 0.31
99 0.33
100 0.36
101 0.42
102 0.44
103 0.43
104 0.48
105 0.48
106 0.48
107 0.52
108 0.54
109 0.55
110 0.52
111 0.51
112 0.48
113 0.47
114 0.44
115 0.45
116 0.43
117 0.42
118 0.42
119 0.4
120 0.38
121 0.34
122 0.32
123 0.28
124 0.28
125 0.22
126 0.17
127 0.19
128 0.24
129 0.3
130 0.36
131 0.41
132 0.45
133 0.54
134 0.6
135 0.61
136 0.6
137 0.6
138 0.59
139 0.62
140 0.56
141 0.49
142 0.48
143 0.45
144 0.41
145 0.37
146 0.32
147 0.23
148 0.24
149 0.22
150 0.18
151 0.17
152 0.16
153 0.12
154 0.12
155 0.11
156 0.08
157 0.07
158 0.05
159 0.05
160 0.09
161 0.1
162 0.1
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.12
167 0.14
168 0.13
169 0.15
170 0.17
171 0.19
172 0.19
173 0.18
174 0.17
175 0.14
176 0.12
177 0.09
178 0.07
179 0.04
180 0.04
181 0.04
182 0.04
183 0.05
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.08
191 0.09
192 0.11
193 0.15
194 0.18
195 0.2
196 0.25
197 0.25
198 0.26
199 0.26
200 0.26
201 0.25
202 0.22
203 0.2
204 0.15
205 0.15
206 0.12
207 0.11
208 0.09
209 0.06
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.03
214 0.03
215 0.03
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.05
224 0.05
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.06
229 0.06
230 0.07
231 0.11
232 0.1
233 0.1
234 0.13
235 0.15
236 0.17
237 0.17
238 0.17
239 0.12
240 0.14
241 0.15
242 0.13
243 0.11
244 0.1
245 0.11
246 0.11
247 0.11
248 0.09
249 0.08
250 0.1
251 0.1
252 0.13
253 0.11
254 0.12
255 0.12
256 0.13
257 0.13
258 0.12
259 0.13
260 0.11
261 0.13
262 0.13
263 0.12
264 0.11
265 0.12
266 0.11
267 0.09
268 0.08
269 0.06
270 0.06
271 0.07
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.08
276 0.09
277 0.12
278 0.12
279 0.12
280 0.13
281 0.12
282 0.15
283 0.15
284 0.17
285 0.14
286 0.14
287 0.14
288 0.14
289 0.13
290 0.09
291 0.08
292 0.07
293 0.06
294 0.07
295 0.07
296 0.07
297 0.07
298 0.07
299 0.07
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.08
304 0.09
305 0.09
306 0.09
307 0.08
308 0.07
309 0.07
310 0.06
311 0.05
312 0.04
313 0.04
314 0.03
315 0.04
316 0.06
317 0.07
318 0.09
319 0.12
320 0.13
321 0.15
322 0.19
323 0.2
324 0.21
325 0.26
326 0.25
327 0.25
328 0.27
329 0.25
330 0.24
331 0.25
332 0.23
333 0.22
334 0.22
335 0.2
336 0.18
337 0.18
338 0.16
339 0.15
340 0.15
341 0.11
342 0.1
343 0.09
344 0.08
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.08
350 0.08
351 0.09
352 0.09
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.11