Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A139A9R1

Protein Details
Accession A0A139A9R1    Localization Confidence High Confidence Score 15.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-61VKTSAATGKRPKKEGKAKKVALSFGHydrophilic
68-88ESEFKIKKSTASRKLNRGAEYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
44-55GKRPKKEGKAKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012890  GCFC2-like  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF15458  NTR2  
Amino Acid Sequences MSFSNFRARKSVGVVRTADDDDSQANQDSMAGEEVSVKTSAATGKRPKKEGKAKKVALSFGVDENQDESEFKIKKSTASRKLNRGAEYISSVAATDAGTESRTYDVESLRQLKESSSRPNQSAVSSTNTVSPFSSQLTAGEAIDVDSIPDAGQIFAARKLREQRRAQQQVEWGPDQTSGGTSDDFVSLTSRSGAVSTSRTARESRLMTEDQEYEGEEAFEDHEGDHIAFGAKDNAKAKMERRAGIASHLADAQGDDDDRDEDMEEWEKEHIRIGGARATLEAQERFDDENRGRKSTARAFAVPEPTAIPTLSDLNSQITTVLSSLRSSMSSNDTLVDHLSNQIAESTKSSASLKHDVEVLGDRYALTQETREFISDLAEFLDEKVAELEIMEEELASIERQRLEEREAMWREVTDGAFGAMTTAGTVRPVSLSAPLENLFVQLDHPLTTSEQSVAITRRLESLRNRHRHLFGDSLPTFSDLDQVLPRIADWSQKYPEDFVRGYGGDSIHGIVDLWARWEILGSELDASPPDLESTTWHGLLTSLVLPSSSSDTTLPDATATPDPDASLETLVKVVEKSVIPQLKLRVDSWVVWDKKETGRLVGWIEAVRGYVGGTSEAYKSLQASLLDRVSLVAQEVADRCDFSRFPPKVDSAAGVVVARGVWWEAMQKLLTSTLHVRKFLPHHGARGLVVDSIVEKCMMPALSRSSTFSDELGRVSKLVSALPVDWTRGMITSAPRFAAVMQHLGEANRGNFSEAESKTFESIMRVVEN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.43
3 0.45
4 0.43
5 0.36
6 0.28
7 0.25
8 0.2
9 0.2
10 0.21
11 0.17
12 0.16
13 0.14
14 0.15
15 0.14
16 0.13
17 0.13
18 0.1
19 0.09
20 0.13
21 0.13
22 0.14
23 0.14
24 0.12
25 0.11
26 0.13
27 0.18
28 0.18
29 0.27
30 0.36
31 0.45
32 0.53
33 0.61
34 0.67
35 0.72
36 0.8
37 0.82
38 0.83
39 0.84
40 0.83
41 0.83
42 0.8
43 0.72
44 0.64
45 0.57
46 0.48
47 0.4
48 0.37
49 0.29
50 0.25
51 0.23
52 0.21
53 0.18
54 0.16
55 0.14
56 0.2
57 0.21
58 0.21
59 0.26
60 0.26
61 0.32
62 0.42
63 0.51
64 0.53
65 0.63
66 0.71
67 0.74
68 0.82
69 0.82
70 0.74
71 0.67
72 0.59
73 0.51
74 0.46
75 0.37
76 0.29
77 0.22
78 0.19
79 0.15
80 0.13
81 0.1
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.08
86 0.08
87 0.09
88 0.1
89 0.1
90 0.11
91 0.13
92 0.15
93 0.17
94 0.24
95 0.29
96 0.29
97 0.31
98 0.3
99 0.29
100 0.34
101 0.36
102 0.39
103 0.43
104 0.47
105 0.47
106 0.5
107 0.5
108 0.44
109 0.43
110 0.36
111 0.32
112 0.29
113 0.28
114 0.29
115 0.28
116 0.27
117 0.24
118 0.23
119 0.18
120 0.18
121 0.19
122 0.14
123 0.14
124 0.16
125 0.16
126 0.15
127 0.13
128 0.11
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.06
133 0.05
134 0.05
135 0.05
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.06
140 0.07
141 0.08
142 0.13
143 0.18
144 0.18
145 0.23
146 0.33
147 0.41
148 0.5
149 0.57
150 0.61
151 0.68
152 0.77
153 0.74
154 0.69
155 0.67
156 0.64
157 0.62
158 0.54
159 0.44
160 0.35
161 0.33
162 0.29
163 0.21
164 0.16
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.1
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.09
173 0.09
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.1
182 0.12
183 0.13
184 0.17
185 0.19
186 0.21
187 0.22
188 0.23
189 0.28
190 0.27
191 0.28
192 0.29
193 0.28
194 0.28
195 0.3
196 0.29
197 0.23
198 0.21
199 0.19
200 0.14
201 0.13
202 0.11
203 0.08
204 0.07
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.05
209 0.06
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.06
214 0.06
215 0.06
216 0.06
217 0.12
218 0.12
219 0.16
220 0.17
221 0.2
222 0.22
223 0.25
224 0.27
225 0.31
226 0.35
227 0.33
228 0.35
229 0.34
230 0.32
231 0.32
232 0.33
233 0.24
234 0.2
235 0.19
236 0.15
237 0.13
238 0.12
239 0.1
240 0.07
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.06
246 0.07
247 0.07
248 0.06
249 0.08
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.13
254 0.13
255 0.13
256 0.14
257 0.13
258 0.11
259 0.12
260 0.13
261 0.15
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.15
268 0.14
269 0.11
270 0.11
271 0.13
272 0.14
273 0.15
274 0.19
275 0.18
276 0.27
277 0.28
278 0.3
279 0.29
280 0.3
281 0.35
282 0.38
283 0.42
284 0.36
285 0.35
286 0.36
287 0.39
288 0.41
289 0.35
290 0.27
291 0.22
292 0.19
293 0.19
294 0.15
295 0.11
296 0.08
297 0.1
298 0.1
299 0.09
300 0.09
301 0.1
302 0.1
303 0.1
304 0.09
305 0.07
306 0.07
307 0.07
308 0.07
309 0.06
310 0.06
311 0.07
312 0.07
313 0.08
314 0.08
315 0.1
316 0.12
317 0.13
318 0.13
319 0.13
320 0.13
321 0.12
322 0.13
323 0.11
324 0.08
325 0.08
326 0.08
327 0.06
328 0.06
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.08
333 0.09
334 0.09
335 0.1
336 0.11
337 0.12
338 0.16
339 0.22
340 0.21
341 0.19
342 0.21
343 0.19
344 0.2
345 0.2
346 0.16
347 0.1
348 0.1
349 0.09
350 0.08
351 0.09
352 0.08
353 0.06
354 0.06
355 0.06
356 0.08
357 0.08
358 0.09
359 0.08
360 0.08
361 0.1
362 0.08
363 0.08
364 0.07
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.07
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.04
375 0.05
376 0.03
377 0.03
378 0.03
379 0.03
380 0.03
381 0.03
382 0.03
383 0.03
384 0.04
385 0.05
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.09
390 0.12
391 0.14
392 0.15
393 0.22
394 0.23
395 0.24
396 0.23
397 0.21
398 0.19
399 0.19
400 0.17
401 0.09
402 0.07
403 0.06
404 0.06
405 0.06
406 0.05
407 0.03
408 0.03
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.04
413 0.04
414 0.04
415 0.04
416 0.05
417 0.05
418 0.08
419 0.09
420 0.09
421 0.11
422 0.11
423 0.12
424 0.11
425 0.11
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.07
434 0.07
435 0.08
436 0.08
437 0.08
438 0.08
439 0.08
440 0.1
441 0.11
442 0.13
443 0.13
444 0.12
445 0.16
446 0.17
447 0.21
448 0.25
449 0.34
450 0.42
451 0.49
452 0.52
453 0.53
454 0.55
455 0.54
456 0.51
457 0.45
458 0.37
459 0.39
460 0.35
461 0.32
462 0.29
463 0.27
464 0.24
465 0.19
466 0.2
467 0.1
468 0.12
469 0.11
470 0.12
471 0.1
472 0.1
473 0.1
474 0.09
475 0.09
476 0.13
477 0.14
478 0.19
479 0.22
480 0.23
481 0.24
482 0.25
483 0.27
484 0.26
485 0.24
486 0.2
487 0.2
488 0.19
489 0.19
490 0.18
491 0.16
492 0.11
493 0.12
494 0.11
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.05
499 0.06
500 0.06
501 0.07
502 0.07
503 0.07
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.08
509 0.07
510 0.08
511 0.08
512 0.08
513 0.08
514 0.09
515 0.07
516 0.07
517 0.07
518 0.06
519 0.06
520 0.08
521 0.15
522 0.16
523 0.16
524 0.16
525 0.15
526 0.15
527 0.15
528 0.15
529 0.09
530 0.07
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.08
535 0.11
536 0.1
537 0.1
538 0.1
539 0.12
540 0.14
541 0.15
542 0.13
543 0.1
544 0.11
545 0.13
546 0.15
547 0.15
548 0.13
549 0.13
550 0.13
551 0.13
552 0.13
553 0.11
554 0.1
555 0.09
556 0.08
557 0.09
558 0.09
559 0.09
560 0.08
561 0.08
562 0.09
563 0.09
564 0.11
565 0.19
566 0.22
567 0.23
568 0.26
569 0.31
570 0.33
571 0.35
572 0.33
573 0.3
574 0.28
575 0.28
576 0.31
577 0.35
578 0.31
579 0.29
580 0.31
581 0.3
582 0.32
583 0.37
584 0.32
585 0.26
586 0.27
587 0.29
588 0.29
589 0.26
590 0.24
591 0.18
592 0.18
593 0.15
594 0.14
595 0.11
596 0.09
597 0.07
598 0.06
599 0.06
600 0.06
601 0.07
602 0.08
603 0.09
604 0.1
605 0.11
606 0.1
607 0.11
608 0.11
609 0.14
610 0.13
611 0.15
612 0.18
613 0.18
614 0.18
615 0.17
616 0.16
617 0.14
618 0.13
619 0.11
620 0.08
621 0.07
622 0.1
623 0.11
624 0.13
625 0.13
626 0.14
627 0.13
628 0.17
629 0.17
630 0.19
631 0.29
632 0.28
633 0.31
634 0.36
635 0.37
636 0.36
637 0.37
638 0.34
639 0.25
640 0.25
641 0.22
642 0.17
643 0.14
644 0.11
645 0.1
646 0.08
647 0.06
648 0.06
649 0.05
650 0.05
651 0.08
652 0.09
653 0.11
654 0.12
655 0.12
656 0.12
657 0.15
658 0.15
659 0.16
660 0.24
661 0.3
662 0.33
663 0.35
664 0.35
665 0.39
666 0.44
667 0.48
668 0.5
669 0.45
670 0.46
671 0.47
672 0.48
673 0.41
674 0.39
675 0.32
676 0.22
677 0.18
678 0.14
679 0.13
680 0.12
681 0.12
682 0.1
683 0.09
684 0.08
685 0.12
686 0.12
687 0.12
688 0.14
689 0.2
690 0.24
691 0.25
692 0.28
693 0.28
694 0.31
695 0.31
696 0.28
697 0.27
698 0.24
699 0.25
700 0.25
701 0.22
702 0.19
703 0.18
704 0.19
705 0.16
706 0.16
707 0.15
708 0.14
709 0.15
710 0.2
711 0.21
712 0.21
713 0.21
714 0.21
715 0.2
716 0.18
717 0.19
718 0.16
719 0.21
720 0.25
721 0.27
722 0.27
723 0.26
724 0.26
725 0.25
726 0.28
727 0.24
728 0.23
729 0.21
730 0.22
731 0.23
732 0.23
733 0.25
734 0.23
735 0.21
736 0.2
737 0.19
738 0.19
739 0.18
740 0.22
741 0.28
742 0.25
743 0.28
744 0.28
745 0.29
746 0.28
747 0.29
748 0.26
749 0.21
750 0.22