Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A139A8D6

Protein Details
Accession A0A139A8D6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
20-46QPNKPSPVPKGLPKRRGRPPKTSTTLIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
27-40VPKGLPKRRGRPPK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 10, mito 3, cyto 2.5, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
CDD cd00084  HMG-box_SF  
Amino Acid Sequences MDKAGDSLDNDLSDTPSTVQPNKPSPVPKGLPKRRGRPPKTSTTLILALPMSAPALFVLFTREKRPEVKAAFPDLSFAMIPATIGNMWKALSNEEKQASKSGKVPGVYFSWDYDKYVVLMRHASIIRPYEINNKGETKQGKWMAVAEAMIQEDPVAYSGVTYINADRNVANLVKAWEQTGASWEKRTGEDEEETMLDALVAAYARDRTRYEMESAEEKENRRAEAEKDMLIAACLRKDATETLSKKRVLEDVDRNTADGQDEGSVPRKQGKPAEEARSSLKVIADMLRADKKQAEGMLEVARESEDRKRKALELKERELEVREMEAKNMRDMMTTMFKELMDIKKKNL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.15
3 0.17
4 0.22
5 0.26
6 0.31
7 0.36
8 0.43
9 0.46
10 0.5
11 0.51
12 0.52
13 0.57
14 0.57
15 0.59
16 0.64
17 0.7
18 0.74
19 0.78
20 0.81
21 0.82
22 0.88
23 0.86
24 0.85
25 0.82
26 0.83
27 0.8
28 0.75
29 0.67
30 0.62
31 0.57
32 0.47
33 0.41
34 0.3
35 0.24
36 0.19
37 0.17
38 0.11
39 0.08
40 0.08
41 0.05
42 0.06
43 0.05
44 0.05
45 0.11
46 0.15
47 0.17
48 0.22
49 0.26
50 0.29
51 0.32
52 0.37
53 0.4
54 0.4
55 0.46
56 0.45
57 0.48
58 0.47
59 0.43
60 0.4
61 0.31
62 0.29
63 0.21
64 0.16
65 0.1
66 0.08
67 0.08
68 0.06
69 0.07
70 0.06
71 0.06
72 0.07
73 0.07
74 0.07
75 0.09
76 0.09
77 0.11
78 0.16
79 0.18
80 0.23
81 0.26
82 0.27
83 0.26
84 0.32
85 0.32
86 0.28
87 0.31
88 0.32
89 0.32
90 0.31
91 0.31
92 0.28
93 0.27
94 0.27
95 0.24
96 0.2
97 0.21
98 0.2
99 0.2
100 0.18
101 0.16
102 0.15
103 0.18
104 0.17
105 0.14
106 0.15
107 0.14
108 0.18
109 0.18
110 0.18
111 0.17
112 0.18
113 0.18
114 0.17
115 0.19
116 0.22
117 0.26
118 0.27
119 0.27
120 0.28
121 0.28
122 0.33
123 0.33
124 0.26
125 0.3
126 0.32
127 0.3
128 0.27
129 0.28
130 0.23
131 0.21
132 0.19
133 0.12
134 0.09
135 0.09
136 0.08
137 0.06
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.04
142 0.04
143 0.03
144 0.03
145 0.04
146 0.05
147 0.05
148 0.05
149 0.06
150 0.09
151 0.09
152 0.1
153 0.09
154 0.1
155 0.11
156 0.11
157 0.1
158 0.08
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.1
163 0.09
164 0.09
165 0.09
166 0.11
167 0.13
168 0.13
169 0.14
170 0.14
171 0.15
172 0.15
173 0.18
174 0.16
175 0.15
176 0.16
177 0.15
178 0.15
179 0.14
180 0.14
181 0.11
182 0.09
183 0.06
184 0.05
185 0.04
186 0.03
187 0.03
188 0.03
189 0.03
190 0.06
191 0.06
192 0.08
193 0.09
194 0.13
195 0.16
196 0.18
197 0.2
198 0.2
199 0.22
200 0.24
201 0.27
202 0.28
203 0.27
204 0.27
205 0.31
206 0.31
207 0.29
208 0.27
209 0.26
210 0.23
211 0.27
212 0.28
213 0.22
214 0.21
215 0.21
216 0.19
217 0.17
218 0.17
219 0.1
220 0.08
221 0.08
222 0.08
223 0.07
224 0.09
225 0.1
226 0.12
227 0.21
228 0.24
229 0.3
230 0.37
231 0.38
232 0.37
233 0.38
234 0.38
235 0.33
236 0.38
237 0.41
238 0.4
239 0.46
240 0.45
241 0.44
242 0.41
243 0.37
244 0.3
245 0.2
246 0.15
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.15
251 0.16
252 0.16
253 0.23
254 0.25
255 0.28
256 0.34
257 0.36
258 0.39
259 0.47
260 0.54
261 0.48
262 0.48
263 0.48
264 0.45
265 0.42
266 0.36
267 0.28
268 0.21
269 0.2
270 0.21
271 0.18
272 0.16
273 0.2
274 0.24
275 0.23
276 0.25
277 0.26
278 0.24
279 0.26
280 0.26
281 0.24
282 0.19
283 0.22
284 0.23
285 0.21
286 0.2
287 0.16
288 0.15
289 0.13
290 0.15
291 0.22
292 0.28
293 0.31
294 0.34
295 0.38
296 0.43
297 0.51
298 0.59
299 0.61
300 0.61
301 0.65
302 0.67
303 0.65
304 0.62
305 0.56
306 0.48
307 0.38
308 0.34
309 0.32
310 0.27
311 0.29
312 0.34
313 0.32
314 0.33
315 0.34
316 0.3
317 0.25
318 0.26
319 0.27
320 0.29
321 0.29
322 0.28
323 0.27
324 0.26
325 0.26
326 0.31
327 0.35
328 0.36